Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VSD9

Protein Details
Accession H1VSD9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
328-376LEEEEKKRLRKEKEEEEKGKKAEEKKRKAEEKKTAKKGESKGKDNKEGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-78KK
332-396EKKRLRKEKEEEEKGKKAEEKKRKAEEKKTAKKGESKGKDNKEGDENKKDESESKDESKGDKEKK
Subcellular Location(s) mito 20, cyto_mito 12.833, cyto 3.5, cyto_nucl 2.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021836  DUF3429  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG chig:CH63R_12312  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11911  DUF3429  
Amino Acid Sequences MLRSSRQLMRLAPRLPAVPAAPKTTSFSTKTPYAALQSPKRTSLAIQGRLTPMALQARYTNSPYDKIDKKAEKEIAKKKLEPRPEEVSAESSTRKFWEPAPANPQNDENLSGGLKKEVNIVRDTFNLSEVPREPYALGLAGTLPYLATSLSTVYLTWDLNVEWPSSSTFANNVFMNHESAQYWLNLLEPIQLGYGAIIISFLGAVHWGMEYAEKTPHPRRTPFRYGMGVLAPMIAWPSLLMPIEYALTSQFAAFTFLYLADVRAKNKGWTPQWYGVYRFVLTAIVGVSIFVSLVGRTKVGNAQPHIGQGLAESMHKGKSDESRDWGKLEEEEKKRLRKEKEEEEKGKKAEEKKRKAEEKKTAKKGESKGKDNKEGDENKKDESESKDESKGDKEKKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.4
3 0.37
4 0.31
5 0.31
6 0.32
7 0.34
8 0.33
9 0.33
10 0.37
11 0.38
12 0.41
13 0.37
14 0.37
15 0.38
16 0.39
17 0.39
18 0.37
19 0.35
20 0.34
21 0.36
22 0.42
23 0.45
24 0.5
25 0.52
26 0.52
27 0.5
28 0.46
29 0.41
30 0.43
31 0.44
32 0.43
33 0.42
34 0.43
35 0.44
36 0.44
37 0.43
38 0.33
39 0.28
40 0.26
41 0.24
42 0.21
43 0.22
44 0.26
45 0.29
46 0.31
47 0.32
48 0.28
49 0.32
50 0.34
51 0.39
52 0.39
53 0.41
54 0.49
55 0.51
56 0.53
57 0.58
58 0.62
59 0.61
60 0.66
61 0.7
62 0.7
63 0.69
64 0.71
65 0.71
66 0.71
67 0.73
68 0.68
69 0.65
70 0.63
71 0.61
72 0.57
73 0.49
74 0.45
75 0.37
76 0.35
77 0.3
78 0.23
79 0.21
80 0.21
81 0.22
82 0.19
83 0.2
84 0.28
85 0.3
86 0.36
87 0.45
88 0.49
89 0.49
90 0.49
91 0.48
92 0.39
93 0.36
94 0.32
95 0.23
96 0.17
97 0.15
98 0.15
99 0.14
100 0.14
101 0.13
102 0.11
103 0.18
104 0.2
105 0.22
106 0.23
107 0.25
108 0.24
109 0.25
110 0.27
111 0.2
112 0.19
113 0.18
114 0.15
115 0.17
116 0.17
117 0.2
118 0.17
119 0.18
120 0.17
121 0.15
122 0.16
123 0.13
124 0.11
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.09
147 0.1
148 0.09
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.1
154 0.08
155 0.09
156 0.1
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.13
162 0.15
163 0.14
164 0.13
165 0.11
166 0.12
167 0.12
168 0.1
169 0.09
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.02
186 0.02
187 0.02
188 0.02
189 0.02
190 0.02
191 0.02
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.04
197 0.05
198 0.06
199 0.08
200 0.08
201 0.14
202 0.21
203 0.29
204 0.32
205 0.39
206 0.45
207 0.52
208 0.6
209 0.59
210 0.57
211 0.52
212 0.48
213 0.43
214 0.36
215 0.28
216 0.19
217 0.15
218 0.1
219 0.07
220 0.06
221 0.04
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.05
237 0.06
238 0.05
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.12
248 0.15
249 0.15
250 0.19
251 0.2
252 0.2
253 0.24
254 0.31
255 0.3
256 0.35
257 0.41
258 0.44
259 0.49
260 0.49
261 0.48
262 0.45
263 0.43
264 0.36
265 0.29
266 0.23
267 0.18
268 0.15
269 0.12
270 0.08
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.06
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.09
285 0.14
286 0.19
287 0.25
288 0.25
289 0.28
290 0.28
291 0.3
292 0.28
293 0.23
294 0.18
295 0.12
296 0.12
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.1
301 0.12
302 0.13
303 0.13
304 0.15
305 0.23
306 0.29
307 0.31
308 0.36
309 0.41
310 0.42
311 0.43
312 0.41
313 0.34
314 0.32
315 0.33
316 0.37
317 0.35
318 0.43
319 0.49
320 0.55
321 0.61
322 0.66
323 0.69
324 0.69
325 0.74
326 0.76
327 0.8
328 0.83
329 0.84
330 0.84
331 0.84
332 0.75
333 0.71
334 0.67
335 0.65
336 0.65
337 0.67
338 0.69
339 0.71
340 0.8
341 0.85
342 0.88
343 0.89
344 0.9
345 0.9
346 0.91
347 0.91
348 0.89
349 0.85
350 0.84
351 0.82
352 0.82
353 0.8
354 0.79
355 0.79
356 0.8
357 0.83
358 0.77
359 0.73
360 0.72
361 0.72
362 0.7
363 0.7
364 0.63
365 0.57
366 0.57
367 0.53
368 0.49
369 0.46
370 0.45
371 0.42
372 0.45
373 0.47
374 0.47
375 0.49
376 0.52
377 0.54