FuNGI

A0A5E3XR99

Protein Details

Accession

A0A5E3XR99

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-28	EAAKLFHPKQKKGQLAKVAAKRP	Hydrophilic
175-195	GPGAGRRKPGKKTRQVYKVAD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
14-31	KQKKGQLAKVAAKRPPAG
167-188	PAKEKQKGGPGAGRRKPGKKTR

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MPLPPEAAKLFHPKQKKGQLAKVAAKRPPAGSQTKPASPAGSAAPSPTPPKAAPSPKPATTAEEEAGFPAGNDYQEFSIVSSSLNGWKYDVMRFESRKPVDVTQWAQPVKLNRKDVRRGNPDADDAEAPPPVGVRPMLGADGKPVIGADGRTVMLDAEGKPIHTNAPAKEKQKGGPGAGRRKPGKKTRQVYKVADSVRELRKEERYPWVIEDGAGQELWTAQMDEVAKSENHGMLMPAGNNSFQFVPAHRWYRFHKKAAHAIPNLETAEKMMASITKNKDPERWLLRRTGKSQLDATTAAAFKQEPIDAGPSGSGPGLRVKEEPVDDLFGDDEEGGRRRRDNDMDADYDEVPYEEEFQDDEEKVGLYEDDELTKEMEERLQKEYMTANKHRDENVVTDDDEPEQGPRVSKSMRKLVGRHEKNDLYGSDDSDENPYASEEEEESSDEDVVTNEPAVKAQPVPHRAGSQTPRPPTNGTTSRQTSPKPATPSHGGHSLIAQRATSPKPPRPKISTSGGSRATSPLATSPTSPRSPSPTKGMPNGTSVSNGKRKADDSSPTAEGSEAPQKKKHRAGAVAATVDANGNPIELKREMVIEWLRGQEGATTRDCISYFTPFLRDAASKDAFSQLVKEIASLQKGVLTLRKAYRGGKKASSSSPAPGGSSQGMDTSA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.7
3	0.76
4	0.75
5	0.78
6	0.8
7	0.81
8	0.83
9	0.82
10	0.8
11	0.74
12	0.71
13	0.65
14	0.58
15	0.56
16	0.54
17	0.52
18	0.49
19	0.55
20	0.55
21	0.55
22	0.56
23	0.5
24	0.44
25	0.37
26	0.35
27	0.29
28	0.26
29	0.22
30	0.21
31	0.22
32	0.23
33	0.27
34	0.26
35	0.27
36	0.24
37	0.3
38	0.37
39	0.44
40	0.48
41	0.54
42	0.59
43	0.58
44	0.62
45	0.57
46	0.54
47	0.49
48	0.47
49	0.38
50	0.33
51	0.3
52	0.26
53	0.26
54	0.19
55	0.14
56	0.11
57	0.11
58	0.1
59	0.1
60	0.11
61	0.11
62	0.12
63	0.12
64	0.11
65	0.11
66	0.1
67	0.1
68	0.09
69	0.1
70	0.15
71	0.17
72	0.17
73	0.16
74	0.19
75	0.21
76	0.24
77	0.27
78	0.27
79	0.34
80	0.37
81	0.42
82	0.49
83	0.48
84	0.5
85	0.5
86	0.47
87	0.45
88	0.48
89	0.46
90	0.43
91	0.49
92	0.44
93	0.4
94	0.4
95	0.44
96	0.46
97	0.51
98	0.53
99	0.52
100	0.61
101	0.7
102	0.76
103	0.77
104	0.75
105	0.74
106	0.7
107	0.67
108	0.61
109	0.53
110	0.46
111	0.37
112	0.3
113	0.25
114	0.19
115	0.16
116	0.13
117	0.12
118	0.09
119	0.1
120	0.08
121	0.07
122	0.08
123	0.09
124	0.11
125	0.12
126	0.11
127	0.12
128	0.13
129	0.12
130	0.11
131	0.1
132	0.09
133	0.09
134	0.09
135	0.08
136	0.09
137	0.09
138	0.09
139	0.09
140	0.09
141	0.08
142	0.1
143	0.09
144	0.12
145	0.13
146	0.13
147	0.14
148	0.14
149	0.15
150	0.18
151	0.22
152	0.2
153	0.3
154	0.35
155	0.37
156	0.42
157	0.44
158	0.43
159	0.47
160	0.47
161	0.42
162	0.42
163	0.49
164	0.54
165	0.56
166	0.61
167	0.59
168	0.62
169	0.67
170	0.71
171	0.72
172	0.73
173	0.77
174	0.78
175	0.81
176	0.83
177	0.79
178	0.74
179	0.7
180	0.62
181	0.55
182	0.48
183	0.46
184	0.43
185	0.42
186	0.38
187	0.35
188	0.41
189	0.42
190	0.43
191	0.44
192	0.42
193	0.4
194	0.4
195	0.38
196	0.3
197	0.27
198	0.25
199	0.17
200	0.14
201	0.12
202	0.1
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.06
207	0.05
208	0.04
209	0.07
210	0.08
211	0.08
212	0.09
213	0.1
214	0.1
215	0.1
216	0.12
217	0.1
218	0.1
219	0.09
220	0.09
221	0.09
222	0.1
223	0.1
224	0.09
225	0.09
226	0.09
227	0.09
228	0.1
229	0.09
230	0.08
231	0.09
232	0.09
233	0.15
234	0.2
235	0.27
236	0.26
237	0.3
238	0.35
239	0.46
240	0.51
241	0.51
242	0.52
243	0.51
244	0.6
245	0.64
246	0.66
247	0.57
248	0.52
249	0.48
250	0.44
251	0.39
252	0.3
253	0.22
254	0.14
255	0.13
256	0.1
257	0.09
258	0.05
259	0.07
260	0.08
261	0.16
262	0.18
263	0.22
264	0.26
265	0.27
266	0.31
267	0.32
268	0.38
269	0.4
270	0.41
271	0.39
272	0.44
273	0.51
274	0.52
275	0.53
276	0.55
277	0.48
278	0.46
279	0.46
280	0.39
281	0.34
282	0.29
283	0.27
284	0.2
285	0.18
286	0.15
287	0.13
288	0.11
289	0.09
290	0.09
291	0.09
292	0.06
293	0.07
294	0.09
295	0.09
296	0.09
297	0.09
298	0.07
299	0.08
300	0.07
301	0.06
302	0.05
303	0.08
304	0.09
305	0.1
306	0.11
307	0.11
308	0.14
309	0.14
310	0.15
311	0.12
312	0.13
313	0.11
314	0.11
315	0.1
316	0.07
317	0.07
318	0.06
319	0.05
320	0.05
321	0.08
322	0.09
323	0.1
324	0.11
325	0.13
326	0.18
327	0.2
328	0.22
329	0.25
330	0.27
331	0.28
332	0.27
333	0.27
334	0.23
335	0.2
336	0.17
337	0.11
338	0.08
339	0.06
340	0.08
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.07
345	0.09
346	0.09
347	0.09
348	0.07
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.06
353	0.04
354	0.05
355	0.05
356	0.06
357	0.06
358	0.07
359	0.07
360	0.07
361	0.07
362	0.06
363	0.09
364	0.11
365	0.13
366	0.16
367	0.17
368	0.17
369	0.17
370	0.21
371	0.23
372	0.27
373	0.3
374	0.32
375	0.35
376	0.37
377	0.37
378	0.36
379	0.32
380	0.28
381	0.27
382	0.23
383	0.2
384	0.19
385	0.18
386	0.17
387	0.15
388	0.13
389	0.09
390	0.1
391	0.09
392	0.1
393	0.1
394	0.12
395	0.15
396	0.19
397	0.24
398	0.3
399	0.35
400	0.38
401	0.4
402	0.47
403	0.56
404	0.56
405	0.54
406	0.53
407	0.48
408	0.46
409	0.46
410	0.36
411	0.3
412	0.25
413	0.24
414	0.18
415	0.17
416	0.16
417	0.16
418	0.16
419	0.11
420	0.1
421	0.1
422	0.09
423	0.09
424	0.09
425	0.07
426	0.07
427	0.08
428	0.08
429	0.09
430	0.09
431	0.09
432	0.08
433	0.07
434	0.07
435	0.07
436	0.07
437	0.06
438	0.06
439	0.06
440	0.07
441	0.07
442	0.08
443	0.09
444	0.14
445	0.22
446	0.25
447	0.29
448	0.31
449	0.32
450	0.32
451	0.39
452	0.38
453	0.4
454	0.43
455	0.44
456	0.44
457	0.45
458	0.46
459	0.41
460	0.46
461	0.43
462	0.38
463	0.42
464	0.44
465	0.45
466	0.47
467	0.45
468	0.44
469	0.44
470	0.47
471	0.45
472	0.43
473	0.44
474	0.47
475	0.48
476	0.44
477	0.43
478	0.37
479	0.32
480	0.33
481	0.32
482	0.28
483	0.26
484	0.22
485	0.18
486	0.22
487	0.25
488	0.29
489	0.33
490	0.38
491	0.48
492	0.54
493	0.61
494	0.63
495	0.66
496	0.64
497	0.65
498	0.66
499	0.6
500	0.61
501	0.57
502	0.51
503	0.46
504	0.42
505	0.34
506	0.26
507	0.22
508	0.17
509	0.16
510	0.16
511	0.17
512	0.21
513	0.26
514	0.28
515	0.3
516	0.29
517	0.35
518	0.39
519	0.41
520	0.43
521	0.45
522	0.47
523	0.52
524	0.56
525	0.49
526	0.47
527	0.45
528	0.38
529	0.35
530	0.33
531	0.34
532	0.35
533	0.36
534	0.35
535	0.36
536	0.37
537	0.38
538	0.42
539	0.4
540	0.36
541	0.39
542	0.38
543	0.36
544	0.34
545	0.29
546	0.23
547	0.22
548	0.27
549	0.28
550	0.29
551	0.36
552	0.42
553	0.51
554	0.58
555	0.62
556	0.6
557	0.6
558	0.63
559	0.65
560	0.65
561	0.57
562	0.49
563	0.42
564	0.34
565	0.28
566	0.21
567	0.13
568	0.07
569	0.07
570	0.07
571	0.07
572	0.11
573	0.12
574	0.13
575	0.13
576	0.14
577	0.14
578	0.2
579	0.23
580	0.21
581	0.24
582	0.24
583	0.23
584	0.22
585	0.22
586	0.2
587	0.21
588	0.22
589	0.21
590	0.22
591	0.23
592	0.26
593	0.26
594	0.24
595	0.23
596	0.25
597	0.25
598	0.24
599	0.27
600	0.25
601	0.25
602	0.26
603	0.25
604	0.22
605	0.27
606	0.28
607	0.25
608	0.26
609	0.29
610	0.26
611	0.25
612	0.25
613	0.19
614	0.2
615	0.19
616	0.18
617	0.19
618	0.23
619	0.24
620	0.22
621	0.2
622	0.19
623	0.2
624	0.22
625	0.23
626	0.22
627	0.27
628	0.31
629	0.37
630	0.38
631	0.46
632	0.53
633	0.56
634	0.6
635	0.61
636	0.63
637	0.63
638	0.65
639	0.64
640	0.57
641	0.53
642	0.52
643	0.45
644	0.41
645	0.35
646	0.33
647	0.29
648	0.27
649	0.23

A0A5E3XR99

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer