Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q8SRQ3

Protein Details
Accession Q8SRQ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-35SNAKGTRNYHKNFQVKRRRRREGKTDYKHRTNMIHydrophilic
244-265AEDPTRKKKETKDYSGFKKYKQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-25KRRRRREGK
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 10, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005485  Rbsml_L5_euk/L18_arc  
IPR025607  Rbsml_L5e_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0008097  F:5S rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF14204  Ribosomal_L18_c  
PF17144  Ribosomal_L5e  
CDD cd00432  Ribosomal_L18_L5e  
Amino Acid Sequences MSNAKGTRNYHKNFQVKRRRRREGKTDYKHRTNMIRQDSNSCGSVKHRLVVRITGSRVICQIVAAYMDGDRVMVYADSRELERYGINFGATNYSAAYATGFLIGRRALTAMSLDEVYRPKEIDGTYSVTKDIDGEKKAPRVFLDIGLARSTRGARVFGALKGASDAGLNVPHSAAKFYGHKPDGSFDAKELHDRIFGYNISEYMKQLRDGDPEKYKTQFSSYIKKGIDPEEIPRIYKSAFDKIAEDPTRKKKETKDYSGFKKYKQARLTYEERAKRVQAKLSAAEGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.8
3 0.81
4 0.88
5 0.9
6 0.91
7 0.91
8 0.92
9 0.92
10 0.92
11 0.93
12 0.93
13 0.93
14 0.91
15 0.9
16 0.85
17 0.79
18 0.77
19 0.75
20 0.74
21 0.72
22 0.7
23 0.63
24 0.64
25 0.63
26 0.56
27 0.49
28 0.4
29 0.31
30 0.27
31 0.34
32 0.3
33 0.31
34 0.32
35 0.34
36 0.36
37 0.4
38 0.42
39 0.39
40 0.39
41 0.4
42 0.37
43 0.34
44 0.32
45 0.28
46 0.23
47 0.17
48 0.15
49 0.09
50 0.09
51 0.08
52 0.07
53 0.06
54 0.07
55 0.06
56 0.06
57 0.05
58 0.04
59 0.05
60 0.04
61 0.05
62 0.05
63 0.06
64 0.07
65 0.08
66 0.09
67 0.09
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.12
72 0.12
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.13
77 0.12
78 0.12
79 0.09
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.07
88 0.06
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.08
94 0.05
95 0.06
96 0.07
97 0.05
98 0.06
99 0.07
100 0.06
101 0.08
102 0.1
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.1
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.14
111 0.17
112 0.17
113 0.17
114 0.18
115 0.15
116 0.14
117 0.13
118 0.14
119 0.14
120 0.14
121 0.17
122 0.19
123 0.24
124 0.25
125 0.25
126 0.22
127 0.22
128 0.21
129 0.19
130 0.2
131 0.16
132 0.16
133 0.16
134 0.16
135 0.12
136 0.12
137 0.11
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.12
143 0.13
144 0.12
145 0.15
146 0.13
147 0.12
148 0.11
149 0.11
150 0.08
151 0.07
152 0.07
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.07
162 0.08
163 0.12
164 0.14
165 0.23
166 0.23
167 0.24
168 0.24
169 0.26
170 0.28
171 0.27
172 0.26
173 0.18
174 0.21
175 0.2
176 0.22
177 0.22
178 0.18
179 0.17
180 0.17
181 0.17
182 0.16
183 0.15
184 0.15
185 0.14
186 0.14
187 0.15
188 0.15
189 0.14
190 0.17
191 0.18
192 0.17
193 0.19
194 0.2
195 0.24
196 0.26
197 0.32
198 0.35
199 0.38
200 0.4
201 0.4
202 0.39
203 0.34
204 0.35
205 0.37
206 0.35
207 0.4
208 0.41
209 0.46
210 0.45
211 0.46
212 0.45
213 0.4
214 0.41
215 0.33
216 0.34
217 0.36
218 0.36
219 0.35
220 0.33
221 0.31
222 0.25
223 0.28
224 0.28
225 0.27
226 0.29
227 0.29
228 0.3
229 0.31
230 0.41
231 0.4
232 0.41
233 0.41
234 0.49
235 0.57
236 0.57
237 0.61
238 0.6
239 0.67
240 0.73
241 0.75
242 0.75
243 0.75
244 0.82
245 0.87
246 0.81
247 0.73
248 0.72
249 0.71
250 0.7
251 0.68
252 0.67
253 0.63
254 0.67
255 0.7
256 0.71
257 0.72
258 0.7
259 0.66
260 0.63
261 0.61
262 0.62
263 0.6
264 0.58
265 0.54
266 0.53
267 0.53