FuNGI

H1VSB9

Protein Details

Accession

H1VSB9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-20	MSSRLPGRRRRRGLEDDDSD	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR003395 RecF/RecN/SMC_N IPR027131 SMC5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030915 C:Smc5-Smc6 complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination
Pfam	View protein in Pfam PF02463 SMC_N

Amino Acid Sequences

MSSRLPGRRRRRGLEDDDSDARSDASEGPKRPRLGRRANDSDDDQKPPRNGVHTNGVNGTTSRLDQDGFSPGAIRRVKVENFVTYEMAEFFPGPNLNMVIGPNGTGKSSLVCAICLGLGFSPKHLGRAGNVKEFVKHGKSSAVIEIELQRRPEDRSHHVIRVQIDRERNSQKWWLNGKDTTHKTIQVLMRDLKIQVDNLCQFLPQDRVVEFASATPVDLLHETLRAAAPQEMLDWQKSLQDLHKDQKELQRGSDSAGDHLKQLEERQSDMQQDVDRLREIEEAQQYIADLTDARAVADYLESKALYKEKKKLERLAQKNLQKLEQEAAPSLQAVNQKQEYHEKVVTVVRKRKDVLRRTEAAADAALNRIEDADEQIKTVEANMETNRKGFEAKKQELGKIRSKIGALENQKKNKPPEFNPQEHNTQIREKEHQLRELEAEQRQAEGKIREIKEQGHAKIQAKNTLIRELEGLDSQQGQVINFIQKKWPDVAKGYLWLQENANMFEKEVFGPPALCCSVKDDRYSDQIQALLHNDDFLCFTAQTRDDHKKLSHHLYKELSLSVNVRSILRPLDDFRPRMSRDELNALGIDAFALDMLAGPEPVLAMLCNEKKLNAAGIALNDVSDAQYERIAQGEVINSWATGRQLYRVSRRKDLGPGAVSTMTRGIQQGMFWTDQPVDEAEKNEIRRKISEVEAEWDILKAKNTEVREQMAGFTNSKKEINDDLKTLRERKNELQKAHNAYQAIPVKLGRQSAATVVAEKLIVV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.83
2	0.78
3	0.73
4	0.68
5	0.62
6	0.53
7	0.43
8	0.34
9	0.24
10	0.21
11	0.19
12	0.24
13	0.3
14	0.34
15	0.42
16	0.49
17	0.53
18	0.6
19	0.64
20	0.66
21	0.69
22	0.74
23	0.76
24	0.78
25	0.79
26	0.76
27	0.72
28	0.7
29	0.64
30	0.61
31	0.55
32	0.52
33	0.49
34	0.48
35	0.47
36	0.45
37	0.44
38	0.42
39	0.48
40	0.45
41	0.47
42	0.45
43	0.41
44	0.36
45	0.33
46	0.3
47	0.22
48	0.19
49	0.17
50	0.16
51	0.15
52	0.15
53	0.17
54	0.19
55	0.17
56	0.17
57	0.18
58	0.18
59	0.26
60	0.27
61	0.25
62	0.24
63	0.31
64	0.33
65	0.36
66	0.4
67	0.37
68	0.39
69	0.41
70	0.38
71	0.31
72	0.3
73	0.25
74	0.21
75	0.17
76	0.13
77	0.11
78	0.13
79	0.14
80	0.13
81	0.13
82	0.13
83	0.13
84	0.13
85	0.13
86	0.12
87	0.11
88	0.12
89	0.12
90	0.12
91	0.12
92	0.11
93	0.11
94	0.11
95	0.12
96	0.15
97	0.13
98	0.13
99	0.13
100	0.13
101	0.13
102	0.11
103	0.11
104	0.07
105	0.12
106	0.12
107	0.12
108	0.19
109	0.19
110	0.21
111	0.23
112	0.23
113	0.22
114	0.32
115	0.36
116	0.36
117	0.39
118	0.37
119	0.37
120	0.39
121	0.42
122	0.37
123	0.33
124	0.27
125	0.27
126	0.28
127	0.29
128	0.3
129	0.25
130	0.2
131	0.21
132	0.27
133	0.27
134	0.28
135	0.27
136	0.24
137	0.24
138	0.28
139	0.31
140	0.31
141	0.34
142	0.41
143	0.45
144	0.49
145	0.5
146	0.5
147	0.49
148	0.51
149	0.48
150	0.44
151	0.45
152	0.43
153	0.48
154	0.51
155	0.49
156	0.46
157	0.5
158	0.48
159	0.51
160	0.55
161	0.52
162	0.51
163	0.54
164	0.54
165	0.56
166	0.57
167	0.53
168	0.48
169	0.45
170	0.4
171	0.43
172	0.41
173	0.36
174	0.37
175	0.34
176	0.33
177	0.32
178	0.31
179	0.27
180	0.25
181	0.21
182	0.18
183	0.22
184	0.21
185	0.22
186	0.21
187	0.19
188	0.18
189	0.19
190	0.2
191	0.15
192	0.16
193	0.14
194	0.17
195	0.18
196	0.18
197	0.15
198	0.12
199	0.13
200	0.11
201	0.11
202	0.08
203	0.08
204	0.08
205	0.08
206	0.09
207	0.07
208	0.08
209	0.08
210	0.09
211	0.09
212	0.08
213	0.09
214	0.09
215	0.09
216	0.09
217	0.09
218	0.11
219	0.12
220	0.13
221	0.12
222	0.11
223	0.12
224	0.13
225	0.14
226	0.16
227	0.22
228	0.26
229	0.33
230	0.38
231	0.38
232	0.41
233	0.46
234	0.51
235	0.44
236	0.42
237	0.38
238	0.34
239	0.34
240	0.34
241	0.28
242	0.22
243	0.23
244	0.22
245	0.18
246	0.18
247	0.17
248	0.13
249	0.15
250	0.19
251	0.17
252	0.19
253	0.22
254	0.23
255	0.24
256	0.24
257	0.24
258	0.18
259	0.2
260	0.19
261	0.17
262	0.15
263	0.14
264	0.15
265	0.14
266	0.14
267	0.16
268	0.18
269	0.17
270	0.16
271	0.16
272	0.14
273	0.13
274	0.12
275	0.07
276	0.04
277	0.04
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.07
285	0.08
286	0.06
287	0.07
288	0.07
289	0.07
290	0.09
291	0.14
292	0.18
293	0.23
294	0.3
295	0.38
296	0.47
297	0.53
298	0.59
299	0.64
300	0.69
301	0.71
302	0.73
303	0.73
304	0.69
305	0.68
306	0.62
307	0.55
308	0.45
309	0.39
310	0.31
311	0.24
312	0.2
313	0.16
314	0.14
315	0.12
316	0.11
317	0.1
318	0.1
319	0.13
320	0.13
321	0.16
322	0.18
323	0.18
324	0.2
325	0.26
326	0.27
327	0.27
328	0.27
329	0.24
330	0.23
331	0.27
332	0.31
333	0.32
334	0.36
335	0.33
336	0.35
337	0.37
338	0.42
339	0.47
340	0.5
341	0.52
342	0.52
343	0.52
344	0.51
345	0.52
346	0.45
347	0.36
348	0.28
349	0.19
350	0.13
351	0.11
352	0.09
353	0.06
354	0.05
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.07
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.08
365	0.08
366	0.08
367	0.06
368	0.08
369	0.09
370	0.13
371	0.13
372	0.14
373	0.14
374	0.13
375	0.15
376	0.14
377	0.21
378	0.27
379	0.28
380	0.35
381	0.36
382	0.4
383	0.45
384	0.49
385	0.48
386	0.42
387	0.42
388	0.36
389	0.35
390	0.33
391	0.28
392	0.31
393	0.3
394	0.37
395	0.42
396	0.46
397	0.49
398	0.52
399	0.54
400	0.53
401	0.53
402	0.48
403	0.52
404	0.54
405	0.56
406	0.56
407	0.54
408	0.52
409	0.47
410	0.45
411	0.36
412	0.32
413	0.31
414	0.29
415	0.29
416	0.31
417	0.38
418	0.39
419	0.41
420	0.38
421	0.36
422	0.35
423	0.34
424	0.33
425	0.25
426	0.25
427	0.19
428	0.19
429	0.19
430	0.17
431	0.18
432	0.15
433	0.18
434	0.24
435	0.25
436	0.28
437	0.29
438	0.3
439	0.33
440	0.38
441	0.35
442	0.32
443	0.37
444	0.36
445	0.4
446	0.4
447	0.38
448	0.34
449	0.37
450	0.33
451	0.33
452	0.3
453	0.25
454	0.24
455	0.19
456	0.18
457	0.14
458	0.13
459	0.08
460	0.09
461	0.08
462	0.09
463	0.09
464	0.08
465	0.08
466	0.1
467	0.15
468	0.16
469	0.17
470	0.19
471	0.19
472	0.21
473	0.24
474	0.25
475	0.22
476	0.23
477	0.27
478	0.24
479	0.26
480	0.26
481	0.26
482	0.25
483	0.24
484	0.21
485	0.22
486	0.22
487	0.21
488	0.23
489	0.19
490	0.17
491	0.17
492	0.17
493	0.14
494	0.14
495	0.13
496	0.1
497	0.11
498	0.11
499	0.14
500	0.14
501	0.13
502	0.12
503	0.17
504	0.23
505	0.24
506	0.27
507	0.26
508	0.28
509	0.33
510	0.35
511	0.3
512	0.25
513	0.24
514	0.22
515	0.21
516	0.21
517	0.17
518	0.15
519	0.14
520	0.13
521	0.11
522	0.12
523	0.11
524	0.1
525	0.08
526	0.09
527	0.12
528	0.14
529	0.16
530	0.22
531	0.29
532	0.3
533	0.34
534	0.36
535	0.38
536	0.43
537	0.51
538	0.51
539	0.46
540	0.51
541	0.49
542	0.49
543	0.44
544	0.4
545	0.3
546	0.25
547	0.23
548	0.19
549	0.18
550	0.17
551	0.16
552	0.15
553	0.16
554	0.16
555	0.16
556	0.17
557	0.17
558	0.25
559	0.3
560	0.31
561	0.34
562	0.4
563	0.4
564	0.42
565	0.44
566	0.39
567	0.37
568	0.42
569	0.39
570	0.33
571	0.31
572	0.27
573	0.22
574	0.17
575	0.13
576	0.06
577	0.05
578	0.03
579	0.03
580	0.02
581	0.03
582	0.03
583	0.04
584	0.04
585	0.04
586	0.04
587	0.04
588	0.04
589	0.04
590	0.04
591	0.04
592	0.11
593	0.13
594	0.16
595	0.16
596	0.16
597	0.18
598	0.19
599	0.2
600	0.15
601	0.15
602	0.14
603	0.14
604	0.16
605	0.14
606	0.13
607	0.1
608	0.1
609	0.08
610	0.07
611	0.08
612	0.07
613	0.08
614	0.09
615	0.09
616	0.1
617	0.11
618	0.1
619	0.11
620	0.12
621	0.11
622	0.12
623	0.12
624	0.1
625	0.11
626	0.12
627	0.11
628	0.12
629	0.12
630	0.15
631	0.21
632	0.28
633	0.38
634	0.46
635	0.51
636	0.56
637	0.59
638	0.59
639	0.61
640	0.6
641	0.57
642	0.51
643	0.46
644	0.42
645	0.4
646	0.36
647	0.29
648	0.26
649	0.18
650	0.16
651	0.16
652	0.15
653	0.13
654	0.14
655	0.17
656	0.18
657	0.19
658	0.18
659	0.2
660	0.18
661	0.18
662	0.19
663	0.16
664	0.17
665	0.18
666	0.19
667	0.23
668	0.27
669	0.31
670	0.38
671	0.4
672	0.39
673	0.39
674	0.42
675	0.41
676	0.41
677	0.44
678	0.39
679	0.4
680	0.38
681	0.37
682	0.33
683	0.28
684	0.25
685	0.19
686	0.19
687	0.16
688	0.17
689	0.22
690	0.25
691	0.31
692	0.34
693	0.36
694	0.36
695	0.36
696	0.35
697	0.36
698	0.35
699	0.31
700	0.31
701	0.31
702	0.31
703	0.33
704	0.31
705	0.28
706	0.35
707	0.41
708	0.4
709	0.41
710	0.42
711	0.47
712	0.53
713	0.56
714	0.55
715	0.54
716	0.57
717	0.62
718	0.7
719	0.71
720	0.7
721	0.72
722	0.73
723	0.75
724	0.73
725	0.67
726	0.57
727	0.49
728	0.53
729	0.51
730	0.43
731	0.36
732	0.32
733	0.32
734	0.35
735	0.36
736	0.27
737	0.22
738	0.22
739	0.22
740	0.27
741	0.24
742	0.22
743	0.2
744	0.2

H1VSB9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer