Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6FXR1

Protein Details
Accession A0A5N6FXR1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
119-143AKSEMGEKKKRKRAPPDPNAPKRALBasic
278-333ASPAETKKASPEKKKTRTPAAREKKAQEETPVSTRKTTAAEKRSKKKRKSEAGADEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-140MGEKKKRKRAPPDPNAPK
259-327PPRAGKRRRSEAAKTAKEVASPAETKKASPEKKKTRTPAAREKKAQEETPVSTRKTTAAEKRSKKKRKS
Subcellular Location(s) mito 18.5, cyto_mito 10.5, nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MARRASTPGPTQPSLPFRDLITSLARATDCVNAATFGVRAVATVPPSQAQLTYSQVIVSIAHLQAAVTKLSEAYINHANTVLSRGSTVDIANVTRITNSLYEGNLLGASVGARATSPGAKSEMGEKKKRKRAPPDPNAPKRALTPFFLFMQHNRSKIAAELGDSAKPKDVSDEGTRRWAEMPEPEKEHWKNMYADNLAVYKEKMKAYKAGLPFSDDVKAANQLQQEADRAEATAAEESDEEEEEEEGEESPEPVREPTPPRAGKRRRSEAAKTAKEVASPAETKKASPEKKKTRTPAAREKKAQEETPVSTRKTTAAEKRSKKKRKSEAGADE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.47
3 0.4
4 0.34
5 0.37
6 0.35
7 0.31
8 0.28
9 0.25
10 0.22
11 0.24
12 0.23
13 0.19
14 0.2
15 0.21
16 0.18
17 0.16
18 0.17
19 0.14
20 0.14
21 0.15
22 0.13
23 0.09
24 0.09
25 0.08
26 0.08
27 0.09
28 0.11
29 0.12
30 0.13
31 0.14
32 0.14
33 0.16
34 0.16
35 0.15
36 0.14
37 0.15
38 0.17
39 0.17
40 0.17
41 0.15
42 0.15
43 0.15
44 0.14
45 0.12
46 0.12
47 0.1
48 0.11
49 0.1
50 0.1
51 0.12
52 0.13
53 0.12
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.09
58 0.11
59 0.09
60 0.12
61 0.19
62 0.19
63 0.19
64 0.2
65 0.19
66 0.17
67 0.2
68 0.16
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.1
73 0.11
74 0.11
75 0.09
76 0.1
77 0.1
78 0.11
79 0.11
80 0.1
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.09
85 0.1
86 0.11
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.09
92 0.08
93 0.06
94 0.05
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.03
99 0.03
100 0.04
101 0.05
102 0.07
103 0.07
104 0.09
105 0.11
106 0.11
107 0.12
108 0.2
109 0.27
110 0.32
111 0.4
112 0.48
113 0.56
114 0.65
115 0.72
116 0.72
117 0.75
118 0.79
119 0.82
120 0.84
121 0.85
122 0.87
123 0.88
124 0.84
125 0.74
126 0.64
127 0.56
128 0.51
129 0.42
130 0.34
131 0.28
132 0.26
133 0.25
134 0.26
135 0.24
136 0.2
137 0.26
138 0.26
139 0.24
140 0.23
141 0.22
142 0.2
143 0.2
144 0.21
145 0.12
146 0.1
147 0.12
148 0.12
149 0.14
150 0.15
151 0.14
152 0.14
153 0.14
154 0.13
155 0.12
156 0.11
157 0.13
158 0.19
159 0.23
160 0.22
161 0.28
162 0.29
163 0.27
164 0.28
165 0.24
166 0.19
167 0.22
168 0.24
169 0.21
170 0.25
171 0.25
172 0.32
173 0.32
174 0.35
175 0.29
176 0.3
177 0.28
178 0.26
179 0.31
180 0.24
181 0.23
182 0.21
183 0.2
184 0.17
185 0.15
186 0.14
187 0.11
188 0.14
189 0.16
190 0.17
191 0.18
192 0.21
193 0.24
194 0.3
195 0.31
196 0.31
197 0.29
198 0.3
199 0.3
200 0.27
201 0.25
202 0.18
203 0.16
204 0.14
205 0.16
206 0.13
207 0.15
208 0.14
209 0.14
210 0.15
211 0.15
212 0.16
213 0.13
214 0.14
215 0.11
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.1
242 0.15
243 0.2
244 0.27
245 0.37
246 0.42
247 0.48
248 0.58
249 0.67
250 0.71
251 0.76
252 0.78
253 0.76
254 0.78
255 0.79
256 0.77
257 0.79
258 0.74
259 0.67
260 0.64
261 0.57
262 0.49
263 0.43
264 0.36
265 0.3
266 0.27
267 0.26
268 0.28
269 0.28
270 0.27
271 0.35
272 0.43
273 0.46
274 0.54
275 0.63
276 0.67
277 0.76
278 0.85
279 0.85
280 0.86
281 0.87
282 0.86
283 0.87
284 0.87
285 0.87
286 0.86
287 0.83
288 0.82
289 0.78
290 0.72
291 0.68
292 0.63
293 0.58
294 0.59
295 0.59
296 0.51
297 0.46
298 0.44
299 0.4
300 0.39
301 0.43
302 0.44
303 0.48
304 0.56
305 0.65
306 0.74
307 0.82
308 0.87
309 0.89
310 0.89
311 0.9
312 0.91
313 0.91