Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5E3XML3

Protein Details
Accession A0A5E3XML3    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-47PSDPPRGRSRTRSRSRTPPVRSPAAHydrophilic
49-71YRSPEIRSKRPSPAPRRPPHAPTHydrophilic
255-279RYSPDYGRRRRSYSRSPPRGSSPRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-67PRGRSRTRSRSRTPPVRSPAASYRSPEIRSKRPSPAPRRPP
245-274RRSPAPSRGGRYSPDYGRRRRSYSRSPPRG
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12363  RRM_TRA2  
Amino Acid Sequences MNVDPYSDAYNDAPPAAGGADAPSDPPRGRSRTRSRSRTPPVRSPAASYRSPEIRSKRPSPAPRRPPHAPTNPNPTNVLGVFGLSIRTTERDLDDEFSRHGRVEQVTIVYDQRSDRSRGFGFIKMATVEDAERCIKELNGLDLNGRRIRVDFSVTDRPHNPTPGEYMGHRRRDDFAPRNSYYGGGGGGGRSDHGRDSYRDRDRDYGSSRYGARDRDRDPYGRDSRDTRDTRDRESFRERDNWRDRRSPAPSRGGRYSPDYGRRRRSYSRSPPRGSSPRRDYDAPADGGGSRW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.11
4 0.09
5 0.06
6 0.06
7 0.08
8 0.08
9 0.1
10 0.11
11 0.15
12 0.15
13 0.2
14 0.27
15 0.32
16 0.39
17 0.47
18 0.56
19 0.64
20 0.74
21 0.79
22 0.79
23 0.84
24 0.88
25 0.88
26 0.85
27 0.83
28 0.8
29 0.78
30 0.72
31 0.67
32 0.65
33 0.6
34 0.55
35 0.48
36 0.47
37 0.45
38 0.47
39 0.48
40 0.46
41 0.5
42 0.55
43 0.58
44 0.62
45 0.66
46 0.73
47 0.76
48 0.8
49 0.81
50 0.81
51 0.83
52 0.81
53 0.78
54 0.77
55 0.77
56 0.74
57 0.69
58 0.72
59 0.68
60 0.63
61 0.58
62 0.49
63 0.42
64 0.34
65 0.29
66 0.18
67 0.14
68 0.12
69 0.11
70 0.1
71 0.07
72 0.07
73 0.06
74 0.08
75 0.09
76 0.1
77 0.11
78 0.13
79 0.14
80 0.17
81 0.18
82 0.18
83 0.18
84 0.18
85 0.18
86 0.16
87 0.15
88 0.15
89 0.14
90 0.15
91 0.15
92 0.14
93 0.14
94 0.15
95 0.15
96 0.12
97 0.13
98 0.12
99 0.13
100 0.15
101 0.17
102 0.17
103 0.21
104 0.21
105 0.24
106 0.26
107 0.26
108 0.25
109 0.22
110 0.23
111 0.18
112 0.17
113 0.14
114 0.11
115 0.09
116 0.07
117 0.09
118 0.09
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.1
124 0.11
125 0.12
126 0.12
127 0.13
128 0.14
129 0.15
130 0.18
131 0.17
132 0.16
133 0.13
134 0.13
135 0.14
136 0.14
137 0.14
138 0.12
139 0.17
140 0.26
141 0.27
142 0.29
143 0.29
144 0.32
145 0.32
146 0.33
147 0.28
148 0.19
149 0.22
150 0.21
151 0.21
152 0.18
153 0.26
154 0.31
155 0.37
156 0.37
157 0.34
158 0.36
159 0.39
160 0.47
161 0.45
162 0.46
163 0.47
164 0.47
165 0.48
166 0.45
167 0.41
168 0.31
169 0.24
170 0.16
171 0.09
172 0.08
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.09
181 0.12
182 0.14
183 0.21
184 0.3
185 0.37
186 0.4
187 0.42
188 0.45
189 0.46
190 0.5
191 0.48
192 0.43
193 0.37
194 0.38
195 0.36
196 0.36
197 0.36
198 0.36
199 0.37
200 0.39
201 0.39
202 0.43
203 0.46
204 0.45
205 0.46
206 0.5
207 0.51
208 0.48
209 0.49
210 0.45
211 0.47
212 0.53
213 0.52
214 0.49
215 0.52
216 0.51
217 0.55
218 0.61
219 0.58
220 0.54
221 0.61
222 0.59
223 0.53
224 0.59
225 0.56
226 0.57
227 0.64
228 0.67
229 0.64
230 0.67
231 0.66
232 0.66
233 0.72
234 0.71
235 0.68
236 0.7
237 0.69
238 0.68
239 0.71
240 0.65
241 0.6
242 0.56
243 0.55
244 0.52
245 0.56
246 0.58
247 0.61
248 0.68
249 0.72
250 0.73
251 0.75
252 0.76
253 0.77
254 0.8
255 0.82
256 0.83
257 0.82
258 0.8
259 0.81
260 0.83
261 0.79
262 0.79
263 0.77
264 0.74
265 0.74
266 0.72
267 0.67
268 0.64
269 0.63
270 0.54
271 0.45
272 0.38