Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6G7U3

Protein Details
Accession A0A5N6G7U3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-123GVAPRAKMNQQRARRFRSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
408-441RRRRQVEERKAANEKRRKEEAQAREERARKRRRS
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 7, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSNKYPKIISPVIEEQPYEINGEQIPVDATRPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPPPANEQEMMLEVFKYTDRVVNMVRPRKVLMIAVDGVAPRAKMNQQRARRFRSAQEARETDEKKEEFRKQFLKKSKGDLEVQEEVIQKTWDSNVITPGTPFMDILAASLRYWIAYKLNTDPAWEKLKIIISDATVPGEGEHKIMEFVRSQRADPEHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPYFRVLREDVFFQESKARTCHLCGQTGHKAEECRGQAKEKNGQFDEKGKGSSLKPFIWLNVSILREYLAVELYVPHQPFPFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIRENGIDTLIAIWRDNIPVMGGYLTKDGHVDFKNAQLILQGLAKQEDAIFRRRRQVEERKAANEKRRKEEAQAREERARKRRRSSPNYEGAEPPASNRARGGGGDAAPPNDLELITPGRGNLSRETRELTHSMVVNRGAVYRANMANKSAAAILKSKLMKGSEDGDAAEESSPIPDADGPSDNKLEPTSPSVLGKRKPDEPEGETETPGNDTESTPKPPKNDEMPPDTVRLWEEGYADRYYEQKFGVDPQDIEFRHKVARAYAEGLAWVLEYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDIGDMELSFEKGTPFKPFEQLMGVLPASSNHAIPEVFHSLMQDPNSEIIDFYPEDFAVDLNGKKFAWQGVILLPFIDEKRLLAAMEKKYPLLSDEEKARNTVGRDVLLLSDGHPLYQDLVANFYSKKQGAPKYKLNMRISEGLAGKVERNETYIPHSSLVSSLEEYGMPTLDDDRSLTVNYEIPKSSHIHKSMLLRGVKFPPPALDNADIQATRSKAQHSGRSFGGAPLRNGHGNRGGRINYAGDRPNPFAAHLDPSFMPLGNTGNQMPSGWIPPAPGSGNFSRGPPPPPHGGASHQQRNNYGSGYPQPQGYQQANYGRGDYYGRGQQGHQHQGFHGSQPGQYSGRSSGYGGQEHRGGGHQRGGYQGHGQGRDYYSSRNQGGYGRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.48
3 0.52
4 0.52
5 0.47
6 0.44
7 0.46
8 0.47
9 0.44
10 0.42
11 0.35
12 0.34
13 0.33
14 0.28
15 0.21
16 0.18
17 0.16
18 0.17
19 0.16
20 0.13
21 0.14
22 0.11
23 0.13
24 0.14
25 0.16
26 0.24
27 0.26
28 0.28
29 0.29
30 0.31
31 0.32
32 0.31
33 0.33
34 0.28
35 0.28
36 0.26
37 0.24
38 0.22
39 0.19
40 0.17
41 0.12
42 0.09
43 0.07
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.1
48 0.12
49 0.17
50 0.2
51 0.2
52 0.28
53 0.36
54 0.44
55 0.5
56 0.5
57 0.54
58 0.57
59 0.6
60 0.52
61 0.46
62 0.39
63 0.34
64 0.32
65 0.24
66 0.18
67 0.14
68 0.14
69 0.12
70 0.12
71 0.11
72 0.14
73 0.14
74 0.18
75 0.2
76 0.28
77 0.37
78 0.44
79 0.46
80 0.45
81 0.46
82 0.45
83 0.44
84 0.39
85 0.32
86 0.29
87 0.27
88 0.25
89 0.24
90 0.21
91 0.2
92 0.18
93 0.15
94 0.1
95 0.13
96 0.19
97 0.26
98 0.36
99 0.45
100 0.54
101 0.65
102 0.74
103 0.79
104 0.8
105 0.77
106 0.73
107 0.75
108 0.74
109 0.7
110 0.71
111 0.64
112 0.6
113 0.65
114 0.6
115 0.52
116 0.52
117 0.46
118 0.42
119 0.49
120 0.54
121 0.51
122 0.58
123 0.64
124 0.64
125 0.72
126 0.77
127 0.78
128 0.73
129 0.76
130 0.75
131 0.71
132 0.68
133 0.63
134 0.59
135 0.54
136 0.5
137 0.45
138 0.39
139 0.34
140 0.3
141 0.26
142 0.19
143 0.16
144 0.16
145 0.16
146 0.16
147 0.17
148 0.2
149 0.22
150 0.22
151 0.21
152 0.22
153 0.19
154 0.17
155 0.15
156 0.11
157 0.1
158 0.09
159 0.1
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.11
164 0.1
165 0.09
166 0.1
167 0.11
168 0.12
169 0.13
170 0.16
171 0.2
172 0.27
173 0.27
174 0.29
175 0.3
176 0.32
177 0.36
178 0.33
179 0.29
180 0.26
181 0.32
182 0.29
183 0.29
184 0.26
185 0.21
186 0.24
187 0.24
188 0.21
189 0.16
190 0.15
191 0.13
192 0.13
193 0.12
194 0.09
195 0.09
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.11
200 0.13
201 0.16
202 0.24
203 0.25
204 0.26
205 0.3
206 0.33
207 0.37
208 0.38
209 0.43
210 0.41
211 0.44
212 0.45
213 0.42
214 0.47
215 0.41
216 0.37
217 0.29
218 0.24
219 0.21
220 0.21
221 0.18
222 0.11
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.08
227 0.06
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.06
236 0.08
237 0.1
238 0.11
239 0.15
240 0.15
241 0.17
242 0.19
243 0.21
244 0.21
245 0.24
246 0.23
247 0.2
248 0.26
249 0.25
250 0.25
251 0.24
252 0.24
253 0.21
254 0.24
255 0.33
256 0.29
257 0.34
258 0.33
259 0.39
260 0.45
261 0.48
262 0.46
263 0.39
264 0.37
265 0.33
266 0.39
267 0.34
268 0.3
269 0.28
270 0.32
271 0.34
272 0.38
273 0.45
274 0.41
275 0.46
276 0.44
277 0.45
278 0.42
279 0.44
280 0.43
281 0.36
282 0.34
283 0.27
284 0.29
285 0.27
286 0.32
287 0.31
288 0.26
289 0.27
290 0.27
291 0.27
292 0.27
293 0.26
294 0.21
295 0.21
296 0.22
297 0.19
298 0.18
299 0.17
300 0.14
301 0.14
302 0.12
303 0.07
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.08
308 0.12
309 0.12
310 0.12
311 0.12
312 0.13
313 0.13
314 0.18
315 0.19
316 0.15
317 0.16
318 0.16
319 0.17
320 0.18
321 0.19
322 0.13
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.08
327 0.07
328 0.06
329 0.05
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.07
341 0.08
342 0.12
343 0.15
344 0.16
345 0.15
346 0.16
347 0.16
348 0.15
349 0.15
350 0.1
351 0.06
352 0.06
353 0.07
354 0.07
355 0.06
356 0.07
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.07
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.08
368 0.08
369 0.07
370 0.08
371 0.08
372 0.13
373 0.13
374 0.15
375 0.14
376 0.18
377 0.2
378 0.2
379 0.19
380 0.15
381 0.14
382 0.13
383 0.13
384 0.11
385 0.09
386 0.1
387 0.1
388 0.09
389 0.1
390 0.13
391 0.13
392 0.2
393 0.26
394 0.28
395 0.37
396 0.39
397 0.43
398 0.48
399 0.57
400 0.59
401 0.63
402 0.65
403 0.62
404 0.68
405 0.69
406 0.69
407 0.66
408 0.62
409 0.59
410 0.61
411 0.57
412 0.57
413 0.61
414 0.6
415 0.62
416 0.63
417 0.6
418 0.61
419 0.65
420 0.65
421 0.65
422 0.67
423 0.65
424 0.65
425 0.7
426 0.74
427 0.78
428 0.8
429 0.79
430 0.78
431 0.74
432 0.68
433 0.59
434 0.51
435 0.44
436 0.34
437 0.26
438 0.24
439 0.21
440 0.19
441 0.18
442 0.17
443 0.15
444 0.15
445 0.16
446 0.11
447 0.11
448 0.14
449 0.14
450 0.13
451 0.12
452 0.12
453 0.1
454 0.08
455 0.07
456 0.05
457 0.06
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.08
463 0.1
464 0.11
465 0.14
466 0.18
467 0.2
468 0.2
469 0.23
470 0.23
471 0.24
472 0.24
473 0.21
474 0.18
475 0.18
476 0.17
477 0.17
478 0.16
479 0.14
480 0.13
481 0.12
482 0.1
483 0.09
484 0.09
485 0.1
486 0.12
487 0.14
488 0.14
489 0.14
490 0.14
491 0.14
492 0.13
493 0.11
494 0.09
495 0.08
496 0.1
497 0.09
498 0.14
499 0.14
500 0.14
501 0.15
502 0.15
503 0.14
504 0.14
505 0.16
506 0.13
507 0.13
508 0.13
509 0.11
510 0.11
511 0.1
512 0.09
513 0.06
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.04
518 0.04
519 0.04
520 0.05
521 0.06
522 0.09
523 0.1
524 0.12
525 0.13
526 0.13
527 0.13
528 0.13
529 0.12
530 0.1
531 0.12
532 0.13
533 0.13
534 0.15
535 0.18
536 0.23
537 0.26
538 0.3
539 0.3
540 0.33
541 0.35
542 0.37
543 0.37
544 0.35
545 0.36
546 0.38
547 0.36
548 0.31
549 0.28
550 0.25
551 0.21
552 0.19
553 0.14
554 0.08
555 0.07
556 0.12
557 0.14
558 0.19
559 0.23
560 0.25
561 0.26
562 0.28
563 0.32
564 0.34
565 0.38
566 0.37
567 0.39
568 0.42
569 0.41
570 0.41
571 0.36
572 0.31
573 0.25
574 0.22
575 0.16
576 0.12
577 0.11
578 0.11
579 0.14
580 0.13
581 0.13
582 0.12
583 0.14
584 0.14
585 0.14
586 0.13
587 0.11
588 0.11
589 0.14
590 0.16
591 0.16
592 0.15
593 0.15
594 0.21
595 0.21
596 0.25
597 0.23
598 0.21
599 0.21
600 0.23
601 0.22
602 0.17
603 0.2
604 0.17
605 0.2
606 0.19
607 0.17
608 0.15
609 0.14
610 0.12
611 0.09
612 0.07
613 0.04
614 0.03
615 0.04
616 0.05
617 0.06
618 0.06
619 0.06
620 0.07
621 0.07
622 0.12
623 0.16
624 0.15
625 0.18
626 0.2
627 0.25
628 0.28
629 0.3
630 0.28
631 0.24
632 0.24
633 0.21
634 0.2
635 0.15
636 0.12
637 0.09
638 0.07
639 0.07
640 0.07
641 0.06
642 0.05
643 0.05
644 0.04
645 0.05
646 0.05
647 0.05
648 0.05
649 0.05
650 0.06
651 0.07
652 0.08
653 0.12
654 0.15
655 0.16
656 0.2
657 0.2
658 0.21
659 0.22
660 0.22
661 0.18
662 0.18
663 0.16
664 0.12
665 0.11
666 0.1
667 0.11
668 0.11
669 0.1
670 0.08
671 0.09
672 0.09
673 0.09
674 0.13
675 0.14
676 0.13
677 0.13
678 0.14
679 0.15
680 0.17
681 0.17
682 0.14
683 0.11
684 0.12
685 0.13
686 0.12
687 0.1
688 0.08
689 0.1
690 0.1
691 0.1
692 0.09
693 0.08
694 0.09
695 0.09
696 0.08
697 0.07
698 0.09
699 0.1
700 0.09
701 0.11
702 0.11
703 0.11
704 0.12
705 0.12
706 0.12
707 0.11
708 0.12
709 0.14
710 0.16
711 0.15
712 0.14
713 0.13
714 0.12
715 0.12
716 0.12
717 0.08
718 0.07
719 0.09
720 0.09
721 0.09
722 0.12
723 0.19
724 0.22
725 0.27
726 0.28
727 0.27
728 0.26
729 0.27
730 0.24
731 0.23
732 0.22
733 0.2
734 0.27
735 0.32
736 0.32
737 0.33
738 0.32
739 0.29
740 0.28
741 0.29
742 0.23
743 0.19
744 0.19
745 0.18
746 0.18
747 0.16
748 0.14
749 0.1
750 0.14
751 0.13
752 0.12
753 0.12
754 0.12
755 0.12
756 0.14
757 0.14
758 0.09
759 0.11
760 0.12
761 0.13
762 0.13
763 0.14
764 0.17
765 0.16
766 0.19
767 0.24
768 0.33
769 0.41
770 0.48
771 0.55
772 0.59
773 0.65
774 0.72
775 0.68
776 0.63
777 0.58
778 0.56
779 0.48
780 0.45
781 0.39
782 0.3
783 0.28
784 0.24
785 0.21
786 0.18
787 0.19
788 0.14
789 0.16
790 0.16
791 0.16
792 0.22
793 0.26
794 0.25
795 0.24
796 0.24
797 0.21
798 0.22
799 0.22
800 0.17
801 0.13
802 0.12
803 0.11
804 0.11
805 0.11
806 0.11
807 0.09
808 0.07
809 0.07
810 0.08
811 0.08
812 0.09
813 0.09
814 0.1
815 0.11
816 0.12
817 0.12
818 0.12
819 0.15
820 0.16
821 0.19
822 0.18
823 0.17
824 0.2
825 0.22
826 0.26
827 0.31
828 0.32
829 0.31
830 0.34
831 0.4
832 0.44
833 0.48
834 0.47
835 0.4
836 0.42
837 0.45
838 0.46
839 0.41
840 0.35
841 0.32
842 0.3
843 0.31
844 0.31
845 0.28
846 0.24
847 0.24
848 0.26
849 0.22
850 0.21
851 0.23
852 0.2
853 0.2
854 0.21
855 0.22
856 0.26
857 0.32
858 0.4
859 0.39
860 0.42
861 0.4
862 0.42
863 0.41
864 0.37
865 0.39
866 0.34
867 0.31
868 0.31
869 0.34
870 0.35
871 0.34
872 0.35
873 0.36
874 0.35
875 0.36
876 0.38
877 0.36
878 0.33
879 0.34
880 0.34
881 0.28
882 0.31
883 0.33
884 0.31
885 0.34
886 0.35
887 0.37
888 0.34
889 0.32
890 0.29
891 0.27
892 0.29
893 0.25
894 0.25
895 0.22
896 0.24
897 0.24
898 0.21
899 0.19
900 0.14
901 0.16
902 0.15
903 0.18
904 0.16
905 0.16
906 0.16
907 0.16
908 0.17
909 0.16
910 0.16
911 0.15
912 0.15
913 0.15
914 0.15
915 0.18
916 0.19
917 0.18
918 0.21
919 0.22
920 0.26
921 0.26
922 0.27
923 0.29
924 0.3
925 0.34
926 0.33
927 0.36
928 0.38
929 0.4
930 0.41
931 0.39
932 0.4
933 0.45
934 0.5
935 0.55
936 0.51
937 0.51
938 0.53
939 0.53
940 0.5
941 0.43
942 0.33
943 0.28
944 0.32
945 0.33
946 0.31
947 0.3
948 0.29
949 0.3
950 0.37
951 0.36
952 0.32
953 0.33
954 0.39
955 0.41
956 0.4
957 0.38
958 0.31
959 0.3
960 0.29
961 0.25
962 0.23
963 0.25
964 0.27
965 0.27
966 0.27
967 0.34
968 0.41
969 0.49
970 0.46
971 0.42
972 0.41
973 0.47
974 0.47
975 0.42
976 0.39
977 0.3
978 0.29
979 0.3
980 0.34
981 0.27
982 0.26
983 0.27
984 0.25
985 0.26
986 0.25
987 0.24
988 0.26
989 0.3
990 0.35
991 0.34
992 0.33
993 0.33
994 0.32
995 0.32
996 0.32
997 0.31
998 0.28
999 0.33
1000 0.32
1001 0.31
1002 0.36
1003 0.36
1004 0.33
1005 0.34
1006 0.36
1007 0.36
1008 0.36
1009 0.36
1010 0.36
1011 0.37
1012 0.4
1013 0.37
1014 0.38
1015 0.38
1016 0.44
1017 0.44
1018 0.41
1019 0.4