Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VVA3

Protein Details
Accession H1VVA3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
323-348KCNYPDCTKTFKRKEHLKRHFKATHEBasic
400-419MCLQSKSRKRVKTSTSSSPSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
KEGG chig:CH63R_10776  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MMSHQHLWQQEHDHSIESIMDSFAPEASFTFDGSVSCGTTTPSFSAASSVYDPNGPFTPRSGRSTPHDHHSGIDFDSSFSSQSSFSFDHGPAQENKGYFHKPEKVEIQMPMQFAPTVPLTPSRRQSSAYAMENLDYNMMLHVTLNSHCMPAMSSPHHQHQQQNQQHHQPQQHHHQHHHAEQYSLPQDLSSSPFVMPTPHRGPANSTPSNAHIWSCSSESPIMMFGNESTPSTSPLHSMTGGNVKRETTHSPSPLQSPPSAAAYRQDPRRKLFAEVQRKTLALQKNQNDMEALRQLRSIQVNQDGSVLDCGSVKVRHVAPRREKCNYPDCTKTFKRKEHLKRHFKATHEKEVELYTCPATNCNHVFKERRDNFVSHLLLHKQGKSSRTPYNERAAKLYDEMCLQSKSRKRVKTSTSSSPSSTSSNKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.29
3 0.25
4 0.2
5 0.17
6 0.13
7 0.12
8 0.11
9 0.11
10 0.1
11 0.1
12 0.09
13 0.08
14 0.12
15 0.12
16 0.12
17 0.13
18 0.13
19 0.12
20 0.14
21 0.15
22 0.11
23 0.11
24 0.11
25 0.12
26 0.13
27 0.16
28 0.15
29 0.16
30 0.16
31 0.15
32 0.17
33 0.16
34 0.17
35 0.18
36 0.18
37 0.17
38 0.2
39 0.2
40 0.21
41 0.23
42 0.22
43 0.2
44 0.22
45 0.3
46 0.31
47 0.37
48 0.37
49 0.38
50 0.43
51 0.52
52 0.52
53 0.51
54 0.51
55 0.45
56 0.44
57 0.43
58 0.38
59 0.3
60 0.29
61 0.21
62 0.17
63 0.18
64 0.17
65 0.14
66 0.12
67 0.12
68 0.1
69 0.1
70 0.15
71 0.14
72 0.15
73 0.18
74 0.18
75 0.23
76 0.24
77 0.28
78 0.25
79 0.29
80 0.3
81 0.27
82 0.29
83 0.28
84 0.3
85 0.29
86 0.34
87 0.37
88 0.36
89 0.41
90 0.43
91 0.43
92 0.44
93 0.43
94 0.41
95 0.37
96 0.36
97 0.31
98 0.27
99 0.21
100 0.18
101 0.18
102 0.13
103 0.1
104 0.1
105 0.18
106 0.22
107 0.28
108 0.35
109 0.37
110 0.38
111 0.39
112 0.41
113 0.4
114 0.42
115 0.4
116 0.36
117 0.32
118 0.3
119 0.28
120 0.26
121 0.19
122 0.12
123 0.09
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.07
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.15
139 0.15
140 0.2
141 0.23
142 0.28
143 0.33
144 0.35
145 0.4
146 0.44
147 0.51
148 0.53
149 0.58
150 0.58
151 0.62
152 0.64
153 0.64
154 0.61
155 0.57
156 0.56
157 0.59
158 0.63
159 0.59
160 0.57
161 0.59
162 0.58
163 0.55
164 0.57
165 0.47
166 0.38
167 0.34
168 0.36
169 0.29
170 0.25
171 0.2
172 0.13
173 0.13
174 0.13
175 0.15
176 0.11
177 0.11
178 0.1
179 0.11
180 0.11
181 0.13
182 0.13
183 0.18
184 0.2
185 0.22
186 0.22
187 0.22
188 0.27
189 0.32
190 0.4
191 0.34
192 0.32
193 0.3
194 0.32
195 0.34
196 0.29
197 0.21
198 0.13
199 0.13
200 0.13
201 0.14
202 0.12
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.1
208 0.09
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.11
218 0.12
219 0.12
220 0.12
221 0.13
222 0.14
223 0.13
224 0.13
225 0.12
226 0.19
227 0.2
228 0.21
229 0.2
230 0.19
231 0.19
232 0.22
233 0.25
234 0.23
235 0.27
236 0.29
237 0.31
238 0.32
239 0.35
240 0.35
241 0.33
242 0.27
243 0.23
244 0.22
245 0.23
246 0.22
247 0.18
248 0.17
249 0.2
250 0.26
251 0.33
252 0.39
253 0.38
254 0.41
255 0.48
256 0.47
257 0.47
258 0.49
259 0.51
260 0.55
261 0.53
262 0.54
263 0.49
264 0.48
265 0.44
266 0.42
267 0.39
268 0.35
269 0.41
270 0.41
271 0.48
272 0.48
273 0.47
274 0.41
275 0.35
276 0.31
277 0.3
278 0.26
279 0.18
280 0.18
281 0.18
282 0.21
283 0.24
284 0.22
285 0.2
286 0.25
287 0.26
288 0.25
289 0.26
290 0.22
291 0.2
292 0.19
293 0.16
294 0.09
295 0.08
296 0.08
297 0.1
298 0.11
299 0.11
300 0.15
301 0.18
302 0.26
303 0.34
304 0.44
305 0.52
306 0.61
307 0.68
308 0.69
309 0.7
310 0.68
311 0.69
312 0.66
313 0.61
314 0.6
315 0.56
316 0.6
317 0.63
318 0.68
319 0.68
320 0.69
321 0.73
322 0.75
323 0.83
324 0.85
325 0.88
326 0.88
327 0.85
328 0.87
329 0.83
330 0.78
331 0.78
332 0.74
333 0.74
334 0.67
335 0.61
336 0.52
337 0.5
338 0.46
339 0.37
340 0.32
341 0.22
342 0.21
343 0.2
344 0.21
345 0.2
346 0.25
347 0.27
348 0.31
349 0.34
350 0.38
351 0.45
352 0.49
353 0.58
354 0.56
355 0.59
356 0.57
357 0.55
358 0.53
359 0.55
360 0.5
361 0.41
362 0.41
363 0.37
364 0.4
365 0.42
366 0.4
367 0.37
368 0.41
369 0.43
370 0.45
371 0.49
372 0.5
373 0.55
374 0.6
375 0.6
376 0.66
377 0.67
378 0.61
379 0.6
380 0.55
381 0.49
382 0.45
383 0.4
384 0.31
385 0.28
386 0.28
387 0.27
388 0.26
389 0.25
390 0.31
391 0.37
392 0.45
393 0.52
394 0.58
395 0.63
396 0.7
397 0.77
398 0.79
399 0.79
400 0.8
401 0.78
402 0.74
403 0.69
404 0.62
405 0.56
406 0.5