FuNGI

A0A5E3XHC8

Protein Details

Accession

A0A5E3XHC8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
48-67	TPDSRERRVEIQPRKRARVE	Basic
280-321	SSSLAPPPKLNKQRRIKPAFKVSESDRGRDRKRYRQDSKLSL	Hydrophilic
1075-1096	EYVWPAQFKVPPRPRRQQRQKG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
288-312	KLNKQRRIKPAFKVSESDRGRDRKR

Subcellular Location(s)

extr 6, cyto 5.5, mito 5, plas 5, cyto_nucl 4.5, nucl 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012337 RNaseH-like_sf IPR002156 RNaseH_domain IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity
Pfam	View protein in Pfam PF00075 RNase_H PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50879 RNASE_H_1 PS50878 RT_POL
CDD	cd09280 RNase_HI_eukaryote_like cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MWQDGWPAARAPDTVGGLRSFAIRSVLDRAGWSDHAPLALVLKVPNDTPDSRERRVEIQPRKRARVELPRDSALDESYADLVLAARSTTLTDRLRSLYGPVIADSAKGTPVKVWTDGSSLNNGRRGASAGAGVFFGPGNRHNIAQRVPDAQTNNRAEVFAVLLALAAVSPAVPLIVHSDSQYAIQSVTTWAPDNADAGWSCKNGDILKDCAAWIRARPARVHFEHVRAHSDDKSNDAADALAKRGAGKPAAAPYHHQRVQAPPTPAAAPDVTVLSLDKVSSSLAPPPKLNKQRRIKPAFKVSESDRGRDRKRYRQDSKLSLLLGSARDSGLFWRTIKHDYDAIPPQVTVSLAELTPEFMRRMNKPEHPPPELDRAAARLAQLQARDLSTITPHLEPDGFFAEPFTMEDIAWLKKHMRERSLEGAPGYDGVSKSELMIIANDDLAALFSRCIEENDVPGVWLTTEVVAILKRDKPEHEAASYRTVGLESIALKMLTLLVHRRLTQWADQHDLLPPTQNGFRQGYRTANNALVLRCLIEKAHAMKIPLYVAFVDVTNAFPSTDRDLLWVKLHRMGISGPMIDWLRNLYRRMSYVVRTSEGSSEAFEADVGVLIGDSASPTLWNLFLADLNLLPRSDDPVLGGVLVSLLAHADDLVLVSTSPAGLQARLNAVFRYCRINQLVTHPGKTVLMLFGEIPAVVPQFYMNGVKLAYKDTWTYVGVTFTSTKGNLFYEHYVGRRKKALAAVFQILGLDLDVGRLPPWPARLLWMARPDAYLTGGADIIPDIDKLADPLEDVQVMFLRRILGLGPSSLHAPLFTETGIAPLRFRRLILALRYLRYAVSLPESHMVSAALRESYAMYTATVSGWIGDIAWALKNRLPSTHIRLPSLADLKEDGAVDALIRQVEKAMRDHLQGEINERSKLYLLRDRQEPASRDGPLQAAAILRFRPYLNVVREDHRFALTRLLLSHHPLALEVLRHEDLTLGRKFVPREHRLCRFCAGAVESPEHALLECMANTTLPLIRARFFAQVERLRPDLVPPISARPTPDAMRALLDWPDFVHVLAAFTNAVLSVFTSVEYVWPAQFKVPPRPRRQQRQKG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.24
3	0.23
4	0.22
5	0.22
6	0.21
7	0.16
8	0.15
9	0.16
10	0.14
11	0.16
12	0.21
13	0.23
14	0.22
15	0.22
16	0.24
17	0.24
18	0.26
19	0.24
20	0.21
21	0.2
22	0.2
23	0.19
24	0.17
25	0.15
26	0.14
27	0.14
28	0.12
29	0.13
30	0.14
31	0.14
32	0.17
33	0.2
34	0.2
35	0.24
36	0.33
37	0.39
38	0.42
39	0.47
40	0.47
41	0.48
42	0.57
43	0.62
44	0.63
45	0.66
46	0.73
47	0.77
48	0.82
49	0.79
50	0.76
51	0.75
52	0.75
53	0.74
54	0.74
55	0.71
56	0.67
57	0.64
58	0.58
59	0.5
60	0.4
61	0.31
62	0.21
63	0.16
64	0.13
65	0.12
66	0.1
67	0.09
68	0.09
69	0.08
70	0.08
71	0.06
72	0.06
73	0.06
74	0.08
75	0.1
76	0.17
77	0.2
78	0.21
79	0.25
80	0.27
81	0.29
82	0.28
83	0.29
84	0.27
85	0.27
86	0.25
87	0.23
88	0.22
89	0.2
90	0.2
91	0.18
92	0.14
93	0.15
94	0.14
95	0.14
96	0.14
97	0.19
98	0.21
99	0.23
100	0.24
101	0.22
102	0.25
103	0.29
104	0.28
105	0.32
106	0.34
107	0.36
108	0.39
109	0.37
110	0.35
111	0.32
112	0.33
113	0.26
114	0.22
115	0.21
116	0.16
117	0.16
118	0.15
119	0.14
120	0.11
121	0.1
122	0.1
123	0.09
124	0.11
125	0.16
126	0.17
127	0.19
128	0.21
129	0.26
130	0.3
131	0.33
132	0.34
133	0.33
134	0.34
135	0.36
136	0.39
137	0.39
138	0.44
139	0.42
140	0.41
141	0.37
142	0.36
143	0.31
144	0.27
145	0.24
146	0.14
147	0.11
148	0.08
149	0.07
150	0.06
151	0.06
152	0.04
153	0.03
154	0.02
155	0.02
156	0.02
157	0.02
158	0.03
159	0.02
160	0.03
161	0.08
162	0.09
163	0.1
164	0.11
165	0.12
166	0.13
167	0.14
168	0.15
169	0.11
170	0.1
171	0.09
172	0.09
173	0.1
174	0.11
175	0.12
176	0.12
177	0.12
178	0.13
179	0.14
180	0.14
181	0.12
182	0.13
183	0.12
184	0.13
185	0.15
186	0.14
187	0.15
188	0.15
189	0.18
190	0.16
191	0.21
192	0.22
193	0.23
194	0.26
195	0.26
196	0.25
197	0.25
198	0.26
199	0.22
200	0.21
201	0.27
202	0.27
203	0.29
204	0.33
205	0.36
206	0.42
207	0.44
208	0.5
209	0.44
210	0.47
211	0.5
212	0.49
213	0.48
214	0.42
215	0.42
216	0.39
217	0.4
218	0.35
219	0.32
220	0.33
221	0.28
222	0.25
223	0.22
224	0.18
225	0.15
226	0.16
227	0.14
228	0.12
229	0.12
230	0.13
231	0.16
232	0.18
233	0.16
234	0.16
235	0.17
236	0.23
237	0.26
238	0.26
239	0.28
240	0.32
241	0.41
242	0.43
243	0.42
244	0.37
245	0.42
246	0.49
247	0.51
248	0.48
249	0.39
250	0.38
251	0.37
252	0.35
253	0.3
254	0.22
255	0.16
256	0.13
257	0.12
258	0.1
259	0.09
260	0.09
261	0.08
262	0.08
263	0.07
264	0.06
265	0.06
266	0.07
267	0.08
268	0.08
269	0.14
270	0.19
271	0.22
272	0.24
273	0.29
274	0.39
275	0.48
276	0.56
277	0.59
278	0.65
279	0.73
280	0.81
281	0.85
282	0.82
283	0.8
284	0.82
285	0.79
286	0.7
287	0.65
288	0.58
289	0.59
290	0.55
291	0.49
292	0.46
293	0.47
294	0.49
295	0.55
296	0.58
297	0.58
298	0.67
299	0.75
300	0.76
301	0.77
302	0.81
303	0.78
304	0.76
305	0.69
306	0.59
307	0.48
308	0.41
309	0.33
310	0.25
311	0.19
312	0.15
313	0.11
314	0.1
315	0.1
316	0.11
317	0.11
318	0.13
319	0.11
320	0.14
321	0.17
322	0.2
323	0.22
324	0.23
325	0.24
326	0.23
327	0.3
328	0.32
329	0.32
330	0.28
331	0.26
332	0.24
333	0.21
334	0.2
335	0.14
336	0.09
337	0.08
338	0.08
339	0.08
340	0.08
341	0.09
342	0.1
343	0.11
344	0.1
345	0.11
346	0.15
347	0.17
348	0.23
349	0.28
350	0.35
351	0.42
352	0.51
353	0.54
354	0.54
355	0.55
356	0.53
357	0.55
358	0.48
359	0.41
360	0.32
361	0.27
362	0.26
363	0.23
364	0.19
365	0.14
366	0.15
367	0.16
368	0.16
369	0.15
370	0.15
371	0.14
372	0.14
373	0.11
374	0.1
375	0.09
376	0.11
377	0.12
378	0.11
379	0.11
380	0.11
381	0.12
382	0.11
383	0.12
384	0.13
385	0.11
386	0.1
387	0.11
388	0.1
389	0.09
390	0.1
391	0.09
392	0.07
393	0.07
394	0.08
395	0.1
396	0.11
397	0.11
398	0.12
399	0.12
400	0.16
401	0.23
402	0.27
403	0.29
404	0.31
405	0.37
406	0.42
407	0.43
408	0.4
409	0.33
410	0.29
411	0.24
412	0.21
413	0.16
414	0.11
415	0.09
416	0.09
417	0.1
418	0.09
419	0.09
420	0.09
421	0.09
422	0.07
423	0.07
424	0.07
425	0.06
426	0.06
427	0.06
428	0.05
429	0.04
430	0.05
431	0.05
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.05
436	0.06
437	0.07
438	0.1
439	0.1
440	0.11
441	0.12
442	0.12
443	0.11
444	0.11
445	0.1
446	0.07
447	0.06
448	0.05
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.04
453	0.05
454	0.05
455	0.08
456	0.1
457	0.12
458	0.13
459	0.15
460	0.19
461	0.24
462	0.26
463	0.25
464	0.26
465	0.26
466	0.29
467	0.28
468	0.23
469	0.18
470	0.16
471	0.13
472	0.11
473	0.1
474	0.06
475	0.07
476	0.07
477	0.07
478	0.07
479	0.07
480	0.07
481	0.06
482	0.06
483	0.08
484	0.11
485	0.13
486	0.14
487	0.15
488	0.17
489	0.19
490	0.22
491	0.24
492	0.23
493	0.25
494	0.25
495	0.25
496	0.25
497	0.23
498	0.2
499	0.17
500	0.15
501	0.12
502	0.14
503	0.14
504	0.15
505	0.17
506	0.18
507	0.18
508	0.21
509	0.23
510	0.23
511	0.25
512	0.23
513	0.21
514	0.22
515	0.21
516	0.19
517	0.15
518	0.13
519	0.12
520	0.1
521	0.09
522	0.07
523	0.06
524	0.08
525	0.11
526	0.14
527	0.15
528	0.15
529	0.16
530	0.17
531	0.16
532	0.14
533	0.12
534	0.08
535	0.07
536	0.07
537	0.06
538	0.06
539	0.06
540	0.06
541	0.06
542	0.06
543	0.06
544	0.06
545	0.07
546	0.1
547	0.11
548	0.1
549	0.12
550	0.13
551	0.14
552	0.17
553	0.18
554	0.16
555	0.2
556	0.2
557	0.18
558	0.18
559	0.17
560	0.16
561	0.15
562	0.13
563	0.09
564	0.11
565	0.11
566	0.1
567	0.1
568	0.09
569	0.11
570	0.14
571	0.15
572	0.15
573	0.16
574	0.17
575	0.21
576	0.21
577	0.21
578	0.23
579	0.24
580	0.24
581	0.23
582	0.23
583	0.2
584	0.19
585	0.17
586	0.12
587	0.11
588	0.09
589	0.08
590	0.07
591	0.06
592	0.04
593	0.04
594	0.03
595	0.03
596	0.02
597	0.02
598	0.02
599	0.02
600	0.02
601	0.02
602	0.02
603	0.02
604	0.03
605	0.03
606	0.04
607	0.04
608	0.04
609	0.05
610	0.05
611	0.05
612	0.06
613	0.05
614	0.06
615	0.07
616	0.06
617	0.06
618	0.06
619	0.09
620	0.09
621	0.09
622	0.09
623	0.09
624	0.09
625	0.09
626	0.08
627	0.05
628	0.04
629	0.04
630	0.03
631	0.02
632	0.02
633	0.02
634	0.02
635	0.02
636	0.02
637	0.02
638	0.02
639	0.03
640	0.03
641	0.03
642	0.03
643	0.03
644	0.03
645	0.03
646	0.04
647	0.05
648	0.05
649	0.06
650	0.08
651	0.1
652	0.12
653	0.13
654	0.12
655	0.12
656	0.13
657	0.14
658	0.19
659	0.17
660	0.2
661	0.22
662	0.24
663	0.24
664	0.29
665	0.37
666	0.33
667	0.34
668	0.29
669	0.28
670	0.25
671	0.24
672	0.19
673	0.1
674	0.09
675	0.08
676	0.07
677	0.07
678	0.07
679	0.06
680	0.06
681	0.05
682	0.05
683	0.04
684	0.04
685	0.04
686	0.04
687	0.06
688	0.07
689	0.07
690	0.07
691	0.08
692	0.09
693	0.09
694	0.12
695	0.11
696	0.12
697	0.12
698	0.13
699	0.14
700	0.14
701	0.15
702	0.13
703	0.14
704	0.12
705	0.13
706	0.13
707	0.12
708	0.13
709	0.11
710	0.11
711	0.11
712	0.12
713	0.12
714	0.14
715	0.15
716	0.16
717	0.18
718	0.21
719	0.29
720	0.3
721	0.31
722	0.33
723	0.32
724	0.33
725	0.37
726	0.39
727	0.35
728	0.37
729	0.36
730	0.32
731	0.31
732	0.26
733	0.2
734	0.16
735	0.1
736	0.06
737	0.04
738	0.04
739	0.04
740	0.04
741	0.04
742	0.05
743	0.07
744	0.08
745	0.1
746	0.12
747	0.12
748	0.15
749	0.2
750	0.21
751	0.25
752	0.29
753	0.28
754	0.27
755	0.28
756	0.25
757	0.21
758	0.19
759	0.15
760	0.1
761	0.09
762	0.08
763	0.08
764	0.07
765	0.06
766	0.06
767	0.05
768	0.05
769	0.04
770	0.05
771	0.05
772	0.05
773	0.06
774	0.06
775	0.06
776	0.07
777	0.08
778	0.08
779	0.08
780	0.08
781	0.1
782	0.1
783	0.1
784	0.1
785	0.1
786	0.09
787	0.09
788	0.09
789	0.09
790	0.09
791	0.1
792	0.09
793	0.09
794	0.1
795	0.11
796	0.1
797	0.08
798	0.09
799	0.09
800	0.09
801	0.08
802	0.08
803	0.08
804	0.11
805	0.13
806	0.12
807	0.12
808	0.14
809	0.18
810	0.18
811	0.18
812	0.18
813	0.2
814	0.25
815	0.27
816	0.35
817	0.34
818	0.35
819	0.36
820	0.33
821	0.29
822	0.25
823	0.22
824	0.14
825	0.15
826	0.15
827	0.16
828	0.19
829	0.19
830	0.18
831	0.17
832	0.16
833	0.11
834	0.12
835	0.11
836	0.08
837	0.07
838	0.08
839	0.08
840	0.08
841	0.09
842	0.08
843	0.07
844	0.08
845	0.09
846	0.08
847	0.08
848	0.07
849	0.06
850	0.06
851	0.06
852	0.05
853	0.05
854	0.05
855	0.06
856	0.09
857	0.1
858	0.11
859	0.13
860	0.18
861	0.19
862	0.2
863	0.23
864	0.27
865	0.35
866	0.42
867	0.43
868	0.4
869	0.4
870	0.41
871	0.44
872	0.42
873	0.34
874	0.26
875	0.25
876	0.23
877	0.24
878	0.22
879	0.15
880	0.1
881	0.1
882	0.09
883	0.08
884	0.08
885	0.07
886	0.07
887	0.07
888	0.09
889	0.12
890	0.14
891	0.16
892	0.19
893	0.21
894	0.23
895	0.24
896	0.25
897	0.28
898	0.26
899	0.29
900	0.32
901	0.32
902	0.31
903	0.3
904	0.28
905	0.25
906	0.27
907	0.28
908	0.29
909	0.33
910	0.37
911	0.42
912	0.44
913	0.49
914	0.54
915	0.51
916	0.48
917	0.47
918	0.43
919	0.39
920	0.38
921	0.33
922	0.26
923	0.23
924	0.19
925	0.15
926	0.15
927	0.16
928	0.15
929	0.15
930	0.15
931	0.15
932	0.17
933	0.2
934	0.27
935	0.29
936	0.34
937	0.36
938	0.4
939	0.43
940	0.45
941	0.42
942	0.37
943	0.34
944	0.29
945	0.34
946	0.3
947	0.28
948	0.25
949	0.27
950	0.25
951	0.28
952	0.3
953	0.23
954	0.21
955	0.2
956	0.21
957	0.19
958	0.19
959	0.16
960	0.18
961	0.18
962	0.18
963	0.18
964	0.18
965	0.18
966	0.23
967	0.23
968	0.21
969	0.23
970	0.27
971	0.28
972	0.34
973	0.43
974	0.45
975	0.52
976	0.58
977	0.66
978	0.65
979	0.67
980	0.63
981	0.55
982	0.47
983	0.43
984	0.39
985	0.35
986	0.34
987	0.34
988	0.3
989	0.29
990	0.28
991	0.24
992	0.19
993	0.13
994	0.11
995	0.1
996	0.1
997	0.1
998	0.1
999	0.1
1000	0.1
1001	0.12
1002	0.12
1003	0.12
1004	0.16
1005	0.16
1006	0.18
1007	0.2
1008	0.23
1009	0.26
1010	0.26
1011	0.29
1012	0.35
1013	0.4
1014	0.44
1015	0.46
1016	0.45
1017	0.41
1018	0.4
1019	0.38
1020	0.37
1021	0.31
1022	0.3
1023	0.28
1024	0.33
1025	0.36
1026	0.38
1027	0.37
1028	0.33
1029	0.37
1030	0.36
1031	0.39
1032	0.35
1033	0.31
1034	0.32
1035	0.3
1036	0.28
1037	0.27
1038	0.25
1039	0.19
1040	0.17
1041	0.19
1042	0.17
1043	0.16
1044	0.15
1045	0.11
1046	0.12
1047	0.12
1048	0.13
1049	0.09
1050	0.09
1051	0.09
1052	0.07
1053	0.07
1054	0.06
1055	0.06
1056	0.07
1057	0.07
1058	0.07
1059	0.08
1060	0.08
1061	0.09
1062	0.12
1063	0.12
1064	0.13
1065	0.15
1066	0.15
1067	0.19
1068	0.24
1069	0.29
1070	0.38
1071	0.47
1072	0.55
1073	0.63
1074	0.73
1075	0.8
1076	0.87

A0A5E3XHC8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer