Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VTM4

Protein Details
Accession H1VTM4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-58APVSSKASRRFSKKPPKRTGTQASMVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-50SRRFSKKPPKR
Subcellular Location(s) nucl 12cyto_nucl 12, cyto 10, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR040108  Laa1/Sip1/HEATR5  
Amino Acid Sequences MDSSSSQVRHAAAEALAEAMIRGYSETGVAEGAPVSSKASRRFSKKPPKRTGTQASMVADEDELPTSRPGSPAPGGKRTQDLALSLTEILKVLSTQYAKMPTSNKARAAIGVCYGKVLRKLGEKTVETNYLRILENLTIDLLGQPNIANNRYRLLISRRIVDTILQDIVGQKILGESGQTSAAKSIINDILKNYPQALTERPEPSKSTLIAALGAVASLINNLGSAANNFAESCRDGLLQVLQHPSYSVQVHASACMKAFVLACPQQLLPCLSVCMNSLSRELSLLTSGRNSPRRCVGFAHGLAATLSASPARPLHGSVDINSRVLTMATNLLKSSGQSELRVSSTQIQVAWILIGGLMSLGPNFVKIHLSQLLLLWKNALPKPLSKDNTAHRSFLEASFLTHVRECALGSILSFLQFNNRLLTVDVSKRIATMLQNTSAFLRTLPSKKITDDVAQRLTPALQLHDLDMMVQRRVLQCYIKLVNLSPAGGSEALLQSNLLTIAISLFADPENYSANSLSASIANAAATFETVWDVGDNSGFGITGLISGFKIKGLPGQQDNLIEGTPVETDTPEEAIDRLLLSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.13
3 0.12
4 0.1
5 0.09
6 0.06
7 0.06
8 0.05
9 0.05
10 0.06
11 0.06
12 0.07
13 0.07
14 0.07
15 0.08
16 0.07
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.07
22 0.1
23 0.14
24 0.19
25 0.26
26 0.35
27 0.43
28 0.5
29 0.58
30 0.67
31 0.74
32 0.79
33 0.83
34 0.85
35 0.85
36 0.84
37 0.86
38 0.85
39 0.81
40 0.78
41 0.72
42 0.63
43 0.56
44 0.5
45 0.4
46 0.3
47 0.23
48 0.17
49 0.13
50 0.11
51 0.11
52 0.12
53 0.13
54 0.14
55 0.15
56 0.14
57 0.19
58 0.23
59 0.29
60 0.35
61 0.41
62 0.42
63 0.43
64 0.47
65 0.43
66 0.41
67 0.35
68 0.3
69 0.24
70 0.22
71 0.21
72 0.17
73 0.16
74 0.13
75 0.11
76 0.1
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.11
81 0.12
82 0.13
83 0.17
84 0.23
85 0.23
86 0.27
87 0.29
88 0.32
89 0.4
90 0.45
91 0.44
92 0.41
93 0.42
94 0.41
95 0.41
96 0.35
97 0.3
98 0.27
99 0.24
100 0.23
101 0.23
102 0.21
103 0.23
104 0.23
105 0.21
106 0.26
107 0.3
108 0.34
109 0.41
110 0.4
111 0.4
112 0.43
113 0.48
114 0.41
115 0.38
116 0.34
117 0.29
118 0.28
119 0.24
120 0.21
121 0.15
122 0.15
123 0.14
124 0.13
125 0.1
126 0.09
127 0.1
128 0.09
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.1
133 0.13
134 0.15
135 0.16
136 0.16
137 0.18
138 0.19
139 0.19
140 0.21
141 0.24
142 0.31
143 0.31
144 0.36
145 0.35
146 0.36
147 0.35
148 0.32
149 0.28
150 0.21
151 0.19
152 0.14
153 0.13
154 0.12
155 0.13
156 0.11
157 0.09
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.1
172 0.13
173 0.14
174 0.16
175 0.16
176 0.17
177 0.21
178 0.22
179 0.22
180 0.19
181 0.16
182 0.16
183 0.18
184 0.19
185 0.18
186 0.23
187 0.28
188 0.29
189 0.3
190 0.31
191 0.32
192 0.33
193 0.29
194 0.25
195 0.21
196 0.19
197 0.18
198 0.15
199 0.12
200 0.08
201 0.07
202 0.05
203 0.04
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.02
208 0.02
209 0.03
210 0.03
211 0.04
212 0.04
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.1
226 0.1
227 0.12
228 0.13
229 0.12
230 0.12
231 0.13
232 0.12
233 0.13
234 0.12
235 0.11
236 0.09
237 0.12
238 0.12
239 0.13
240 0.14
241 0.12
242 0.12
243 0.11
244 0.1
245 0.09
246 0.1
247 0.08
248 0.12
249 0.13
250 0.13
251 0.14
252 0.14
253 0.13
254 0.14
255 0.14
256 0.11
257 0.09
258 0.1
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.12
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.08
275 0.1
276 0.15
277 0.22
278 0.22
279 0.23
280 0.3
281 0.31
282 0.31
283 0.32
284 0.3
285 0.3
286 0.29
287 0.29
288 0.22
289 0.2
290 0.19
291 0.17
292 0.13
293 0.06
294 0.05
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.07
301 0.08
302 0.1
303 0.14
304 0.14
305 0.15
306 0.21
307 0.2
308 0.2
309 0.19
310 0.17
311 0.13
312 0.12
313 0.11
314 0.06
315 0.09
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.11
320 0.11
321 0.11
322 0.12
323 0.12
324 0.12
325 0.13
326 0.14
327 0.15
328 0.16
329 0.17
330 0.16
331 0.16
332 0.16
333 0.16
334 0.15
335 0.14
336 0.12
337 0.12
338 0.1
339 0.06
340 0.05
341 0.04
342 0.04
343 0.03
344 0.02
345 0.02
346 0.02
347 0.02
348 0.03
349 0.03
350 0.04
351 0.04
352 0.05
353 0.07
354 0.07
355 0.11
356 0.13
357 0.14
358 0.13
359 0.15
360 0.2
361 0.19
362 0.19
363 0.17
364 0.16
365 0.21
366 0.21
367 0.23
368 0.19
369 0.22
370 0.28
371 0.36
372 0.38
373 0.36
374 0.4
375 0.44
376 0.53
377 0.51
378 0.46
379 0.36
380 0.38
381 0.36
382 0.31
383 0.27
384 0.18
385 0.17
386 0.19
387 0.19
388 0.17
389 0.15
390 0.15
391 0.12
392 0.12
393 0.11
394 0.09
395 0.1
396 0.08
397 0.08
398 0.1
399 0.09
400 0.09
401 0.09
402 0.08
403 0.12
404 0.15
405 0.16
406 0.16
407 0.16
408 0.16
409 0.17
410 0.2
411 0.18
412 0.19
413 0.21
414 0.21
415 0.21
416 0.2
417 0.2
418 0.19
419 0.17
420 0.2
421 0.21
422 0.23
423 0.24
424 0.24
425 0.25
426 0.24
427 0.22
428 0.15
429 0.15
430 0.17
431 0.21
432 0.25
433 0.28
434 0.29
435 0.3
436 0.32
437 0.33
438 0.33
439 0.37
440 0.39
441 0.39
442 0.37
443 0.36
444 0.34
445 0.31
446 0.27
447 0.21
448 0.16
449 0.14
450 0.14
451 0.15
452 0.15
453 0.15
454 0.13
455 0.17
456 0.17
457 0.15
458 0.15
459 0.17
460 0.18
461 0.21
462 0.23
463 0.22
464 0.22
465 0.29
466 0.31
467 0.29
468 0.28
469 0.26
470 0.29
471 0.27
472 0.26
473 0.18
474 0.16
475 0.16
476 0.15
477 0.14
478 0.11
479 0.11
480 0.11
481 0.11
482 0.1
483 0.08
484 0.09
485 0.09
486 0.06
487 0.05
488 0.04
489 0.05
490 0.06
491 0.06
492 0.05
493 0.05
494 0.06
495 0.07
496 0.07
497 0.08
498 0.11
499 0.11
500 0.13
501 0.13
502 0.13
503 0.12
504 0.13
505 0.12
506 0.1
507 0.1
508 0.09
509 0.09
510 0.09
511 0.09
512 0.08
513 0.07
514 0.07
515 0.06
516 0.06
517 0.07
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.08
522 0.08
523 0.08
524 0.08
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.06
529 0.06
530 0.05
531 0.06
532 0.06
533 0.06
534 0.06
535 0.08
536 0.08
537 0.09
538 0.1
539 0.09
540 0.15
541 0.2
542 0.27
543 0.3
544 0.33
545 0.36
546 0.36
547 0.37
548 0.33
549 0.28
550 0.2
551 0.16
552 0.14
553 0.11
554 0.1
555 0.09
556 0.08
557 0.1
558 0.12
559 0.13
560 0.12
561 0.12
562 0.12
563 0.12
564 0.12