FuNGI

A0A5E3WUP4

Protein Details

Accession

A0A5E3WUP4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
455-476	IYCSAKPRCREHDLKKLWRDLS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 10, cyto 6.5, pero 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000210 BTB/POZ_dom IPR019761 DNA-dir_RNA_pol-M_15_CS IPR001529 DNA-dir_RNA_pol_M/15kDasu IPR012164 Rpa12/Rpb9/Rpc10/TFS IPR001222 Znf_TFIIS
Gene Ontology	GO:1990234 C:transferase complex GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF02150 RNA_POL_M_15KD PF01096 TFIIS_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS50097 BTB PS01030 RNA_POL_M_15KD

Amino Acid Sequences

MSDSAKVTLHFCQDCNNLLYPKADPTRRTMVYACRICEYNTVVDNALVYRNDLLTVTKEQVGVTVDLGADTTLAHSVIPCPKCSNEDAVFFQDQSKRKETPYLPMVLCRKAWRHRERLDLDFGESQLPLLSTHALLPFTFSRHVGIQVRHTLGWPHDHATVRRLYADGDEHSFDLEESARMQWPQTLKRARLEGRDSSRTLVCDELFFSDGTIILRAYSSVNRTYTLFKVHKSLLAMHAGFFRDLFADSTSALLDASSEKYDGLPVMDMQDNPEDLADFLRAIYMPGFMRRHMDSKARLYDFPKMYTGVMRLVKKFDAAQIHAVFAADLRAAWPPNLRDAEARWKVYDARWENAGSAVVWPERRLYSYPDAGHAIRMAVDYHIPDVLPHLFYELANYYGVGSIVEGREACCGDLSALDAREMRTLLLGSAALRTHIAACFPLDIAEVIDIDNALIYCSAKPRCREHDLKKLWRDLSEHIREGDSPWTVLEENSIFDDYVICAPCKDAVETHLRYYREDLWPRLPELFRLTEYDVPANWPQSGNS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.38
3	0.39
4	0.33
5	0.33
6	0.35
7	0.3
8	0.35
9	0.39
10	0.41
11	0.38
12	0.43
13	0.5
14	0.5
15	0.52
16	0.48
17	0.49
18	0.53
19	0.57
20	0.52
21	0.46
22	0.46
23	0.43
24	0.43
25	0.38
26	0.33
27	0.3
28	0.29
29	0.27
30	0.25
31	0.25
32	0.21
33	0.21
34	0.15
35	0.14
36	0.14
37	0.13
38	0.14
39	0.13
40	0.14
41	0.14
42	0.18
43	0.19
44	0.2
45	0.2
46	0.2
47	0.21
48	0.22
49	0.19
50	0.15
51	0.14
52	0.12
53	0.11
54	0.11
55	0.09
56	0.06
57	0.05
58	0.06
59	0.05
60	0.05
61	0.05
62	0.06
63	0.1
64	0.19
65	0.21
66	0.22
67	0.25
68	0.27
69	0.3
70	0.33
71	0.36
72	0.32
73	0.34
74	0.36
75	0.38
76	0.37
77	0.34
78	0.36
79	0.35
80	0.37
81	0.39
82	0.4
83	0.37
84	0.38
85	0.47
86	0.44
87	0.46
88	0.46
89	0.48
90	0.43
91	0.48
92	0.51
93	0.45
94	0.45
95	0.41
96	0.44
97	0.45
98	0.55
99	0.57
100	0.63
101	0.66
102	0.73
103	0.73
104	0.7
105	0.69
106	0.6
107	0.54
108	0.46
109	0.4
110	0.31
111	0.25
112	0.2
113	0.13
114	0.12
115	0.09
116	0.08
117	0.08
118	0.08
119	0.1
120	0.11
121	0.11
122	0.1
123	0.14
124	0.14
125	0.16
126	0.17
127	0.15
128	0.16
129	0.17
130	0.22
131	0.24
132	0.25
133	0.28
134	0.32
135	0.34
136	0.32
137	0.31
138	0.29
139	0.25
140	0.28
141	0.25
142	0.21
143	0.24
144	0.27
145	0.27
146	0.29
147	0.3
148	0.26
149	0.25
150	0.22
151	0.18
152	0.17
153	0.19
154	0.17
155	0.16
156	0.16
157	0.16
158	0.15
159	0.15
160	0.12
161	0.1
162	0.09
163	0.07
164	0.07
165	0.08
166	0.09
167	0.09
168	0.1
169	0.12
170	0.17
171	0.2
172	0.28
173	0.34
174	0.35
175	0.39
176	0.46
177	0.46
178	0.48
179	0.49
180	0.49
181	0.49
182	0.51
183	0.48
184	0.43
185	0.41
186	0.35
187	0.31
188	0.25
189	0.18
190	0.14
191	0.13
192	0.12
193	0.12
194	0.11
195	0.1
196	0.08
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.06
201	0.05
202	0.05
203	0.06
204	0.07
205	0.08
206	0.1
207	0.13
208	0.14
209	0.15
210	0.16
211	0.19
212	0.19
213	0.25
214	0.24
215	0.22
216	0.25
217	0.25
218	0.26
219	0.24
220	0.25
221	0.19
222	0.22
223	0.21
224	0.17
225	0.19
226	0.17
227	0.16
228	0.14
229	0.11
230	0.07
231	0.08
232	0.08
233	0.07
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.06
239	0.05
240	0.04
241	0.04
242	0.05
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.07
249	0.06
250	0.06
251	0.05
252	0.05
253	0.07
254	0.08
255	0.08
256	0.09
257	0.09
258	0.09
259	0.09
260	0.08
261	0.06
262	0.05
263	0.06
264	0.05
265	0.04
266	0.04
267	0.04
268	0.04
269	0.05
270	0.05
271	0.06
272	0.06
273	0.11
274	0.12
275	0.12
276	0.15
277	0.16
278	0.19
279	0.2
280	0.25
281	0.24
282	0.3
283	0.36
284	0.35
285	0.35
286	0.35
287	0.41
288	0.37
289	0.34
290	0.3
291	0.24
292	0.22
293	0.22
294	0.21
295	0.18
296	0.21
297	0.22
298	0.22
299	0.23
300	0.23
301	0.22
302	0.22
303	0.2
304	0.19
305	0.18
306	0.23
307	0.21
308	0.21
309	0.2
310	0.2
311	0.15
312	0.11
313	0.1
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.06
318	0.06
319	0.07
320	0.1
321	0.1
322	0.16
323	0.17
324	0.18
325	0.17
326	0.2
327	0.3
328	0.32
329	0.33
330	0.28
331	0.28
332	0.29
333	0.29
334	0.36
335	0.29
336	0.26
337	0.27
338	0.27
339	0.26
340	0.25
341	0.23
342	0.14
343	0.11
344	0.11
345	0.1
346	0.1
347	0.11
348	0.12
349	0.12
350	0.14
351	0.15
352	0.19
353	0.23
354	0.28
355	0.28
356	0.28
357	0.31
358	0.29
359	0.28
360	0.22
361	0.17
362	0.12
363	0.12
364	0.1
365	0.07
366	0.08
367	0.08
368	0.08
369	0.09
370	0.08
371	0.07
372	0.1
373	0.1
374	0.1
375	0.09
376	0.1
377	0.1
378	0.1
379	0.13
380	0.12
381	0.11
382	0.11
383	0.11
384	0.1
385	0.09
386	0.1
387	0.07
388	0.06
389	0.07
390	0.07
391	0.08
392	0.08
393	0.08
394	0.1
395	0.1
396	0.1
397	0.08
398	0.08
399	0.08
400	0.08
401	0.09
402	0.1
403	0.11
404	0.12
405	0.13
406	0.13
407	0.15
408	0.15
409	0.13
410	0.11
411	0.1
412	0.09
413	0.09
414	0.09
415	0.07
416	0.09
417	0.09
418	0.09
419	0.09
420	0.09
421	0.1
422	0.1
423	0.1
424	0.09
425	0.1
426	0.1
427	0.1
428	0.1
429	0.09
430	0.08
431	0.08
432	0.08
433	0.07
434	0.07
435	0.07
436	0.06
437	0.05
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.06
443	0.07
444	0.14
445	0.21
446	0.26
447	0.31
448	0.39
449	0.47
450	0.55
451	0.64
452	0.66
453	0.71
454	0.76
455	0.8
456	0.8
457	0.81
458	0.74
459	0.68
460	0.63
461	0.59
462	0.59
463	0.56
464	0.51
465	0.44
466	0.43
467	0.4
468	0.38
469	0.36
470	0.27
471	0.19
472	0.17
473	0.18
474	0.17
475	0.16
476	0.18
477	0.14
478	0.14
479	0.16
480	0.17
481	0.14
482	0.13
483	0.14
484	0.12
485	0.16
486	0.17
487	0.15
488	0.14
489	0.15
490	0.18
491	0.19
492	0.19
493	0.16
494	0.19
495	0.28
496	0.31
497	0.37
498	0.39
499	0.38
500	0.39
501	0.43
502	0.45
503	0.46
504	0.5
505	0.49
506	0.51
507	0.55
508	0.55
509	0.57
510	0.51
511	0.45
512	0.44
513	0.43
514	0.36
515	0.36
516	0.38
517	0.35
518	0.38
519	0.37
520	0.31
521	0.33
522	0.35
523	0.33
524	0.3

A0A5E3WUP4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer