Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5E3XGB3

Protein Details
Accession A0A5E3XGB3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-106KETGSVKKKATKKTAKKPAAKPKPKPKPKKAAPKPKPKKVKKAVPPPKPRFIKSBasic
196-217QTVKIINDHRRKRKLPRVVIPVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-111KETGSVKKKATKKTAKKPAAKPKPKPKPKKAAPKPKPKKVKKAVPPPKPRFIKSMMPPR
205-209RRKRK
Subcellular Location(s) mito 24.5, cyto_mito 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MFNLLSRRVAVTAARAPLRANSSPYVYQRSPIYRTFFSAPVLADPAAKAAAAKETGSVKKKATKKTAKKPAAKPKPKPKPKKAAPKPKPKKVKKAVPPPKPRFIKSMMPPRRPAYPYVIFATEYFARQSEVKASLSAHDVSREDVKALIAARGKAAGVAWHELPQFEKDKYRAEYEKRLEQYRLDLAAWQQSVEPQTVKIINDHRRKRKLPRVVIPVQGPKRPLSSYLLFSQEKMDEVKRALPPGSVPTEFHKELGRLWNNLSDEEKQPYAEKGKELMEAYSKAKAEYVADSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.29
4 0.32
5 0.37
6 0.34
7 0.32
8 0.3
9 0.33
10 0.38
11 0.42
12 0.45
13 0.39
14 0.4
15 0.42
16 0.45
17 0.44
18 0.44
19 0.47
20 0.4
21 0.44
22 0.45
23 0.4
24 0.35
25 0.33
26 0.28
27 0.23
28 0.25
29 0.2
30 0.17
31 0.15
32 0.14
33 0.12
34 0.11
35 0.09
36 0.07
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.12
41 0.17
42 0.24
43 0.29
44 0.31
45 0.32
46 0.39
47 0.46
48 0.53
49 0.58
50 0.63
51 0.69
52 0.77
53 0.85
54 0.86
55 0.89
56 0.9
57 0.9
58 0.91
59 0.9
60 0.9
61 0.9
62 0.91
63 0.92
64 0.93
65 0.92
66 0.92
67 0.92
68 0.93
69 0.92
70 0.93
71 0.92
72 0.93
73 0.93
74 0.91
75 0.93
76 0.9
77 0.9
78 0.89
79 0.89
80 0.88
81 0.89
82 0.89
83 0.89
84 0.91
85 0.87
86 0.86
87 0.82
88 0.74
89 0.67
90 0.62
91 0.6
92 0.57
93 0.61
94 0.61
95 0.6
96 0.62
97 0.59
98 0.61
99 0.54
100 0.48
101 0.45
102 0.39
103 0.37
104 0.34
105 0.33
106 0.27
107 0.25
108 0.26
109 0.19
110 0.16
111 0.13
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.13
121 0.13
122 0.15
123 0.15
124 0.12
125 0.11
126 0.11
127 0.12
128 0.13
129 0.13
130 0.11
131 0.1
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.11
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.08
147 0.1
148 0.11
149 0.11
150 0.12
151 0.13
152 0.15
153 0.14
154 0.17
155 0.17
156 0.22
157 0.25
158 0.29
159 0.32
160 0.34
161 0.42
162 0.43
163 0.49
164 0.47
165 0.48
166 0.44
167 0.39
168 0.38
169 0.32
170 0.29
171 0.22
172 0.19
173 0.17
174 0.2
175 0.19
176 0.16
177 0.13
178 0.13
179 0.14
180 0.14
181 0.14
182 0.09
183 0.12
184 0.14
185 0.15
186 0.17
187 0.24
188 0.33
189 0.42
190 0.51
191 0.59
192 0.65
193 0.72
194 0.78
195 0.8
196 0.81
197 0.81
198 0.81
199 0.8
200 0.76
201 0.75
202 0.7
203 0.7
204 0.63
205 0.57
206 0.49
207 0.42
208 0.4
209 0.36
210 0.32
211 0.29
212 0.28
213 0.29
214 0.3
215 0.35
216 0.32
217 0.31
218 0.32
219 0.26
220 0.24
221 0.24
222 0.22
223 0.18
224 0.2
225 0.26
226 0.25
227 0.27
228 0.27
229 0.24
230 0.24
231 0.27
232 0.31
233 0.26
234 0.25
235 0.28
236 0.35
237 0.34
238 0.34
239 0.32
240 0.27
241 0.3
242 0.39
243 0.37
244 0.32
245 0.34
246 0.38
247 0.36
248 0.37
249 0.37
250 0.3
251 0.29
252 0.32
253 0.31
254 0.27
255 0.27
256 0.3
257 0.33
258 0.32
259 0.31
260 0.3
261 0.31
262 0.34
263 0.33
264 0.31
265 0.29
266 0.3
267 0.3
268 0.32
269 0.3
270 0.26
271 0.26
272 0.25
273 0.22