Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5E3WJ11

Protein Details
Accession A0A5E3WJ11    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
893-917RFEPLSPSYRPKRRKLNPPVPVKVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
904-906KRR
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 8, cyto_mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR016059  DNA_ligase_ATP-dep_CS  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00697  DNA_LIGASE_A1  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
Amino Acid Sequences MSTAKPTTSKTSNGVPFSHFVSLIRAISEITPVRVGDKKRQSLVDGTQTPRARKVFGTWLKEIRAKYSPLPPGTTAAILRLLFPEVDVDRKYSMQEKRLGEQLAQALGISTQKGHCGSVLRSWNEWDTRGCLGHVVQGLFESRANENPEEHVSSLSVIDVDRLLSDLARYSPWSSNDVRHSRNSNEPAKSKIRDVLSRLYSDLPPFDAAVLTQIILKDLRPILYPLPATGTTASLLSYNTNAVYMLSLQDALRDWTPHNKEWCWAWWQYHILSDLTAIGQFIEQNAVGTTAMPRVGTRVLIPKCAKGRGCKSSLGMFKTASVVWAETKYDGERAQIHVWVDDKGKLRIKIFSKQGRDSSLDRHAVHATIREALGYCPNTKLPLKPKVKKEAILEAEMVAFNDQQGRIDEFWHIRSLVENTAYGIRHKPRKTLEARAAETGPVNTSMDSNAPDDGRRHLALVFFDILLLDSEPLHHHPYHIRRAHLEQTINVKHGWSMLAARQRIQIRGPDGIPRISEARAQLRRIFAEHVADYEEGVVLKDEKSQYRETKRPWVKLKKDYIPGYGDCLDMVIVGAGWNKERGRELRVAPSTFTTFYLGALTNADELAHNPRARPSFAVYFTVSYGPARSALEDINVTLQQADHVKYTEAQKRPAVLPYSFTLATGLDSPDVMLTTPRLAEIFGAGFSKAPGSKVYELRWPRLTKMYREAERDWREGMPLSEIQRIAHEVVGRPSDEDNYRFLWEHEFKRPSEQSSDVPLEVAGLRTPAKRARIMKECLTRLEKDDGVFVPQDQYQHQDQTQTQHQATAHPSSLQDCGIVCASSKSGERSEAATPLPLLHRLVSSTNVSRVPDSPPRAHAPPPTPPSVPRKRRAVQKDDENADIKDHTPASPRRFEPLSPSYRPKRRKLNPPVPVKVEVDEPGLFFPPLSSPPATEPQPEVKTSQDHSHRLLLSRPLCPEPTVIMSKDEATPRTPGSSSTSRTISYGRRAQSAIYLEKLRAAKAGLPQTLGSTRAVTTASSSTLAPPPPTTSLPTLPDSSPPPSRPISQQYPLYPQSLPAPPPLDDPSPALLAARTQLSKYWIYLDLYSDAQRVNSWQSVLHVCGWTAQKPPTLAPSSAGKRGGIIILDLEDRDPDWSAIAAQVMDAVQACYNHGHARFDVRVLDIGVLGNGAVESTGGDMSSWIRHLLTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.45
3 0.43
4 0.42
5 0.4
6 0.31
7 0.24
8 0.25
9 0.27
10 0.24
11 0.22
12 0.19
13 0.17
14 0.18
15 0.23
16 0.2
17 0.18
18 0.19
19 0.19
20 0.23
21 0.28
22 0.32
23 0.36
24 0.45
25 0.5
26 0.54
27 0.57
28 0.56
29 0.58
30 0.6
31 0.6
32 0.57
33 0.53
34 0.56
35 0.58
36 0.57
37 0.57
38 0.52
39 0.44
40 0.39
41 0.42
42 0.44
43 0.48
44 0.52
45 0.51
46 0.55
47 0.58
48 0.61
49 0.56
50 0.51
51 0.47
52 0.44
53 0.43
54 0.47
55 0.5
56 0.48
57 0.51
58 0.47
59 0.44
60 0.43
61 0.4
62 0.31
63 0.25
64 0.26
65 0.22
66 0.21
67 0.19
68 0.18
69 0.15
70 0.15
71 0.17
72 0.14
73 0.19
74 0.19
75 0.2
76 0.21
77 0.22
78 0.25
79 0.28
80 0.34
81 0.36
82 0.43
83 0.45
84 0.46
85 0.52
86 0.51
87 0.43
88 0.41
89 0.37
90 0.3
91 0.26
92 0.22
93 0.16
94 0.15
95 0.16
96 0.11
97 0.1
98 0.1
99 0.14
100 0.15
101 0.15
102 0.16
103 0.2
104 0.22
105 0.28
106 0.36
107 0.36
108 0.36
109 0.39
110 0.43
111 0.4
112 0.4
113 0.34
114 0.3
115 0.3
116 0.29
117 0.26
118 0.23
119 0.21
120 0.23
121 0.24
122 0.21
123 0.17
124 0.17
125 0.19
126 0.18
127 0.19
128 0.16
129 0.15
130 0.19
131 0.24
132 0.24
133 0.24
134 0.26
135 0.28
136 0.29
137 0.28
138 0.23
139 0.19
140 0.19
141 0.18
142 0.14
143 0.11
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.09
154 0.09
155 0.11
156 0.13
157 0.16
158 0.21
159 0.23
160 0.27
161 0.28
162 0.33
163 0.42
164 0.47
165 0.47
166 0.49
167 0.52
168 0.53
169 0.59
170 0.61
171 0.59
172 0.59
173 0.58
174 0.58
175 0.61
176 0.59
177 0.53
178 0.51
179 0.49
180 0.47
181 0.48
182 0.5
183 0.46
184 0.45
185 0.43
186 0.4
187 0.37
188 0.33
189 0.29
190 0.22
191 0.19
192 0.17
193 0.16
194 0.13
195 0.11
196 0.11
197 0.1
198 0.08
199 0.09
200 0.08
201 0.09
202 0.1
203 0.1
204 0.13
205 0.14
206 0.15
207 0.15
208 0.18
209 0.18
210 0.22
211 0.23
212 0.18
213 0.21
214 0.2
215 0.21
216 0.19
217 0.18
218 0.14
219 0.14
220 0.13
221 0.09
222 0.1
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.08
227 0.09
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.11
239 0.12
240 0.13
241 0.14
242 0.23
243 0.29
244 0.33
245 0.38
246 0.37
247 0.38
248 0.39
249 0.42
250 0.37
251 0.35
252 0.32
253 0.31
254 0.34
255 0.32
256 0.32
257 0.3
258 0.25
259 0.21
260 0.19
261 0.14
262 0.12
263 0.11
264 0.08
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.08
280 0.08
281 0.1
282 0.11
283 0.11
284 0.12
285 0.2
286 0.21
287 0.29
288 0.31
289 0.34
290 0.38
291 0.43
292 0.45
293 0.44
294 0.52
295 0.51
296 0.53
297 0.5
298 0.48
299 0.5
300 0.52
301 0.46
302 0.4
303 0.33
304 0.3
305 0.29
306 0.26
307 0.19
308 0.14
309 0.12
310 0.11
311 0.12
312 0.12
313 0.11
314 0.13
315 0.13
316 0.14
317 0.14
318 0.15
319 0.16
320 0.19
321 0.2
322 0.21
323 0.21
324 0.2
325 0.2
326 0.2
327 0.19
328 0.2
329 0.21
330 0.24
331 0.3
332 0.31
333 0.32
334 0.37
335 0.4
336 0.42
337 0.49
338 0.52
339 0.53
340 0.55
341 0.57
342 0.53
343 0.53
344 0.48
345 0.44
346 0.43
347 0.42
348 0.37
349 0.36
350 0.33
351 0.3
352 0.29
353 0.26
354 0.2
355 0.16
356 0.15
357 0.13
358 0.13
359 0.13
360 0.17
361 0.16
362 0.16
363 0.16
364 0.17
365 0.2
366 0.21
367 0.27
368 0.29
369 0.38
370 0.47
371 0.53
372 0.6
373 0.67
374 0.7
375 0.69
376 0.65
377 0.64
378 0.57
379 0.51
380 0.43
381 0.33
382 0.29
383 0.24
384 0.2
385 0.11
386 0.08
387 0.06
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.1
392 0.13
393 0.12
394 0.13
395 0.17
396 0.16
397 0.18
398 0.18
399 0.16
400 0.14
401 0.15
402 0.16
403 0.15
404 0.14
405 0.13
406 0.13
407 0.16
408 0.16
409 0.16
410 0.19
411 0.23
412 0.31
413 0.33
414 0.38
415 0.39
416 0.48
417 0.52
418 0.56
419 0.58
420 0.58
421 0.58
422 0.55
423 0.51
424 0.42
425 0.37
426 0.28
427 0.2
428 0.13
429 0.11
430 0.09
431 0.08
432 0.08
433 0.09
434 0.1
435 0.1
436 0.1
437 0.1
438 0.11
439 0.12
440 0.14
441 0.16
442 0.15
443 0.15
444 0.15
445 0.16
446 0.15
447 0.16
448 0.14
449 0.1
450 0.1
451 0.09
452 0.08
453 0.07
454 0.07
455 0.05
456 0.04
457 0.05
458 0.06
459 0.09
460 0.12
461 0.11
462 0.12
463 0.19
464 0.26
465 0.35
466 0.37
467 0.37
468 0.37
469 0.41
470 0.45
471 0.44
472 0.38
473 0.31
474 0.36
475 0.36
476 0.34
477 0.3
478 0.24
479 0.19
480 0.19
481 0.16
482 0.08
483 0.08
484 0.11
485 0.17
486 0.17
487 0.18
488 0.23
489 0.24
490 0.25
491 0.25
492 0.25
493 0.21
494 0.24
495 0.23
496 0.23
497 0.23
498 0.22
499 0.21
500 0.19
501 0.18
502 0.16
503 0.17
504 0.15
505 0.22
506 0.25
507 0.27
508 0.28
509 0.28
510 0.28
511 0.28
512 0.27
513 0.2
514 0.19
515 0.17
516 0.14
517 0.14
518 0.14
519 0.12
520 0.1
521 0.09
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.04
526 0.05
527 0.08
528 0.1
529 0.11
530 0.15
531 0.2
532 0.27
533 0.34
534 0.4
535 0.41
536 0.5
537 0.54
538 0.59
539 0.64
540 0.67
541 0.68
542 0.71
543 0.75
544 0.71
545 0.72
546 0.66
547 0.59
548 0.52
549 0.45
550 0.4
551 0.32
552 0.25
553 0.17
554 0.15
555 0.12
556 0.08
557 0.07
558 0.03
559 0.02
560 0.03
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.07
565 0.07
566 0.08
567 0.11
568 0.13
569 0.16
570 0.21
571 0.22
572 0.28
573 0.31
574 0.31
575 0.29
576 0.29
577 0.26
578 0.22
579 0.21
580 0.15
581 0.11
582 0.11
583 0.12
584 0.1
585 0.09
586 0.08
587 0.08
588 0.06
589 0.06
590 0.06
591 0.04
592 0.05
593 0.1
594 0.14
595 0.14
596 0.14
597 0.18
598 0.19
599 0.2
600 0.21
601 0.2
602 0.2
603 0.21
604 0.23
605 0.2
606 0.19
607 0.19
608 0.19
609 0.15
610 0.11
611 0.1
612 0.07
613 0.08
614 0.08
615 0.07
616 0.08
617 0.08
618 0.08
619 0.08
620 0.08
621 0.08
622 0.08
623 0.07
624 0.06
625 0.06
626 0.06
627 0.08
628 0.09
629 0.08
630 0.09
631 0.09
632 0.11
633 0.18
634 0.24
635 0.25
636 0.27
637 0.28
638 0.3
639 0.31
640 0.33
641 0.3
642 0.23
643 0.22
644 0.2
645 0.22
646 0.19
647 0.18
648 0.15
649 0.11
650 0.12
651 0.1
652 0.09
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.05
657 0.05
658 0.05
659 0.04
660 0.04
661 0.05
662 0.05
663 0.05
664 0.05
665 0.05
666 0.05
667 0.05
668 0.05
669 0.05
670 0.06
671 0.06
672 0.06
673 0.06
674 0.07
675 0.07
676 0.07
677 0.08
678 0.12
679 0.16
680 0.19
681 0.21
682 0.28
683 0.3
684 0.33
685 0.39
686 0.36
687 0.34
688 0.4
689 0.42
690 0.38
691 0.44
692 0.48
693 0.46
694 0.49
695 0.51
696 0.52
697 0.53
698 0.51
699 0.44
700 0.36
701 0.32
702 0.28
703 0.25
704 0.18
705 0.16
706 0.17
707 0.18
708 0.18
709 0.17
710 0.17
711 0.18
712 0.16
713 0.14
714 0.13
715 0.11
716 0.14
717 0.15
718 0.14
719 0.14
720 0.14
721 0.15
722 0.16
723 0.16
724 0.16
725 0.16
726 0.18
727 0.17
728 0.17
729 0.21
730 0.24
731 0.27
732 0.34
733 0.35
734 0.34
735 0.41
736 0.43
737 0.38
738 0.37
739 0.36
740 0.29
741 0.32
742 0.34
743 0.26
744 0.24
745 0.21
746 0.18
747 0.15
748 0.13
749 0.07
750 0.07
751 0.08
752 0.09
753 0.12
754 0.15
755 0.18
756 0.24
757 0.29
758 0.36
759 0.42
760 0.47
761 0.52
762 0.56
763 0.54
764 0.53
765 0.52
766 0.46
767 0.41
768 0.41
769 0.34
770 0.27
771 0.27
772 0.22
773 0.21
774 0.19
775 0.16
776 0.14
777 0.13
778 0.14
779 0.12
780 0.16
781 0.16
782 0.19
783 0.19
784 0.21
785 0.22
786 0.26
787 0.32
788 0.33
789 0.31
790 0.31
791 0.31
792 0.3
793 0.32
794 0.3
795 0.24
796 0.2
797 0.21
798 0.19
799 0.2
800 0.16
801 0.14
802 0.1
803 0.11
804 0.1
805 0.1
806 0.08
807 0.08
808 0.09
809 0.1
810 0.11
811 0.12
812 0.13
813 0.15
814 0.16
815 0.18
816 0.19
817 0.19
818 0.18
819 0.16
820 0.15
821 0.15
822 0.15
823 0.14
824 0.13
825 0.12
826 0.12
827 0.12
828 0.13
829 0.15
830 0.17
831 0.17
832 0.2
833 0.21
834 0.22
835 0.22
836 0.22
837 0.25
838 0.29
839 0.33
840 0.32
841 0.34
842 0.39
843 0.4
844 0.42
845 0.43
846 0.4
847 0.43
848 0.45
849 0.45
850 0.41
851 0.44
852 0.5
853 0.55
854 0.59
855 0.57
856 0.62
857 0.64
858 0.73
859 0.78
860 0.77
861 0.74
862 0.75
863 0.77
864 0.7
865 0.68
866 0.6
867 0.51
868 0.43
869 0.36
870 0.26
871 0.2
872 0.18
873 0.16
874 0.21
875 0.27
876 0.32
877 0.39
878 0.39
879 0.41
880 0.42
881 0.42
882 0.42
883 0.44
884 0.46
885 0.44
886 0.52
887 0.56
888 0.64
889 0.71
890 0.71
891 0.74
892 0.75
893 0.81
894 0.84
895 0.85
896 0.84
897 0.86
898 0.85
899 0.78
900 0.73
901 0.63
902 0.53
903 0.45
904 0.37
905 0.31
906 0.24
907 0.2
908 0.17
909 0.17
910 0.15
911 0.12
912 0.11
913 0.1
914 0.11
915 0.14
916 0.14
917 0.14
918 0.18
919 0.24
920 0.25
921 0.25
922 0.27
923 0.32
924 0.34
925 0.34
926 0.32
927 0.29
928 0.32
929 0.33
930 0.37
931 0.37
932 0.38
933 0.4
934 0.45
935 0.44
936 0.41
937 0.42
938 0.42
939 0.38
940 0.38
941 0.39
942 0.36
943 0.35
944 0.34
945 0.31
946 0.26
947 0.27
948 0.27
949 0.24
950 0.23
951 0.23
952 0.24
953 0.26
954 0.27
955 0.23
956 0.22
957 0.24
958 0.23
959 0.25
960 0.24
961 0.21
962 0.25
963 0.3
964 0.32
965 0.33
966 0.34
967 0.32
968 0.33
969 0.36
970 0.34
971 0.36
972 0.4
973 0.37
974 0.39
975 0.39
976 0.38
977 0.39
978 0.39
979 0.33
980 0.31
981 0.3
982 0.27
983 0.32
984 0.32
985 0.27
986 0.23
987 0.21
988 0.2
989 0.25
990 0.33
991 0.28
992 0.29
993 0.28
994 0.3
995 0.31
996 0.28
997 0.22
998 0.17
999 0.16
1000 0.15
1001 0.16
1002 0.13
1003 0.14
1004 0.14
1005 0.14
1006 0.14
1007 0.14
1008 0.15
1009 0.19
1010 0.21
1011 0.2
1012 0.2
1013 0.22
1014 0.25
1015 0.27
1016 0.28
1017 0.28
1018 0.31
1019 0.33
1020 0.34
1021 0.34
1022 0.31
1023 0.33
1024 0.33
1025 0.34
1026 0.36
1027 0.34
1028 0.36
1029 0.36
1030 0.39
1031 0.42
1032 0.47
1033 0.49
1034 0.49
1035 0.54
1036 0.53
1037 0.58
1038 0.57
1039 0.52
1040 0.44
1041 0.37
1042 0.36
1043 0.35
1044 0.33
1045 0.3
1046 0.31
1047 0.29
1048 0.33
1049 0.36
1050 0.32
1051 0.28
1052 0.3
1053 0.27
1054 0.25
1055 0.24
1056 0.2
1057 0.16
1058 0.14
1059 0.15
1060 0.17
1061 0.15
1062 0.15
1063 0.17
1064 0.21
1065 0.22
1066 0.22
1067 0.24
1068 0.23
1069 0.25
1070 0.25
1071 0.26
1072 0.24
1073 0.25
1074 0.25
1075 0.23
1076 0.2
1077 0.18
1078 0.17
1079 0.17
1080 0.2
1081 0.2
1082 0.19
1083 0.19
1084 0.22
1085 0.25
1086 0.27
1087 0.27
1088 0.23
1089 0.2
1090 0.25
1091 0.28
1092 0.27
1093 0.28
1094 0.3
1095 0.3
1096 0.31
1097 0.33
1098 0.36
1099 0.37
1100 0.35
1101 0.33
1102 0.39
1103 0.4
1104 0.44
1105 0.44
1106 0.36
1107 0.32
1108 0.33
1109 0.31
1110 0.22
1111 0.18
1112 0.13
1113 0.13
1114 0.14
1115 0.13
1116 0.12
1117 0.11
1118 0.11
1119 0.12
1120 0.12
1121 0.11
1122 0.11
1123 0.11
1124 0.11
1125 0.11
1126 0.12
1127 0.1
1128 0.08
1129 0.09
1130 0.08
1131 0.09
1132 0.09
1133 0.09
1134 0.09
1135 0.1
1136 0.11
1137 0.11
1138 0.14
1139 0.19
1140 0.21
1141 0.23
1142 0.23
1143 0.31
1144 0.31
1145 0.32
1146 0.32
1147 0.28
1148 0.28
1149 0.25
1150 0.24
1151 0.17
1152 0.16
1153 0.13
1154 0.11
1155 0.09
1156 0.07
1157 0.05
1158 0.05
1159 0.04
1160 0.03
1161 0.04
1162 0.05
1163 0.05
1164 0.05
1165 0.05
1166 0.06
1167 0.08
1168 0.11
1169 0.12
1170 0.12