Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5E3W9J1

Protein Details
Accession A0A5E3W9J1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-128DGVAPRAKMNQQRSRRFRTAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
419-421KRR
Subcellular Location(s) mito 17, cyto 6, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSKKYPKIISTVAEEEEQKEEGEDGVERIIPVDMSGPNPNEMEFDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPETEGEMMLEIFSYTERVVNMVRPRKLLFMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRTAQETKEKEEARAEAEAMWEAMGKTISEGEKGKKTWDSNAITPGTPFMSFLAASLRYWVRQKMNTDPGWKNLEVIISDASVPGEGEHKIMDYIRRVRTNPGHNPNTRHVIYGLDADLIMLALATHEPHFKVLREDVFAQSGSATACRNCGEEGHFAAQCTAQPGEKKVPVKEKKPFIFLDVAILREYLEFELNVQNAPFPFNLEMAIDDWVLLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLLRIWRDELPRMGGYLTNHGELVLPRAQIILEGLARREDDIFRKRRESEERQASNAKRRKLEQKSFGADSTGPSAREMLSAGQRPPQNFAKNADAIGLGRVKDDTAMANASEAERALGGSNQDVIANRAAIRLANLSAAETLKAQMKGLMPASARPAGLPPKPQTSMVDSTPAPAPQAPIATEMPVPDVPATIAPAPPSQLDEPMEDGDELPGLGTGDPEALSMPPPPIPDAAAPTNGSETPGEGDGDSPASAGTKRTFDEAAEDLVDDAMAEDDTEASDSDAPGAKAKLALKVNPDGTVEQEDTVRLWEPGYRERYYRQKFGVERSDLETRRKITTCYIEGLCWVLRYYYQGAPSWTWFYPYHFAPFANDFEDVGKMDIQFNEGKPFKPYEQLMGVFPASSRVHIPAPFHPLMTEDDSPIKDFYPETFEIDMNGKRMAWQGVALLPFIDEKRLLDAMATRYPELSEDEVLRNGWGHNVLMASDAHPVYPALEALYGKRKSEDPVPLDPAQSQGISGTVLPEPGLIPGSTYTSPLVQEGLPDISADKALEARYMYPEQIMPHRSALLAGVKRPPRVLTSADAQRARGGGGGGPRRNDYGGMHANMVGQQFGGGGGGRFNGGGGGGYGGGGYGNGGGGGYGGGGGGYGGGGGGGYGGNGGYGGGGRGGYGGGGGGYGGGGYGGGGRGGNNSYGNGGGYSNGRGGYGGSGGSGYRGGSSGGYGGGNGGGGGRGGYNGYSGGGTGGGYHGGGYNQSGGYNRGGGGGYGSGAPRGRGRGRGY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.6
3 0.62
4 0.62
5 0.58
6 0.55
7 0.51
8 0.45
9 0.38
10 0.37
11 0.33
12 0.31
13 0.28
14 0.21
15 0.17
16 0.16
17 0.13
18 0.13
19 0.12
20 0.1
21 0.11
22 0.12
23 0.11
24 0.11
25 0.11
26 0.1
27 0.09
28 0.12
29 0.12
30 0.14
31 0.2
32 0.21
33 0.23
34 0.23
35 0.23
36 0.21
37 0.21
38 0.24
39 0.19
40 0.19
41 0.18
42 0.18
43 0.18
44 0.16
45 0.15
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.1
53 0.12
54 0.17
55 0.2
56 0.2
57 0.27
58 0.32
59 0.36
60 0.41
61 0.4
62 0.39
63 0.37
64 0.39
65 0.34
66 0.3
67 0.25
68 0.2
69 0.18
70 0.14
71 0.13
72 0.09
73 0.08
74 0.05
75 0.07
76 0.06
77 0.08
78 0.08
79 0.11
80 0.12
81 0.19
82 0.28
83 0.36
84 0.39
85 0.41
86 0.42
87 0.44
88 0.44
89 0.42
90 0.34
91 0.29
92 0.29
93 0.25
94 0.25
95 0.21
96 0.21
97 0.18
98 0.16
99 0.12
100 0.14
101 0.2
102 0.27
103 0.37
104 0.45
105 0.55
106 0.66
107 0.74
108 0.8
109 0.82
110 0.79
111 0.77
112 0.78
113 0.78
114 0.77
115 0.79
116 0.75
117 0.72
118 0.76
119 0.69
120 0.6
121 0.54
122 0.47
123 0.39
124 0.35
125 0.3
126 0.22
127 0.21
128 0.19
129 0.15
130 0.13
131 0.1
132 0.08
133 0.09
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.11
138 0.12
139 0.15
140 0.18
141 0.23
142 0.29
143 0.3
144 0.33
145 0.36
146 0.38
147 0.41
148 0.47
149 0.47
150 0.44
151 0.5
152 0.48
153 0.42
154 0.4
155 0.34
156 0.27
157 0.21
158 0.18
159 0.12
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.14
164 0.13
165 0.13
166 0.17
167 0.18
168 0.19
169 0.23
170 0.29
171 0.3
172 0.35
173 0.4
174 0.45
175 0.52
176 0.55
177 0.6
178 0.56
179 0.56
180 0.56
181 0.51
182 0.43
183 0.35
184 0.32
185 0.24
186 0.23
187 0.18
188 0.12
189 0.12
190 0.12
191 0.1
192 0.08
193 0.08
194 0.06
195 0.08
196 0.07
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.09
201 0.11
202 0.14
203 0.2
204 0.27
205 0.33
206 0.38
207 0.39
208 0.47
209 0.53
210 0.59
211 0.63
212 0.65
213 0.67
214 0.67
215 0.72
216 0.69
217 0.69
218 0.6
219 0.51
220 0.41
221 0.34
222 0.3
223 0.27
224 0.21
225 0.14
226 0.13
227 0.11
228 0.1
229 0.08
230 0.06
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.05
237 0.07
238 0.08
239 0.11
240 0.14
241 0.14
242 0.18
243 0.22
244 0.24
245 0.26
246 0.28
247 0.27
248 0.27
249 0.26
250 0.22
251 0.17
252 0.15
253 0.12
254 0.11
255 0.1
256 0.09
257 0.11
258 0.12
259 0.13
260 0.12
261 0.14
262 0.16
263 0.18
264 0.21
265 0.22
266 0.22
267 0.21
268 0.21
269 0.2
270 0.17
271 0.17
272 0.14
273 0.13
274 0.15
275 0.19
276 0.24
277 0.29
278 0.33
279 0.36
280 0.46
281 0.51
282 0.57
283 0.62
284 0.65
285 0.64
286 0.65
287 0.6
288 0.53
289 0.49
290 0.41
291 0.4
292 0.31
293 0.28
294 0.23
295 0.22
296 0.18
297 0.14
298 0.15
299 0.09
300 0.08
301 0.07
302 0.08
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.11
307 0.12
308 0.11
309 0.13
310 0.12
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.11
315 0.1
316 0.11
317 0.1
318 0.11
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.05
325 0.04
326 0.03
327 0.02
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.04
332 0.05
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.12
340 0.13
341 0.13
342 0.12
343 0.12
344 0.12
345 0.11
346 0.11
347 0.07
348 0.05
349 0.08
350 0.1
351 0.09
352 0.1
353 0.11
354 0.16
355 0.19
356 0.22
357 0.21
358 0.23
359 0.23
360 0.24
361 0.22
362 0.19
363 0.17
364 0.21
365 0.2
366 0.17
367 0.16
368 0.16
369 0.16
370 0.14
371 0.17
372 0.14
373 0.12
374 0.12
375 0.12
376 0.12
377 0.11
378 0.11
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.09
383 0.1
384 0.1
385 0.1
386 0.11
387 0.12
388 0.17
389 0.26
390 0.33
391 0.36
392 0.41
393 0.42
394 0.48
395 0.55
396 0.56
397 0.57
398 0.61
399 0.6
400 0.59
401 0.65
402 0.61
403 0.62
404 0.59
405 0.54
406 0.47
407 0.5
408 0.56
409 0.59
410 0.64
411 0.62
412 0.64
413 0.64
414 0.62
415 0.58
416 0.49
417 0.39
418 0.31
419 0.27
420 0.21
421 0.16
422 0.14
423 0.14
424 0.13
425 0.13
426 0.12
427 0.1
428 0.13
429 0.16
430 0.16
431 0.21
432 0.23
433 0.23
434 0.27
435 0.32
436 0.31
437 0.3
438 0.33
439 0.33
440 0.32
441 0.31
442 0.27
443 0.21
444 0.17
445 0.17
446 0.15
447 0.1
448 0.09
449 0.09
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.07
454 0.06
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.06
462 0.05
463 0.04
464 0.04
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.06
470 0.06
471 0.07
472 0.07
473 0.08
474 0.08
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.08
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.06
485 0.06
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.06
490 0.07
491 0.1
492 0.1
493 0.1
494 0.12
495 0.12
496 0.14
497 0.14
498 0.16
499 0.13
500 0.14
501 0.17
502 0.15
503 0.15
504 0.13
505 0.15
506 0.16
507 0.18
508 0.22
509 0.22
510 0.25
511 0.26
512 0.27
513 0.26
514 0.27
515 0.28
516 0.24
517 0.25
518 0.2
519 0.2
520 0.2
521 0.19
522 0.14
523 0.11
524 0.11
525 0.09
526 0.1
527 0.08
528 0.1
529 0.1
530 0.11
531 0.11
532 0.1
533 0.11
534 0.1
535 0.1
536 0.07
537 0.07
538 0.06
539 0.06
540 0.07
541 0.06
542 0.06
543 0.07
544 0.07
545 0.08
546 0.08
547 0.1
548 0.09
549 0.1
550 0.11
551 0.11
552 0.12
553 0.11
554 0.12
555 0.09
556 0.09
557 0.07
558 0.06
559 0.05
560 0.04
561 0.03
562 0.03
563 0.03
564 0.03
565 0.03
566 0.03
567 0.04
568 0.04
569 0.04
570 0.04
571 0.04
572 0.05
573 0.06
574 0.07
575 0.07
576 0.08
577 0.08
578 0.09
579 0.09
580 0.12
581 0.12
582 0.12
583 0.13
584 0.12
585 0.13
586 0.12
587 0.12
588 0.09
589 0.08
590 0.07
591 0.07
592 0.07
593 0.06
594 0.07
595 0.06
596 0.06
597 0.06
598 0.05
599 0.04
600 0.05
601 0.05
602 0.06
603 0.08
604 0.09
605 0.09
606 0.11
607 0.12
608 0.11
609 0.14
610 0.13
611 0.13
612 0.11
613 0.11
614 0.09
615 0.08
616 0.08
617 0.05
618 0.04
619 0.03
620 0.03
621 0.03
622 0.02
623 0.03
624 0.03
625 0.03
626 0.03
627 0.04
628 0.04
629 0.04
630 0.05
631 0.07
632 0.07
633 0.08
634 0.08
635 0.08
636 0.11
637 0.12
638 0.17
639 0.17
640 0.19
641 0.21
642 0.25
643 0.25
644 0.23
645 0.24
646 0.18
647 0.18
648 0.18
649 0.16
650 0.12
651 0.12
652 0.11
653 0.1
654 0.1
655 0.1
656 0.07
657 0.07
658 0.08
659 0.1
660 0.17
661 0.22
662 0.22
663 0.24
664 0.29
665 0.39
666 0.42
667 0.45
668 0.41
669 0.43
670 0.44
671 0.49
672 0.52
673 0.44
674 0.41
675 0.4
676 0.45
677 0.4
678 0.42
679 0.39
680 0.33
681 0.36
682 0.35
683 0.32
684 0.29
685 0.33
686 0.31
687 0.31
688 0.29
689 0.24
690 0.24
691 0.24
692 0.2
693 0.14
694 0.12
695 0.08
696 0.07
697 0.1
698 0.13
699 0.14
700 0.16
701 0.17
702 0.19
703 0.2
704 0.21
705 0.23
706 0.19
707 0.2
708 0.19
709 0.2
710 0.22
711 0.22
712 0.24
713 0.21
714 0.21
715 0.2
716 0.22
717 0.2
718 0.18
719 0.17
720 0.14
721 0.14
722 0.14
723 0.12
724 0.1
725 0.1
726 0.08
727 0.1
728 0.09
729 0.11
730 0.13
731 0.13
732 0.2
733 0.2
734 0.2
735 0.21
736 0.25
737 0.23
738 0.26
739 0.27
740 0.23
741 0.26
742 0.26
743 0.24
744 0.23
745 0.22
746 0.17
747 0.16
748 0.17
749 0.13
750 0.13
751 0.13
752 0.13
753 0.16
754 0.18
755 0.21
756 0.2
757 0.27
758 0.27
759 0.26
760 0.24
761 0.23
762 0.24
763 0.26
764 0.23
765 0.16
766 0.19
767 0.19
768 0.21
769 0.2
770 0.17
771 0.13
772 0.12
773 0.12
774 0.16
775 0.16
776 0.18
777 0.19
778 0.19
779 0.2
780 0.23
781 0.23
782 0.18
783 0.18
784 0.14
785 0.13
786 0.16
787 0.15
788 0.12
789 0.11
790 0.11
791 0.13
792 0.14
793 0.13
794 0.1
795 0.09
796 0.1
797 0.1
798 0.1
799 0.08
800 0.08
801 0.11
802 0.11
803 0.11
804 0.1
805 0.14
806 0.17
807 0.2
808 0.21
809 0.18
810 0.18
811 0.18
812 0.19
813 0.18
814 0.16
815 0.14
816 0.15
817 0.16
818 0.17
819 0.17
820 0.16
821 0.14
822 0.12
823 0.12
824 0.1
825 0.09
826 0.09
827 0.09
828 0.08
829 0.09
830 0.09
831 0.08
832 0.11
833 0.11
834 0.1
835 0.1
836 0.1
837 0.09
838 0.1
839 0.09
840 0.06
841 0.08
842 0.08
843 0.11
844 0.2
845 0.2
846 0.21
847 0.22
848 0.23
849 0.25
850 0.32
851 0.37
852 0.33
853 0.38
854 0.44
855 0.43
856 0.43
857 0.4
858 0.35
859 0.28
860 0.22
861 0.16
862 0.1
863 0.1
864 0.09
865 0.09
866 0.08
867 0.07
868 0.07
869 0.07
870 0.07
871 0.07
872 0.07
873 0.09
874 0.06
875 0.07
876 0.08
877 0.12
878 0.12
879 0.13
880 0.13
881 0.13
882 0.13
883 0.13
884 0.14
885 0.1
886 0.1
887 0.11
888 0.12
889 0.1
890 0.1
891 0.1
892 0.09
893 0.1
894 0.09
895 0.07
896 0.08
897 0.08
898 0.1
899 0.1
900 0.11
901 0.16
902 0.17
903 0.17
904 0.17
905 0.18
906 0.19
907 0.25
908 0.26
909 0.23
910 0.23
911 0.24
912 0.22
913 0.21
914 0.21
915 0.22
916 0.22
917 0.23
918 0.29
919 0.33
920 0.34
921 0.36
922 0.35
923 0.3
924 0.32
925 0.32
926 0.28
927 0.32
928 0.38
929 0.43
930 0.42
931 0.4
932 0.38
933 0.35
934 0.31
935 0.24
936 0.17
937 0.13
938 0.19
939 0.27
940 0.29
941 0.31
942 0.32
943 0.33
944 0.33
945 0.32
946 0.25
947 0.25
948 0.29
949 0.28
950 0.27
951 0.26
952 0.26
953 0.27
954 0.26
955 0.17
956 0.1
957 0.09
958 0.08
959 0.07
960 0.07
961 0.05
962 0.05
963 0.05
964 0.06
965 0.06
966 0.06
967 0.06
968 0.05
969 0.05
970 0.05
971 0.05
972 0.05
973 0.05
974 0.05
975 0.05
976 0.04
977 0.04
978 0.04
979 0.04
980 0.03
981 0.03
982 0.03
983 0.03
984 0.03
985 0.03
986 0.03
987 0.03
988 0.03
989 0.03
990 0.02
991 0.03
992 0.03
993 0.02
994 0.02
995 0.02
996 0.02
997 0.02
998 0.02
999 0.02
1000 0.02
1001 0.02
1002 0.02
1003 0.03
1004 0.03
1005 0.03
1006 0.03
1007 0.03
1008 0.03
1009 0.03
1010 0.04
1011 0.04
1012 0.04
1013 0.05
1014 0.05
1015 0.05
1016 0.05
1017 0.04
1018 0.04
1019 0.03
1020 0.03
1021 0.03
1022 0.03
1023 0.03
1024 0.03
1025 0.03
1026 0.02
1027 0.02
1028 0.02
1029 0.03
1030 0.04
1031 0.04
1032 0.05
1033 0.05
1034 0.08
1035 0.09
1036 0.12
1037 0.12
1038 0.12
1039 0.13
1040 0.14
1041 0.14
1042 0.12
1043 0.11
1044 0.11
1045 0.12
1046 0.13
1047 0.13
1048 0.13
1049 0.13
1050 0.12
1051 0.12
1052 0.12
1053 0.11
1054 0.1
1055 0.08
1056 0.08
1057 0.08
1058 0.09
1059 0.09
1060 0.08
1061 0.07
1062 0.08
1063 0.09
1064 0.08
1065 0.09
1066 0.09
1067 0.09
1068 0.09
1069 0.08
1070 0.08
1071 0.08
1072 0.07
1073 0.07
1074 0.06
1075 0.05
1076 0.05
1077 0.05
1078 0.05
1079 0.05
1080 0.06
1081 0.06
1082 0.07
1083 0.07
1084 0.08
1085 0.08
1086 0.07
1087 0.07
1088 0.07
1089 0.07
1090 0.06
1091 0.07
1092 0.07
1093 0.06
1094 0.07
1095 0.07
1096 0.08
1097 0.08
1098 0.09
1099 0.11
1100 0.11
1101 0.13
1102 0.14
1103 0.15
1104 0.17
1105 0.18
1106 0.17
1107 0.16
1108 0.16
1109 0.15
1110 0.15
1111 0.13
1112 0.12
1113 0.12
1114 0.12
1115 0.14
1116 0.14
1117 0.16
1118 0.18
1119 0.25
1120 0.29