Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VMR3

Protein Details
Accession H1VMR3    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-48DRGWQQQQQQQQQQQQQQQQHydrophilic
816-835NLGKAFKNDRPKNVKKKGIFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
74-99GPRTPGRDGEPRRSGERSRSKGRGGR
827-827K
830-830K
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008936  Rho_GTPase_activation_prot  
IPR000198  RhoGAP_dom  
IPR001781  Znf_LIM  
Gene Ontology GO:0005096  F:GTPase activator activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0007165  P:signal transduction  
KEGG chig:CH63R_00641  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00412  LIM  
PF00620  RhoGAP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00478  LIM_DOMAIN_1  
PS50023  LIM_DOMAIN_2  
PS50238  RHOGAP  
CDD cd09391  LIM1_Lrg1p_like  
cd09392  LIM2_Lrg1p_like  
cd09393  LIM3_Lrg1p_like  
Amino Acid Sequences MASDYDHGAPDDRLQAHPAAPMELGYPGDRGWQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHNGGRRTPDNSYRTQQHSRSPGPRTPGRDGEPRRSGERSRSKGRGGRSASGQQRICKKCGEPLTGQFVRALDGTFHLDCFKCRDCGQIVASKFFPVDDENGEGQYPLCETDYFRRLGLLCYKCGGALRGSYITALDRKYHVDHFTCSLCPTVFGAQDSYYEHDGNVYCHYHYSTQFAQRCNGCQTAILKQFVEIYRNGQNQHWHPECYMIHKFWNVRLTQPSDSSEGPQETDDPAAREIIREEEERMEEKVYRIWSVLSTFEESSAACISDMLLHVSNGAYVDGVLVAKKFIWHVEILFQSADRLDYSMDQLKLKGLSYGREAKLLCKKIVSFFSLLSKTQDTGARKLGVTQELLSLVTGLAHYLKLLIRICLQGALRLEKESKSSDGIYQFLDDLSELDAAKPDDNTLQAITGNSRLSAKDSDHCALCSKSVEDECAKHSDRRWHIACVSCSRCTRDIGRKLEDAHYNAFDKKIYCNNCIGANNEDMPPFEHVTKLQQYVFLLKVALARLLDILRSNGALPRQDDDQNMDGYGPGEGSRTLAPGEAPYLNSDNRSKSYAGDQREHNRESSYENTLNDVRRLRSTRLDKHLSSSFRKARTSRIMDGPEGRSVRPGSAGEDSGRADGDLQIVEDRRGPNDEGTTDKMFNHQDALTLDDIPRIVAAEQVKEQQYKPSRQELFRSPATDPMGHQRSQSAGREAEIRMGDPMPQRLGRKYFSELSGLEYFIVRHLAVLTLAPAVENEFSLDELLSFIELRKQPTFWKNLGKAFKNDRPKNVKKKGIFGVPLDVIIDKDGAESTDGVGPGTLKIPAIIDDLISSMRKMDLSVEGVFRKNGNIKKLSELCERIDREGCDSINFMDQPVVQVAALLKRYLRELPDPLMTFKLQKLWIAVAKIQDDAKRKQYLHLICCLLPKPHRDCLEILFCFLKWAGSFHQVDEEAGSRMDIKNLATVIAPNILYSSNKAPTLDSDPMFAIVAVNDMITSIEEMCLVPDELMDLVNDPFVFGNTADLTTKDILKRYQDRMGQRSGLGGDVSEVFNRPDNSTRPPPRRVETDPALWQQQESSVRPVQDPPMPIPPFNPANPGTPPQRWRAQQEENGHPSPYSGGGQFEPSDAEGPTEAQKREWRQSGGVWGRQNGGVGVGGNL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.27
3 0.26
4 0.29
5 0.27
6 0.21
7 0.19
8 0.18
9 0.16
10 0.16
11 0.16
12 0.13
13 0.13
14 0.11
15 0.16
16 0.17
17 0.2
18 0.26
19 0.32
20 0.37
21 0.42
22 0.52
23 0.57
24 0.66
25 0.7
26 0.73
27 0.74
28 0.77
29 0.8
30 0.8
31 0.78
32 0.78
33 0.78
34 0.77
35 0.77
36 0.77
37 0.76
38 0.76
39 0.75
40 0.74
41 0.7
42 0.67
43 0.64
44 0.61
45 0.57
46 0.56
47 0.57
48 0.54
49 0.56
50 0.59
51 0.6
52 0.63
53 0.67
54 0.65
55 0.64
56 0.68
57 0.7
58 0.71
59 0.7
60 0.67
61 0.67
62 0.69
63 0.67
64 0.66
65 0.64
66 0.61
67 0.65
68 0.66
69 0.68
70 0.69
71 0.66
72 0.63
73 0.61
74 0.61
75 0.61
76 0.65
77 0.63
78 0.65
79 0.67
80 0.71
81 0.7
82 0.71
83 0.7
84 0.66
85 0.63
86 0.6
87 0.63
88 0.62
89 0.66
90 0.63
91 0.6
92 0.64
93 0.63
94 0.59
95 0.55
96 0.5
97 0.5
98 0.54
99 0.54
100 0.5
101 0.52
102 0.59
103 0.55
104 0.53
105 0.46
106 0.38
107 0.33
108 0.27
109 0.22
110 0.13
111 0.13
112 0.18
113 0.16
114 0.17
115 0.18
116 0.19
117 0.19
118 0.25
119 0.26
120 0.25
121 0.25
122 0.31
123 0.3
124 0.35
125 0.38
126 0.39
127 0.38
128 0.38
129 0.38
130 0.33
131 0.3
132 0.24
133 0.22
134 0.17
135 0.17
136 0.15
137 0.2
138 0.19
139 0.2
140 0.2
141 0.19
142 0.17
143 0.15
144 0.12
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.12
149 0.2
150 0.25
151 0.26
152 0.25
153 0.27
154 0.26
155 0.3
156 0.37
157 0.32
158 0.29
159 0.29
160 0.3
161 0.27
162 0.28
163 0.25
164 0.18
165 0.16
166 0.18
167 0.18
168 0.18
169 0.18
170 0.17
171 0.18
172 0.19
173 0.19
174 0.18
175 0.18
176 0.21
177 0.25
178 0.29
179 0.31
180 0.3
181 0.32
182 0.33
183 0.34
184 0.31
185 0.29
186 0.27
187 0.21
188 0.19
189 0.19
190 0.19
191 0.18
192 0.18
193 0.19
194 0.17
195 0.18
196 0.19
197 0.2
198 0.19
199 0.18
200 0.17
201 0.18
202 0.18
203 0.18
204 0.2
205 0.18
206 0.16
207 0.17
208 0.19
209 0.2
210 0.2
211 0.25
212 0.26
213 0.34
214 0.38
215 0.39
216 0.43
217 0.42
218 0.45
219 0.44
220 0.4
221 0.31
222 0.3
223 0.3
224 0.33
225 0.37
226 0.35
227 0.3
228 0.29
229 0.34
230 0.32
231 0.32
232 0.24
233 0.22
234 0.28
235 0.31
236 0.33
237 0.3
238 0.36
239 0.38
240 0.47
241 0.46
242 0.39
243 0.37
244 0.42
245 0.39
246 0.39
247 0.4
248 0.32
249 0.32
250 0.35
251 0.36
252 0.34
253 0.4
254 0.34
255 0.33
256 0.38
257 0.4
258 0.38
259 0.39
260 0.37
261 0.34
262 0.34
263 0.31
264 0.29
265 0.25
266 0.23
267 0.2
268 0.19
269 0.17
270 0.18
271 0.17
272 0.14
273 0.14
274 0.15
275 0.15
276 0.14
277 0.14
278 0.15
279 0.17
280 0.16
281 0.17
282 0.18
283 0.2
284 0.21
285 0.22
286 0.2
287 0.19
288 0.18
289 0.2
290 0.19
291 0.18
292 0.17
293 0.16
294 0.16
295 0.16
296 0.17
297 0.15
298 0.17
299 0.16
300 0.16
301 0.15
302 0.14
303 0.14
304 0.13
305 0.11
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.08
318 0.07
319 0.05
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.05
324 0.05
325 0.04
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.08
332 0.09
333 0.09
334 0.14
335 0.14
336 0.15
337 0.15
338 0.14
339 0.13
340 0.12
341 0.12
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.07
346 0.11
347 0.16
348 0.17
349 0.17
350 0.17
351 0.19
352 0.19
353 0.18
354 0.19
355 0.15
356 0.15
357 0.2
358 0.28
359 0.27
360 0.3
361 0.3
362 0.33
363 0.4
364 0.42
365 0.38
366 0.32
367 0.32
368 0.33
369 0.36
370 0.32
371 0.25
372 0.22
373 0.27
374 0.27
375 0.27
376 0.25
377 0.23
378 0.2
379 0.21
380 0.26
381 0.23
382 0.24
383 0.27
384 0.26
385 0.25
386 0.27
387 0.28
388 0.24
389 0.22
390 0.19
391 0.16
392 0.15
393 0.15
394 0.12
395 0.09
396 0.07
397 0.06
398 0.05
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.05
404 0.06
405 0.1
406 0.11
407 0.12
408 0.13
409 0.14
410 0.14
411 0.16
412 0.15
413 0.14
414 0.16
415 0.18
416 0.17
417 0.18
418 0.2
419 0.17
420 0.2
421 0.19
422 0.18
423 0.17
424 0.18
425 0.19
426 0.19
427 0.2
428 0.18
429 0.16
430 0.15
431 0.12
432 0.11
433 0.08
434 0.06
435 0.06
436 0.07
437 0.06
438 0.06
439 0.08
440 0.08
441 0.09
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.09
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.1
453 0.1
454 0.09
455 0.1
456 0.1
457 0.12
458 0.14
459 0.15
460 0.16
461 0.2
462 0.22
463 0.22
464 0.22
465 0.22
466 0.2
467 0.19
468 0.16
469 0.13
470 0.14
471 0.14
472 0.16
473 0.15
474 0.16
475 0.18
476 0.22
477 0.23
478 0.23
479 0.26
480 0.33
481 0.35
482 0.42
483 0.42
484 0.39
485 0.41
486 0.45
487 0.44
488 0.42
489 0.42
490 0.39
491 0.38
492 0.39
493 0.37
494 0.33
495 0.37
496 0.39
497 0.44
498 0.45
499 0.47
500 0.45
501 0.46
502 0.48
503 0.45
504 0.37
505 0.31
506 0.27
507 0.25
508 0.23
509 0.21
510 0.18
511 0.15
512 0.16
513 0.21
514 0.23
515 0.23
516 0.25
517 0.25
518 0.28
519 0.28
520 0.27
521 0.22
522 0.2
523 0.19
524 0.18
525 0.17
526 0.14
527 0.13
528 0.14
529 0.13
530 0.11
531 0.11
532 0.1
533 0.15
534 0.17
535 0.18
536 0.16
537 0.16
538 0.16
539 0.18
540 0.19
541 0.14
542 0.11
543 0.1
544 0.11
545 0.1
546 0.1
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.07
552 0.06
553 0.06
554 0.06
555 0.06
556 0.06
557 0.07
558 0.09
559 0.1
560 0.1
561 0.12
562 0.14
563 0.16
564 0.16
565 0.18
566 0.18
567 0.16
568 0.15
569 0.14
570 0.11
571 0.1
572 0.09
573 0.06
574 0.04
575 0.04
576 0.04
577 0.05
578 0.05
579 0.06
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.06
584 0.07
585 0.07
586 0.07
587 0.08
588 0.1
589 0.1
590 0.12
591 0.14
592 0.14
593 0.15
594 0.17
595 0.16
596 0.15
597 0.23
598 0.26
599 0.28
600 0.3
601 0.33
602 0.38
603 0.43
604 0.43
605 0.36
606 0.31
607 0.28
608 0.28
609 0.27
610 0.25
611 0.22
612 0.21
613 0.23
614 0.25
615 0.25
616 0.25
617 0.24
618 0.2
619 0.22
620 0.26
621 0.26
622 0.31
623 0.38
624 0.42
625 0.48
626 0.52
627 0.47
628 0.48
629 0.52
630 0.48
631 0.44
632 0.45
633 0.43
634 0.41
635 0.45
636 0.42
637 0.43
638 0.48
639 0.5
640 0.45
641 0.46
642 0.44
643 0.42
644 0.44
645 0.39
646 0.34
647 0.3
648 0.26
649 0.22
650 0.2
651 0.19
652 0.17
653 0.16
654 0.13
655 0.14
656 0.15
657 0.13
658 0.14
659 0.14
660 0.12
661 0.12
662 0.09
663 0.08
664 0.07
665 0.07
666 0.06
667 0.05
668 0.07
669 0.07
670 0.08
671 0.1
672 0.1
673 0.11
674 0.13
675 0.14
676 0.13
677 0.14
678 0.15
679 0.15
680 0.19
681 0.2
682 0.18
683 0.18
684 0.2
685 0.19
686 0.19
687 0.18
688 0.14
689 0.14
690 0.13
691 0.16
692 0.13
693 0.13
694 0.13
695 0.11
696 0.11
697 0.08
698 0.08
699 0.06
700 0.05
701 0.08
702 0.08
703 0.09
704 0.1
705 0.14
706 0.16
707 0.18
708 0.18
709 0.23
710 0.29
711 0.34
712 0.37
713 0.43
714 0.46
715 0.46
716 0.51
717 0.5
718 0.49
719 0.46
720 0.44
721 0.36
722 0.36
723 0.36
724 0.32
725 0.26
726 0.29
727 0.3
728 0.28
729 0.27
730 0.23
731 0.23
732 0.27
733 0.29
734 0.23
735 0.2
736 0.2
737 0.23
738 0.22
739 0.23
740 0.19
741 0.17
742 0.14
743 0.14
744 0.17
745 0.16
746 0.17
747 0.16
748 0.19
749 0.21
750 0.24
751 0.27
752 0.26
753 0.28
754 0.3
755 0.3
756 0.28
757 0.3
758 0.25
759 0.27
760 0.25
761 0.23
762 0.18
763 0.15
764 0.14
765 0.12
766 0.13
767 0.07
768 0.06
769 0.06
770 0.06
771 0.06
772 0.06
773 0.06
774 0.05
775 0.05
776 0.05
777 0.05
778 0.05
779 0.05
780 0.05
781 0.05
782 0.05
783 0.06
784 0.06
785 0.06
786 0.05
787 0.05
788 0.05
789 0.05
790 0.05
791 0.05
792 0.11
793 0.13
794 0.17
795 0.17
796 0.19
797 0.25
798 0.31
799 0.37
800 0.35
801 0.43
802 0.43
803 0.5
804 0.57
805 0.54
806 0.54
807 0.57
808 0.61
809 0.62
810 0.62
811 0.64
812 0.67
813 0.73
814 0.78
815 0.79
816 0.8
817 0.72
818 0.75
819 0.71
820 0.68
821 0.61
822 0.52
823 0.47
824 0.38
825 0.35
826 0.28
827 0.22
828 0.15
829 0.12
830 0.11
831 0.06
832 0.06
833 0.06
834 0.05
835 0.06
836 0.06
837 0.07
838 0.09
839 0.09
840 0.08
841 0.08
842 0.08
843 0.08
844 0.09
845 0.08
846 0.06
847 0.06
848 0.07
849 0.08
850 0.09
851 0.09
852 0.08
853 0.08
854 0.08
855 0.09
856 0.09
857 0.08
858 0.07
859 0.07
860 0.08
861 0.08
862 0.09
863 0.1
864 0.13
865 0.15
866 0.17
867 0.19
868 0.2
869 0.21
870 0.19
871 0.2
872 0.24
873 0.26
874 0.3
875 0.33
876 0.34
877 0.42
878 0.46
879 0.48
880 0.49
881 0.48
882 0.44
883 0.48
884 0.48
885 0.43
886 0.42
887 0.37
888 0.34
889 0.35
890 0.31
891 0.24
892 0.23
893 0.21
894 0.2
895 0.2
896 0.15
897 0.14
898 0.13
899 0.14
900 0.13
901 0.13
902 0.08
903 0.09
904 0.1
905 0.12
906 0.13
907 0.12
908 0.12
909 0.12
910 0.15
911 0.17
912 0.2
913 0.2
914 0.23
915 0.26
916 0.32
917 0.32
918 0.32
919 0.32
920 0.29
921 0.27
922 0.24
923 0.27
924 0.22
925 0.22
926 0.22
927 0.23
928 0.25
929 0.26
930 0.27
931 0.25
932 0.24
933 0.25
934 0.26
935 0.27
936 0.3
937 0.32
938 0.37
939 0.41
940 0.4
941 0.43
942 0.49
943 0.52
944 0.49
945 0.52
946 0.47
947 0.42
948 0.46
949 0.44
950 0.41
951 0.37
952 0.42
953 0.41
954 0.45
955 0.47
956 0.46
957 0.45
958 0.46
959 0.5
960 0.42
961 0.39
962 0.32
963 0.28
964 0.27
965 0.25
966 0.2
967 0.11
968 0.14
969 0.15
970 0.21
971 0.22
972 0.21
973 0.26
974 0.25
975 0.25
976 0.24
977 0.22
978 0.15
979 0.15
980 0.14
981 0.11
982 0.11
983 0.13
984 0.13
985 0.12
986 0.14
987 0.14
988 0.14
989 0.13
990 0.13
991 0.13
992 0.14
993 0.14
994 0.11
995 0.11
996 0.12
997 0.12
998 0.15
999 0.18
1000 0.19
1001 0.2
1002 0.21
1003 0.21
1004 0.24
1005 0.3
1006 0.32
1007 0.28
1008 0.26
1009 0.25
1010 0.26
1011 0.25
1012 0.21
1013 0.14
1014 0.08
1015 0.09
1016 0.07
1017 0.06
1018 0.05
1019 0.05
1020 0.05
1021 0.05
1022 0.06
1023 0.06
1024 0.06
1025 0.06
1026 0.07
1027 0.07
1028 0.08
1029 0.09
1030 0.08
1031 0.07
1032 0.08
1033 0.07
1034 0.08
1035 0.07
1036 0.07
1037 0.07
1038 0.08
1039 0.08
1040 0.08
1041 0.08
1042 0.08
1043 0.09
1044 0.08
1045 0.11
1046 0.1
1047 0.12
1048 0.12
1049 0.12
1050 0.15
1051 0.16
1052 0.2
1053 0.2
1054 0.23
1055 0.26
1056 0.34
1057 0.41
1058 0.44
1059 0.5
1060 0.53
1061 0.59
1062 0.61
1063 0.63
1064 0.57
1065 0.49
1066 0.47
1067 0.39
1068 0.34
1069 0.25
1070 0.19
1071 0.14
1072 0.13
1073 0.14
1074 0.12
1075 0.12
1076 0.12
1077 0.17
1078 0.19
1079 0.21
1080 0.25
1081 0.28
1082 0.36
1083 0.46
1084 0.55
1085 0.58
1086 0.64
1087 0.68
1088 0.68
1089 0.72
1090 0.7
1091 0.69
1092 0.64
1093 0.64
1094 0.63
1095 0.6
1096 0.59
1097 0.51
1098 0.44
1099 0.36
1100 0.36
1101 0.35
1102 0.31
1103 0.33
1104 0.33
1105 0.34
1106 0.36
1107 0.38
1108 0.37
1109 0.36
1110 0.37
1111 0.34
1112 0.41
1113 0.41
1114 0.39
1115 0.37
1116 0.39
1117 0.39
1118 0.37
1119 0.38
1120 0.3
1121 0.33
1122 0.37
1123 0.41
1124 0.41
1125 0.44
1126 0.47
1127 0.48
1128 0.54
1129 0.55
1130 0.58
1131 0.62
1132 0.64
1133 0.65
1134 0.69
1135 0.72
1136 0.71
1137 0.68
1138 0.61
1139 0.52
1140 0.43
1141 0.37
1142 0.31
1143 0.23
1144 0.17
1145 0.18
1146 0.18
1147 0.21
1148 0.21
1149 0.2
1150 0.19
1151 0.17
1152 0.18
1153 0.15
1154 0.15
1155 0.13
1156 0.14
1157 0.2
1158 0.25
1159 0.25
1160 0.28
1161 0.37
1162 0.43
1163 0.52
1164 0.57
1165 0.54
1166 0.51
1167 0.54
1168 0.6
1169 0.6
1170 0.6
1171 0.55
1172 0.5
1173 0.49
1174 0.47
1175 0.43
1176 0.33
1177 0.25
1178 0.19