Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N7CFD3

Protein Details
Accession A0A5N7CFD3    Localization Confidence Low Confidence Score 8.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
384-404GHYAPNPKKTRRNQVENTRALHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11.5, cyto 8.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR030843  PAN2  
IPR028881  PAN2_UCH_dom  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR028889  USP_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0031251  C:PAN complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004535  F:poly(A)-specific ribonuclease activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
PF13423  UCH_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50235  USP_3  
CDD cd06143  PAN2_exo  
Amino Acid Sequences MEADWDELSRIPVPPPTPHGLPTNATTIAFDDVMELLWVGNEYGRITSFCGPELQRYTSVRAHVSEGPVRQILFHDRGVISLSPKSVHMITRRGLTQWHITHEEMTELRCMSFTAQLNKIIVAGCQNTMFTIDIDKGQIVDKLPTEYKYTMMKKSRYLCAATDTGSVNALSLSDFRVVKSWKAHGTAINDMDARNDLLVTCGFSVRHLGQPIVDPLANVYDLKTLSPLPPIPFHAGAAYVRMHPKLHTTSFVASQNGQLQVVDLMNPNAINLRQANVSFMLGIDLSPSGEALAINDADCAIHLWGSPAKIHFNEMSKEVEFADVPARPPPLDWSPDTPLNMIGMPYYHERLFSAWPSHLVFEVGNPPAPVDQALIPYLRPAEIGHYAPNPKKTRRNQVENTRALATAEPALIAPKFLSEKAREQSKAKSDGLITDTVEALAGTKLNGEADDDPLLKYSNVEIKYSRFGVDDFDFRFYNQTKFSGLETHIANSFTNALLQLFKFIPLIRNVALHHAASTCIFENCLLCEMGYLFDMLEKANGQNCQATNLLKTFSSFREASSLGLLEENLTNKSLSNAIQAVNRFFLGQISHDFRMISPNSDDLDQKLATVASESIRCMFCQKEIIRPGNSLVNELIYPAIDLKQIRRNPAYRFSNILRASIERETQNRGWCNYCRRYQQVAIRKTVHRMPLVMMLNTALNNPICRRLWAIPGWLPEAVGLVVDAGQILCFEGEDLRMRIQSNMPGLVVYELVGVVSEIDIPEHQKAHLVSFINVSISSREPEAGSKWHLFNDFLVTEVDKDEALRFNQPWKVPCVVAYQVKDARHAMDDTWKKLLDTTLLFRDWSLNGGRSVDSLVTLSEEEKPTPGTPVALDTEFVDLEKAEIDVKADGSQEIVRPSKSGLARVSVLRGSGVREGAPFIDDYITIKETIVDYVTQYSGIKPGDLDPRTSQHNLVPLKVAYKKLWLLLNLGCIFVGHGLASDFRKINIQVPKSQTVDTQYLFFHPGKNRRLSLRYLAWAVFKEYIQEEPSDNNQGHDSIEDARMALRLWKKFQEYEDAGVVAQILEELFREGTKLGFRPPARNGAATVLSRPGTAVTMQNNSGRNTPSTPEVTGPAASAPTTPRQGFRRSVALTPSNGSFAGPGTGDFFGGSPLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.33
3 0.37
4 0.37
5 0.39
6 0.42
7 0.41
8 0.4
9 0.38
10 0.37
11 0.32
12 0.29
13 0.27
14 0.23
15 0.22
16 0.19
17 0.16
18 0.12
19 0.11
20 0.11
21 0.1
22 0.09
23 0.06
24 0.06
25 0.07
26 0.06
27 0.06
28 0.07
29 0.08
30 0.09
31 0.11
32 0.11
33 0.15
34 0.2
35 0.2
36 0.2
37 0.26
38 0.26
39 0.33
40 0.37
41 0.37
42 0.38
43 0.4
44 0.45
45 0.43
46 0.45
47 0.41
48 0.37
49 0.38
50 0.36
51 0.39
52 0.39
53 0.37
54 0.37
55 0.36
56 0.34
57 0.3
58 0.29
59 0.31
60 0.29
61 0.28
62 0.29
63 0.27
64 0.27
65 0.3
66 0.28
67 0.24
68 0.23
69 0.23
70 0.19
71 0.2
72 0.23
73 0.21
74 0.25
75 0.28
76 0.32
77 0.33
78 0.38
79 0.39
80 0.37
81 0.37
82 0.35
83 0.39
84 0.37
85 0.4
86 0.38
87 0.38
88 0.38
89 0.36
90 0.36
91 0.28
92 0.25
93 0.22
94 0.19
95 0.18
96 0.16
97 0.16
98 0.14
99 0.2
100 0.24
101 0.27
102 0.3
103 0.33
104 0.34
105 0.33
106 0.33
107 0.26
108 0.21
109 0.19
110 0.18
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.14
115 0.16
116 0.16
117 0.11
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.14
122 0.14
123 0.13
124 0.13
125 0.15
126 0.14
127 0.16
128 0.16
129 0.2
130 0.23
131 0.24
132 0.28
133 0.26
134 0.28
135 0.34
136 0.37
137 0.41
138 0.48
139 0.5
140 0.53
141 0.59
142 0.63
143 0.58
144 0.56
145 0.48
146 0.46
147 0.43
148 0.38
149 0.34
150 0.28
151 0.24
152 0.22
153 0.2
154 0.14
155 0.12
156 0.1
157 0.08
158 0.07
159 0.08
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.19
164 0.21
165 0.24
166 0.29
167 0.33
168 0.34
169 0.37
170 0.39
171 0.38
172 0.41
173 0.43
174 0.39
175 0.36
176 0.32
177 0.28
178 0.27
179 0.23
180 0.19
181 0.12
182 0.11
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.1
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.15
192 0.16
193 0.2
194 0.2
195 0.2
196 0.2
197 0.23
198 0.24
199 0.23
200 0.21
201 0.16
202 0.15
203 0.16
204 0.16
205 0.13
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.13
213 0.17
214 0.2
215 0.2
216 0.22
217 0.25
218 0.29
219 0.28
220 0.28
221 0.24
222 0.22
223 0.2
224 0.2
225 0.17
226 0.15
227 0.17
228 0.19
229 0.19
230 0.18
231 0.24
232 0.27
233 0.28
234 0.28
235 0.28
236 0.29
237 0.33
238 0.36
239 0.31
240 0.26
241 0.27
242 0.28
243 0.25
244 0.23
245 0.18
246 0.15
247 0.15
248 0.14
249 0.13
250 0.09
251 0.09
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.11
258 0.11
259 0.12
260 0.13
261 0.14
262 0.15
263 0.15
264 0.15
265 0.12
266 0.11
267 0.1
268 0.08
269 0.08
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.04
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.07
291 0.09
292 0.1
293 0.12
294 0.12
295 0.16
296 0.16
297 0.19
298 0.2
299 0.22
300 0.23
301 0.23
302 0.25
303 0.22
304 0.22
305 0.2
306 0.18
307 0.14
308 0.13
309 0.14
310 0.12
311 0.13
312 0.15
313 0.16
314 0.15
315 0.15
316 0.19
317 0.2
318 0.23
319 0.24
320 0.27
321 0.31
322 0.34
323 0.34
324 0.3
325 0.26
326 0.23
327 0.21
328 0.15
329 0.1
330 0.07
331 0.09
332 0.11
333 0.13
334 0.12
335 0.12
336 0.13
337 0.14
338 0.17
339 0.18
340 0.18
341 0.16
342 0.19
343 0.19
344 0.2
345 0.18
346 0.16
347 0.12
348 0.11
349 0.15
350 0.14
351 0.14
352 0.13
353 0.13
354 0.12
355 0.13
356 0.11
357 0.08
358 0.08
359 0.09
360 0.1
361 0.1
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.09
366 0.08
367 0.07
368 0.1
369 0.12
370 0.13
371 0.15
372 0.18
373 0.24
374 0.26
375 0.35
376 0.37
377 0.41
378 0.5
379 0.56
380 0.63
381 0.68
382 0.75
383 0.75
384 0.8
385 0.84
386 0.77
387 0.72
388 0.62
389 0.52
390 0.43
391 0.34
392 0.24
393 0.15
394 0.11
395 0.09
396 0.07
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.06
401 0.06
402 0.08
403 0.09
404 0.13
405 0.15
406 0.21
407 0.26
408 0.33
409 0.34
410 0.35
411 0.41
412 0.44
413 0.47
414 0.41
415 0.38
416 0.32
417 0.32
418 0.32
419 0.26
420 0.2
421 0.14
422 0.14
423 0.12
424 0.11
425 0.08
426 0.06
427 0.05
428 0.05
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.05
433 0.05
434 0.06
435 0.06
436 0.08
437 0.1
438 0.1
439 0.1
440 0.11
441 0.11
442 0.09
443 0.09
444 0.09
445 0.14
446 0.14
447 0.16
448 0.16
449 0.18
450 0.21
451 0.22
452 0.21
453 0.15
454 0.14
455 0.17
456 0.17
457 0.19
458 0.17
459 0.19
460 0.18
461 0.17
462 0.21
463 0.19
464 0.2
465 0.18
466 0.18
467 0.16
468 0.17
469 0.18
470 0.18
471 0.17
472 0.18
473 0.17
474 0.17
475 0.17
476 0.17
477 0.16
478 0.13
479 0.12
480 0.08
481 0.08
482 0.07
483 0.06
484 0.07
485 0.07
486 0.09
487 0.08
488 0.08
489 0.09
490 0.09
491 0.11
492 0.12
493 0.14
494 0.12
495 0.14
496 0.14
497 0.16
498 0.17
499 0.15
500 0.14
501 0.12
502 0.12
503 0.1
504 0.11
505 0.08
506 0.07
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.08
512 0.07
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.04
520 0.04
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.06
526 0.08
527 0.09
528 0.09
529 0.11
530 0.11
531 0.14
532 0.14
533 0.14
534 0.13
535 0.14
536 0.14
537 0.11
538 0.12
539 0.12
540 0.11
541 0.15
542 0.14
543 0.13
544 0.16
545 0.16
546 0.16
547 0.14
548 0.13
549 0.09
550 0.09
551 0.08
552 0.06
553 0.06
554 0.07
555 0.07
556 0.07
557 0.07
558 0.07
559 0.07
560 0.08
561 0.08
562 0.09
563 0.09
564 0.1
565 0.12
566 0.13
567 0.13
568 0.12
569 0.12
570 0.1
571 0.09
572 0.09
573 0.07
574 0.07
575 0.1
576 0.13
577 0.14
578 0.14
579 0.14
580 0.13
581 0.18
582 0.18
583 0.16
584 0.13
585 0.14
586 0.14
587 0.15
588 0.15
589 0.11
590 0.14
591 0.12
592 0.11
593 0.1
594 0.09
595 0.08
596 0.08
597 0.08
598 0.06
599 0.07
600 0.07
601 0.09
602 0.09
603 0.1
604 0.11
605 0.11
606 0.1
607 0.17
608 0.18
609 0.23
610 0.29
611 0.33
612 0.33
613 0.33
614 0.33
615 0.3
616 0.29
617 0.23
618 0.17
619 0.13
620 0.12
621 0.11
622 0.1
623 0.06
624 0.06
625 0.05
626 0.05
627 0.06
628 0.07
629 0.1
630 0.18
631 0.21
632 0.25
633 0.29
634 0.33
635 0.35
636 0.44
637 0.46
638 0.4
639 0.42
640 0.4
641 0.44
642 0.4
643 0.38
644 0.29
645 0.25
646 0.26
647 0.23
648 0.24
649 0.17
650 0.19
651 0.23
652 0.25
653 0.3
654 0.29
655 0.29
656 0.31
657 0.33
658 0.4
659 0.41
660 0.44
661 0.44
662 0.47
663 0.51
664 0.53
665 0.57
666 0.57
667 0.56
668 0.56
669 0.55
670 0.51
671 0.49
672 0.47
673 0.43
674 0.35
675 0.3
676 0.26
677 0.29
678 0.29
679 0.25
680 0.21
681 0.17
682 0.16
683 0.16
684 0.14
685 0.08
686 0.07
687 0.08
688 0.09
689 0.14
690 0.13
691 0.14
692 0.18
693 0.18
694 0.23
695 0.23
696 0.26
697 0.25
698 0.26
699 0.27
700 0.23
701 0.21
702 0.16
703 0.15
704 0.1
705 0.07
706 0.05
707 0.03
708 0.03
709 0.03
710 0.03
711 0.03
712 0.03
713 0.03
714 0.03
715 0.03
716 0.03
717 0.03
718 0.03
719 0.05
720 0.07
721 0.08
722 0.09
723 0.11
724 0.12
725 0.13
726 0.14
727 0.16
728 0.16
729 0.16
730 0.15
731 0.13
732 0.13
733 0.12
734 0.1
735 0.07
736 0.05
737 0.04
738 0.04
739 0.04
740 0.03
741 0.03
742 0.03
743 0.03
744 0.03
745 0.03
746 0.04
747 0.06
748 0.08
749 0.08
750 0.08
751 0.11
752 0.12
753 0.13
754 0.17
755 0.16
756 0.16
757 0.17
758 0.17
759 0.14
760 0.14
761 0.13
762 0.11
763 0.1
764 0.11
765 0.1
766 0.1
767 0.1
768 0.12
769 0.13
770 0.15
771 0.18
772 0.2
773 0.21
774 0.22
775 0.23
776 0.22
777 0.2
778 0.22
779 0.17
780 0.15
781 0.15
782 0.13
783 0.12
784 0.12
785 0.12
786 0.07
787 0.08
788 0.08
789 0.1
790 0.12
791 0.15
792 0.15
793 0.2
794 0.25
795 0.28
796 0.28
797 0.3
798 0.31
799 0.27
800 0.28
801 0.28
802 0.28
803 0.3
804 0.3
805 0.32
806 0.34
807 0.34
808 0.35
809 0.31
810 0.28
811 0.24
812 0.23
813 0.18
814 0.23
815 0.27
816 0.27
817 0.3
818 0.29
819 0.26
820 0.27
821 0.27
822 0.21
823 0.19
824 0.21
825 0.22
826 0.22
827 0.22
828 0.21
829 0.22
830 0.19
831 0.19
832 0.17
833 0.15
834 0.15
835 0.16
836 0.16
837 0.14
838 0.15
839 0.12
840 0.1
841 0.09
842 0.08
843 0.08
844 0.08
845 0.08
846 0.12
847 0.13
848 0.13
849 0.13
850 0.16
851 0.15
852 0.17
853 0.16
854 0.13
855 0.12
856 0.14
857 0.16
858 0.14
859 0.14
860 0.12
861 0.14
862 0.13
863 0.12
864 0.1
865 0.07
866 0.07
867 0.07
868 0.06
869 0.06
870 0.06
871 0.07
872 0.07
873 0.08
874 0.09
875 0.09
876 0.09
877 0.1
878 0.11
879 0.12
880 0.16
881 0.18
882 0.17
883 0.17
884 0.18
885 0.23
886 0.23
887 0.26
888 0.24
889 0.25
890 0.27
891 0.27
892 0.29
893 0.23
894 0.22
895 0.18
896 0.17
897 0.16
898 0.16
899 0.16
900 0.14
901 0.13
902 0.14
903 0.14
904 0.14
905 0.11
906 0.09
907 0.09
908 0.09
909 0.1
910 0.12
911 0.13
912 0.12
913 0.12
914 0.12
915 0.12
916 0.13
917 0.12
918 0.1
919 0.1
920 0.11
921 0.12
922 0.11
923 0.11
924 0.11
925 0.14
926 0.14
927 0.13
928 0.12
929 0.17
930 0.25
931 0.26
932 0.29
933 0.28
934 0.31
935 0.36
936 0.37
937 0.34
938 0.28
939 0.35
940 0.32
941 0.3
942 0.31
943 0.27
944 0.3
945 0.33
946 0.34
947 0.27
948 0.31
949 0.32
950 0.32
951 0.35
952 0.3
953 0.3
954 0.28
955 0.34
956 0.29
957 0.27
958 0.23
959 0.19
960 0.18
961 0.14
962 0.13
963 0.05
964 0.05
965 0.06
966 0.09
967 0.1
968 0.14
969 0.14
970 0.14
971 0.19
972 0.19
973 0.26
974 0.32
975 0.35
976 0.39
977 0.44
978 0.5
979 0.48
980 0.48
981 0.43
982 0.4
983 0.41
984 0.34
985 0.3
986 0.25
987 0.25
988 0.28
989 0.26
990 0.27
991 0.31
992 0.39
993 0.44
994 0.51
995 0.53
996 0.56
997 0.6
998 0.59
999 0.58
1000 0.56
1001 0.53
1002 0.49
1003 0.46
1004 0.42
1005 0.39
1006 0.36
1007 0.3
1008 0.24
1009 0.22
1010 0.21
1011 0.22
1012 0.2
1013 0.21
1014 0.19
1015 0.2
1016 0.25
1017 0.28
1018 0.26
1019 0.25
1020 0.25
1021 0.24
1022 0.23
1023 0.19
1024 0.17
1025 0.14
1026 0.16
1027 0.14
1028 0.13
1029 0.13
1030 0.13
1031 0.13
1032 0.18
1033 0.22
1034 0.26
1035 0.31
1036 0.37
1037 0.42
1038 0.45
1039 0.47
1040 0.5
1041 0.47
1042 0.46
1043 0.43
1044 0.37
1045 0.32
1046 0.28
1047 0.25
1048 0.15
1049 0.11
1050 0.07
1051 0.04
1052 0.04
1053 0.04
1054 0.06
1055 0.06
1056 0.07
1057 0.08
1058 0.08
1059 0.1
1060 0.15
1061 0.17
1062 0.2
1063 0.29
1064 0.32
1065 0.38
1066 0.43
1067 0.5
1068 0.48
1069 0.48
1070 0.44
1071 0.41
1072 0.43
1073 0.37
1074 0.35
1075 0.3
1076 0.27
1077 0.25
1078 0.24
1079 0.2
1080 0.16
1081 0.17
1082 0.19
1083 0.19
1084 0.23
1085 0.26
1086 0.31
1087 0.34
1088 0.35
1089 0.37
1090 0.35
1091 0.34
1092 0.32
1093 0.32
1094 0.33
1095 0.33
1096 0.33
1097 0.31
1098 0.3
1099 0.29
1100 0.27
1101 0.24
1102 0.2
1103 0.17
1104 0.15
1105 0.15
1106 0.16
1107 0.2
1108 0.26
1109 0.27
1110 0.33
1111 0.37
1112 0.44
1113 0.48
1114 0.49
1115 0.52
1116 0.49
1117 0.52
1118 0.53
1119 0.52
1120 0.48
1121 0.46
1122 0.42
1123 0.35
1124 0.31
1125 0.27
1126 0.2
1127 0.16
1128 0.15
1129 0.12
1130 0.11
1131 0.13
1132 0.13
1133 0.13
1134 0.13
1135 0.12