Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6FH60

Protein Details
Accession A0A5N6FH60    Localization Confidence High Confidence Score 19.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MAPDKKDKKRKGMLALPLFRLHydrophilic
78-98KLKVNGKPARQVKPRKRAADFHydrophilic
208-234VPKIPDSKKAKRKILKKQKENKQEAEEBasic
322-349WKGANRRFKRTPWNRLEKKRLEKGKTREBasic
414-442LKEEKKKADDTPRKAKKDKKTGAQQAEQEBasic
457-477ASPTTKAGAKAKKAKKTKAKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-49KTKKVA
61-94KPIMKKDMDSGAEKPAAKLKVNGKPARQVKPRKR
124-151KKTKKADGTAAPAPKEKTKAKASTKAKK
214-227SKKAKRKILKKQKE
325-349ANRRFKRTPWNRLEKKRLEKGKTRE
417-434EKKKADDTPRKAKKDKKT
462-477KAGAKAKKAKKTKAKA
Subcellular Location(s) nucl 15, mito_nucl 12.666, cyto_nucl 9.666, mito 9, cyto_mito 6.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPDKKDKKRKGMLALPLFRLFMSVAHNFAAAAATAAADSPAKKTKKVAAKPTESTNASPKPIMKKDMDSGAEKPAAKLKVNGKPARQVKPRKRAADFLSDNDDSEPEEAAETKAETEMKSINKKTKKADGTAAPAPKEKTKAKASTKAKKTEPVVEVSDDDEESAASGASASEVEEDDRTAALIRGFESSGDEGESGDEGFNPDQSVPKIPDSKKAKRKILKKQKENKQEAEEPGTVYVGRIPHGFYEHQMRAYFSQFGDISRLRLSRNRVTGRSKHYAFIEFSSTSVAKIVAATMDNYLMYGHILKCKYVPQEQLHPEIWKGANRRFKRTPWNRLEKKRLEKGKTREQWSERIEREQQKRIAKAEALKALGYELELPQLKSVDEVPVQQEENKTIGVSETAPEEPPKTIETLKEEKKKADDTPRKAKKDKKTGAQQAEQEAPKEQPTKEASAATASPTTKAGAKAKKAKKTKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.82
3 0.76
4 0.67
5 0.59
6 0.49
7 0.41
8 0.31
9 0.22
10 0.21
11 0.18
12 0.18
13 0.18
14 0.18
15 0.16
16 0.16
17 0.15
18 0.09
19 0.08
20 0.06
21 0.06
22 0.05
23 0.06
24 0.06
25 0.07
26 0.08
27 0.12
28 0.2
29 0.23
30 0.25
31 0.3
32 0.38
33 0.47
34 0.56
35 0.62
36 0.64
37 0.7
38 0.72
39 0.74
40 0.73
41 0.65
42 0.59
43 0.57
44 0.52
45 0.46
46 0.45
47 0.44
48 0.45
49 0.48
50 0.51
51 0.46
52 0.46
53 0.48
54 0.52
55 0.5
56 0.44
57 0.41
58 0.41
59 0.42
60 0.37
61 0.34
62 0.33
63 0.33
64 0.31
65 0.35
66 0.38
67 0.41
68 0.51
69 0.56
70 0.53
71 0.59
72 0.66
73 0.69
74 0.71
75 0.73
76 0.74
77 0.79
78 0.85
79 0.83
80 0.79
81 0.77
82 0.72
83 0.72
84 0.65
85 0.58
86 0.56
87 0.47
88 0.44
89 0.36
90 0.32
91 0.21
92 0.19
93 0.15
94 0.08
95 0.08
96 0.09
97 0.08
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.16
106 0.2
107 0.28
108 0.33
109 0.4
110 0.46
111 0.52
112 0.56
113 0.61
114 0.6
115 0.56
116 0.59
117 0.55
118 0.55
119 0.56
120 0.54
121 0.46
122 0.44
123 0.42
124 0.38
125 0.39
126 0.35
127 0.36
128 0.4
129 0.48
130 0.52
131 0.6
132 0.66
133 0.7
134 0.75
135 0.76
136 0.71
137 0.68
138 0.64
139 0.63
140 0.55
141 0.49
142 0.43
143 0.37
144 0.34
145 0.28
146 0.26
147 0.17
148 0.14
149 0.1
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.04
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.04
161 0.04
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.06
182 0.07
183 0.07
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.08
193 0.09
194 0.12
195 0.12
196 0.16
197 0.24
198 0.24
199 0.33
200 0.4
201 0.49
202 0.55
203 0.62
204 0.67
205 0.67
206 0.76
207 0.78
208 0.81
209 0.82
210 0.84
211 0.85
212 0.86
213 0.89
214 0.86
215 0.8
216 0.75
217 0.7
218 0.61
219 0.56
220 0.47
221 0.36
222 0.3
223 0.25
224 0.18
225 0.13
226 0.12
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.1
233 0.11
234 0.1
235 0.17
236 0.17
237 0.19
238 0.19
239 0.2
240 0.19
241 0.2
242 0.21
243 0.13
244 0.16
245 0.13
246 0.13
247 0.17
248 0.15
249 0.15
250 0.16
251 0.17
252 0.16
253 0.2
254 0.26
255 0.27
256 0.35
257 0.39
258 0.42
259 0.47
260 0.53
261 0.56
262 0.58
263 0.53
264 0.47
265 0.44
266 0.42
267 0.37
268 0.32
269 0.28
270 0.2
271 0.19
272 0.19
273 0.17
274 0.14
275 0.13
276 0.11
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.05
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.05
289 0.05
290 0.07
291 0.07
292 0.12
293 0.13
294 0.13
295 0.14
296 0.19
297 0.23
298 0.26
299 0.32
300 0.31
301 0.4
302 0.43
303 0.47
304 0.45
305 0.42
306 0.37
307 0.34
308 0.32
309 0.27
310 0.28
311 0.3
312 0.38
313 0.41
314 0.49
315 0.5
316 0.55
317 0.62
318 0.67
319 0.71
320 0.71
321 0.79
322 0.8
323 0.85
324 0.89
325 0.88
326 0.87
327 0.86
328 0.85
329 0.81
330 0.81
331 0.79
332 0.8
333 0.78
334 0.75
335 0.74
336 0.68
337 0.7
338 0.66
339 0.67
340 0.58
341 0.56
342 0.59
343 0.59
344 0.63
345 0.62
346 0.64
347 0.62
348 0.64
349 0.6
350 0.55
351 0.5
352 0.49
353 0.47
354 0.44
355 0.38
356 0.34
357 0.31
358 0.27
359 0.23
360 0.18
361 0.13
362 0.08
363 0.12
364 0.14
365 0.14
366 0.15
367 0.15
368 0.15
369 0.14
370 0.15
371 0.14
372 0.14
373 0.16
374 0.17
375 0.19
376 0.21
377 0.22
378 0.23
379 0.21
380 0.21
381 0.2
382 0.17
383 0.14
384 0.14
385 0.12
386 0.11
387 0.1
388 0.11
389 0.12
390 0.14
391 0.15
392 0.16
393 0.16
394 0.17
395 0.17
396 0.17
397 0.18
398 0.21
399 0.27
400 0.35
401 0.43
402 0.51
403 0.53
404 0.54
405 0.58
406 0.59
407 0.6
408 0.62
409 0.63
410 0.63
411 0.71
412 0.77
413 0.8
414 0.83
415 0.84
416 0.84
417 0.85
418 0.85
419 0.84
420 0.85
421 0.87
422 0.87
423 0.85
424 0.79
425 0.73
426 0.72
427 0.63
428 0.54
429 0.46
430 0.39
431 0.38
432 0.38
433 0.33
434 0.32
435 0.35
436 0.39
437 0.39
438 0.39
439 0.34
440 0.33
441 0.34
442 0.29
443 0.29
444 0.24
445 0.23
446 0.22
447 0.23
448 0.22
449 0.27
450 0.33
451 0.37
452 0.46
453 0.56
454 0.64
455 0.72
456 0.78
457 0.83