Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VP85

Protein Details
Accession H1VP85    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
430-458PAKKAPAKKAPAKKAPARGRKKPVFEEESBasic
471-495EPPAPTRARRSQPARAPPKSRQTKLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
417-452ARKAAATRVTKAAPAKKAPAKKAPAKKAPARGRKKP
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11.333, cyto 8, cyto_mito 7.333, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029052  Metallo-depent_PP-like  
IPR003701  Mre11  
IPR038487  Mre11_capping_dom  
IPR007281  Mre11_DNA-bd  
Gene Ontology GO:0030870  C:Mre11 complex  
GO:0008296  F:3'-5'-DNA exonuclease activity  
GO:0004520  F:DNA endonuclease activity  
GO:0030145  F:manganese ion binding  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF04152  Mre11_DNA_bind  
Amino Acid Sequences MNFTKLALFGLSNVRDERMFRTFRDHKVKWVRPGVQQSDWFNLLTVHQNHHANTATSYLPENVLPDWMDLVVWGHEHECLIDPQQNPETGFHVMQPGSSVATSLVPGEAVPKHVAILNVTGKDFKVEKLPLKTVRPFITKELQLATDPRFKGLHAKKDNRQELTKRLMVVVEEMIQEANEEWYAVQDNDEEEPPLPLIRLKVEYTAPEGGQYDCENPQRFSNRFIGKVANTNDVVYFHRKKAGATRRNADTDVPEMLEETLGLDTVKVEALVQEFLMAQSLKILPTAPFGDAVNQFVNKDDKHAMEEFVSESLAGQVKQMLSLDSDEEDLDNAMEAYRAKLEEQFSKGALKRSTKRTVKPKPDEWDSDLDGHWEDQPGVVETETVSQAPARSRRAQTREEDDLMEMEDEPAVGPAPARKAAATRVTKAAPAKKAPAKKAPAKKAPARGRKKPVFEEESEEEDVVMDNDFEEPPAPTRARRSQPARAPPKSRQTKLNFSQATTSQAAVEISDDEISDEDAFEPPPPTTRSRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.27
4 0.3
5 0.3
6 0.31
7 0.3
8 0.39
9 0.44
10 0.53
11 0.62
12 0.58
13 0.6
14 0.68
15 0.75
16 0.74
17 0.77
18 0.73
19 0.71
20 0.8
21 0.76
22 0.71
23 0.7
24 0.64
25 0.59
26 0.55
27 0.46
28 0.36
29 0.3
30 0.26
31 0.28
32 0.27
33 0.25
34 0.3
35 0.33
36 0.33
37 0.37
38 0.38
39 0.3
40 0.28
41 0.27
42 0.22
43 0.19
44 0.21
45 0.17
46 0.16
47 0.15
48 0.16
49 0.13
50 0.15
51 0.14
52 0.12
53 0.12
54 0.11
55 0.1
56 0.09
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.07
62 0.08
63 0.08
64 0.09
65 0.1
66 0.11
67 0.13
68 0.19
69 0.19
70 0.24
71 0.27
72 0.29
73 0.28
74 0.28
75 0.28
76 0.25
77 0.25
78 0.21
79 0.22
80 0.19
81 0.18
82 0.18
83 0.16
84 0.14
85 0.13
86 0.12
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.09
95 0.09
96 0.11
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.14
101 0.15
102 0.13
103 0.18
104 0.19
105 0.2
106 0.2
107 0.21
108 0.19
109 0.22
110 0.22
111 0.17
112 0.2
113 0.23
114 0.29
115 0.34
116 0.41
117 0.44
118 0.5
119 0.54
120 0.52
121 0.53
122 0.51
123 0.48
124 0.46
125 0.48
126 0.43
127 0.4
128 0.36
129 0.31
130 0.28
131 0.29
132 0.28
133 0.27
134 0.26
135 0.26
136 0.24
137 0.23
138 0.32
139 0.37
140 0.43
141 0.46
142 0.54
143 0.59
144 0.69
145 0.76
146 0.7
147 0.7
148 0.64
149 0.61
150 0.6
151 0.55
152 0.46
153 0.39
154 0.35
155 0.28
156 0.25
157 0.19
158 0.13
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.07
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.05
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.12
187 0.12
188 0.14
189 0.15
190 0.16
191 0.18
192 0.19
193 0.17
194 0.15
195 0.15
196 0.13
197 0.14
198 0.14
199 0.12
200 0.13
201 0.19
202 0.2
203 0.2
204 0.24
205 0.29
206 0.3
207 0.32
208 0.37
209 0.35
210 0.34
211 0.35
212 0.34
213 0.28
214 0.34
215 0.32
216 0.27
217 0.24
218 0.23
219 0.22
220 0.2
221 0.21
222 0.21
223 0.22
224 0.19
225 0.24
226 0.24
227 0.24
228 0.33
229 0.41
230 0.42
231 0.45
232 0.49
233 0.48
234 0.5
235 0.5
236 0.41
237 0.32
238 0.26
239 0.21
240 0.16
241 0.12
242 0.1
243 0.09
244 0.08
245 0.06
246 0.05
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.03
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.03
255 0.03
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.05
265 0.04
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.06
272 0.08
273 0.1
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.12
278 0.12
279 0.14
280 0.13
281 0.12
282 0.12
283 0.13
284 0.16
285 0.12
286 0.15
287 0.15
288 0.14
289 0.17
290 0.18
291 0.17
292 0.15
293 0.16
294 0.13
295 0.11
296 0.1
297 0.07
298 0.06
299 0.07
300 0.08
301 0.07
302 0.06
303 0.08
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.08
311 0.07
312 0.08
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.05
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.11
328 0.13
329 0.17
330 0.2
331 0.21
332 0.21
333 0.26
334 0.28
335 0.3
336 0.33
337 0.36
338 0.4
339 0.47
340 0.56
341 0.58
342 0.64
343 0.69
344 0.75
345 0.78
346 0.8
347 0.8
348 0.77
349 0.76
350 0.73
351 0.66
352 0.6
353 0.51
354 0.45
355 0.37
356 0.3
357 0.24
358 0.2
359 0.17
360 0.12
361 0.1
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.09
367 0.08
368 0.08
369 0.1
370 0.1
371 0.09
372 0.08
373 0.08
374 0.1
375 0.16
376 0.21
377 0.25
378 0.31
379 0.37
380 0.46
381 0.52
382 0.56
383 0.56
384 0.58
385 0.59
386 0.54
387 0.49
388 0.4
389 0.35
390 0.3
391 0.24
392 0.16
393 0.1
394 0.08
395 0.07
396 0.06
397 0.06
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.07
402 0.11
403 0.12
404 0.13
405 0.13
406 0.15
407 0.21
408 0.3
409 0.32
410 0.32
411 0.35
412 0.35
413 0.39
414 0.44
415 0.45
416 0.42
417 0.42
418 0.48
419 0.51
420 0.58
421 0.61
422 0.64
423 0.65
424 0.69
425 0.75
426 0.76
427 0.78
428 0.79
429 0.8
430 0.81
431 0.83
432 0.84
433 0.83
434 0.83
435 0.85
436 0.84
437 0.84
438 0.81
439 0.8
440 0.76
441 0.69
442 0.67
443 0.6
444 0.57
445 0.51
446 0.43
447 0.33
448 0.27
449 0.24
450 0.17
451 0.12
452 0.07
453 0.05
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.08
458 0.09
459 0.11
460 0.17
461 0.19
462 0.21
463 0.3
464 0.39
465 0.46
466 0.54
467 0.59
468 0.63
469 0.71
470 0.79
471 0.81
472 0.81
473 0.81
474 0.8
475 0.83
476 0.84
477 0.78
478 0.78
479 0.75
480 0.77
481 0.76
482 0.78
483 0.7
484 0.61
485 0.62
486 0.54
487 0.52
488 0.43
489 0.37
490 0.26
491 0.25
492 0.23
493 0.17
494 0.16
495 0.11
496 0.1
497 0.1
498 0.09
499 0.09
500 0.09
501 0.1
502 0.1
503 0.09
504 0.09
505 0.1
506 0.11
507 0.12
508 0.13
509 0.13
510 0.18
511 0.21
512 0.27