Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5E3WLK0

Protein Details
Accession A0A5E3WLK0    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
405-424SSPPPAKKSRAAPARKPSAVHydrophilic
435-455RRTAGARRGTRQPIKRGGRRFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
384-389KSKPAK
410-420AKKSRAAPARK
436-455RTAGARRGTRQPIKRGGRRF
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MEDFSQDHSKLLLSREWLSKVDGDSSTAYLMKFSASFSDQSCVFMVTDTKSVWAEVLNTQRLIRRWQSLNPSTSPTDLPPPEANLEQWIDAIVQCLRDSHTLGGMDDMSMELEPSPYADLCIAFGGHGFKWRWDTCILPPKLAAEVLSRHLIIPLICTANLAFTTSDPLADMPEGELEKAVDKVGRTARRSVDTHLRTTVTRPRLSTTLRRVTALFDFNTSPPRIAGEADRPDIRLPIAPQEPEPGDSKGKGKVSGHDSASTKTPSRASSPDIAPDVEPMAVDEPNIFVGNDIKGKDKVHTQPESQVSATAPSQPQPSAPADEGSDTAPDSDAEAVPPRKTPVPAASSTLPVPIPNLPAKAKPTAPRKATTPDGSSGDSDAKPKSKPAKAPPTRHADDDSSSSDSSPPPAKKSRAAPARKPSAVDDSSSDSDGERRTAGARRGTRQPIKRGGRRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.33
3 0.36
4 0.35
5 0.35
6 0.35
7 0.32
8 0.33
9 0.28
10 0.26
11 0.24
12 0.24
13 0.23
14 0.21
15 0.19
16 0.15
17 0.14
18 0.13
19 0.12
20 0.11
21 0.13
22 0.14
23 0.16
24 0.18
25 0.21
26 0.2
27 0.21
28 0.21
29 0.19
30 0.16
31 0.16
32 0.16
33 0.15
34 0.18
35 0.16
36 0.18
37 0.16
38 0.17
39 0.16
40 0.14
41 0.14
42 0.17
43 0.24
44 0.26
45 0.26
46 0.28
47 0.32
48 0.34
49 0.38
50 0.38
51 0.38
52 0.39
53 0.45
54 0.53
55 0.56
56 0.59
57 0.54
58 0.54
59 0.48
60 0.46
61 0.41
62 0.33
63 0.34
64 0.3
65 0.32
66 0.29
67 0.3
68 0.31
69 0.3
70 0.28
71 0.23
72 0.24
73 0.19
74 0.17
75 0.15
76 0.12
77 0.11
78 0.13
79 0.1
80 0.1
81 0.09
82 0.1
83 0.12
84 0.13
85 0.15
86 0.14
87 0.17
88 0.16
89 0.16
90 0.17
91 0.15
92 0.13
93 0.11
94 0.1
95 0.07
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.07
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.07
110 0.06
111 0.07
112 0.09
113 0.08
114 0.14
115 0.14
116 0.16
117 0.23
118 0.23
119 0.25
120 0.24
121 0.27
122 0.29
123 0.39
124 0.38
125 0.32
126 0.32
127 0.31
128 0.3
129 0.27
130 0.2
131 0.12
132 0.14
133 0.15
134 0.16
135 0.16
136 0.14
137 0.15
138 0.15
139 0.12
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.07
150 0.06
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.08
158 0.08
159 0.05
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.06
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.11
171 0.18
172 0.24
173 0.26
174 0.3
175 0.33
176 0.36
177 0.38
178 0.37
179 0.41
180 0.38
181 0.38
182 0.35
183 0.34
184 0.29
185 0.32
186 0.35
187 0.31
188 0.31
189 0.29
190 0.3
191 0.32
192 0.36
193 0.4
194 0.41
195 0.43
196 0.41
197 0.41
198 0.39
199 0.37
200 0.36
201 0.31
202 0.23
203 0.16
204 0.17
205 0.16
206 0.2
207 0.18
208 0.15
209 0.12
210 0.13
211 0.12
212 0.11
213 0.12
214 0.15
215 0.18
216 0.19
217 0.2
218 0.19
219 0.19
220 0.19
221 0.17
222 0.12
223 0.1
224 0.14
225 0.15
226 0.15
227 0.15
228 0.18
229 0.18
230 0.18
231 0.19
232 0.16
233 0.15
234 0.16
235 0.18
236 0.19
237 0.2
238 0.22
239 0.21
240 0.24
241 0.27
242 0.31
243 0.31
244 0.31
245 0.3
246 0.28
247 0.31
248 0.28
249 0.23
250 0.21
251 0.22
252 0.19
253 0.22
254 0.23
255 0.23
256 0.26
257 0.26
258 0.27
259 0.26
260 0.25
261 0.21
262 0.19
263 0.17
264 0.11
265 0.1
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.06
275 0.05
276 0.07
277 0.08
278 0.11
279 0.11
280 0.13
281 0.15
282 0.16
283 0.18
284 0.23
285 0.29
286 0.34
287 0.37
288 0.36
289 0.41
290 0.44
291 0.45
292 0.38
293 0.33
294 0.25
295 0.23
296 0.22
297 0.2
298 0.17
299 0.16
300 0.18
301 0.17
302 0.17
303 0.18
304 0.2
305 0.19
306 0.19
307 0.18
308 0.17
309 0.18
310 0.18
311 0.15
312 0.13
313 0.1
314 0.09
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.15
322 0.17
323 0.17
324 0.19
325 0.21
326 0.22
327 0.23
328 0.26
329 0.27
330 0.3
331 0.31
332 0.34
333 0.33
334 0.32
335 0.31
336 0.3
337 0.23
338 0.17
339 0.18
340 0.15
341 0.18
342 0.18
343 0.22
344 0.22
345 0.25
346 0.29
347 0.32
348 0.35
349 0.39
350 0.45
351 0.51
352 0.53
353 0.52
354 0.53
355 0.55
356 0.57
357 0.54
358 0.49
359 0.45
360 0.43
361 0.42
362 0.38
363 0.34
364 0.31
365 0.26
366 0.25
367 0.25
368 0.25
369 0.25
370 0.32
371 0.39
372 0.42
373 0.5
374 0.58
375 0.65
376 0.71
377 0.79
378 0.8
379 0.8
380 0.75
381 0.7
382 0.64
383 0.56
384 0.49
385 0.45
386 0.41
387 0.35
388 0.32
389 0.29
390 0.27
391 0.24
392 0.25
393 0.29
394 0.29
395 0.32
396 0.4
397 0.44
398 0.49
399 0.56
400 0.62
401 0.64
402 0.7
403 0.73
404 0.75
405 0.8
406 0.75
407 0.7
408 0.64
409 0.63
410 0.55
411 0.47
412 0.4
413 0.37
414 0.37
415 0.35
416 0.31
417 0.23
418 0.25
419 0.25
420 0.24
421 0.17
422 0.16
423 0.19
424 0.26
425 0.32
426 0.38
427 0.43
428 0.47
429 0.56
430 0.65
431 0.71
432 0.73
433 0.76
434 0.77
435 0.81