Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5E3WPV6

Protein Details
Accession A0A5E3WPV6    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
261-284ALGKKPSTPRKAPKSRGRPKQEAGBasic
332-356GSPKAPASVKRPRGRPRKESTKDGABasic
362-385SDAAPVRRGRKPKQQSSARAHTPSHydrophilic
417-440EGARTDGEGRQRKKRRVAAPASDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
223-228RRAKRR
263-280GKKPSTPRKAPKSRGRPK
304-318AKKARAPRSRKAPGK
335-353KAPASVKRPRGRPRKESTK
368-374RRGRKPK
427-432QRKKRR
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MFGFFSKKPSETGLTQSPDAPKPSGSTEPIQQLRTPSPSVAPSNDLHVPPSTSGRPSEEPEPSLPSRPEPTTESLHALVSSVPPKTLHAYTMTEIGKADESMLNALAAFFATLSPPPRLHCVRCHADYMDVENTERSCHVAHDDDTAEVERGGPSGYQTLWGCCEKITPGDGSEGPPDGWCYEGFHTTDIKRARFRADSTPTDDKLKSCLRLNCHGVRDALPRRAKRRREQEPDPAEVADDAASSGTEDSGVAEIARGVGALGKKPSTPRKAPKSRGRPKQEAGENGMDVDDTSSVAASASASAKKARAPRSRKAPGKEGTEVMDVDASTSGSPKAPASVKRPRGRPRKESTKDGAETGAESDAAPVRRGRKPKQQSSARAHTPSQVEVVLPQRTRSQSRNARAVSRARTGAETDNEGARTDGEGRQRKKRRVAAPASDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.42
3 0.44
4 0.45
5 0.44
6 0.45
7 0.39
8 0.32
9 0.3
10 0.34
11 0.35
12 0.34
13 0.33
14 0.36
15 0.43
16 0.47
17 0.46
18 0.43
19 0.43
20 0.43
21 0.45
22 0.41
23 0.33
24 0.32
25 0.35
26 0.37
27 0.34
28 0.33
29 0.29
30 0.32
31 0.35
32 0.32
33 0.28
34 0.26
35 0.26
36 0.24
37 0.29
38 0.26
39 0.24
40 0.26
41 0.3
42 0.32
43 0.34
44 0.39
45 0.37
46 0.37
47 0.37
48 0.42
49 0.38
50 0.4
51 0.38
52 0.35
53 0.37
54 0.35
55 0.36
56 0.34
57 0.36
58 0.35
59 0.36
60 0.36
61 0.32
62 0.3
63 0.27
64 0.23
65 0.19
66 0.17
67 0.18
68 0.14
69 0.14
70 0.14
71 0.16
72 0.21
73 0.21
74 0.19
75 0.2
76 0.22
77 0.22
78 0.29
79 0.27
80 0.23
81 0.22
82 0.22
83 0.19
84 0.16
85 0.16
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.1
91 0.09
92 0.09
93 0.07
94 0.05
95 0.05
96 0.03
97 0.03
98 0.04
99 0.06
100 0.09
101 0.12
102 0.13
103 0.15
104 0.22
105 0.27
106 0.29
107 0.34
108 0.4
109 0.44
110 0.45
111 0.47
112 0.41
113 0.4
114 0.37
115 0.35
116 0.3
117 0.24
118 0.22
119 0.2
120 0.19
121 0.16
122 0.16
123 0.13
124 0.1
125 0.1
126 0.12
127 0.14
128 0.14
129 0.17
130 0.17
131 0.16
132 0.17
133 0.17
134 0.14
135 0.11
136 0.11
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.1
145 0.11
146 0.11
147 0.14
148 0.15
149 0.14
150 0.13
151 0.14
152 0.11
153 0.12
154 0.13
155 0.11
156 0.11
157 0.13
158 0.14
159 0.14
160 0.14
161 0.14
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.09
169 0.1
170 0.12
171 0.12
172 0.13
173 0.16
174 0.15
175 0.21
176 0.23
177 0.25
178 0.25
179 0.26
180 0.29
181 0.29
182 0.32
183 0.35
184 0.37
185 0.37
186 0.41
187 0.45
188 0.42
189 0.43
190 0.4
191 0.32
192 0.31
193 0.31
194 0.27
195 0.28
196 0.3
197 0.31
198 0.36
199 0.42
200 0.41
201 0.39
202 0.38
203 0.33
204 0.32
205 0.36
206 0.33
207 0.36
208 0.37
209 0.39
210 0.47
211 0.54
212 0.6
213 0.61
214 0.67
215 0.7
216 0.73
217 0.75
218 0.76
219 0.72
220 0.68
221 0.6
222 0.49
223 0.39
224 0.3
225 0.24
226 0.13
227 0.08
228 0.05
229 0.04
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.03
245 0.03
246 0.05
247 0.06
248 0.07
249 0.09
250 0.09
251 0.11
252 0.17
253 0.26
254 0.31
255 0.39
256 0.47
257 0.57
258 0.66
259 0.75
260 0.8
261 0.83
262 0.86
263 0.87
264 0.87
265 0.84
266 0.77
267 0.76
268 0.72
269 0.64
270 0.6
271 0.52
272 0.43
273 0.35
274 0.31
275 0.22
276 0.16
277 0.12
278 0.07
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.03
286 0.05
287 0.07
288 0.08
289 0.09
290 0.11
291 0.12
292 0.16
293 0.23
294 0.32
295 0.4
296 0.46
297 0.54
298 0.63
299 0.73
300 0.76
301 0.75
302 0.74
303 0.7
304 0.7
305 0.64
306 0.55
307 0.48
308 0.42
309 0.36
310 0.28
311 0.22
312 0.15
313 0.13
314 0.11
315 0.08
316 0.06
317 0.07
318 0.08
319 0.07
320 0.09
321 0.08
322 0.12
323 0.17
324 0.23
325 0.3
326 0.4
327 0.49
328 0.56
329 0.65
330 0.71
331 0.77
332 0.81
333 0.83
334 0.83
335 0.84
336 0.83
337 0.83
338 0.8
339 0.78
340 0.7
341 0.62
342 0.53
343 0.42
344 0.36
345 0.28
346 0.22
347 0.12
348 0.1
349 0.11
350 0.13
351 0.14
352 0.15
353 0.17
354 0.23
355 0.3
356 0.38
357 0.45
358 0.52
359 0.61
360 0.7
361 0.77
362 0.81
363 0.84
364 0.85
365 0.87
366 0.84
367 0.78
368 0.69
369 0.64
370 0.57
371 0.48
372 0.41
373 0.32
374 0.24
375 0.23
376 0.28
377 0.29
378 0.27
379 0.27
380 0.32
381 0.37
382 0.42
383 0.43
384 0.48
385 0.51
386 0.59
387 0.66
388 0.64
389 0.64
390 0.65
391 0.68
392 0.64
393 0.6
394 0.55
395 0.47
396 0.46
397 0.44
398 0.43
399 0.38
400 0.37
401 0.33
402 0.33
403 0.32
404 0.3
405 0.27
406 0.21
407 0.2
408 0.18
409 0.21
410 0.27
411 0.36
412 0.42
413 0.52
414 0.62
415 0.69
416 0.76
417 0.81
418 0.8
419 0.82
420 0.86