FuNGI

H1UXX4

Protein Details

Accession

H1UXX4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
16-40	SKSAKASKVSRPSKRDTPTKDRTTA	Hydrophilic
94-122	LFDPNVKSKAKKEKRRKAKDTKDVKPARD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-29	TPPSKSAKASKVSRPSK
100-116	KSKAKKEKRRKAKDTKD

Subcellular Location(s)

cyto 9, mito 8, cyto_nucl 8, nucl 5, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012340 NA-bd_OB-fold IPR045209 Rrp5 IPR022967 S1_dom IPR003029 S1_domain
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006364 P:rRNA processing
PROSITE	View protein in PROSITE PS50126 S1
CDD	cd05693 S1_Rrp5_repeat_hs1_sc1

Amino Acid Sequences

MSSLKRKDAPGGTPPSKSAKASKVSRPSKRDTPTKDRTTATADAPALKAPAVSALLKDEEPLFPRGGGSILTPLEQKQITMEAKADAAKEEAELFDPNVKSKAKKEKRRKAKDTKDVKPARDEDAVKIEGLNFKRLVKGSLVLGQITHIDTVQLTIALPNNLTGHVSIASISDTTNSKLEKDLNAADEESDDDEEEDDEGIDLKSMFKIGQYVRTHVLSTADESGPGKAKRRIELSLRPAEANAGITGDDVVAHTTLMASIASVQDHGYEMDLGIEGDLKGFLPKKEVGPDMDEASLRPGAVCLCVVKSVTGIVVQLSTDPLKLGNTSLVASTAPTINSFLPGSLADVLLTEVTSRGIQGKLLGHLPVTADLIHSGVGPDNVDLEAKYTVGTRVKARIICNFPAAREPKLGISLLPHIVGLQPKSSGKGSRAKAPLDILPIASFVEKCTVRKVEPEIGLYVDTGVPGIAGFVHISRVKDGKVDALYETSGPHKVGSTHRGRVVGYSSLDGMFLLSFEQNILDQPFIRLEDVPVGEVVSGKIEKVIVGENGVSGLIVKLAEGITGY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.54
3	0.52
4	0.49
5	0.48
6	0.46
7	0.51
8	0.56
9	0.62
10	0.66
11	0.72
12	0.79
13	0.78
14	0.78
15	0.79
16	0.8
17	0.8
18	0.79
19	0.79
20	0.8
21	0.81
22	0.79
23	0.71
24	0.66
25	0.63
26	0.57
27	0.49
28	0.45
29	0.38
30	0.35
31	0.33
32	0.31
33	0.25
34	0.21
35	0.18
36	0.11
37	0.13
38	0.12
39	0.12
40	0.12
41	0.14
42	0.16
43	0.16
44	0.17
45	0.16
46	0.17
47	0.19
48	0.21
49	0.19
50	0.17
51	0.17
52	0.17
53	0.16
54	0.13
55	0.11
56	0.13
57	0.13
58	0.14
59	0.15
60	0.15
61	0.19
62	0.19
63	0.18
64	0.15
65	0.21
66	0.22
67	0.22
68	0.22
69	0.18
70	0.2
71	0.22
72	0.21
73	0.14
74	0.14
75	0.13
76	0.12
77	0.12
78	0.11
79	0.11
80	0.11
81	0.11
82	0.16
83	0.17
84	0.18
85	0.22
86	0.24
87	0.25
88	0.33
89	0.43
90	0.48
91	0.58
92	0.68
93	0.75
94	0.83
95	0.92
96	0.94
97	0.94
98	0.94
99	0.94
100	0.93
101	0.9
102	0.9
103	0.86
104	0.78
105	0.75
106	0.67
107	0.61
108	0.58
109	0.51
110	0.44
111	0.43
112	0.4
113	0.32
114	0.29
115	0.26
116	0.25
117	0.25
118	0.26
119	0.21
120	0.21
121	0.25
122	0.26
123	0.26
124	0.21
125	0.22
126	0.19
127	0.23
128	0.23
129	0.19
130	0.19
131	0.17
132	0.16
133	0.15
134	0.13
135	0.07
136	0.07
137	0.06
138	0.07
139	0.07
140	0.06
141	0.05
142	0.06
143	0.08
144	0.09
145	0.09
146	0.09
147	0.1
148	0.1
149	0.1
150	0.09
151	0.08
152	0.08
153	0.08
154	0.07
155	0.07
156	0.07
157	0.07
158	0.07
159	0.08
160	0.08
161	0.1
162	0.12
163	0.12
164	0.13
165	0.15
166	0.17
167	0.17
168	0.2
169	0.2
170	0.19
171	0.2
172	0.19
173	0.17
174	0.15
175	0.14
176	0.11
177	0.09
178	0.08
179	0.07
180	0.07
181	0.07
182	0.07
183	0.06
184	0.05
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.06
193	0.06
194	0.05
195	0.1
196	0.11
197	0.2
198	0.21
199	0.24
200	0.26
201	0.27
202	0.27
203	0.23
204	0.24
205	0.15
206	0.16
207	0.16
208	0.14
209	0.13
210	0.14
211	0.14
212	0.18
213	0.18
214	0.21
215	0.23
216	0.26
217	0.29
218	0.32
219	0.35
220	0.36
221	0.43
222	0.46
223	0.47
224	0.45
225	0.42
226	0.38
227	0.35
228	0.28
229	0.21
230	0.13
231	0.07
232	0.06
233	0.05
234	0.06
235	0.05
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.03
242	0.03
243	0.03
244	0.04
245	0.03
246	0.03
247	0.03
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.05
252	0.05
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.03
262	0.04
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.05
268	0.07
269	0.07
270	0.09
271	0.11
272	0.12
273	0.15
274	0.17
275	0.16
276	0.18
277	0.19
278	0.17
279	0.17
280	0.15
281	0.12
282	0.13
283	0.12
284	0.09
285	0.07
286	0.06
287	0.06
288	0.06
289	0.06
290	0.05
291	0.05
292	0.06
293	0.07
294	0.06
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.04
303	0.05
304	0.06
305	0.06
306	0.05
307	0.05
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.07
312	0.06
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.06
322	0.06
323	0.08
324	0.08
325	0.09
326	0.09
327	0.08
328	0.08
329	0.08
330	0.09
331	0.08
332	0.08
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.05
337	0.05
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.05
342	0.05
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.1
347	0.11
348	0.12
349	0.13
350	0.13
351	0.11
352	0.12
353	0.12
354	0.1
355	0.09
356	0.08
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.06
361	0.06
362	0.05
363	0.05
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.1
377	0.13
378	0.16
379	0.17
380	0.21
381	0.26
382	0.29
383	0.31
384	0.36
385	0.38
386	0.38
387	0.42
388	0.38
389	0.34
390	0.38
391	0.39
392	0.33
393	0.29
394	0.29
395	0.24
396	0.25
397	0.24
398	0.16
399	0.16
400	0.18
401	0.17
402	0.16
403	0.14
404	0.12
405	0.14
406	0.16
407	0.15
408	0.12
409	0.14
410	0.15
411	0.18
412	0.2
413	0.22
414	0.23
415	0.31
416	0.32
417	0.39
418	0.43
419	0.41
420	0.41
421	0.4
422	0.38
423	0.34
424	0.32
425	0.24
426	0.19
427	0.19
428	0.17
429	0.15
430	0.12
431	0.09
432	0.15
433	0.16
434	0.16
435	0.22
436	0.26
437	0.26
438	0.31
439	0.36
440	0.37
441	0.38
442	0.4
443	0.34
444	0.32
445	0.31
446	0.26
447	0.21
448	0.13
449	0.1
450	0.08
451	0.06
452	0.05
453	0.04
454	0.04
455	0.03
456	0.04
457	0.04
458	0.05
459	0.09
460	0.12
461	0.13
462	0.16
463	0.19
464	0.19
465	0.21
466	0.21
467	0.23
468	0.22
469	0.22
470	0.21
471	0.2
472	0.21
473	0.19
474	0.19
475	0.16
476	0.16
477	0.15
478	0.15
479	0.14
480	0.17
481	0.24
482	0.32
483	0.37
484	0.41
485	0.45
486	0.46
487	0.45
488	0.44
489	0.42
490	0.37
491	0.31
492	0.26
493	0.23
494	0.21
495	0.21
496	0.17
497	0.14
498	0.09
499	0.07
500	0.07
501	0.06
502	0.06
503	0.07
504	0.07
505	0.07
506	0.1
507	0.11
508	0.11
509	0.12
510	0.13
511	0.16
512	0.16
513	0.18
514	0.16
515	0.16
516	0.21
517	0.21
518	0.2
519	0.18
520	0.17
521	0.15
522	0.15
523	0.14
524	0.12
525	0.11
526	0.1
527	0.12
528	0.11
529	0.12
530	0.13
531	0.16
532	0.12
533	0.14
534	0.14
535	0.13
536	0.13
537	0.13
538	0.11
539	0.08
540	0.07
541	0.06
542	0.06
543	0.06
544	0.07
545	0.07

H1UXX4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer