Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VSN4

Protein Details
Accession H1VSN4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-69HDDWDSQPQPPKKKGKKKKTAGLQCFVCKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-59PKKKGKKKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002125  CMP_dCMP_dom  
IPR016193  Cytidine_deaminase-like  
IPR015517  dCMP_deaminase-rel  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003824  F:catalytic activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006139  P:nucleobase-containing compound metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00383  dCMP_cyt_deam_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MTAQHVAEGQADQAQGSWCFCPRATQAGSPAPEPAPSTAGHDDWDSQPQPPKKKGKKKKTAGLQCFVCKQEGHTKTECPLRAQDTTAVAVNGNGNGNSNGNVTRVDESPARDYTPPMIVGAYAMVTRPSRPPQPPHANNSFHAPAPGGQAPASSRQQQQQLTFSSADALVDFVTTRWQSRFVTTDVHNEAVLDTLSRRPFFMLISVDGPLTVRHARFRALHNPHCTLESFARASDNHLYDPDHGMQPLISRATVRLLNTSSSLAHLYATLGKLQLADPVRLRPSWDAYFMSLAELASLRSNCMKRRVGAVLVGREKRENALLEAGRERIREGAIIYCDTCPCLTCSIKICQVGIEEVVYAHGYSMDSETAAVFAQAGVKLRQYIPAPNGLIHLENLENLELY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.16
4 0.17
5 0.17
6 0.19
7 0.19
8 0.24
9 0.25
10 0.32
11 0.34
12 0.36
13 0.4
14 0.46
15 0.48
16 0.42
17 0.42
18 0.34
19 0.32
20 0.29
21 0.24
22 0.18
23 0.17
24 0.22
25 0.22
26 0.22
27 0.22
28 0.21
29 0.22
30 0.23
31 0.3
32 0.25
33 0.26
34 0.34
35 0.41
36 0.48
37 0.54
38 0.64
39 0.67
40 0.77
41 0.84
42 0.87
43 0.91
44 0.92
45 0.93
46 0.93
47 0.93
48 0.9
49 0.88
50 0.83
51 0.77
52 0.72
53 0.63
54 0.55
55 0.44
56 0.39
57 0.41
58 0.39
59 0.4
60 0.38
61 0.39
62 0.41
63 0.49
64 0.46
65 0.4
66 0.4
67 0.39
68 0.38
69 0.37
70 0.36
71 0.3
72 0.3
73 0.27
74 0.22
75 0.17
76 0.16
77 0.15
78 0.13
79 0.12
80 0.1
81 0.1
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.12
86 0.11
87 0.11
88 0.12
89 0.12
90 0.14
91 0.14
92 0.16
93 0.17
94 0.19
95 0.23
96 0.23
97 0.24
98 0.22
99 0.23
100 0.22
101 0.22
102 0.2
103 0.16
104 0.15
105 0.12
106 0.11
107 0.1
108 0.08
109 0.05
110 0.05
111 0.07
112 0.07
113 0.09
114 0.13
115 0.18
116 0.25
117 0.3
118 0.36
119 0.45
120 0.55
121 0.6
122 0.63
123 0.66
124 0.62
125 0.58
126 0.58
127 0.49
128 0.38
129 0.33
130 0.26
131 0.19
132 0.2
133 0.2
134 0.14
135 0.12
136 0.13
137 0.14
138 0.18
139 0.2
140 0.19
141 0.21
142 0.24
143 0.3
144 0.33
145 0.34
146 0.33
147 0.33
148 0.32
149 0.3
150 0.26
151 0.21
152 0.17
153 0.15
154 0.1
155 0.08
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.04
160 0.07
161 0.07
162 0.09
163 0.09
164 0.12
165 0.13
166 0.15
167 0.18
168 0.16
169 0.2
170 0.2
171 0.25
172 0.24
173 0.24
174 0.22
175 0.19
176 0.18
177 0.14
178 0.12
179 0.06
180 0.05
181 0.09
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.14
189 0.11
190 0.1
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.1
196 0.07
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.12
201 0.13
202 0.16
203 0.18
204 0.23
205 0.3
206 0.36
207 0.42
208 0.44
209 0.47
210 0.45
211 0.43
212 0.39
213 0.31
214 0.25
215 0.22
216 0.17
217 0.14
218 0.16
219 0.15
220 0.17
221 0.2
222 0.2
223 0.17
224 0.17
225 0.18
226 0.18
227 0.21
228 0.19
229 0.15
230 0.14
231 0.13
232 0.12
233 0.12
234 0.13
235 0.1
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.11
240 0.13
241 0.13
242 0.14
243 0.15
244 0.15
245 0.16
246 0.17
247 0.14
248 0.13
249 0.13
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.08
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.09
258 0.09
259 0.1
260 0.1
261 0.14
262 0.14
263 0.16
264 0.16
265 0.2
266 0.22
267 0.22
268 0.24
269 0.21
270 0.26
271 0.25
272 0.27
273 0.24
274 0.23
275 0.24
276 0.22
277 0.2
278 0.14
279 0.12
280 0.1
281 0.09
282 0.08
283 0.1
284 0.1
285 0.11
286 0.16
287 0.2
288 0.24
289 0.32
290 0.35
291 0.33
292 0.39
293 0.41
294 0.37
295 0.39
296 0.41
297 0.41
298 0.45
299 0.46
300 0.42
301 0.4
302 0.38
303 0.34
304 0.33
305 0.26
306 0.21
307 0.26
308 0.26
309 0.27
310 0.28
311 0.3
312 0.27
313 0.26
314 0.24
315 0.19
316 0.18
317 0.16
318 0.15
319 0.17
320 0.18
321 0.19
322 0.2
323 0.19
324 0.19
325 0.19
326 0.18
327 0.14
328 0.14
329 0.18
330 0.18
331 0.21
332 0.25
333 0.3
334 0.36
335 0.37
336 0.35
337 0.31
338 0.31
339 0.29
340 0.25
341 0.19
342 0.13
343 0.11
344 0.12
345 0.1
346 0.09
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.09
352 0.09
353 0.08
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.07
359 0.06
360 0.05
361 0.08
362 0.09
363 0.12
364 0.13
365 0.15
366 0.18
367 0.19
368 0.25
369 0.25
370 0.3
371 0.31
372 0.37
373 0.37
374 0.34
375 0.36
376 0.32
377 0.31
378 0.24
379 0.23
380 0.16
381 0.16
382 0.16