Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5E3X9V3

Protein Details
Accession A0A5E3X9V3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
542-565PEPTPARRARGRGRGRGRGRGRGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
492-524ASTRGRGRGGRRARGRGRGRGRGRGAAAAGKAA
547-570ARRARGRGRGRGRGRGRGRGRAHK
Subcellular Location(s) nucl 10.5cyto_nucl 10.5, cyto 9.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000286  His_deacetylse  
IPR003084  His_deacetylse_1  
IPR023801  His_deacetylse_dom  
IPR037138  His_deacetylse_dom_sf  
IPR023696  Ureohydrolase_dom_sf  
Gene Ontology GO:0004407  F:histone deacetylase activity  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00850  Hist_deacetyl  
Amino Acid Sequences MTRKFETYTFSNSKFFADRGPKFGVAEPITERINPHSKPIVSYYAPKGVGEHHFGERHPMKPHRMTLTNSLVIGYGLDKQIHNWYNPRPATREELETYHDPAYIDFLSKVTPNNADQMKAMIDQFNCVEDNPIFADMYDFSRMYAGGSLAGARKLCAGTTDIAINWSGGLHHAKRGEASGFCFVNDIVIAILEMLKYHPRVMYIDIDIHHGDGVEFAFYHTNRVMTVSFHKYTGDFFPGTGKLDDNGAGMGKHFALNVPLKDGIDDDMYIVLFKQVINDAVDHFKPSAIVLQCGADSLGLDRLGAFNLSIAAHGECVNHVRAFNVPLLVLGGGGYTVKNVARCWTYETSVLTGTKVPNELPMTIYDPQFAESDYKLHPKLIGTVDNSNTAGSLQRIMISIREKLRYLSHAPSVGMQELPPGLEEWLAEETKTPLEREEEEHGTARTGDSRSEDRTMANNEFFDAEMDVDQDDNVSIDGPVESKPPSKEAPVASTRGRGRGGRRARGRGRGRGRGRGAAAAGKAAKEGEVDESEESTSDSSDPEPTPARRARGRGRGRGRGRGRGRGRAHKTPEEVAEDSSDDDSNAKERSPMGAAEEEEDGPEEEGMDES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.37
3 0.36
4 0.39
5 0.39
6 0.42
7 0.47
8 0.45
9 0.44
10 0.47
11 0.46
12 0.37
13 0.37
14 0.35
15 0.32
16 0.32
17 0.31
18 0.3
19 0.28
20 0.35
21 0.32
22 0.36
23 0.4
24 0.4
25 0.42
26 0.45
27 0.45
28 0.4
29 0.46
30 0.44
31 0.44
32 0.43
33 0.4
34 0.36
35 0.34
36 0.36
37 0.35
38 0.33
39 0.31
40 0.33
41 0.33
42 0.42
43 0.41
44 0.41
45 0.44
46 0.48
47 0.51
48 0.56
49 0.63
50 0.61
51 0.62
52 0.61
53 0.61
54 0.62
55 0.56
56 0.49
57 0.42
58 0.34
59 0.29
60 0.25
61 0.17
62 0.12
63 0.12
64 0.13
65 0.13
66 0.15
67 0.24
68 0.27
69 0.3
70 0.33
71 0.37
72 0.45
73 0.49
74 0.51
75 0.46
76 0.46
77 0.5
78 0.47
79 0.47
80 0.4
81 0.38
82 0.4
83 0.38
84 0.38
85 0.32
86 0.3
87 0.24
88 0.21
89 0.22
90 0.17
91 0.16
92 0.13
93 0.13
94 0.13
95 0.14
96 0.16
97 0.15
98 0.18
99 0.18
100 0.24
101 0.25
102 0.25
103 0.24
104 0.24
105 0.22
106 0.21
107 0.21
108 0.18
109 0.17
110 0.18
111 0.18
112 0.18
113 0.16
114 0.15
115 0.17
116 0.12
117 0.14
118 0.13
119 0.14
120 0.12
121 0.11
122 0.12
123 0.1
124 0.13
125 0.14
126 0.13
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.09
133 0.07
134 0.07
135 0.09
136 0.09
137 0.11
138 0.11
139 0.1
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.13
148 0.11
149 0.12
150 0.12
151 0.11
152 0.09
153 0.07
154 0.06
155 0.07
156 0.12
157 0.12
158 0.16
159 0.17
160 0.18
161 0.18
162 0.2
163 0.21
164 0.17
165 0.19
166 0.21
167 0.19
168 0.19
169 0.19
170 0.17
171 0.14
172 0.13
173 0.1
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.03
180 0.04
181 0.05
182 0.07
183 0.08
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.13
188 0.15
189 0.17
190 0.16
191 0.18
192 0.18
193 0.2
194 0.19
195 0.17
196 0.15
197 0.11
198 0.1
199 0.08
200 0.07
201 0.05
202 0.04
203 0.05
204 0.08
205 0.08
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.13
211 0.12
212 0.11
213 0.17
214 0.21
215 0.21
216 0.21
217 0.22
218 0.2
219 0.22
220 0.22
221 0.2
222 0.14
223 0.13
224 0.16
225 0.16
226 0.18
227 0.17
228 0.14
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.09
233 0.09
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.09
243 0.12
244 0.12
245 0.14
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.14
250 0.12
251 0.09
252 0.09
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.07
265 0.08
266 0.09
267 0.11
268 0.11
269 0.12
270 0.11
271 0.1
272 0.09
273 0.09
274 0.13
275 0.11
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.11
282 0.05
283 0.04
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.04
293 0.03
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.07
304 0.09
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.09
309 0.1
310 0.11
311 0.09
312 0.08
313 0.07
314 0.08
315 0.07
316 0.06
317 0.04
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.04
324 0.05
325 0.06
326 0.06
327 0.09
328 0.1
329 0.11
330 0.16
331 0.18
332 0.18
333 0.19
334 0.2
335 0.19
336 0.2
337 0.2
338 0.15
339 0.15
340 0.14
341 0.13
342 0.13
343 0.12
344 0.14
345 0.15
346 0.14
347 0.13
348 0.14
349 0.17
350 0.18
351 0.18
352 0.15
353 0.14
354 0.15
355 0.14
356 0.13
357 0.12
358 0.1
359 0.12
360 0.13
361 0.18
362 0.17
363 0.17
364 0.18
365 0.16
366 0.2
367 0.21
368 0.23
369 0.21
370 0.25
371 0.25
372 0.26
373 0.26
374 0.21
375 0.18
376 0.14
377 0.12
378 0.09
379 0.09
380 0.07
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.12
385 0.13
386 0.18
387 0.2
388 0.22
389 0.22
390 0.23
391 0.25
392 0.26
393 0.28
394 0.27
395 0.27
396 0.27
397 0.27
398 0.27
399 0.26
400 0.22
401 0.18
402 0.14
403 0.12
404 0.1
405 0.1
406 0.08
407 0.07
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.07
412 0.1
413 0.1
414 0.09
415 0.09
416 0.1
417 0.13
418 0.15
419 0.13
420 0.12
421 0.15
422 0.17
423 0.2
424 0.25
425 0.25
426 0.26
427 0.27
428 0.26
429 0.23
430 0.22
431 0.18
432 0.17
433 0.14
434 0.14
435 0.16
436 0.19
437 0.22
438 0.25
439 0.25
440 0.22
441 0.27
442 0.3
443 0.3
444 0.29
445 0.25
446 0.23
447 0.23
448 0.21
449 0.17
450 0.12
451 0.09
452 0.08
453 0.08
454 0.07
455 0.07
456 0.06
457 0.06
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.04
463 0.05
464 0.05
465 0.06
466 0.07
467 0.08
468 0.1
469 0.14
470 0.16
471 0.19
472 0.21
473 0.23
474 0.28
475 0.29
476 0.34
477 0.34
478 0.37
479 0.35
480 0.4
481 0.4
482 0.39
483 0.39
484 0.37
485 0.39
486 0.45
487 0.52
488 0.55
489 0.61
490 0.67
491 0.71
492 0.76
493 0.78
494 0.79
495 0.79
496 0.79
497 0.78
498 0.77
499 0.75
500 0.71
501 0.65
502 0.58
503 0.5
504 0.44
505 0.37
506 0.32
507 0.28
508 0.22
509 0.21
510 0.17
511 0.16
512 0.12
513 0.12
514 0.12
515 0.12
516 0.14
517 0.14
518 0.15
519 0.15
520 0.15
521 0.14
522 0.1
523 0.1
524 0.08
525 0.09
526 0.09
527 0.13
528 0.14
529 0.17
530 0.23
531 0.24
532 0.33
533 0.37
534 0.43
535 0.45
536 0.53
537 0.59
538 0.63
539 0.71
540 0.73
541 0.77
542 0.81
543 0.81
544 0.83
545 0.81
546 0.8
547 0.78
548 0.78
549 0.76
550 0.76
551 0.78
552 0.78
553 0.79
554 0.79
555 0.8
556 0.77
557 0.75
558 0.7
559 0.65
560 0.61
561 0.54
562 0.45
563 0.39
564 0.32
565 0.29
566 0.25
567 0.21
568 0.15
569 0.14
570 0.14
571 0.15
572 0.16
573 0.14
574 0.15
575 0.16
576 0.19
577 0.21
578 0.21
579 0.21
580 0.24
581 0.25
582 0.25
583 0.26
584 0.22
585 0.2
586 0.2
587 0.17
588 0.13
589 0.13
590 0.11