Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VIX8

Protein Details
Accession H1VIX8    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
354-379AFNDSKQEQKNKKFRKERKARDGFISHydrophilic
582-623REKEEEADRDRRRRRGRDSSERDPYRERPRSRGERSHRSSGRBasic
661-702LSVDRERRPSPPPRRERERERERDRDRERDRDYDRHRSRRDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
363-374KNKKFRKERKAR
584-653KEEEADRDRRRRRGRDSSERDPYRERPRSRGERSHRSSGRATRRSRSPEPDAYEADRRKAIAERERNHRK
665-691RERRPSPPPRRERERERERDRDRERDR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002713  FF_domain  
IPR036517  FF_domain_sf  
IPR039726  Prp40-like  
IPR001202  WW_dom  
IPR036020  WW_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01846  FF  
PF00397  WW  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51676  FF  
PS01159  WW_DOMAIN_1  
PS50020  WW_DOMAIN_2  
CDD cd00201  WW  
Amino Acid Sequences MNGAGSPYGQPPAWQEHRTPDGRAYYYNAATKVTQWTKPEDMMTPAERALANQPWKEYTAEGGRKYWYNTETKTSSWEMPDVYKKALGATSGPSTPADRPAPYDRGAPSDRYSNDRYDSYRDHRDTFHESRQLTFGNDTTAKAFVPASNEPEFATQEEAEAAFNKLLKRSGVQPDWTWEQALRTIAKDPQYRAIKDPKDRKAAFEKYCHDMIVQDKERAKERLTKLRTDFETMLKRHPEIKHYTRWKTARPMIEGETIFRSTDNETERRQLFEEYIIELKKAHVENQAAMRKTAMDGLIDLLPKLNLEPYTRWSDAQGLISSTAPFQNDEKYKTLSKFDILIAFQNHMKALERAFNDSKQEQKNKKFRKERKARDGFISLLAELRKDGKINASTKWRQIHPLIENDDRYKAMLGQGGSGPQELFWDLVEEEEKAMRGARNDVYDVIDDERFDITPQTTFEEFYAVMKKSRRTANIDRDILLVLFERVRVSSPHRNTQELTCALQAKEKRSLKRSDDERQSERQQRRAADDLRAYLKRMDPPITPDDTYEKVKVRLTDAPAFQAVTSEDVRIATFDRYVRRLREKEEEADRDRRRRRGRDSSERDPYRERPRSRGERSHRSSGRATRRSRSPEPDAYEADRRKAIAERERNHRKSTMAESLLSVDRERRPSPPPRRERERERERDRDRERDRDYDRHRSRRDDDSHYDRERRDXEERXAVSTP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.36
3 0.42
4 0.5
5 0.52
6 0.51
7 0.48
8 0.48
9 0.47
10 0.46
11 0.44
12 0.42
13 0.44
14 0.45
15 0.39
16 0.34
17 0.33
18 0.33
19 0.37
20 0.37
21 0.37
22 0.36
23 0.42
24 0.44
25 0.46
26 0.46
27 0.38
28 0.37
29 0.38
30 0.37
31 0.32
32 0.28
33 0.28
34 0.25
35 0.24
36 0.25
37 0.28
38 0.32
39 0.33
40 0.35
41 0.35
42 0.37
43 0.36
44 0.31
45 0.29
46 0.33
47 0.37
48 0.37
49 0.37
50 0.39
51 0.4
52 0.42
53 0.43
54 0.37
55 0.38
56 0.38
57 0.44
58 0.43
59 0.41
60 0.43
61 0.41
62 0.4
63 0.35
64 0.34
65 0.29
66 0.32
67 0.39
68 0.36
69 0.34
70 0.32
71 0.3
72 0.29
73 0.28
74 0.23
75 0.17
76 0.19
77 0.2
78 0.19
79 0.2
80 0.19
81 0.21
82 0.21
83 0.26
84 0.26
85 0.23
86 0.28
87 0.34
88 0.37
89 0.36
90 0.39
91 0.34
92 0.37
93 0.39
94 0.37
95 0.33
96 0.37
97 0.37
98 0.38
99 0.4
100 0.37
101 0.39
102 0.38
103 0.39
104 0.38
105 0.43
106 0.44
107 0.51
108 0.5
109 0.49
110 0.48
111 0.5
112 0.53
113 0.52
114 0.53
115 0.49
116 0.46
117 0.45
118 0.46
119 0.41
120 0.35
121 0.3
122 0.23
123 0.22
124 0.23
125 0.22
126 0.2
127 0.19
128 0.17
129 0.16
130 0.16
131 0.12
132 0.16
133 0.18
134 0.21
135 0.22
136 0.23
137 0.23
138 0.24
139 0.23
140 0.19
141 0.2
142 0.14
143 0.13
144 0.13
145 0.13
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.09
150 0.12
151 0.12
152 0.14
153 0.15
154 0.16
155 0.17
156 0.23
157 0.31
158 0.33
159 0.35
160 0.35
161 0.39
162 0.42
163 0.41
164 0.35
165 0.26
166 0.23
167 0.23
168 0.24
169 0.2
170 0.17
171 0.19
172 0.22
173 0.28
174 0.31
175 0.3
176 0.37
177 0.42
178 0.43
179 0.45
180 0.51
181 0.52
182 0.57
183 0.65
184 0.63
185 0.67
186 0.65
187 0.65
188 0.65
189 0.67
190 0.62
191 0.6
192 0.56
193 0.51
194 0.51
195 0.46
196 0.36
197 0.3
198 0.29
199 0.31
200 0.3
201 0.31
202 0.33
203 0.35
204 0.4
205 0.39
206 0.38
207 0.37
208 0.4
209 0.46
210 0.46
211 0.51
212 0.51
213 0.56
214 0.55
215 0.52
216 0.47
217 0.43
218 0.48
219 0.42
220 0.45
221 0.39
222 0.39
223 0.4
224 0.4
225 0.4
226 0.4
227 0.45
228 0.49
229 0.55
230 0.59
231 0.61
232 0.63
233 0.62
234 0.62
235 0.63
236 0.59
237 0.53
238 0.52
239 0.46
240 0.47
241 0.42
242 0.34
243 0.3
244 0.25
245 0.22
246 0.18
247 0.16
248 0.12
249 0.16
250 0.19
251 0.2
252 0.21
253 0.27
254 0.28
255 0.28
256 0.28
257 0.25
258 0.22
259 0.21
260 0.2
261 0.15
262 0.18
263 0.16
264 0.15
265 0.14
266 0.13
267 0.16
268 0.15
269 0.16
270 0.18
271 0.19
272 0.21
273 0.29
274 0.34
275 0.3
276 0.3
277 0.27
278 0.22
279 0.21
280 0.21
281 0.13
282 0.08
283 0.07
284 0.09
285 0.1
286 0.1
287 0.09
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.09
295 0.11
296 0.14
297 0.21
298 0.22
299 0.22
300 0.21
301 0.22
302 0.21
303 0.22
304 0.19
305 0.13
306 0.13
307 0.13
308 0.13
309 0.1
310 0.1
311 0.08
312 0.09
313 0.09
314 0.14
315 0.16
316 0.2
317 0.21
318 0.23
319 0.26
320 0.27
321 0.29
322 0.24
323 0.22
324 0.21
325 0.19
326 0.19
327 0.16
328 0.17
329 0.15
330 0.15
331 0.15
332 0.13
333 0.12
334 0.1
335 0.11
336 0.09
337 0.09
338 0.13
339 0.13
340 0.18
341 0.2
342 0.21
343 0.23
344 0.23
345 0.3
346 0.31
347 0.39
348 0.42
349 0.5
350 0.59
351 0.65
352 0.74
353 0.78
354 0.81
355 0.83
356 0.86
357 0.87
358 0.88
359 0.88
360 0.8
361 0.74
362 0.67
363 0.57
364 0.48
365 0.38
366 0.27
367 0.2
368 0.17
369 0.13
370 0.1
371 0.11
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.12
376 0.17
377 0.19
378 0.22
379 0.29
380 0.31
381 0.36
382 0.39
383 0.36
384 0.35
385 0.35
386 0.39
387 0.33
388 0.37
389 0.36
390 0.35
391 0.36
392 0.33
393 0.32
394 0.26
395 0.23
396 0.17
397 0.13
398 0.11
399 0.12
400 0.11
401 0.1
402 0.11
403 0.11
404 0.11
405 0.11
406 0.09
407 0.07
408 0.07
409 0.06
410 0.06
411 0.05
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.07
416 0.06
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.06
421 0.08
422 0.08
423 0.09
424 0.12
425 0.14
426 0.15
427 0.16
428 0.16
429 0.16
430 0.15
431 0.15
432 0.14
433 0.12
434 0.11
435 0.11
436 0.11
437 0.09
438 0.09
439 0.1
440 0.08
441 0.09
442 0.1
443 0.13
444 0.12
445 0.13
446 0.13
447 0.13
448 0.13
449 0.13
450 0.17
451 0.14
452 0.18
453 0.2
454 0.23
455 0.27
456 0.33
457 0.36
458 0.4
459 0.49
460 0.56
461 0.62
462 0.61
463 0.55
464 0.5
465 0.46
466 0.37
467 0.28
468 0.18
469 0.09
470 0.08
471 0.08
472 0.07
473 0.07
474 0.08
475 0.1
476 0.17
477 0.26
478 0.31
479 0.4
480 0.42
481 0.44
482 0.45
483 0.46
484 0.46
485 0.38
486 0.35
487 0.28
488 0.28
489 0.26
490 0.3
491 0.3
492 0.27
493 0.35
494 0.39
495 0.43
496 0.46
497 0.54
498 0.55
499 0.61
500 0.64
501 0.64
502 0.68
503 0.69
504 0.67
505 0.66
506 0.7
507 0.7
508 0.68
509 0.66
510 0.61
511 0.56
512 0.57
513 0.58
514 0.52
515 0.49
516 0.47
517 0.43
518 0.44
519 0.42
520 0.38
521 0.33
522 0.34
523 0.32
524 0.33
525 0.32
526 0.28
527 0.32
528 0.36
529 0.37
530 0.34
531 0.3
532 0.31
533 0.31
534 0.33
535 0.32
536 0.29
537 0.28
538 0.31
539 0.31
540 0.31
541 0.34
542 0.36
543 0.38
544 0.36
545 0.36
546 0.34
547 0.32
548 0.28
549 0.23
550 0.17
551 0.14
552 0.14
553 0.12
554 0.11
555 0.11
556 0.11
557 0.11
558 0.12
559 0.1
560 0.12
561 0.15
562 0.2
563 0.24
564 0.29
565 0.36
566 0.44
567 0.47
568 0.5
569 0.56
570 0.56
571 0.59
572 0.63
573 0.63
574 0.6
575 0.66
576 0.68
577 0.68
578 0.71
579 0.74
580 0.75
581 0.76
582 0.8
583 0.81
584 0.84
585 0.86
586 0.87
587 0.87
588 0.88
589 0.82
590 0.77
591 0.72
592 0.7
593 0.69
594 0.7
595 0.65
596 0.62
597 0.69
598 0.75
599 0.78
600 0.8
601 0.79
602 0.8
603 0.83
604 0.85
605 0.79
606 0.73
607 0.72
608 0.71
609 0.73
610 0.7
611 0.69
612 0.66
613 0.72
614 0.75
615 0.75
616 0.73
617 0.71
618 0.7
619 0.7
620 0.68
621 0.63
622 0.59
623 0.61
624 0.56
625 0.51
626 0.44
627 0.38
628 0.36
629 0.37
630 0.4
631 0.41
632 0.48
633 0.51
634 0.61
635 0.71
636 0.73
637 0.72
638 0.67
639 0.59
640 0.55
641 0.56
642 0.55
643 0.47
644 0.43
645 0.39
646 0.4
647 0.41
648 0.36
649 0.29
650 0.25
651 0.28
652 0.33
653 0.34
654 0.35
655 0.4
656 0.49
657 0.59
658 0.65
659 0.69
660 0.73
661 0.82
662 0.87
663 0.9
664 0.91
665 0.91
666 0.91
667 0.9
668 0.91
669 0.88
670 0.89
671 0.86
672 0.85
673 0.82
674 0.81
675 0.78
676 0.77
677 0.76
678 0.76
679 0.76
680 0.77
681 0.8
682 0.8
683 0.8
684 0.79
685 0.77
686 0.77
687 0.76
688 0.74
689 0.73
690 0.71
691 0.74
692 0.73
693 0.75
694 0.66
695 0.67
696 0.63
697 0.58
698 0.57
699 0.55
700 0.51