FuNGI

A0A5E3X9M9

Protein Details

Accession

A0A5E3X9M9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1139-1158	CLKGHRLRSKAQFEKQFRLR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 14, nucl 6.5, cyto_nucl 6, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR041577 RT_RNaseH_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17919 RT_RNaseH_2 PF00665 rve
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MPQQLVSSSSASTSPCSRSPRPSFVLTPPARDIPCLPRPLVSPRSTYSKSKSVRSGLVPSCVPRPSSSSPTIIPICKLLNLVSSSTDCLPYAPFLSLTPSYDETHDPPPSTLSPSSLIADSSMHVLSSNLVRIVSPPQATPDSASEEELEQPAPATKAPSASGSAAKARARQTRSSRAAPIRSNTTKANIQVMGAYKPVDRKIRPVPGIFPQEAAVERRIPEDPLLSLPTLPTHPPDFEPTERLTRERLELVKLNEDGFLLPEEVKLFEYILRLCDKSLAFSDEERGTLRQDYFSDYIIPTVPHIPWTHKNIPIPPGIEPQVIDMLREKIRAGVYEPAQSSYRSRWFCVVKKNGKLRIVHDLQTLNGVTIKDAGVPPHLDHFVEKYANRACNTVFDLFWGFDARRIHPKSRDTTAFQTPLGALRLTAMPMGFTNSPAEFQNCMVFILGPEIPDVANIFIDDLAIRGPETTYPDAEGNPELLEANPGIRRFIWEHAHDVLRVMHRIMCAGATFNPLKAQIARKAVVILGQTCTPEGRLVERQKAEKISEWPTPRNPTDVRGFLGLCGTVRIWIADYSRIARPLTALTRKDIDFVWSDACQEAFDKLKEKVTAAPALRSIDYTSHRPIILSVDSSHIAVGFILSQLDEEGRRRPARYGSLPMGDTESRYSQAKLELYGLYRAIKAFSIYLVGAHPLFVEVDAAYIKGMLAAPDLQPSASINRWIQGILNFDFTLVHVPGKEFSGPDGLSRRTPNPWDFVSEDVEDTENFVLYAMPGDPMRTFKPSREQPVPYVRAATSEVTSAVSAVHVYAARVDSQLSDILSYLRDNRKPAWISSDKEQRQFEAKAIRFFIRDDALFRRRLGRIPQKVIFEQDTRRKILEGAHERAGHRGIEAVTQTVKLRFYWPDLETDVANHVKSCHECQIRQTAQWKIPPTVSAPTRIWEKVYIDVMFMPKAQGYRYIVAARDDLTRVTEGRALRTLSAKNLANFFWDQIYTRYGVISQVVTDNGSEVQKAFAWMMERLGVPHVHISPYNPRANGVVERGHFILREAIVKACQGKIERWPEHVAAALYADRITVSRQTGYSPYFLLHGRHPTLPMDLTEATFLGRPFSSHMTTEDLLAYRIRQVQRLPADLEKAAACLKGHRLRSKAQFEKQFRLRLMTKVMNPGALVLVANSSTFRSLNKKAKPRYIGPYRVVRRNPQGAYILCELDGTTIMSKFAAIRVVPYIARDPDAIRALTADETPQDPTLEKDVLEQALTDDSESETEDETSDESE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.29
3	0.36
4	0.41
5	0.5
6	0.57
7	0.62
8	0.63
9	0.64
10	0.63
11	0.62
12	0.67
13	0.59
14	0.57
15	0.53
16	0.54
17	0.48
18	0.45
19	0.43
20	0.41
21	0.46
22	0.45
23	0.41
24	0.38
25	0.41
26	0.48
27	0.51
28	0.46
29	0.44
30	0.43
31	0.51
32	0.53
33	0.56
34	0.54
35	0.55
36	0.57
37	0.59
38	0.63
39	0.6
40	0.62
41	0.6
42	0.63
43	0.57
44	0.57
45	0.53
46	0.47
47	0.47
48	0.43
49	0.39
50	0.32
51	0.36
52	0.37
53	0.41
54	0.43
55	0.41
56	0.4
57	0.45
58	0.48
59	0.43
60	0.37
61	0.34
62	0.31
63	0.28
64	0.28
65	0.22
66	0.22
67	0.22
68	0.22
69	0.21
70	0.21
71	0.23
72	0.23
73	0.23
74	0.18
75	0.17
76	0.17
77	0.16
78	0.17
79	0.15
80	0.14
81	0.13
82	0.19
83	0.2
84	0.2
85	0.22
86	0.24
87	0.24
88	0.25
89	0.28
90	0.27
91	0.32
92	0.34
93	0.31
94	0.29
95	0.32
96	0.31
97	0.33
98	0.31
99	0.26
100	0.25
101	0.26
102	0.27
103	0.23
104	0.21
105	0.16
106	0.16
107	0.14
108	0.14
109	0.12
110	0.1
111	0.09
112	0.09
113	0.11
114	0.13
115	0.15
116	0.13
117	0.13
118	0.13
119	0.14
120	0.19
121	0.22
122	0.21
123	0.19
124	0.23
125	0.26
126	0.26
127	0.28
128	0.26
129	0.27
130	0.26
131	0.27
132	0.23
133	0.22
134	0.23
135	0.22
136	0.19
137	0.12
138	0.12
139	0.13
140	0.13
141	0.12
142	0.13
143	0.13
144	0.15
145	0.16
146	0.18
147	0.19
148	0.2
149	0.22
150	0.22
151	0.25
152	0.28
153	0.29
154	0.32
155	0.37
156	0.43
157	0.45
158	0.52
159	0.56
160	0.62
161	0.66
162	0.66
163	0.68
164	0.68
165	0.71
166	0.67
167	0.64
168	0.63
169	0.6
170	0.58
171	0.52
172	0.49
173	0.46
174	0.42
175	0.42
176	0.33
177	0.29
178	0.29
179	0.29
180	0.25
181	0.22
182	0.21
183	0.18
184	0.21
185	0.27
186	0.32
187	0.31
188	0.37
189	0.45
190	0.53
191	0.56
192	0.55
193	0.53
194	0.53
195	0.59
196	0.52
197	0.44
198	0.35
199	0.32
200	0.31
201	0.29
202	0.24
203	0.19
204	0.19
205	0.21
206	0.21
207	0.21
208	0.2
209	0.19
210	0.18
211	0.18
212	0.2
213	0.18
214	0.17
215	0.16
216	0.16
217	0.16
218	0.16
219	0.17
220	0.17
221	0.18
222	0.2
223	0.25
224	0.29
225	0.29
226	0.32
227	0.32
228	0.37
229	0.37
230	0.37
231	0.35
232	0.32
233	0.32
234	0.34
235	0.32
236	0.3
237	0.34
238	0.35
239	0.37
240	0.36
241	0.33
242	0.28
243	0.26
244	0.21
245	0.16
246	0.14
247	0.1
248	0.09
249	0.09
250	0.1
251	0.1
252	0.11
253	0.1
254	0.09
255	0.1
256	0.12
257	0.12
258	0.14
259	0.16
260	0.16
261	0.16
262	0.2
263	0.19
264	0.19
265	0.21
266	0.21
267	0.19
268	0.2
269	0.24
270	0.2
271	0.21
272	0.21
273	0.19
274	0.18
275	0.2
276	0.2
277	0.18
278	0.18
279	0.23
280	0.22
281	0.22
282	0.22
283	0.19
284	0.19
285	0.18
286	0.17
287	0.13
288	0.15
289	0.14
290	0.15
291	0.16
292	0.21
293	0.26
294	0.35
295	0.4
296	0.42
297	0.46
298	0.47
299	0.49
300	0.47
301	0.43
302	0.36
303	0.35
304	0.33
305	0.3
306	0.25
307	0.23
308	0.25
309	0.23
310	0.21
311	0.18
312	0.2
313	0.21
314	0.21
315	0.2
316	0.17
317	0.18
318	0.18
319	0.19
320	0.2
321	0.21
322	0.26
323	0.26
324	0.25
325	0.26
326	0.26
327	0.26
328	0.25
329	0.32
330	0.28
331	0.29
332	0.33
333	0.39
334	0.43
335	0.51
336	0.56
337	0.56
338	0.63
339	0.71
340	0.71
341	0.7
342	0.68
343	0.61
344	0.6
345	0.55
346	0.49
347	0.44
348	0.37
349	0.32
350	0.32
351	0.28
352	0.19
353	0.17
354	0.15
355	0.11
356	0.11
357	0.11
358	0.1
359	0.11
360	0.11
361	0.11
362	0.13
363	0.13
364	0.15
365	0.16
366	0.14
367	0.14
368	0.16
369	0.17
370	0.19
371	0.19
372	0.21
373	0.25
374	0.29
375	0.29
376	0.28
377	0.25
378	0.25
379	0.28
380	0.25
381	0.19
382	0.16
383	0.17
384	0.16
385	0.16
386	0.15
387	0.11
388	0.14
389	0.17
390	0.18
391	0.26
392	0.31
393	0.36
394	0.4
395	0.47
396	0.48
397	0.52
398	0.54
399	0.49
400	0.51
401	0.52
402	0.47
403	0.4
404	0.36
405	0.3
406	0.27
407	0.23
408	0.18
409	0.11
410	0.1
411	0.1
412	0.1
413	0.1
414	0.07
415	0.06
416	0.07
417	0.1
418	0.09
419	0.09
420	0.11
421	0.1
422	0.12
423	0.12
424	0.14
425	0.12
426	0.12
427	0.13
428	0.12
429	0.12
430	0.11
431	0.1
432	0.08
433	0.1
434	0.1
435	0.08
436	0.08
437	0.08
438	0.07
439	0.07
440	0.08
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.04
446	0.05
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.06
455	0.1
456	0.11
457	0.12
458	0.13
459	0.14
460	0.14
461	0.15
462	0.14
463	0.1
464	0.09
465	0.09
466	0.07
467	0.07
468	0.07
469	0.06
470	0.07
471	0.09
472	0.09
473	0.1
474	0.1
475	0.12
476	0.14
477	0.19
478	0.22
479	0.21
480	0.25
481	0.27
482	0.28
483	0.25
484	0.24
485	0.22
486	0.19
487	0.18
488	0.15
489	0.14
490	0.13
491	0.13
492	0.12
493	0.09
494	0.08
495	0.08
496	0.08
497	0.11
498	0.11
499	0.11
500	0.12
501	0.12
502	0.12
503	0.14
504	0.17
505	0.19
506	0.23
507	0.23
508	0.23
509	0.23
510	0.22
511	0.21
512	0.18
513	0.14
514	0.11
515	0.11
516	0.11
517	0.1
518	0.1
519	0.09
520	0.09
521	0.08
522	0.11
523	0.18
524	0.21
525	0.28
526	0.3
527	0.32
528	0.34
529	0.36
530	0.34
531	0.29
532	0.3
533	0.28
534	0.32
535	0.33
536	0.34
537	0.36
538	0.41
539	0.38
540	0.39
541	0.35
542	0.32
543	0.33
544	0.31
545	0.28
546	0.24
547	0.23
548	0.18
549	0.18
550	0.14
551	0.09
552	0.08
553	0.07
554	0.06
555	0.06
556	0.06
557	0.06
558	0.07
559	0.08
560	0.09
561	0.1
562	0.12
563	0.13
564	0.15
565	0.14
566	0.13
567	0.13
568	0.14
569	0.19
570	0.23
571	0.22
572	0.22
573	0.25
574	0.25
575	0.26
576	0.23
577	0.19
578	0.14
579	0.14
580	0.14
581	0.11
582	0.12
583	0.11
584	0.11
585	0.09
586	0.08
587	0.08
588	0.08
589	0.09
590	0.11
591	0.12
592	0.15
593	0.15
594	0.16
595	0.18
596	0.18
597	0.23
598	0.21
599	0.21
600	0.2
601	0.2
602	0.2
603	0.17
604	0.15
605	0.13
606	0.15
607	0.17
608	0.18
609	0.18
610	0.18
611	0.17
612	0.17
613	0.16
614	0.15
615	0.12
616	0.11
617	0.11
618	0.12
619	0.12
620	0.11
621	0.08
622	0.07
623	0.06
624	0.05
625	0.03
626	0.03
627	0.03
628	0.03
629	0.03
630	0.03
631	0.04
632	0.05
633	0.06
634	0.09
635	0.14
636	0.15
637	0.16
638	0.18
639	0.22
640	0.27
641	0.29
642	0.31
643	0.29
644	0.3
645	0.29
646	0.28
647	0.27
648	0.21
649	0.18
650	0.15
651	0.13
652	0.12
653	0.12
654	0.13
655	0.11
656	0.14
657	0.14
658	0.13
659	0.14
660	0.13
661	0.14
662	0.14
663	0.14
664	0.12
665	0.11
666	0.11
667	0.09
668	0.08
669	0.08
670	0.07
671	0.06
672	0.07
673	0.06
674	0.06
675	0.06
676	0.07
677	0.06
678	0.06
679	0.06
680	0.05
681	0.05
682	0.04
683	0.04
684	0.03
685	0.04
686	0.04
687	0.04
688	0.04
689	0.04
690	0.04
691	0.04
692	0.04
693	0.03
694	0.04
695	0.05
696	0.06
697	0.07
698	0.07
699	0.06
700	0.06
701	0.07
702	0.09
703	0.09
704	0.12
705	0.11
706	0.12
707	0.12
708	0.12
709	0.12
710	0.12
711	0.15
712	0.13
713	0.15
714	0.14
715	0.13
716	0.13
717	0.12
718	0.13
719	0.1
720	0.09
721	0.07
722	0.08
723	0.09
724	0.1
725	0.1
726	0.08
727	0.08
728	0.11
729	0.11
730	0.13
731	0.16
732	0.16
733	0.19
734	0.21
735	0.22
736	0.22
737	0.27
738	0.27
739	0.27
740	0.26
741	0.27
742	0.25
743	0.25
744	0.25
745	0.21
746	0.19
747	0.15
748	0.15
749	0.11
750	0.12
751	0.1
752	0.06
753	0.06
754	0.06
755	0.05
756	0.04
757	0.05
758	0.04
759	0.05
760	0.05
761	0.06
762	0.07
763	0.09
764	0.11
765	0.15
766	0.16
767	0.18
768	0.28
769	0.33
770	0.39
771	0.43
772	0.45
773	0.46
774	0.54
775	0.55
776	0.46
777	0.42
778	0.35
779	0.3
780	0.29
781	0.25
782	0.15
783	0.13
784	0.12
785	0.11
786	0.1
787	0.09
788	0.07
789	0.06
790	0.05
791	0.04
792	0.05
793	0.05
794	0.05
795	0.06
796	0.07
797	0.07
798	0.08
799	0.08
800	0.07
801	0.08
802	0.09
803	0.08
804	0.07
805	0.07
806	0.07
807	0.08
808	0.08
809	0.13
810	0.19
811	0.22
812	0.24
813	0.25
814	0.33
815	0.34
816	0.34
817	0.37
818	0.36
819	0.37
820	0.42
821	0.51
822	0.47
823	0.51
824	0.51
825	0.44
826	0.43
827	0.41
828	0.37
829	0.36
830	0.36
831	0.33
832	0.35
833	0.35
834	0.3
835	0.3
836	0.29
837	0.22
838	0.19
839	0.19
840	0.23
841	0.26
842	0.27
843	0.27
844	0.3
845	0.29
846	0.33
847	0.39
848	0.43
849	0.47
850	0.52
851	0.56
852	0.55
853	0.54
854	0.54
855	0.48
856	0.41
857	0.4
858	0.42
859	0.42
860	0.4
861	0.39
862	0.36
863	0.34
864	0.34
865	0.37
866	0.36
867	0.36
868	0.39
869	0.41
870	0.41
871	0.42
872	0.38
873	0.28
874	0.2
875	0.19
876	0.14
877	0.13
878	0.13
879	0.13
880	0.12
881	0.13
882	0.14
883	0.14
884	0.14
885	0.13
886	0.15
887	0.16
888	0.19
889	0.23
890	0.23
891	0.24
892	0.25
893	0.25
894	0.22
895	0.21
896	0.21
897	0.17
898	0.16
899	0.13
900	0.13
901	0.15
902	0.17
903	0.2
904	0.25
905	0.28
906	0.29
907	0.33
908	0.43
909	0.42
910	0.44
911	0.46
912	0.44
913	0.44
914	0.49
915	0.48
916	0.4
917	0.39
918	0.36
919	0.33
920	0.33
921	0.3
922	0.3
923	0.27
924	0.28
925	0.31
926	0.31
927	0.29
928	0.26
929	0.26
930	0.25
931	0.27
932	0.25
933	0.21
934	0.22
935	0.21
936	0.19
937	0.17
938	0.13
939	0.11
940	0.11
941	0.11
942	0.15
943	0.17
944	0.18
945	0.21
946	0.23
947	0.23
948	0.24
949	0.24
950	0.2
951	0.19
952	0.18
953	0.15
954	0.15
955	0.15
956	0.14
957	0.14
958	0.17
959	0.16
960	0.18
961	0.21
962	0.2
963	0.21
964	0.25
965	0.25
966	0.24
967	0.29
968	0.29
969	0.27
970	0.28
971	0.27
972	0.26
973	0.25
974	0.23
975	0.18
976	0.16
977	0.16
978	0.15
979	0.17
980	0.15
981	0.14
982	0.14
983	0.12
984	0.12
985	0.13
986	0.11
987	0.1
988	0.1
989	0.1
990	0.1
991	0.1
992	0.1
993	0.1
994	0.1
995	0.1
996	0.09
997	0.1
998	0.1
999	0.11
1000	0.1
1001	0.1
1002	0.12
1003	0.12
1004	0.13
1005	0.13
1006	0.13
1007	0.13
1008	0.15
1009	0.14
1010	0.12
1011	0.15
1012	0.16
1013	0.15
1014	0.16
1015	0.19
1016	0.26
1017	0.33
1018	0.37
1019	0.33
1020	0.33
1021	0.33
1022	0.36
1023	0.35
1024	0.3
1025	0.28
1026	0.24
1027	0.26
1028	0.27
1029	0.26
1030	0.22
1031	0.2
1032	0.2
1033	0.16
1034	0.18
1035	0.16
1036	0.17
1037	0.17
1038	0.19
1039	0.2
1040	0.17
1041	0.2
1042	0.2
1043	0.21
1044	0.29
1045	0.38
1046	0.39
1047	0.41
1048	0.44
1049	0.41
1050	0.4
1051	0.4
1052	0.31
1053	0.21
1054	0.2
1055	0.16
1056	0.12
1057	0.11
1058	0.1
1059	0.08
1060	0.08
1061	0.1
1062	0.12
1063	0.14
1064	0.16
1065	0.16
1066	0.19
1067	0.23
1068	0.25
1069	0.24
1070	0.21
1071	0.19
1072	0.19
1073	0.21
1074	0.21
1075	0.22
1076	0.27
1077	0.29
1078	0.3
1079	0.31
1080	0.3
1081	0.31
1082	0.3
1083	0.26
1084	0.23
1085	0.2
1086	0.19
1087	0.18
1088	0.17
1089	0.14
1090	0.15
1091	0.14
1092	0.12
1093	0.11
1094	0.11
1095	0.14
1096	0.19
1097	0.21
1098	0.2
1099	0.22
1100	0.25
1101	0.26
1102	0.26
1103	0.25
1104	0.21
1105	0.19
1106	0.19
1107	0.18
1108	0.16
1109	0.23
1110	0.24
1111	0.25
1112	0.27
1113	0.35
1114	0.39
1115	0.43
1116	0.43
1117	0.39
1118	0.41
1119	0.37
1120	0.37
1121	0.28
1122	0.24
1123	0.21
1124	0.19
1125	0.16
1126	0.16
1127	0.25
1128	0.3
1129	0.38
1130	0.44
1131	0.47
1132	0.53
1133	0.63
1134	0.7
1135	0.7
1136	0.72
1137	0.75
1138	0.74
1139	0.8
1140	0.79
1141	0.77
1142	0.67
1143	0.66
1144	0.6
1145	0.54
1146	0.56
1147	0.53
1148	0.49
1149	0.51
1150	0.5
1151	0.43
1152	0.4
1153	0.36
1154	0.28
1155	0.21
1156	0.17
1157	0.09
1158	0.09
1159	0.08
1160	0.08
1161	0.08
1162	0.08
1163	0.1
1164	0.1
1165	0.13
1166	0.2
1167	0.29
1168	0.38
1169	0.48
1170	0.57
1171	0.64
1172	0.73
1173	0.78
1174	0.78
1175	0.79
1176	0.79
1177	0.79
1178	0.75
1179	0.77
1180	0.75
1181	0.77
1182	0.76
1183	0.74
1184	0.73
1185	0.73
1186	0.68
1187	0.62
1188	0.61
1189	0.52
1190	0.52
1191	0.47
1192	0.38
1193	0.29
1194	0.28
1195	0.23
1196	0.17
1197	0.16
1198	0.12
1199	0.11
1200	0.11
1201	0.11
1202	0.11
1203	0.11
1204	0.11
1205	0.12
1206	0.15
1207	0.13
1208	0.15
1209	0.17
1210	0.2
1211	0.2
1212	0.22
1213	0.26
1214	0.24
1215	0.26
1216	0.25
1217	0.23
1218	0.27
1219	0.31
1220	0.28
1221	0.22
1222	0.21
1223	0.21
1224	0.21
1225	0.2
1226	0.15
1227	0.13
1228	0.15
1229	0.17
1230	0.18
1231	0.17
1232	0.16
1233	0.19
1234	0.23
1235	0.22
1236	0.21
1237	0.21
1238	0.24
1239	0.24
1240	0.24
1241	0.2
1242	0.17
1243	0.18
1244	0.18
1245	0.15
1246	0.11
1247	0.11
1248	0.12
1249	0.13
1250	0.13
1251	0.12
1252	0.12
1253	0.12
1254	0.12

A0A5E3X9M9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer