Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q8SWC9

Protein Details
Accession Q8SWC9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-36MGINHRGDHKRRKTGAKAVISRKKRNNRAGSQPSSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-54DHKRRKTGAKAVISRKKRNNRAGSQPSSTKIGERKVTPVRVRGGNRK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, mito_nucl 11, cyto 6, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001047  Ribosomal_S8e  
IPR022309  Ribosomal_S8e/biogenesis_NSA2  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG ecu:ECU02_0880  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01201  Ribosomal_S8e  
CDD cd11380  Ribosomal_S8e_like  
Amino Acid Sequences MGINHRGDHKRRKTGAKAVISRKKRNNRAGSQPSSTKIGERKVTPVRVRGGNRKYKALRLDMGHFKFITTGKFRMAKLLQVVYHPSSNELVRTNTLTKSSVVKISAEPFKNDIKDVARDVDPSLHESFEKGHLYAIITSRPGQVGMAQGHVLQGDELKFYADKFNKKSKEVRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.82
3 0.81
4 0.8
5 0.8
6 0.83
7 0.82
8 0.83
9 0.84
10 0.85
11 0.85
12 0.86
13 0.86
14 0.84
15 0.86
16 0.86
17 0.82
18 0.77
19 0.71
20 0.63
21 0.57
22 0.5
23 0.43
24 0.38
25 0.38
26 0.37
27 0.35
28 0.4
29 0.43
30 0.51
31 0.5
32 0.5
33 0.49
34 0.51
35 0.55
36 0.57
37 0.59
38 0.61
39 0.6
40 0.63
41 0.6
42 0.59
43 0.58
44 0.52
45 0.47
46 0.41
47 0.44
48 0.45
49 0.44
50 0.4
51 0.35
52 0.3
53 0.28
54 0.26
55 0.24
56 0.19
57 0.18
58 0.2
59 0.24
60 0.24
61 0.28
62 0.28
63 0.26
64 0.24
65 0.25
66 0.22
67 0.19
68 0.22
69 0.17
70 0.18
71 0.15
72 0.14
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.12
77 0.11
78 0.11
79 0.14
80 0.14
81 0.14
82 0.15
83 0.15
84 0.14
85 0.16
86 0.17
87 0.17
88 0.16
89 0.16
90 0.16
91 0.2
92 0.25
93 0.23
94 0.23
95 0.24
96 0.26
97 0.26
98 0.25
99 0.24
100 0.2
101 0.21
102 0.21
103 0.22
104 0.19
105 0.19
106 0.19
107 0.2
108 0.18
109 0.19
110 0.18
111 0.16
112 0.15
113 0.15
114 0.16
115 0.17
116 0.18
117 0.14
118 0.14
119 0.14
120 0.16
121 0.18
122 0.18
123 0.15
124 0.15
125 0.16
126 0.17
127 0.16
128 0.15
129 0.13
130 0.13
131 0.16
132 0.16
133 0.16
134 0.15
135 0.15
136 0.15
137 0.15
138 0.13
139 0.08
140 0.1
141 0.08
142 0.09
143 0.09
144 0.1
145 0.11
146 0.11
147 0.21
148 0.25
149 0.33
150 0.39
151 0.49
152 0.53
153 0.59