Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6GH01

Protein Details
Accession A0A5N6GH01    Localization Confidence Low Confidence Score 6.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-193DSESKNSSKKMRSKRKSDNSDDDEDMHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 19, cyto_nucl 5, nucl 4, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR013934  Utp13_C  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08625  Utp13  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MSKAVVKTTFEASRTLRPIYTGGSTALDASGRLLAACVGEDALIVDLETGDQLASLEGDGEIITSLAITPSASHVIICSRSMSMRIYSLTPLEDSSRTINAKLVRSLKPHTAPVVTTATDQTGTLLATGASDGSIKVWDIRGGYVTHTFHGHAGVVSALCFFQVPFLDSESKNSSKKMRSKRKSDNSDDDEDMQDVASTSIGGFRLASGSEEGKVRVWDLNKRKSIASLESHVSVVRSLSYSPAENALLSASRDKTVIVWDVRTFKTRRIIPVLESVEAAAFVADSGLALVGGENGKLRVWDCNRGGEVTQEQEAAAEFEAVVAIQYTPGMPFAMTVHADQTLKLHSLESLLNYKPGSSLDPLPVIRRISGNDDDIIDLAYVGPDRSMLALATNTESIRLISVRPSTDRPSDKEEGYFGADIAHLDGHDDIIICIDVDWSGHWLATGAKDNAARLWRLDPKTSSYTCFAVMTGHAESLGAISFPRVPPPANTPARNDPLNHPPQFLLTGSQDRTIKRWDMGKLAPLTSSKPHTPKAIFTRKAHEKDINALDVDPTSTLFASASQDRTVKIWSAEEGTVVGILRGHKRGVWSARFAPHGTPTISTRPQSSTNRGLIVTGSGDKTVKLWSLSDYSCLLTFEGHTNSVLKVLWLPPSDLSTKKDGGDDEDDDDEEAPMQNTATQPRPLVASAAADGLVKIWSPYTGELETTLDNHTDRVWALASPTPSGSRADVLSSSNTHKISSPYAIASGSADSTVTFWTDTTSATYTATVSANAARIEQDQKLENYIRAGAYREAITLALQLNHPGRLLSLFTAAVDAADNPYSTDSQKNERADSLTGDPSIDEVLQTLDSDNLRILLLRLRDWNTNARTSRVAQRILYALFRSYPASAFIELATASMANRRNDSRTATSMKDILQAMAAYTERHYRRIEELTDESYLVEWVLGEMDGGVGLGGLSVSGTRDADDVPDHEKDTIMLGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.42
3 0.36
4 0.34
5 0.35
6 0.33
7 0.32
8 0.25
9 0.22
10 0.21
11 0.21
12 0.19
13 0.18
14 0.15
15 0.12
16 0.11
17 0.11
18 0.09
19 0.09
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.06
26 0.06
27 0.06
28 0.07
29 0.07
30 0.06
31 0.06
32 0.05
33 0.05
34 0.05
35 0.05
36 0.05
37 0.04
38 0.04
39 0.04
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.05
48 0.05
49 0.05
50 0.04
51 0.04
52 0.04
53 0.04
54 0.05
55 0.04
56 0.05
57 0.08
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.12
62 0.16
63 0.18
64 0.18
65 0.17
66 0.16
67 0.17
68 0.2
69 0.21
70 0.19
71 0.2
72 0.21
73 0.21
74 0.22
75 0.22
76 0.22
77 0.2
78 0.19
79 0.2
80 0.19
81 0.19
82 0.2
83 0.24
84 0.24
85 0.24
86 0.27
87 0.3
88 0.33
89 0.37
90 0.41
91 0.41
92 0.45
93 0.49
94 0.53
95 0.52
96 0.52
97 0.48
98 0.44
99 0.39
100 0.38
101 0.38
102 0.3
103 0.27
104 0.24
105 0.21
106 0.19
107 0.19
108 0.15
109 0.12
110 0.11
111 0.09
112 0.08
113 0.07
114 0.06
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.07
123 0.08
124 0.1
125 0.11
126 0.12
127 0.13
128 0.15
129 0.15
130 0.17
131 0.22
132 0.21
133 0.21
134 0.21
135 0.21
136 0.19
137 0.2
138 0.18
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.08
151 0.1
152 0.1
153 0.14
154 0.19
155 0.19
156 0.25
157 0.29
158 0.33
159 0.33
160 0.35
161 0.4
162 0.44
163 0.53
164 0.6
165 0.65
166 0.69
167 0.78
168 0.86
169 0.89
170 0.9
171 0.9
172 0.89
173 0.84
174 0.8
175 0.72
176 0.63
177 0.53
178 0.44
179 0.34
180 0.24
181 0.17
182 0.12
183 0.09
184 0.07
185 0.05
186 0.05
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.1
197 0.11
198 0.13
199 0.13
200 0.14
201 0.14
202 0.15
203 0.16
204 0.19
205 0.27
206 0.35
207 0.44
208 0.47
209 0.49
210 0.48
211 0.48
212 0.49
213 0.45
214 0.4
215 0.35
216 0.32
217 0.31
218 0.31
219 0.28
220 0.24
221 0.18
222 0.14
223 0.1
224 0.09
225 0.08
226 0.1
227 0.12
228 0.12
229 0.13
230 0.15
231 0.14
232 0.13
233 0.13
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.14
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.13
242 0.13
243 0.15
244 0.19
245 0.17
246 0.18
247 0.21
248 0.26
249 0.27
250 0.33
251 0.31
252 0.3
253 0.37
254 0.39
255 0.41
256 0.43
257 0.44
258 0.4
259 0.48
260 0.45
261 0.37
262 0.34
263 0.28
264 0.21
265 0.18
266 0.16
267 0.06
268 0.04
269 0.03
270 0.03
271 0.02
272 0.02
273 0.02
274 0.02
275 0.02
276 0.02
277 0.02
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.07
285 0.07
286 0.14
287 0.17
288 0.25
289 0.27
290 0.31
291 0.31
292 0.32
293 0.32
294 0.27
295 0.26
296 0.2
297 0.19
298 0.14
299 0.13
300 0.12
301 0.12
302 0.1
303 0.08
304 0.06
305 0.05
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.05
318 0.04
319 0.05
320 0.06
321 0.08
322 0.09
323 0.09
324 0.1
325 0.12
326 0.12
327 0.11
328 0.12
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.11
333 0.09
334 0.11
335 0.11
336 0.12
337 0.15
338 0.14
339 0.15
340 0.15
341 0.15
342 0.13
343 0.14
344 0.13
345 0.12
346 0.14
347 0.14
348 0.18
349 0.18
350 0.19
351 0.22
352 0.21
353 0.19
354 0.18
355 0.18
356 0.2
357 0.22
358 0.21
359 0.19
360 0.18
361 0.18
362 0.16
363 0.15
364 0.09
365 0.07
366 0.05
367 0.05
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.03
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.07
380 0.08
381 0.07
382 0.08
383 0.08
384 0.07
385 0.08
386 0.07
387 0.07
388 0.09
389 0.12
390 0.13
391 0.15
392 0.18
393 0.21
394 0.28
395 0.31
396 0.31
397 0.36
398 0.37
399 0.36
400 0.33
401 0.3
402 0.25
403 0.23
404 0.2
405 0.12
406 0.1
407 0.09
408 0.08
409 0.08
410 0.07
411 0.04
412 0.05
413 0.05
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.06
432 0.08
433 0.11
434 0.1
435 0.12
436 0.13
437 0.13
438 0.15
439 0.16
440 0.14
441 0.11
442 0.15
443 0.2
444 0.22
445 0.24
446 0.24
447 0.27
448 0.32
449 0.32
450 0.3
451 0.25
452 0.24
453 0.22
454 0.21
455 0.16
456 0.12
457 0.11
458 0.11
459 0.09
460 0.08
461 0.07
462 0.06
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.03
467 0.03
468 0.03
469 0.05
470 0.05
471 0.07
472 0.08
473 0.09
474 0.1
475 0.16
476 0.25
477 0.28
478 0.3
479 0.32
480 0.37
481 0.4
482 0.4
483 0.36
484 0.31
485 0.35
486 0.41
487 0.37
488 0.32
489 0.29
490 0.28
491 0.28
492 0.24
493 0.17
494 0.12
495 0.15
496 0.15
497 0.18
498 0.2
499 0.19
500 0.21
501 0.22
502 0.21
503 0.2
504 0.23
505 0.22
506 0.24
507 0.24
508 0.27
509 0.26
510 0.24
511 0.24
512 0.2
513 0.2
514 0.18
515 0.21
516 0.2
517 0.22
518 0.24
519 0.27
520 0.28
521 0.32
522 0.39
523 0.46
524 0.48
525 0.46
526 0.53
527 0.57
528 0.59
529 0.57
530 0.51
531 0.42
532 0.43
533 0.43
534 0.35
535 0.27
536 0.23
537 0.19
538 0.16
539 0.15
540 0.08
541 0.06
542 0.05
543 0.05
544 0.05
545 0.05
546 0.05
547 0.08
548 0.09
549 0.1
550 0.12
551 0.13
552 0.13
553 0.14
554 0.14
555 0.13
556 0.12
557 0.11
558 0.11
559 0.13
560 0.12
561 0.11
562 0.1
563 0.09
564 0.08
565 0.08
566 0.07
567 0.05
568 0.07
569 0.1
570 0.11
571 0.11
572 0.12
573 0.13
574 0.19
575 0.24
576 0.26
577 0.28
578 0.31
579 0.34
580 0.35
581 0.34
582 0.3
583 0.26
584 0.26
585 0.23
586 0.2
587 0.19
588 0.23
589 0.26
590 0.25
591 0.24
592 0.24
593 0.31
594 0.34
595 0.38
596 0.38
597 0.37
598 0.38
599 0.36
600 0.33
601 0.26
602 0.22
603 0.17
604 0.12
605 0.1
606 0.09
607 0.09
608 0.09
609 0.1
610 0.1
611 0.1
612 0.09
613 0.09
614 0.11
615 0.14
616 0.15
617 0.16
618 0.16
619 0.15
620 0.15
621 0.15
622 0.13
623 0.09
624 0.1
625 0.11
626 0.12
627 0.12
628 0.12
629 0.12
630 0.12
631 0.13
632 0.12
633 0.09
634 0.09
635 0.1
636 0.14
637 0.14
638 0.15
639 0.14
640 0.17
641 0.2
642 0.2
643 0.22
644 0.22
645 0.23
646 0.23
647 0.24
648 0.22
649 0.23
650 0.24
651 0.23
652 0.21
653 0.2
654 0.19
655 0.18
656 0.18
657 0.13
658 0.09
659 0.08
660 0.06
661 0.06
662 0.05
663 0.07
664 0.08
665 0.12
666 0.15
667 0.16
668 0.17
669 0.17
670 0.19
671 0.18
672 0.17
673 0.14
674 0.12
675 0.1
676 0.1
677 0.1
678 0.08
679 0.08
680 0.07
681 0.06
682 0.05
683 0.05
684 0.05
685 0.05
686 0.06
687 0.08
688 0.11
689 0.11
690 0.11
691 0.12
692 0.14
693 0.14
694 0.14
695 0.14
696 0.11
697 0.11
698 0.11
699 0.1
700 0.1
701 0.09
702 0.09
703 0.09
704 0.08
705 0.1
706 0.13
707 0.14
708 0.14
709 0.15
710 0.15
711 0.15
712 0.16
713 0.15
714 0.14
715 0.13
716 0.14
717 0.14
718 0.14
719 0.15
720 0.16
721 0.19
722 0.22
723 0.22
724 0.21
725 0.22
726 0.23
727 0.24
728 0.24
729 0.23
730 0.19
731 0.19
732 0.19
733 0.17
734 0.15
735 0.12
736 0.1
737 0.08
738 0.07
739 0.06
740 0.07
741 0.07
742 0.07
743 0.06
744 0.06
745 0.08
746 0.08
747 0.09
748 0.11
749 0.12
750 0.12
751 0.13
752 0.13
753 0.12
754 0.13
755 0.13
756 0.1
757 0.1
758 0.11
759 0.13
760 0.13
761 0.13
762 0.12
763 0.14
764 0.17
765 0.18
766 0.19
767 0.2
768 0.21
769 0.26
770 0.26
771 0.24
772 0.23
773 0.23
774 0.21
775 0.19
776 0.21
777 0.17
778 0.17
779 0.17
780 0.15
781 0.14
782 0.13
783 0.12
784 0.12
785 0.12
786 0.11
787 0.11
788 0.15
789 0.16
790 0.17
791 0.17
792 0.14
793 0.13
794 0.13
795 0.15
796 0.11
797 0.12
798 0.11
799 0.11
800 0.11
801 0.11
802 0.09
803 0.08
804 0.08
805 0.07
806 0.08
807 0.08
808 0.08
809 0.1
810 0.11
811 0.13
812 0.18
813 0.19
814 0.26
815 0.34
816 0.36
817 0.37
818 0.38
819 0.39
820 0.35
821 0.36
822 0.33
823 0.28
824 0.25
825 0.23
826 0.2
827 0.18
828 0.17
829 0.13
830 0.09
831 0.07
832 0.08
833 0.08
834 0.08
835 0.08
836 0.1
837 0.1
838 0.11
839 0.11
840 0.1
841 0.1
842 0.1
843 0.11
844 0.13
845 0.15
846 0.17
847 0.23
848 0.25
849 0.3
850 0.33
851 0.41
852 0.4
853 0.46
854 0.46
855 0.43
856 0.44
857 0.44
858 0.5
859 0.48
860 0.48
861 0.4
862 0.41
863 0.42
864 0.4
865 0.39
866 0.31
867 0.26
868 0.23
869 0.23
870 0.22
871 0.19
872 0.18
873 0.18
874 0.19
875 0.18
876 0.18
877 0.16
878 0.15
879 0.14
880 0.13
881 0.1
882 0.08
883 0.07
884 0.12
885 0.18
886 0.19
887 0.24
888 0.27
889 0.31
890 0.35
891 0.41
892 0.42
893 0.43
894 0.46
895 0.45
896 0.45
897 0.44
898 0.41
899 0.4
900 0.34
901 0.28
902 0.24
903 0.21
904 0.18
905 0.18
906 0.17
907 0.12
908 0.14
909 0.22
910 0.22
911 0.27
912 0.29
913 0.29
914 0.35
915 0.41
916 0.42
917 0.4
918 0.42
919 0.41
920 0.4
921 0.37
922 0.31
923 0.24
924 0.22
925 0.15
926 0.1
927 0.07
928 0.06
929 0.06
930 0.06
931 0.05
932 0.05
933 0.05
934 0.04
935 0.04
936 0.04
937 0.03
938 0.03
939 0.03
940 0.03
941 0.02
942 0.03
943 0.03
944 0.05
945 0.06
946 0.07
947 0.08
948 0.09
949 0.1
950 0.12
951 0.14
952 0.16
953 0.19
954 0.21
955 0.22
956 0.21
957 0.21
958 0.19