Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VMP6

Protein Details
Accession H1VMP6    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
346-366DEEARARRERHKRMLQSVDRDBasic
402-430EGDGQGGKSKRKRGAKKRKGDANNAADVLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
112-116VKKKG
124-130APGKKRS
408-421GKSKRKRGAKKRKG
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039896  Red-like  
IPR012916  RED_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF07808  RED_N  
Amino Acid Sequences SQYRARERTDEEEEDDREKRIKALEEALKNEEIDQATFEKLSSEIAGGDLSSTHLIKGLDFKLLERVRKGEDVYGDSKNDPDEEEVPPEEEVDEAFDQLADTEVQAVEKEKVKKKGQFAPVALAPGKKRSRDQILAEMKAAREAAKAEQEAALGNKFKKIGAKQQPGTRIERDSKGREILIIVDEDGHEKRKVRKVQPGAVQEQRNEFIPDKDAKPLGMEVPEFYKKQQEELEEDENDDIFADAGDDYDPLAGMDDSTDEDSDGEVKDKKEEVKDERSADTIAMPPPPRPVQARNYFKDAKTDLISSQALKGPSMSDPAIQAAFKRAAQLNAANKDRQEDEDDEDDEEARARRERHKRMLQSVDRDAEDLDMGFGTSRFEDEADFDEAPVKLSQWGNDDEDEGDGQGGKSKRKRGAKKRKGDANNAADVLRVMEQRKAASK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.46
3 0.4
4 0.36
5 0.33
6 0.31
7 0.3
8 0.32
9 0.31
10 0.39
11 0.45
12 0.48
13 0.51
14 0.53
15 0.49
16 0.44
17 0.4
18 0.35
19 0.28
20 0.22
21 0.2
22 0.18
23 0.17
24 0.17
25 0.16
26 0.13
27 0.12
28 0.13
29 0.11
30 0.1
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.08
35 0.08
36 0.07
37 0.07
38 0.09
39 0.09
40 0.08
41 0.11
42 0.11
43 0.12
44 0.18
45 0.18
46 0.21
47 0.21
48 0.21
49 0.29
50 0.33
51 0.37
52 0.33
53 0.35
54 0.35
55 0.38
56 0.39
57 0.33
58 0.32
59 0.33
60 0.34
61 0.34
62 0.32
63 0.3
64 0.29
65 0.26
66 0.23
67 0.19
68 0.18
69 0.17
70 0.17
71 0.21
72 0.2
73 0.21
74 0.2
75 0.19
76 0.15
77 0.13
78 0.1
79 0.11
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.09
87 0.05
88 0.05
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.09
94 0.11
95 0.17
96 0.25
97 0.31
98 0.4
99 0.47
100 0.53
101 0.59
102 0.65
103 0.68
104 0.67
105 0.62
106 0.58
107 0.52
108 0.5
109 0.44
110 0.38
111 0.3
112 0.32
113 0.35
114 0.32
115 0.34
116 0.37
117 0.45
118 0.48
119 0.51
120 0.52
121 0.54
122 0.53
123 0.51
124 0.46
125 0.37
126 0.32
127 0.28
128 0.18
129 0.12
130 0.12
131 0.13
132 0.15
133 0.15
134 0.15
135 0.15
136 0.15
137 0.14
138 0.14
139 0.14
140 0.13
141 0.13
142 0.15
143 0.15
144 0.15
145 0.2
146 0.22
147 0.31
148 0.38
149 0.47
150 0.5
151 0.54
152 0.61
153 0.59
154 0.6
155 0.53
156 0.47
157 0.42
158 0.43
159 0.44
160 0.4
161 0.4
162 0.37
163 0.34
164 0.29
165 0.25
166 0.21
167 0.16
168 0.12
169 0.09
170 0.07
171 0.07
172 0.09
173 0.09
174 0.11
175 0.11
176 0.14
177 0.21
178 0.29
179 0.37
180 0.41
181 0.5
182 0.55
183 0.61
184 0.65
185 0.64
186 0.61
187 0.59
188 0.55
189 0.47
190 0.42
191 0.36
192 0.29
193 0.26
194 0.22
195 0.16
196 0.17
197 0.19
198 0.18
199 0.2
200 0.19
201 0.16
202 0.16
203 0.16
204 0.13
205 0.11
206 0.1
207 0.08
208 0.12
209 0.14
210 0.14
211 0.14
212 0.19
213 0.17
214 0.2
215 0.22
216 0.2
217 0.21
218 0.26
219 0.29
220 0.23
221 0.24
222 0.21
223 0.19
224 0.16
225 0.13
226 0.08
227 0.04
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.03
238 0.04
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.08
252 0.1
253 0.1
254 0.12
255 0.14
256 0.17
257 0.2
258 0.26
259 0.3
260 0.35
261 0.4
262 0.41
263 0.4
264 0.38
265 0.35
266 0.29
267 0.24
268 0.19
269 0.15
270 0.17
271 0.16
272 0.16
273 0.2
274 0.22
275 0.23
276 0.25
277 0.29
278 0.34
279 0.44
280 0.52
281 0.5
282 0.56
283 0.58
284 0.54
285 0.55
286 0.47
287 0.4
288 0.34
289 0.32
290 0.25
291 0.25
292 0.25
293 0.19
294 0.2
295 0.2
296 0.18
297 0.16
298 0.16
299 0.14
300 0.14
301 0.16
302 0.14
303 0.12
304 0.12
305 0.14
306 0.14
307 0.13
308 0.13
309 0.13
310 0.15
311 0.14
312 0.18
313 0.18
314 0.18
315 0.21
316 0.27
317 0.3
318 0.36
319 0.39
320 0.36
321 0.35
322 0.37
323 0.35
324 0.32
325 0.29
326 0.24
327 0.26
328 0.28
329 0.29
330 0.27
331 0.25
332 0.23
333 0.18
334 0.18
335 0.14
336 0.13
337 0.17
338 0.19
339 0.29
340 0.39
341 0.49
342 0.57
343 0.66
344 0.72
345 0.77
346 0.84
347 0.82
348 0.79
349 0.77
350 0.7
351 0.6
352 0.53
353 0.43
354 0.33
355 0.26
356 0.18
357 0.12
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.08
367 0.09
368 0.1
369 0.14
370 0.16
371 0.16
372 0.16
373 0.18
374 0.18
375 0.2
376 0.18
377 0.15
378 0.16
379 0.17
380 0.2
381 0.21
382 0.25
383 0.25
384 0.26
385 0.26
386 0.22
387 0.22
388 0.2
389 0.16
390 0.12
391 0.1
392 0.09
393 0.15
394 0.18
395 0.25
396 0.32
397 0.4
398 0.48
399 0.58
400 0.7
401 0.75
402 0.83
403 0.85
404 0.89
405 0.91
406 0.93
407 0.91
408 0.9
409 0.89
410 0.85
411 0.81
412 0.71
413 0.6
414 0.5
415 0.41
416 0.33
417 0.26
418 0.23
419 0.18
420 0.21
421 0.23