FuNGI

Q8SQN6

Protein Details

Accession

Q8SQN6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
259-281	RDYFSPSKERRKRTCTKCGRTGH	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, mito_nucl 12.333, mito 9, cyto_mito 6.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPSLFRWLQLSHKETIHSIMEKPSVDALYLDFNAIIHTCIKPGLGSEEEIERDLYKTVGDFIDHILLKTRPRKLLYIAVDGVAPRAKLSHQRARRYKSALGKKEGSAVIAAAKADPTMSSPSEKKDEIPNEEFTGESSLYDKFIAEDPSESSSLAIDVETEKFDLNCITPGTPFMERLHKVLISYIQCKLSSDPEVSNLRIIYSSYLVPGEGEQKIMSFIRSQGSIARNDVHMIYSPDGDLIFLGLSLQRNRVLIMRDYFSPSKERRKRTCTKCGRTGHSDEECGVFTNYHFVYVNISELRTRLIREFRRHTAQRFSEERILDDWIFLCFLLGNDFVPPIPCLDIRFHSIETITEIMMKSFSEMKSYITCNKMINYQALRNFYAILASKEDGLYHRKSQSLDKFREGLKGMPRIVYEKIPIHTKTGKVQYYTSKLNATTESDIKNICYEYVKGLYWVYSYYVLGWTGWDWYYPYHFAPLAADLSKLSINDIQISPGHPLRPLEQLLVVLPPMSRGMVPEGLQPIFDDYKDYYPEDVKTDMFDKVYLWQEIVLLPFMDFRPILSENAVKFNTLGYEDLSRNLRSLDLLFTTDKKSSEVILGMYSKLKPMCSIRSPGYFGTICPYSFASFPGDVLEYNGARFVNKTVVAFIEPRN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.4
3	0.39
4	0.41
5	0.39
6	0.32
7	0.31
8	0.31
9	0.34
10	0.32
11	0.32
12	0.31
13	0.26
14	0.24
15	0.22
16	0.17
17	0.18
18	0.18
19	0.17
20	0.13
21	0.13
22	0.14
23	0.14
24	0.13
25	0.1
26	0.11
27	0.11
28	0.12
29	0.12
30	0.11
31	0.12
32	0.16
33	0.16
34	0.17
35	0.18
36	0.21
37	0.22
38	0.23
39	0.22
40	0.18
41	0.17
42	0.16
43	0.14
44	0.11
45	0.1
46	0.12
47	0.12
48	0.12
49	0.12
50	0.13
51	0.2
52	0.2
53	0.19
54	0.21
55	0.23
56	0.3
57	0.37
58	0.42
59	0.42
60	0.45
61	0.48
62	0.49
63	0.56
64	0.53
65	0.52
66	0.46
67	0.4
68	0.37
69	0.34
70	0.31
71	0.23
72	0.18
73	0.11
74	0.11
75	0.14
76	0.22
77	0.31
78	0.39
79	0.46
80	0.57
81	0.67
82	0.73
83	0.78
84	0.75
85	0.73
86	0.73
87	0.76
88	0.73
89	0.71
90	0.68
91	0.61
92	0.62
93	0.54
94	0.45
95	0.34
96	0.26
97	0.2
98	0.17
99	0.16
100	0.1
101	0.1
102	0.09
103	0.08
104	0.08
105	0.08
106	0.11
107	0.13
108	0.17
109	0.2
110	0.24
111	0.29
112	0.3
113	0.3
114	0.35
115	0.4
116	0.43
117	0.45
118	0.44
119	0.41
120	0.41
121	0.38
122	0.3
123	0.27
124	0.19
125	0.15
126	0.13
127	0.11
128	0.11
129	0.12
130	0.11
131	0.09
132	0.11
133	0.13
134	0.13
135	0.14
136	0.15
137	0.18
138	0.18
139	0.17
140	0.14
141	0.12
142	0.11
143	0.1
144	0.08
145	0.05
146	0.06
147	0.08
148	0.08
149	0.09
150	0.09
151	0.09
152	0.09
153	0.1
154	0.09
155	0.1
156	0.11
157	0.11
158	0.11
159	0.13
160	0.16
161	0.15
162	0.17
163	0.17
164	0.24
165	0.24
166	0.26
167	0.28
168	0.25
169	0.24
170	0.24
171	0.27
172	0.23
173	0.25
174	0.26
175	0.26
176	0.25
177	0.26
178	0.26
179	0.24
180	0.23
181	0.22
182	0.2
183	0.23
184	0.26
185	0.25
186	0.26
187	0.21
188	0.19
189	0.17
190	0.16
191	0.12
192	0.11
193	0.11
194	0.09
195	0.09
196	0.09
197	0.09
198	0.09
199	0.12
200	0.1
201	0.11
202	0.1
203	0.1
204	0.12
205	0.12
206	0.12
207	0.09
208	0.1
209	0.11
210	0.12
211	0.12
212	0.16
213	0.18
214	0.2
215	0.2
216	0.2
217	0.18
218	0.19
219	0.19
220	0.14
221	0.13
222	0.13
223	0.12
224	0.11
225	0.11
226	0.1
227	0.1
228	0.09
229	0.07
230	0.05
231	0.04
232	0.03
233	0.03
234	0.05
235	0.07
236	0.08
237	0.1
238	0.11
239	0.11
240	0.12
241	0.15
242	0.16
243	0.17
244	0.19
245	0.19
246	0.19
247	0.24
248	0.24
249	0.23
250	0.27
251	0.28
252	0.37
253	0.43
254	0.52
255	0.55
256	0.64
257	0.73
258	0.75
259	0.82
260	0.81
261	0.81
262	0.81
263	0.8
264	0.76
265	0.72
266	0.68
267	0.64
268	0.55
269	0.47
270	0.38
271	0.33
272	0.27
273	0.22
274	0.18
275	0.1
276	0.08
277	0.12
278	0.11
279	0.11
280	0.11
281	0.09
282	0.11
283	0.11
284	0.14
285	0.1
286	0.1
287	0.09
288	0.1
289	0.11
290	0.1
291	0.11
292	0.12
293	0.2
294	0.26
295	0.34
296	0.39
297	0.43
298	0.51
299	0.53
300	0.53
301	0.53
302	0.5
303	0.49
304	0.46
305	0.45
306	0.42
307	0.38
308	0.36
309	0.28
310	0.28
311	0.21
312	0.18
313	0.14
314	0.09
315	0.09
316	0.08
317	0.06
318	0.04
319	0.04
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.05
329	0.06
330	0.07
331	0.08
332	0.1
333	0.12
334	0.14
335	0.16
336	0.16
337	0.15
338	0.15
339	0.13
340	0.13
341	0.12
342	0.09
343	0.08
344	0.08
345	0.08
346	0.08
347	0.08
348	0.07
349	0.1
350	0.1
351	0.11
352	0.11
353	0.13
354	0.15
355	0.18
356	0.22
357	0.2
358	0.22
359	0.21
360	0.21
361	0.23
362	0.22
363	0.25
364	0.23
365	0.25
366	0.27
367	0.29
368	0.29
369	0.26
370	0.25
371	0.19
372	0.19
373	0.16
374	0.13
375	0.12
376	0.12
377	0.12
378	0.11
379	0.12
380	0.11
381	0.15
382	0.17
383	0.19
384	0.21
385	0.23
386	0.24
387	0.32
388	0.4
389	0.45
390	0.45
391	0.45
392	0.46
393	0.44
394	0.48
395	0.41
396	0.36
397	0.33
398	0.34
399	0.32
400	0.3
401	0.3
402	0.28
403	0.28
404	0.25
405	0.23
406	0.2
407	0.22
408	0.25
409	0.26
410	0.28
411	0.3
412	0.3
413	0.33
414	0.38
415	0.39
416	0.35
417	0.37
418	0.39
419	0.41
420	0.42
421	0.38
422	0.32
423	0.3
424	0.3
425	0.28
426	0.25
427	0.23
428	0.23
429	0.22
430	0.21
431	0.21
432	0.2
433	0.2
434	0.16
435	0.14
436	0.12
437	0.12
438	0.13
439	0.15
440	0.15
441	0.14
442	0.15
443	0.14
444	0.13
445	0.13
446	0.11
447	0.1
448	0.1
449	0.09
450	0.1
451	0.1
452	0.09
453	0.09
454	0.08
455	0.09
456	0.09
457	0.08
458	0.08
459	0.09
460	0.12
461	0.14
462	0.14
463	0.15
464	0.15
465	0.15
466	0.15
467	0.16
468	0.15
469	0.13
470	0.13
471	0.1
472	0.12
473	0.13
474	0.11
475	0.11
476	0.11
477	0.11
478	0.14
479	0.15
480	0.15
481	0.15
482	0.16
483	0.18
484	0.18
485	0.18
486	0.17
487	0.18
488	0.19
489	0.23
490	0.23
491	0.21
492	0.19
493	0.19
494	0.18
495	0.17
496	0.15
497	0.1
498	0.09
499	0.08
500	0.08
501	0.08
502	0.07
503	0.08
504	0.12
505	0.14
506	0.14
507	0.17
508	0.2
509	0.2
510	0.2
511	0.19
512	0.19
513	0.17
514	0.17
515	0.16
516	0.15
517	0.19
518	0.21
519	0.22
520	0.2
521	0.22
522	0.24
523	0.24
524	0.23
525	0.2
526	0.2
527	0.21
528	0.2
529	0.18
530	0.17
531	0.15
532	0.18
533	0.22
534	0.2
535	0.18
536	0.17
537	0.17
538	0.18
539	0.18
540	0.14
541	0.1
542	0.09
543	0.11
544	0.11
545	0.13
546	0.12
547	0.11
548	0.15
549	0.16
550	0.17
551	0.18
552	0.23
553	0.22
554	0.29
555	0.29
556	0.24
557	0.23
558	0.22
559	0.21
560	0.18
561	0.17
562	0.12
563	0.17
564	0.17
565	0.21
566	0.24
567	0.23
568	0.22
569	0.22
570	0.2
571	0.17
572	0.18
573	0.17
574	0.15
575	0.18
576	0.19
577	0.21
578	0.24
579	0.26
580	0.25
581	0.23
582	0.23
583	0.21
584	0.22
585	0.21
586	0.18
587	0.2
588	0.2
589	0.2
590	0.22
591	0.21
592	0.22
593	0.22
594	0.22
595	0.23
596	0.28
597	0.35
598	0.37
599	0.43
600	0.44
601	0.49
602	0.52
603	0.48
604	0.48
605	0.4
606	0.35
607	0.34
608	0.31
609	0.25
610	0.24
611	0.25
612	0.2
613	0.2
614	0.22
615	0.2
616	0.18
617	0.18
618	0.19
619	0.18
620	0.16
621	0.18
622	0.22
623	0.17
624	0.17
625	0.19
626	0.17
627	0.16
628	0.18
629	0.17
630	0.19
631	0.2
632	0.21
633	0.2
634	0.22
635	0.25

Q8SQN6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer