Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VHD9

Protein Details
Accession H1VHD9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
284-303YRPEHHTRKRSRNTHTRQAYBasic
455-474VPPHVRKAQKLKKPTPEWDDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039970  TF_Grauzone  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
KEGG chig:CH63R_09003  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13894  zf-C2H2_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MAYFYEHVQGGHLPDEQLYYGHQSFSQMPMSYLESSSSSDSSTPVDPSFASYPPEPQYQTPWPVNQTHQIQQYMEGPRTAFFVPEYAQVFHDIARPAQESTTLPPASQRRHGSPCSQQTLSSSDSNSPPTESDVLPATPPDCSATSPFMQHKQYTGDWETQQYRSHTLLGLGKQGTVFVNPHEVNISQAIFEEEAMPAPFDHSRTFSFCCSDSDESSIPQQSAFSSREMTPEALESIVKKELPTAESSYQQSYPDPELSEQDSLESTTKIEPLISFDDKKDSDYRPEHHTRKRSRNTHTRQAYSPGSTQERKRPRVNSDTSGLPPSRLNAPIHSTRNPKIVCTECKTPFSDESTYQKHMKQHHTRPFACIFNYAGCPSTFASKNEWKRHVSSQHLALQYWLCVQDGCSKTTNPPINRHSSSSSSCSVSPTPPALPNGAIFNRKDLYTQHVRRMHVPPHVRKAQKLKKPTPEWDDHLKDLQAEAEQTRCDLPQYMRCPAGDCGHEFNGPQAWDERMEHVARHLERAADGKEPTVHFGGETDLTLTQWASSPGVYVVRQTDTPGNWELINPLKGEIGPSSGNGKGGNSGGKALSSLKEIVVAACSDEDAEGEEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.18
3 0.16
4 0.15
5 0.14
6 0.19
7 0.18
8 0.18
9 0.18
10 0.2
11 0.22
12 0.25
13 0.29
14 0.22
15 0.22
16 0.24
17 0.27
18 0.26
19 0.24
20 0.22
21 0.18
22 0.2
23 0.22
24 0.2
25 0.17
26 0.16
27 0.16
28 0.18
29 0.18
30 0.19
31 0.16
32 0.17
33 0.16
34 0.21
35 0.22
36 0.21
37 0.23
38 0.21
39 0.26
40 0.29
41 0.34
42 0.32
43 0.3
44 0.36
45 0.39
46 0.46
47 0.45
48 0.46
49 0.45
50 0.47
51 0.49
52 0.5
53 0.49
54 0.48
55 0.49
56 0.48
57 0.43
58 0.42
59 0.45
60 0.42
61 0.38
62 0.33
63 0.27
64 0.25
65 0.27
66 0.25
67 0.18
68 0.13
69 0.14
70 0.14
71 0.18
72 0.21
73 0.19
74 0.2
75 0.21
76 0.21
77 0.2
78 0.23
79 0.19
80 0.17
81 0.2
82 0.21
83 0.19
84 0.19
85 0.2
86 0.17
87 0.2
88 0.27
89 0.24
90 0.22
91 0.28
92 0.35
93 0.38
94 0.44
95 0.46
96 0.45
97 0.52
98 0.56
99 0.56
100 0.59
101 0.62
102 0.61
103 0.56
104 0.5
105 0.45
106 0.45
107 0.42
108 0.35
109 0.27
110 0.25
111 0.26
112 0.28
113 0.27
114 0.24
115 0.21
116 0.22
117 0.23
118 0.19
119 0.19
120 0.18
121 0.18
122 0.17
123 0.17
124 0.14
125 0.11
126 0.12
127 0.13
128 0.11
129 0.12
130 0.14
131 0.18
132 0.19
133 0.23
134 0.27
135 0.3
136 0.33
137 0.33
138 0.32
139 0.33
140 0.32
141 0.34
142 0.33
143 0.32
144 0.3
145 0.35
146 0.36
147 0.34
148 0.37
149 0.33
150 0.33
151 0.3
152 0.29
153 0.24
154 0.24
155 0.26
156 0.23
157 0.26
158 0.23
159 0.22
160 0.2
161 0.21
162 0.18
163 0.15
164 0.14
165 0.09
166 0.17
167 0.16
168 0.17
169 0.17
170 0.17
171 0.16
172 0.18
173 0.17
174 0.09
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.08
180 0.06
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.06
185 0.08
186 0.09
187 0.1
188 0.11
189 0.13
190 0.14
191 0.18
192 0.2
193 0.2
194 0.21
195 0.2
196 0.21
197 0.24
198 0.25
199 0.22
200 0.24
201 0.23
202 0.22
203 0.24
204 0.23
205 0.17
206 0.15
207 0.14
208 0.11
209 0.14
210 0.15
211 0.13
212 0.15
213 0.15
214 0.17
215 0.18
216 0.18
217 0.14
218 0.14
219 0.13
220 0.11
221 0.1
222 0.09
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.11
228 0.13
229 0.14
230 0.16
231 0.18
232 0.18
233 0.22
234 0.23
235 0.24
236 0.23
237 0.22
238 0.2
239 0.18
240 0.19
241 0.17
242 0.16
243 0.14
244 0.16
245 0.17
246 0.17
247 0.14
248 0.12
249 0.11
250 0.11
251 0.11
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.09
260 0.14
261 0.16
262 0.16
263 0.16
264 0.2
265 0.2
266 0.22
267 0.23
268 0.2
269 0.25
270 0.28
271 0.31
272 0.34
273 0.43
274 0.48
275 0.52
276 0.6
277 0.62
278 0.69
279 0.76
280 0.76
281 0.76
282 0.79
283 0.79
284 0.8
285 0.78
286 0.7
287 0.62
288 0.59
289 0.53
290 0.44
291 0.38
292 0.32
293 0.3
294 0.3
295 0.31
296 0.35
297 0.42
298 0.45
299 0.5
300 0.51
301 0.53
302 0.58
303 0.6
304 0.54
305 0.48
306 0.45
307 0.4
308 0.38
309 0.32
310 0.24
311 0.19
312 0.17
313 0.17
314 0.18
315 0.17
316 0.15
317 0.2
318 0.25
319 0.29
320 0.32
321 0.34
322 0.33
323 0.4
324 0.39
325 0.35
326 0.34
327 0.35
328 0.36
329 0.36
330 0.42
331 0.37
332 0.4
333 0.41
334 0.39
335 0.35
336 0.34
337 0.31
338 0.26
339 0.3
340 0.31
341 0.33
342 0.33
343 0.35
344 0.35
345 0.4
346 0.47
347 0.51
348 0.57
349 0.62
350 0.69
351 0.67
352 0.66
353 0.63
354 0.55
355 0.46
356 0.38
357 0.29
358 0.22
359 0.23
360 0.19
361 0.16
362 0.13
363 0.14
364 0.13
365 0.17
366 0.17
367 0.17
368 0.23
369 0.3
370 0.39
371 0.46
372 0.5
373 0.48
374 0.5
375 0.56
376 0.56
377 0.54
378 0.49
379 0.47
380 0.49
381 0.47
382 0.43
383 0.37
384 0.31
385 0.25
386 0.22
387 0.16
388 0.1
389 0.08
390 0.1
391 0.17
392 0.18
393 0.21
394 0.21
395 0.21
396 0.23
397 0.32
398 0.39
399 0.34
400 0.4
401 0.43
402 0.5
403 0.51
404 0.53
405 0.48
406 0.45
407 0.44
408 0.41
409 0.38
410 0.32
411 0.3
412 0.29
413 0.27
414 0.23
415 0.23
416 0.21
417 0.21
418 0.22
419 0.23
420 0.21
421 0.2
422 0.19
423 0.22
424 0.23
425 0.24
426 0.21
427 0.23
428 0.23
429 0.23
430 0.23
431 0.19
432 0.24
433 0.31
434 0.35
435 0.41
436 0.45
437 0.47
438 0.52
439 0.57
440 0.55
441 0.53
442 0.58
443 0.56
444 0.6
445 0.67
446 0.63
447 0.63
448 0.69
449 0.7
450 0.69
451 0.72
452 0.71
453 0.73
454 0.78
455 0.8
456 0.77
457 0.74
458 0.71
459 0.7
460 0.66
461 0.58
462 0.54
463 0.46
464 0.38
465 0.32
466 0.27
467 0.18
468 0.16
469 0.14
470 0.13
471 0.13
472 0.13
473 0.14
474 0.13
475 0.13
476 0.16
477 0.19
478 0.25
479 0.3
480 0.34
481 0.35
482 0.35
483 0.37
484 0.36
485 0.36
486 0.31
487 0.28
488 0.29
489 0.3
490 0.3
491 0.27
492 0.26
493 0.26
494 0.23
495 0.21
496 0.18
497 0.17
498 0.19
499 0.2
500 0.21
501 0.21
502 0.22
503 0.21
504 0.23
505 0.29
506 0.27
507 0.29
508 0.28
509 0.24
510 0.25
511 0.29
512 0.27
513 0.24
514 0.23
515 0.22
516 0.25
517 0.25
518 0.27
519 0.24
520 0.23
521 0.18
522 0.18
523 0.18
524 0.14
525 0.14
526 0.12
527 0.11
528 0.11
529 0.11
530 0.11
531 0.09
532 0.09
533 0.11
534 0.1
535 0.09
536 0.1
537 0.11
538 0.15
539 0.15
540 0.16
541 0.17
542 0.19
543 0.2
544 0.22
545 0.26
546 0.24
547 0.28
548 0.28
549 0.26
550 0.24
551 0.24
552 0.24
553 0.25
554 0.26
555 0.23
556 0.21
557 0.21
558 0.21
559 0.22
560 0.19
561 0.16
562 0.15
563 0.16
564 0.19
565 0.19
566 0.2
567 0.19
568 0.19
569 0.18
570 0.19
571 0.22
572 0.19
573 0.2
574 0.19
575 0.19
576 0.19
577 0.19
578 0.18
579 0.18
580 0.18
581 0.16
582 0.18
583 0.18
584 0.17
585 0.16
586 0.15
587 0.13
588 0.12
589 0.12
590 0.1
591 0.09
592 0.09
593 0.09