Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1V027

Protein Details
Accession H1V027    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-34MGSVLQKKKRRSSRQKVKMPNRPKKQLNPLGNDIHydrophilic
160-180AAIPRVKKPRHMSQQEREWLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-25KKKRRSSRQKVKMPNRPKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019002  Ribosome_biogenesis_Nop16  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF09420  Nop16  
Amino Acid Sequences MGSVLQKKKRRSSRQKVKMPNRPKKQLNPLGNDIIAKNWNKKETLTQNYRRLGLTARLKAPTGGSAAPSSSASRRPRRDPFAIAPTEEVIFEEARVERDENGKIIKIHYGSDRRSNPLNDPLNALESDAEGSSDDGAEQEWGGIDDESRPEVIRLLEKDAAIPRVKKPRHMSQQEREWLERLTAKHGDDVAAMARDRKLNPMQQTQGDIARRIKRLTGKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.94
3 0.95
4 0.95
5 0.94
6 0.94
7 0.93
8 0.92
9 0.92
10 0.9
11 0.89
12 0.89
13 0.88
14 0.86
15 0.82
16 0.78
17 0.72
18 0.64
19 0.55
20 0.44
21 0.37
22 0.34
23 0.3
24 0.31
25 0.32
26 0.34
27 0.34
28 0.35
29 0.42
30 0.46
31 0.52
32 0.55
33 0.59
34 0.65
35 0.67
36 0.67
37 0.58
38 0.49
39 0.43
40 0.41
41 0.4
42 0.38
43 0.38
44 0.37
45 0.37
46 0.36
47 0.34
48 0.27
49 0.21
50 0.15
51 0.14
52 0.13
53 0.12
54 0.13
55 0.13
56 0.13
57 0.12
58 0.2
59 0.26
60 0.35
61 0.41
62 0.48
63 0.55
64 0.6
65 0.63
66 0.61
67 0.59
68 0.58
69 0.53
70 0.46
71 0.39
72 0.33
73 0.28
74 0.22
75 0.16
76 0.09
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.12
86 0.13
87 0.13
88 0.13
89 0.14
90 0.13
91 0.13
92 0.14
93 0.12
94 0.13
95 0.17
96 0.22
97 0.22
98 0.3
99 0.31
100 0.31
101 0.34
102 0.34
103 0.32
104 0.35
105 0.37
106 0.29
107 0.3
108 0.27
109 0.25
110 0.24
111 0.21
112 0.12
113 0.09
114 0.09
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.03
127 0.03
128 0.04
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.09
139 0.1
140 0.13
141 0.14
142 0.18
143 0.2
144 0.2
145 0.22
146 0.23
147 0.26
148 0.25
149 0.26
150 0.28
151 0.36
152 0.38
153 0.44
154 0.49
155 0.56
156 0.63
157 0.71
158 0.74
159 0.73
160 0.81
161 0.81
162 0.78
163 0.69
164 0.6
165 0.51
166 0.44
167 0.39
168 0.31
169 0.29
170 0.29
171 0.27
172 0.28
173 0.28
174 0.26
175 0.21
176 0.21
177 0.17
178 0.16
179 0.16
180 0.15
181 0.17
182 0.2
183 0.2
184 0.26
185 0.3
186 0.35
187 0.42
188 0.49
189 0.52
190 0.51
191 0.54
192 0.5
193 0.51
194 0.47
195 0.45
196 0.44
197 0.46
198 0.47
199 0.44
200 0.48