Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q8SU42

Protein Details
Accession Q8SU42    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
331-350KKVQKPGKTSVRKAAKKSPVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
328-352SIAKKVQKPGKTSVRKAAKKSPVSK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14.5, nucl 13.5, cyto 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ecu:ECU11_1020  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
Amino Acid Sequences MDNYTIAICFKNNPSRIIGAFLSNEDGKVKLENAFFETNPGVVFPTISISESDIITVTKMNGRQAEKGKDASERGSGAKEDSGWSSFRTDSEISGGPKEMPEAVLPKAADLEKSLEEECKDWNQFEANSKLFNIDSRFDEEEYMEVLDKSSESYKSKVSMARRIEKEIMLSATTDAHRLEERGLGNSVENEDIYSSVVREECRSAESKSASAMEVRQEKVAAAKQPADDGTKRKMVIEIEGLSLLENRKDEAVSKAVSSKSEGPSSGQEEGKNGKPKKSVRYGWMHTKFDSSKNLLEMIKSKFKSVFDIGGGELKWGTGPNWEAAAKSIAKKVQKPGKTSVRKAAKKSPVSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.42
3 0.42
4 0.42
5 0.36
6 0.29
7 0.28
8 0.26
9 0.26
10 0.22
11 0.22
12 0.18
13 0.18
14 0.15
15 0.16
16 0.16
17 0.17
18 0.19
19 0.2
20 0.24
21 0.27
22 0.25
23 0.27
24 0.26
25 0.21
26 0.2
27 0.18
28 0.14
29 0.11
30 0.11
31 0.08
32 0.1
33 0.1
34 0.11
35 0.11
36 0.12
37 0.13
38 0.13
39 0.13
40 0.1
41 0.1
42 0.09
43 0.1
44 0.09
45 0.12
46 0.14
47 0.18
48 0.24
49 0.27
50 0.33
51 0.4
52 0.45
53 0.45
54 0.46
55 0.44
56 0.42
57 0.41
58 0.36
59 0.32
60 0.27
61 0.25
62 0.24
63 0.23
64 0.2
65 0.19
66 0.17
67 0.15
68 0.15
69 0.16
70 0.15
71 0.15
72 0.16
73 0.16
74 0.15
75 0.18
76 0.16
77 0.15
78 0.18
79 0.21
80 0.2
81 0.2
82 0.21
83 0.17
84 0.17
85 0.17
86 0.13
87 0.1
88 0.1
89 0.11
90 0.11
91 0.14
92 0.14
93 0.13
94 0.15
95 0.15
96 0.14
97 0.13
98 0.15
99 0.12
100 0.14
101 0.15
102 0.14
103 0.14
104 0.15
105 0.16
106 0.18
107 0.18
108 0.17
109 0.17
110 0.18
111 0.19
112 0.23
113 0.26
114 0.21
115 0.21
116 0.21
117 0.21
118 0.19
119 0.2
120 0.18
121 0.14
122 0.15
123 0.19
124 0.21
125 0.2
126 0.2
127 0.18
128 0.16
129 0.14
130 0.13
131 0.08
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.08
138 0.1
139 0.12
140 0.13
141 0.15
142 0.17
143 0.19
144 0.23
145 0.25
146 0.3
147 0.35
148 0.42
149 0.42
150 0.44
151 0.43
152 0.39
153 0.36
154 0.29
155 0.23
156 0.15
157 0.13
158 0.1
159 0.1
160 0.09
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.09
167 0.11
168 0.11
169 0.12
170 0.13
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.08
176 0.08
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.11
190 0.13
191 0.14
192 0.17
193 0.18
194 0.17
195 0.17
196 0.18
197 0.16
198 0.15
199 0.15
200 0.15
201 0.18
202 0.19
203 0.18
204 0.17
205 0.17
206 0.19
207 0.22
208 0.2
209 0.17
210 0.19
211 0.19
212 0.2
213 0.22
214 0.22
215 0.22
216 0.22
217 0.25
218 0.26
219 0.26
220 0.26
221 0.27
222 0.24
223 0.24
224 0.24
225 0.21
226 0.17
227 0.17
228 0.17
229 0.14
230 0.15
231 0.13
232 0.1
233 0.09
234 0.09
235 0.1
236 0.1
237 0.11
238 0.13
239 0.16
240 0.15
241 0.16
242 0.19
243 0.19
244 0.2
245 0.22
246 0.25
247 0.25
248 0.26
249 0.26
250 0.24
251 0.27
252 0.31
253 0.31
254 0.28
255 0.25
256 0.26
257 0.3
258 0.35
259 0.4
260 0.39
261 0.4
262 0.46
263 0.52
264 0.58
265 0.63
266 0.62
267 0.6
268 0.67
269 0.69
270 0.72
271 0.74
272 0.68
273 0.59
274 0.6
275 0.55
276 0.5
277 0.51
278 0.44
279 0.38
280 0.36
281 0.39
282 0.33
283 0.32
284 0.33
285 0.33
286 0.38
287 0.35
288 0.37
289 0.36
290 0.37
291 0.4
292 0.38
293 0.35
294 0.27
295 0.29
296 0.27
297 0.27
298 0.26
299 0.21
300 0.17
301 0.13
302 0.12
303 0.11
304 0.11
305 0.12
306 0.14
307 0.15
308 0.18
309 0.19
310 0.18
311 0.19
312 0.24
313 0.22
314 0.24
315 0.28
316 0.3
317 0.37
318 0.42
319 0.5
320 0.55
321 0.59
322 0.61
323 0.66
324 0.71
325 0.74
326 0.75
327 0.76
328 0.77
329 0.78
330 0.8
331 0.8
332 0.8