Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1V7K3

Protein Details
Accession H1V7K3    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-22QDPNLYGQPPPKKRKTSTAFHydrophilic
290-321DERIRTETSRKERENKREARRREVEQRRKDVEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
187-198RADKERLERQRR
299-327RKERENKREARRREVEQRRKDVEAKRAKK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 11.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025066  CCDC174-like  
KEGG chig:CH63R_14155  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13300  DUF4078  
Amino Acid Sequences MPQDPNLYGQPPPKKRKTSTAFGNSLDFTAQLTSLMSASPTTTSAPARPRPSRTKDLVLGGARSKARGGGSGSSVPADASNKLNLKEPLGTEEDSSNLARARRRMEEKARLYAAMKRGDYVPKENESAPLIDFDRKWAESEADKDNKAGTSSGSGSGSDDEADQDKDEGNVIIEYEDEFGRLRRGTRADKERLERQRRRGLLGAEELERMSARPAAPAKLLYGDAIQTMAFNPEDPDRMEELASKRDRSATPPEARHYDADSEIRTKGTGFYKFSKDEETRKREFQNLEDERIRTETSRKERENKREARRREVEQRRKDVEAKRAKKLADSFLDGLAAGMNSNQSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.74
3 0.8
4 0.8
5 0.79
6 0.79
7 0.79
8 0.75
9 0.67
10 0.65
11 0.55
12 0.48
13 0.38
14 0.28
15 0.18
16 0.14
17 0.12
18 0.08
19 0.08
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.07
25 0.08
26 0.08
27 0.09
28 0.1
29 0.13
30 0.15
31 0.2
32 0.28
33 0.35
34 0.43
35 0.48
36 0.55
37 0.63
38 0.69
39 0.72
40 0.7
41 0.7
42 0.66
43 0.63
44 0.62
45 0.54
46 0.49
47 0.42
48 0.41
49 0.34
50 0.3
51 0.26
52 0.22
53 0.2
54 0.2
55 0.21
56 0.18
57 0.22
58 0.23
59 0.23
60 0.21
61 0.2
62 0.17
63 0.15
64 0.14
65 0.12
66 0.12
67 0.17
68 0.2
69 0.21
70 0.26
71 0.25
72 0.26
73 0.27
74 0.26
75 0.24
76 0.25
77 0.25
78 0.2
79 0.2
80 0.18
81 0.17
82 0.17
83 0.14
84 0.13
85 0.16
86 0.18
87 0.21
88 0.25
89 0.31
90 0.37
91 0.44
92 0.51
93 0.58
94 0.59
95 0.62
96 0.58
97 0.52
98 0.47
99 0.44
100 0.4
101 0.36
102 0.31
103 0.26
104 0.27
105 0.31
106 0.32
107 0.33
108 0.31
109 0.28
110 0.3
111 0.29
112 0.28
113 0.25
114 0.23
115 0.18
116 0.16
117 0.14
118 0.15
119 0.14
120 0.15
121 0.17
122 0.16
123 0.17
124 0.16
125 0.17
126 0.16
127 0.2
128 0.25
129 0.25
130 0.25
131 0.24
132 0.23
133 0.22
134 0.21
135 0.17
136 0.1
137 0.09
138 0.1
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.1
143 0.11
144 0.1
145 0.08
146 0.07
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.07
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.12
171 0.17
172 0.22
173 0.3
174 0.38
175 0.42
176 0.47
177 0.51
178 0.56
179 0.62
180 0.67
181 0.66
182 0.66
183 0.69
184 0.65
185 0.64
186 0.59
187 0.5
188 0.43
189 0.39
190 0.33
191 0.25
192 0.24
193 0.2
194 0.16
195 0.14
196 0.11
197 0.08
198 0.09
199 0.08
200 0.12
201 0.13
202 0.14
203 0.16
204 0.16
205 0.16
206 0.15
207 0.15
208 0.11
209 0.1
210 0.09
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.08
220 0.09
221 0.11
222 0.11
223 0.14
224 0.14
225 0.15
226 0.15
227 0.18
228 0.19
229 0.26
230 0.28
231 0.26
232 0.25
233 0.29
234 0.3
235 0.3
236 0.37
237 0.38
238 0.43
239 0.46
240 0.5
241 0.5
242 0.51
243 0.48
244 0.41
245 0.35
246 0.3
247 0.28
248 0.25
249 0.24
250 0.22
251 0.21
252 0.18
253 0.16
254 0.18
255 0.21
256 0.25
257 0.27
258 0.31
259 0.37
260 0.39
261 0.4
262 0.44
263 0.42
264 0.47
265 0.53
266 0.55
267 0.55
268 0.59
269 0.61
270 0.6
271 0.59
272 0.54
273 0.54
274 0.51
275 0.53
276 0.51
277 0.48
278 0.43
279 0.42
280 0.39
281 0.3
282 0.31
283 0.34
284 0.39
285 0.49
286 0.53
287 0.61
288 0.7
289 0.78
290 0.83
291 0.83
292 0.85
293 0.85
294 0.85
295 0.86
296 0.83
297 0.81
298 0.81
299 0.82
300 0.82
301 0.82
302 0.85
303 0.79
304 0.78
305 0.77
306 0.74
307 0.73
308 0.73
309 0.7
310 0.69
311 0.7
312 0.65
313 0.64
314 0.62
315 0.6
316 0.55
317 0.55
318 0.48
319 0.43
320 0.42
321 0.34
322 0.29
323 0.21
324 0.15
325 0.08
326 0.07