Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1UXJ3

Protein Details
Accession H1UXJ3    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
119-141ELARTKKIWERLRRKSHVPSEERBasic
632-654HASALKKTLKKHKKALEKAATEEHydrophilic
672-691KSEKGAKKGKKGGAKSDKPVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-28KRKSAPAGKGASDGKFSKKAK
102-134IQKKLALERKAAKPLADELARTKKIWERLRRKS
637-649KKTLKKHKKALEK
662-689KEAMAQKEREKSEKGAKKGKKGGAKSDK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10.333, cyto_mito 5.333, cyto 5, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR012959  CPL_dom  
IPR033133  PUM-HD  
IPR040059  PUM3  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG chig:CH63R_11824  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08144  CPL  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50303  PUM_HD  
Amino Acid Sequences MASSNGVKRKSAPAGKGASDGKFSKKAKIDSTKKAEPVETLESDNEDDFDNESLDSDDGGVQLNPRDRAQQAQAKGKKEGANGADKNKAFERGQNSRESHAIQKKLALERKAAKPLADELARTKKIWERLRRKSHVPSEERKQLVDELFTIITGRIKEFVMKHDATRAVQTALKYATAAQRKQITRELQGTYTQLAESRYAKFLIAKMVVQADGEIKDLIIPEFYGKVRKLINHPEASWILDDIYRQIATKEQKAILLREWYGPEFALLERSKDEKPTSDLAEILEKNPSKKQPILKSLHDMINSLVQKKMTGFTMLHDAMLQYFLNIKPGTEDFNLFVEMIKDDEEGDLLKNMAFTRSGSRLVALLLANGTSKDRRNLLKAYKDNFVLMSGDAFAHIVILTAFDVIDDTKMTSKAIFPELIGDGKETATDNIVVSTTNPYARATLLYLLEGQSRALFPANMSENLAILKEVHEIRQATSKKDAEVRRKELVAVISPALIEAVVSAAPALVADPFGCQLVADVLLSAEGDKTAALEAVAAVAEGDPSAEPMEVEGITTPVHVSRTPYGGRLIKTLIAGGKFNKETGKVEPVEPPLKFADILYPVIKDYILDWATGPSSFVVLNMMEAEDFSHASALKKTLKKHKKALEKAATEETAEQKESKEAMAQKEREKSEKGAKKGKKGGAKSDKPVGNLGSKLLLEKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.55
3 0.58
4 0.54
5 0.46
6 0.44
7 0.43
8 0.41
9 0.44
10 0.44
11 0.46
12 0.5
13 0.54
14 0.58
15 0.66
16 0.69
17 0.7
18 0.78
19 0.77
20 0.74
21 0.71
22 0.63
23 0.54
24 0.52
25 0.47
26 0.41
27 0.35
28 0.31
29 0.3
30 0.3
31 0.27
32 0.22
33 0.16
34 0.15
35 0.13
36 0.13
37 0.12
38 0.1
39 0.11
40 0.11
41 0.1
42 0.1
43 0.09
44 0.09
45 0.08
46 0.1
47 0.09
48 0.1
49 0.14
50 0.19
51 0.21
52 0.22
53 0.26
54 0.26
55 0.32
56 0.38
57 0.42
58 0.44
59 0.52
60 0.57
61 0.57
62 0.59
63 0.6
64 0.56
65 0.5
66 0.5
67 0.45
68 0.48
69 0.48
70 0.5
71 0.51
72 0.47
73 0.49
74 0.44
75 0.45
76 0.36
77 0.37
78 0.42
79 0.43
80 0.47
81 0.51
82 0.51
83 0.48
84 0.51
85 0.48
86 0.48
87 0.47
88 0.48
89 0.41
90 0.43
91 0.46
92 0.52
93 0.56
94 0.48
95 0.48
96 0.51
97 0.57
98 0.61
99 0.56
100 0.48
101 0.44
102 0.45
103 0.44
104 0.37
105 0.31
106 0.29
107 0.37
108 0.39
109 0.37
110 0.36
111 0.35
112 0.43
113 0.52
114 0.56
115 0.57
116 0.66
117 0.77
118 0.79
119 0.81
120 0.82
121 0.82
122 0.82
123 0.79
124 0.76
125 0.75
126 0.78
127 0.71
128 0.61
129 0.54
130 0.48
131 0.41
132 0.34
133 0.26
134 0.2
135 0.18
136 0.18
137 0.16
138 0.12
139 0.13
140 0.12
141 0.12
142 0.11
143 0.11
144 0.16
145 0.16
146 0.2
147 0.25
148 0.26
149 0.26
150 0.3
151 0.33
152 0.29
153 0.31
154 0.28
155 0.22
156 0.24
157 0.23
158 0.21
159 0.19
160 0.18
161 0.16
162 0.17
163 0.22
164 0.27
165 0.27
166 0.29
167 0.36
168 0.38
169 0.42
170 0.46
171 0.43
172 0.42
173 0.46
174 0.43
175 0.37
176 0.38
177 0.35
178 0.29
179 0.25
180 0.2
181 0.16
182 0.14
183 0.16
184 0.16
185 0.16
186 0.17
187 0.17
188 0.18
189 0.18
190 0.18
191 0.2
192 0.19
193 0.17
194 0.16
195 0.17
196 0.17
197 0.15
198 0.14
199 0.1
200 0.09
201 0.1
202 0.09
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.08
211 0.09
212 0.13
213 0.13
214 0.17
215 0.19
216 0.23
217 0.28
218 0.36
219 0.43
220 0.42
221 0.42
222 0.43
223 0.41
224 0.39
225 0.33
226 0.23
227 0.16
228 0.13
229 0.12
230 0.09
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.14
236 0.17
237 0.21
238 0.23
239 0.22
240 0.26
241 0.28
242 0.29
243 0.27
244 0.27
245 0.24
246 0.23
247 0.24
248 0.21
249 0.19
250 0.17
251 0.14
252 0.11
253 0.1
254 0.14
255 0.13
256 0.13
257 0.14
258 0.17
259 0.18
260 0.2
261 0.22
262 0.17
263 0.21
264 0.23
265 0.24
266 0.22
267 0.22
268 0.19
269 0.23
270 0.21
271 0.18
272 0.2
273 0.18
274 0.2
275 0.24
276 0.26
277 0.25
278 0.29
279 0.36
280 0.39
281 0.48
282 0.52
283 0.5
284 0.53
285 0.53
286 0.51
287 0.44
288 0.36
289 0.27
290 0.28
291 0.26
292 0.22
293 0.19
294 0.15
295 0.15
296 0.16
297 0.16
298 0.1
299 0.11
300 0.1
301 0.1
302 0.16
303 0.16
304 0.15
305 0.14
306 0.13
307 0.11
308 0.12
309 0.11
310 0.05
311 0.07
312 0.07
313 0.1
314 0.1
315 0.1
316 0.11
317 0.11
318 0.15
319 0.13
320 0.14
321 0.12
322 0.13
323 0.13
324 0.11
325 0.11
326 0.08
327 0.07
328 0.07
329 0.06
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.1
345 0.12
346 0.13
347 0.12
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.13
352 0.09
353 0.07
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.07
359 0.07
360 0.09
361 0.11
362 0.15
363 0.17
364 0.21
365 0.27
366 0.32
367 0.39
368 0.44
369 0.45
370 0.44
371 0.42
372 0.39
373 0.33
374 0.27
375 0.18
376 0.12
377 0.09
378 0.07
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.04
395 0.04
396 0.05
397 0.06
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.08
402 0.1
403 0.12
404 0.12
405 0.1
406 0.12
407 0.13
408 0.13
409 0.12
410 0.11
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.07
423 0.09
424 0.09
425 0.1
426 0.1
427 0.11
428 0.11
429 0.12
430 0.12
431 0.1
432 0.11
433 0.11
434 0.1
435 0.1
436 0.1
437 0.11
438 0.1
439 0.09
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.07
446 0.12
447 0.14
448 0.14
449 0.15
450 0.14
451 0.14
452 0.14
453 0.14
454 0.09
455 0.07
456 0.07
457 0.09
458 0.1
459 0.11
460 0.14
461 0.15
462 0.16
463 0.25
464 0.26
465 0.25
466 0.32
467 0.32
468 0.3
469 0.37
470 0.44
471 0.45
472 0.53
473 0.56
474 0.52
475 0.52
476 0.5
477 0.45
478 0.4
479 0.32
480 0.25
481 0.19
482 0.16
483 0.15
484 0.14
485 0.11
486 0.08
487 0.05
488 0.03
489 0.03
490 0.03
491 0.03
492 0.03
493 0.03
494 0.03
495 0.03
496 0.03
497 0.03
498 0.03
499 0.03
500 0.04
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.06
507 0.06
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.04
515 0.03
516 0.04
517 0.03
518 0.04
519 0.04
520 0.04
521 0.04
522 0.04
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.04
527 0.03
528 0.03
529 0.03
530 0.03
531 0.04
532 0.03
533 0.04
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.07
539 0.06
540 0.07
541 0.06
542 0.07
543 0.07
544 0.07
545 0.07
546 0.07
547 0.09
548 0.09
549 0.13
550 0.15
551 0.21
552 0.22
553 0.23
554 0.29
555 0.32
556 0.32
557 0.31
558 0.3
559 0.27
560 0.26
561 0.26
562 0.23
563 0.2
564 0.21
565 0.2
566 0.25
567 0.24
568 0.25
569 0.25
570 0.25
571 0.26
572 0.28
573 0.34
574 0.29
575 0.3
576 0.34
577 0.39
578 0.42
579 0.39
580 0.38
581 0.31
582 0.31
583 0.29
584 0.24
585 0.23
586 0.19
587 0.23
588 0.21
589 0.2
590 0.19
591 0.19
592 0.19
593 0.13
594 0.11
595 0.16
596 0.15
597 0.15
598 0.15
599 0.16
600 0.17
601 0.17
602 0.17
603 0.09
604 0.09
605 0.09
606 0.08
607 0.09
608 0.08
609 0.08
610 0.08
611 0.08
612 0.07
613 0.07
614 0.08
615 0.07
616 0.08
617 0.07
618 0.08
619 0.09
620 0.11
621 0.14
622 0.18
623 0.26
624 0.31
625 0.39
626 0.49
627 0.58
628 0.66
629 0.73
630 0.77
631 0.8
632 0.85
633 0.88
634 0.87
635 0.8
636 0.77
637 0.73
638 0.64
639 0.55
640 0.48
641 0.42
642 0.35
643 0.32
644 0.28
645 0.23
646 0.26
647 0.25
648 0.23
649 0.24
650 0.27
651 0.34
652 0.43
653 0.48
654 0.51
655 0.58
656 0.62
657 0.61
658 0.6
659 0.57
660 0.59
661 0.62
662 0.64
663 0.65
664 0.69
665 0.73
666 0.79
667 0.8
668 0.78
669 0.76
670 0.79
671 0.79
672 0.8
673 0.77
674 0.77
675 0.73
676 0.65
677 0.63
678 0.56
679 0.5
680 0.43
681 0.38
682 0.32
683 0.29