Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6FTZ5

Protein Details
Accession A0A5N6FTZ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-57SIPSTGPPPKPLRKNRAGQTKQGMTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1216-1250PPTGPIKRPQQPGSRGGRRGGLGMKRGGAPSHGER
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 4, cyto 2, pero 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR034397  Prp24_RRM1  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR031766  RRM_occluded  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF16842  RRM_occluded  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12296  RRM1_Prp24  
cd12299  RRM4_Prp24  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MMDINSLLSPQDSNSQSGRSSPTVGPTAVSNTSIPSTGPPPKPLRKNRAGQTKQGMTSSPLAQHVFAPPHVSEPSPPAISPTVGPSMSGGGTPPAADLPPPRQPSTPGMDTLADLASMQHHQPQRSSAPLLRSTESYESQLSPSTMYPHVSSVSHNTPTPRSSFDIAMSDGPREAARRNYLDTSLVPNAQRLATELFAQIQENPQSYDAHVNFVRLLHAGFVNHVYPPNNPDIHGDPRNYDLLKDMRTAREEMDKLFAMGEDLWAEWIQDESMLAQTVDERIAVMELCQRSVEEEYGSTKLWTIYGEWVLYLYNSAHGEGGQHQWTEEDRMIGREVFSWQSVLDVWQRGAEATRWRIHDSHMVWDRLLDLHVQDTARNPTQEKIGHVRGLFDIRLQTPHANWDQTFQTFSGFISTYYNANYETIMADTAGRYATACKEKYSAREEFEIRLCKAAESGNLTQEWTIFTEYIEWEVINNRRKRHTNFDLVNAVYQRAVLRFPTDTNMWEDFVMFLIDESMHGNANTTTISTLDRATRHCPCCGTLWSQYLLSSEREGQSFAKIADIKHKATSTGLLDAGGMEEVLKVHTAWCSYLRRRAFMSDSTDEDLDVAEVGIRSAIESVQELGEKKYGRSYQGDPLFRLERIYIRYLSESGSWDSARETFKGLVGRRGNSYEFWLTYYEWELISWSKFVQGEATVDAARRTPNPSYATAVLKQAIKRTDLDWPEKIMQTYIAHCEDYEDSDELQLAILETRKAMRAVTTRRERDARELAAQQTQQQAAVAEEAPHPEKRKREEETTANGLPTKRARGDEDAPSTEAEPAALRRDRENATVVVKNLPHQITEHKVRQFFRHCGTINSVKMFPGDDGNSEVAVIEFESKDEALVAQTRDQKLIDENTIEVQIGLPSTLFVTNFPPEANEKYIRDLFRECGEIIDVRFPSLKYNTHRRFCYVQFRTAQAAQNATKLDGTTVGKHLKLVAKISDPSRKQDRHGPIYEGREIHVSNIDWKASEADLKELFSQYGTVELVRIPKKVDGGSKGFGYVVFSSKEEATAALAKHEQEYRGRPLHVRISTPQSSKRNATTILSRVGKSQSPAAEMNGNKGSTDADMPSSDRTARTLGLMNIPDTVNDARIRTLVEPYGKLIKIVLRPDHQGAIVEFADVNHAGRASLELEGQEISPGRKLHVGTVPEMLKQSAETRDGPTQPSKPKEKQGGFLPPTGPIKRPQQPGSRGGRRGGLGMKRGGAPSHGERRAHNGENTMTTTMMTTDSAPSAEGGKTKKSNDDFRAMIQRGREN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.26
3 0.26
4 0.3
5 0.34
6 0.28
7 0.32
8 0.3
9 0.33
10 0.34
11 0.33
12 0.3
13 0.27
14 0.29
15 0.25
16 0.26
17 0.2
18 0.19
19 0.2
20 0.2
21 0.18
22 0.17
23 0.22
24 0.29
25 0.33
26 0.39
27 0.47
28 0.57
29 0.67
30 0.74
31 0.78
32 0.78
33 0.84
34 0.86
35 0.88
36 0.83
37 0.82
38 0.81
39 0.78
40 0.72
41 0.64
42 0.56
43 0.48
44 0.48
45 0.42
46 0.35
47 0.32
48 0.3
49 0.29
50 0.29
51 0.31
52 0.29
53 0.26
54 0.27
55 0.23
56 0.26
57 0.27
58 0.26
59 0.22
60 0.24
61 0.29
62 0.26
63 0.26
64 0.26
65 0.26
66 0.26
67 0.25
68 0.24
69 0.23
70 0.21
71 0.22
72 0.19
73 0.19
74 0.18
75 0.17
76 0.13
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.11
84 0.15
85 0.2
86 0.29
87 0.34
88 0.36
89 0.36
90 0.4
91 0.44
92 0.48
93 0.45
94 0.38
95 0.36
96 0.33
97 0.32
98 0.3
99 0.24
100 0.16
101 0.12
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.12
106 0.17
107 0.22
108 0.24
109 0.26
110 0.31
111 0.33
112 0.36
113 0.41
114 0.39
115 0.41
116 0.45
117 0.47
118 0.44
119 0.41
120 0.41
121 0.4
122 0.37
123 0.34
124 0.3
125 0.27
126 0.27
127 0.28
128 0.23
129 0.2
130 0.19
131 0.2
132 0.2
133 0.2
134 0.2
135 0.19
136 0.21
137 0.2
138 0.21
139 0.24
140 0.28
141 0.29
142 0.3
143 0.32
144 0.34
145 0.36
146 0.36
147 0.33
148 0.32
149 0.32
150 0.31
151 0.3
152 0.3
153 0.29
154 0.3
155 0.27
156 0.24
157 0.21
158 0.2
159 0.18
160 0.17
161 0.19
162 0.21
163 0.26
164 0.29
165 0.33
166 0.35
167 0.36
168 0.36
169 0.34
170 0.34
171 0.31
172 0.32
173 0.28
174 0.26
175 0.26
176 0.24
177 0.22
178 0.18
179 0.18
180 0.15
181 0.16
182 0.16
183 0.16
184 0.16
185 0.17
186 0.15
187 0.17
188 0.19
189 0.19
190 0.2
191 0.2
192 0.2
193 0.21
194 0.29
195 0.24
196 0.27
197 0.26
198 0.25
199 0.25
200 0.24
201 0.24
202 0.15
203 0.15
204 0.11
205 0.12
206 0.11
207 0.11
208 0.13
209 0.13
210 0.13
211 0.16
212 0.15
213 0.16
214 0.19
215 0.24
216 0.23
217 0.23
218 0.26
219 0.28
220 0.35
221 0.38
222 0.36
223 0.32
224 0.34
225 0.37
226 0.34
227 0.29
228 0.26
229 0.26
230 0.26
231 0.29
232 0.3
233 0.29
234 0.32
235 0.33
236 0.3
237 0.34
238 0.33
239 0.3
240 0.3
241 0.26
242 0.24
243 0.23
244 0.2
245 0.13
246 0.12
247 0.11
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.06
254 0.07
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.06
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.11
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.12
277 0.14
278 0.16
279 0.16
280 0.12
281 0.12
282 0.15
283 0.16
284 0.17
285 0.15
286 0.14
287 0.13
288 0.12
289 0.12
290 0.11
291 0.13
292 0.14
293 0.14
294 0.13
295 0.13
296 0.12
297 0.12
298 0.11
299 0.07
300 0.09
301 0.09
302 0.1
303 0.09
304 0.09
305 0.11
306 0.12
307 0.16
308 0.15
309 0.14
310 0.14
311 0.15
312 0.16
313 0.19
314 0.17
315 0.15
316 0.14
317 0.16
318 0.17
319 0.17
320 0.16
321 0.13
322 0.15
323 0.14
324 0.14
325 0.12
326 0.1
327 0.11
328 0.11
329 0.12
330 0.13
331 0.13
332 0.13
333 0.13
334 0.14
335 0.13
336 0.14
337 0.15
338 0.18
339 0.22
340 0.26
341 0.28
342 0.31
343 0.31
344 0.33
345 0.37
346 0.32
347 0.36
348 0.38
349 0.37
350 0.34
351 0.33
352 0.31
353 0.24
354 0.23
355 0.14
356 0.08
357 0.08
358 0.11
359 0.11
360 0.1
361 0.13
362 0.18
363 0.2
364 0.22
365 0.22
366 0.21
367 0.26
368 0.28
369 0.29
370 0.3
371 0.31
372 0.33
373 0.32
374 0.32
375 0.29
376 0.29
377 0.25
378 0.19
379 0.18
380 0.16
381 0.17
382 0.18
383 0.18
384 0.15
385 0.21
386 0.22
387 0.22
388 0.21
389 0.23
390 0.23
391 0.22
392 0.23
393 0.18
394 0.16
395 0.14
396 0.13
397 0.13
398 0.11
399 0.1
400 0.12
401 0.13
402 0.12
403 0.13
404 0.14
405 0.11
406 0.11
407 0.11
408 0.09
409 0.08
410 0.08
411 0.07
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.05
418 0.05
419 0.06
420 0.11
421 0.17
422 0.18
423 0.19
424 0.22
425 0.25
426 0.3
427 0.34
428 0.33
429 0.3
430 0.34
431 0.34
432 0.34
433 0.37
434 0.37
435 0.31
436 0.3
437 0.27
438 0.22
439 0.22
440 0.2
441 0.16
442 0.18
443 0.19
444 0.18
445 0.18
446 0.18
447 0.17
448 0.16
449 0.15
450 0.1
451 0.1
452 0.08
453 0.08
454 0.09
455 0.09
456 0.1
457 0.1
458 0.08
459 0.07
460 0.12
461 0.19
462 0.25
463 0.29
464 0.31
465 0.38
466 0.45
467 0.5
468 0.55
469 0.56
470 0.57
471 0.56
472 0.58
473 0.55
474 0.49
475 0.46
476 0.36
477 0.29
478 0.19
479 0.18
480 0.13
481 0.09
482 0.1
483 0.08
484 0.09
485 0.1
486 0.11
487 0.13
488 0.13
489 0.14
490 0.18
491 0.18
492 0.17
493 0.16
494 0.15
495 0.12
496 0.12
497 0.11
498 0.06
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.06
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.06
515 0.07
516 0.08
517 0.1
518 0.12
519 0.15
520 0.2
521 0.27
522 0.28
523 0.29
524 0.29
525 0.28
526 0.3
527 0.3
528 0.3
529 0.26
530 0.26
531 0.26
532 0.25
533 0.24
534 0.21
535 0.2
536 0.16
537 0.13
538 0.13
539 0.13
540 0.13
541 0.14
542 0.13
543 0.13
544 0.13
545 0.12
546 0.13
547 0.13
548 0.13
549 0.21
550 0.24
551 0.24
552 0.25
553 0.25
554 0.22
555 0.21
556 0.24
557 0.16
558 0.15
559 0.13
560 0.11
561 0.1
562 0.1
563 0.09
564 0.06
565 0.05
566 0.03
567 0.03
568 0.03
569 0.03
570 0.04
571 0.03
572 0.04
573 0.05
574 0.06
575 0.07
576 0.11
577 0.17
578 0.2
579 0.27
580 0.28
581 0.29
582 0.3
583 0.32
584 0.3
585 0.28
586 0.32
587 0.26
588 0.27
589 0.27
590 0.25
591 0.22
592 0.19
593 0.15
594 0.09
595 0.07
596 0.04
597 0.03
598 0.03
599 0.03
600 0.03
601 0.03
602 0.03
603 0.03
604 0.03
605 0.03
606 0.04
607 0.04
608 0.05
609 0.06
610 0.07
611 0.07
612 0.11
613 0.11
614 0.11
615 0.16
616 0.17
617 0.18
618 0.21
619 0.24
620 0.28
621 0.35
622 0.36
623 0.32
624 0.34
625 0.33
626 0.29
627 0.27
628 0.19
629 0.15
630 0.16
631 0.18
632 0.15
633 0.15
634 0.16
635 0.15
636 0.16
637 0.14
638 0.13
639 0.11
640 0.12
641 0.11
642 0.1
643 0.11
644 0.13
645 0.13
646 0.12
647 0.12
648 0.11
649 0.13
650 0.18
651 0.18
652 0.23
653 0.25
654 0.25
655 0.25
656 0.27
657 0.26
658 0.21
659 0.24
660 0.18
661 0.15
662 0.15
663 0.15
664 0.13
665 0.13
666 0.14
667 0.11
668 0.1
669 0.09
670 0.09
671 0.09
672 0.09
673 0.09
674 0.07
675 0.08
676 0.09
677 0.09
678 0.09
679 0.08
680 0.09
681 0.09
682 0.1
683 0.08
684 0.09
685 0.09
686 0.09
687 0.09
688 0.09
689 0.12
690 0.12
691 0.17
692 0.19
693 0.2
694 0.23
695 0.24
696 0.26
697 0.24
698 0.24
699 0.21
700 0.21
701 0.2
702 0.21
703 0.2
704 0.19
705 0.19
706 0.19
707 0.24
708 0.26
709 0.29
710 0.26
711 0.28
712 0.29
713 0.29
714 0.28
715 0.21
716 0.19
717 0.16
718 0.16
719 0.16
720 0.15
721 0.14
722 0.14
723 0.15
724 0.13
725 0.13
726 0.14
727 0.11
728 0.1
729 0.1
730 0.1
731 0.08
732 0.08
733 0.06
734 0.04
735 0.04
736 0.05
737 0.05
738 0.05
739 0.06
740 0.07
741 0.08
742 0.08
743 0.11
744 0.17
745 0.23
746 0.32
747 0.41
748 0.42
749 0.46
750 0.49
751 0.47
752 0.47
753 0.47
754 0.4
755 0.35
756 0.35
757 0.33
758 0.33
759 0.32
760 0.27
761 0.24
762 0.22
763 0.18
764 0.15
765 0.14
766 0.1
767 0.11
768 0.09
769 0.08
770 0.08
771 0.1
772 0.12
773 0.14
774 0.17
775 0.2
776 0.25
777 0.3
778 0.37
779 0.4
780 0.44
781 0.49
782 0.51
783 0.53
784 0.54
785 0.48
786 0.41
787 0.38
788 0.33
789 0.29
790 0.26
791 0.24
792 0.2
793 0.21
794 0.24
795 0.28
796 0.32
797 0.35
798 0.37
799 0.34
800 0.33
801 0.31
802 0.28
803 0.23
804 0.18
805 0.12
806 0.09
807 0.08
808 0.13
809 0.15
810 0.15
811 0.16
812 0.21
813 0.23
814 0.24
815 0.26
816 0.22
817 0.24
818 0.25
819 0.25
820 0.23
821 0.22
822 0.22
823 0.24
824 0.23
825 0.19
826 0.18
827 0.22
828 0.24
829 0.31
830 0.36
831 0.35
832 0.4
833 0.41
834 0.47
835 0.5
836 0.48
837 0.45
838 0.46
839 0.42
840 0.4
841 0.44
842 0.44
843 0.4
844 0.37
845 0.34
846 0.27
847 0.27
848 0.25
849 0.19
850 0.15
851 0.13
852 0.11
853 0.13
854 0.13
855 0.13
856 0.12
857 0.11
858 0.08
859 0.07
860 0.07
861 0.06
862 0.05
863 0.05
864 0.06
865 0.06
866 0.06
867 0.06
868 0.06
869 0.06
870 0.09
871 0.1
872 0.14
873 0.2
874 0.21
875 0.22
876 0.22
877 0.22
878 0.22
879 0.24
880 0.21
881 0.17
882 0.16
883 0.16
884 0.16
885 0.15
886 0.12
887 0.09
888 0.07
889 0.06
890 0.06
891 0.04
892 0.04
893 0.05
894 0.06
895 0.06
896 0.07
897 0.1
898 0.11
899 0.12
900 0.12
901 0.12
902 0.14
903 0.18
904 0.21
905 0.22
906 0.22
907 0.27
908 0.32
909 0.31
910 0.32
911 0.31
912 0.28
913 0.26
914 0.27
915 0.22
916 0.18
917 0.18
918 0.17
919 0.15
920 0.18
921 0.16
922 0.15
923 0.16
924 0.16
925 0.19
926 0.21
927 0.26
928 0.28
929 0.39
930 0.47
931 0.53
932 0.55
933 0.55
934 0.57
935 0.57
936 0.61
937 0.54
938 0.53
939 0.48
940 0.49
941 0.49
942 0.47
943 0.46
944 0.37
945 0.38
946 0.31
947 0.32
948 0.29
949 0.26
950 0.22
951 0.18
952 0.16
953 0.15
954 0.16
955 0.16
956 0.2
957 0.22
958 0.22
959 0.22
960 0.26
961 0.26
962 0.26
963 0.27
964 0.25
965 0.25
966 0.29
967 0.34
968 0.39
969 0.36
970 0.41
971 0.47
972 0.47
973 0.47
974 0.53
975 0.57
976 0.57
977 0.59
978 0.58
979 0.54
980 0.56
981 0.57
982 0.48
983 0.4
984 0.35
985 0.31
986 0.26
987 0.24
988 0.2
989 0.2
990 0.22
991 0.21
992 0.18
993 0.18
994 0.19
995 0.15
996 0.18
997 0.14
998 0.16
999 0.17
1000 0.18
1001 0.19
1002 0.18
1003 0.17
1004 0.14
1005 0.14
1006 0.1
1007 0.11
1008 0.1
1009 0.08
1010 0.08
1011 0.1
1012 0.17
1013 0.18
1014 0.19
1015 0.19
1016 0.21
1017 0.24
1018 0.26
1019 0.31
1020 0.29
1021 0.32
1022 0.34
1023 0.33
1024 0.31
1025 0.29
1026 0.25
1027 0.23
1028 0.18
1029 0.16
1030 0.15
1031 0.15
1032 0.16
1033 0.16
1034 0.17
1035 0.14
1036 0.12
1037 0.12
1038 0.15
1039 0.14
1040 0.15
1041 0.16
1042 0.16
1043 0.19
1044 0.21
1045 0.22
1046 0.23
1047 0.28
1048 0.34
1049 0.37
1050 0.38
1051 0.38
1052 0.41
1053 0.48
1054 0.45
1055 0.44
1056 0.41
1057 0.45
1058 0.5
1059 0.52
1060 0.55
1061 0.52
1062 0.54
1063 0.55
1064 0.54
1065 0.51
1066 0.46
1067 0.45
1068 0.43
1069 0.41
1070 0.44
1071 0.42
1072 0.39
1073 0.37
1074 0.38
1075 0.37
1076 0.32
1077 0.34
1078 0.27
1079 0.28
1080 0.28
1081 0.28
1082 0.31
1083 0.29
1084 0.32
1085 0.31
1086 0.29
1087 0.25
1088 0.24
1089 0.23
1090 0.17
1091 0.19
1092 0.14
1093 0.12
1094 0.13
1095 0.15
1096 0.17
1097 0.18
1098 0.18
1099 0.17
1100 0.18
1101 0.18
1102 0.17
1103 0.18
1104 0.2
1105 0.2
1106 0.25
1107 0.25
1108 0.24
1109 0.24
1110 0.24
1111 0.21
1112 0.21
1113 0.19
1114 0.17
1115 0.17
1116 0.17
1117 0.16
1118 0.17
1119 0.19
1120 0.17
1121 0.2
1122 0.22
1123 0.24
1124 0.24
1125 0.26
1126 0.33
1127 0.31
1128 0.29
1129 0.28
1130 0.28
1131 0.3
1132 0.36
1133 0.39
1134 0.35
1135 0.4
1136 0.42
1137 0.42
1138 0.37
1139 0.34
1140 0.27
1141 0.26
1142 0.22
1143 0.18
1144 0.15
1145 0.13
1146 0.15
1147 0.13
1148 0.14
1149 0.1
1150 0.1
1151 0.09
1152 0.09
1153 0.11
1154 0.09
1155 0.1
1156 0.1
1157 0.09
1158 0.1
1159 0.11
1160 0.11
1161 0.11
1162 0.12
1163 0.12
1164 0.16
1165 0.17
1166 0.18
1167 0.21
1168 0.22
1169 0.26
1170 0.31
1171 0.32
1172 0.3
1173 0.36
1174 0.36
1175 0.33
1176 0.34
1177 0.28
1178 0.22
1179 0.21
1180 0.23
1181 0.21
1182 0.23
1183 0.23
1184 0.27
1185 0.34
1186 0.36
1187 0.39
1188 0.42
1189 0.45
1190 0.5
1191 0.57
1192 0.61
1193 0.62
1194 0.69
1195 0.75
1196 0.72
1197 0.71
1198 0.7
1199 0.73
1200 0.67
1201 0.64
1202 0.56
1203 0.51
1204 0.54
1205 0.5
1206 0.44
1207 0.39
1208 0.46
1209 0.5
1210 0.57
1211 0.59
1212 0.62
1213 0.66
1214 0.73
1215 0.77
1216 0.77
1217 0.73
1218 0.67
1219 0.64
1220 0.55
1221 0.53
1222 0.51
1223 0.47
1224 0.43
1225 0.42
1226 0.42
1227 0.39
1228 0.4
1229 0.36
1230 0.3
1231 0.3
1232 0.33
1233 0.4
1234 0.44
1235 0.43
1236 0.43
1237 0.51
1238 0.57
1239 0.56
1240 0.51
1241 0.46
1242 0.43
1243 0.45
1244 0.47
1245 0.39
1246 0.31
1247 0.26
1248 0.23
1249 0.19
1250 0.16
1251 0.13
1252 0.11
1253 0.12
1254 0.13
1255 0.13
1256 0.13
1257 0.12
1258 0.14
1259 0.15
1260 0.18
1261 0.19
1262 0.27
1263 0.32
1264 0.35
1265 0.44
1266 0.49
1267 0.57
1268 0.58
1269 0.63
1270 0.57
1271 0.57
1272 0.65
1273 0.58
1274 0.54