Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6FQ15

Protein Details
Accession A0A5N6FQ15    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
331-350GTPIRRKKRKGALTNPSAYSHydrophilic
441-464NTSSQAKRKGAKAKRGKNGNEAIGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
116-118GKG
335-340RRKKRK
447-458KRKGAKAKRGKN
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 7, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPPRKQWIDKKNATTYQLFHRAQHDPLIHDSSADDRVLYPVSGPAPGTSTSEARGKKLADLASEFGVETVRKNEGEAANYGVFYDDSKYDYMQHLRELGTGGGDSYFVEARSKDKGKGKVKGMKLEDALREASLDDVRSEYGPRSVYGSEIRSTASSYARQPTYQDQQNVPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEEFVDEEDVDDVFGKLTSQAEEMEEGDWEDTLFDEEDDDGWESDATEKAPVQPSTTDYKPQQKDTSAQSKSQDAGSDELPDHDAPAPDMHPEDQGWMREFAKFKKDGKVKAAPAAPASIVPSEQRSTLASTVFTAGGTPIRRKKRKGALTNPSAYSMTSSALARTEGHRLLDDRFDRVEALYALDEEDEYDDSMSMVSGMTGMTGMTGFSTASSQAPSLIDANGVAVAPRHDFNEVMDSFLAGWDGNTSSQAKRKGAKAKRGKNGNEAIGIKMLDEIRQGLGPARMSGKASGRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.63
3 0.62
4 0.63
5 0.56
6 0.5
7 0.49
8 0.48
9 0.46
10 0.5
11 0.43
12 0.36
13 0.4
14 0.42
15 0.36
16 0.32
17 0.31
18 0.26
19 0.26
20 0.23
21 0.18
22 0.13
23 0.15
24 0.16
25 0.16
26 0.13
27 0.13
28 0.14
29 0.15
30 0.15
31 0.14
32 0.15
33 0.16
34 0.18
35 0.18
36 0.18
37 0.2
38 0.26
39 0.27
40 0.27
41 0.31
42 0.29
43 0.29
44 0.34
45 0.33
46 0.29
47 0.31
48 0.3
49 0.27
50 0.26
51 0.23
52 0.17
53 0.17
54 0.14
55 0.12
56 0.13
57 0.15
58 0.14
59 0.15
60 0.21
61 0.22
62 0.24
63 0.24
64 0.26
65 0.23
66 0.23
67 0.22
68 0.17
69 0.14
70 0.12
71 0.13
72 0.09
73 0.11
74 0.12
75 0.13
76 0.15
77 0.2
78 0.24
79 0.23
80 0.24
81 0.25
82 0.25
83 0.25
84 0.24
85 0.19
86 0.15
87 0.13
88 0.11
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.07
93 0.08
94 0.07
95 0.09
96 0.09
97 0.12
98 0.2
99 0.23
100 0.27
101 0.34
102 0.44
103 0.51
104 0.58
105 0.65
106 0.66
107 0.69
108 0.71
109 0.67
110 0.62
111 0.57
112 0.54
113 0.46
114 0.4
115 0.35
116 0.26
117 0.23
118 0.18
119 0.16
120 0.12
121 0.11
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.13
129 0.13
130 0.13
131 0.15
132 0.14
133 0.16
134 0.19
135 0.2
136 0.18
137 0.18
138 0.18
139 0.15
140 0.16
141 0.16
142 0.15
143 0.16
144 0.18
145 0.24
146 0.24
147 0.24
148 0.26
149 0.29
150 0.35
151 0.38
152 0.39
153 0.35
154 0.37
155 0.4
156 0.38
157 0.32
158 0.25
159 0.19
160 0.15
161 0.14
162 0.11
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.13
172 0.13
173 0.13
174 0.13
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.06
184 0.05
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.03
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.08
230 0.12
231 0.12
232 0.13
233 0.13
234 0.16
235 0.2
236 0.21
237 0.23
238 0.23
239 0.32
240 0.34
241 0.37
242 0.37
243 0.34
244 0.36
245 0.39
246 0.45
247 0.38
248 0.38
249 0.36
250 0.35
251 0.33
252 0.3
253 0.26
254 0.17
255 0.16
256 0.14
257 0.14
258 0.12
259 0.12
260 0.13
261 0.11
262 0.11
263 0.1
264 0.1
265 0.09
266 0.1
267 0.1
268 0.09
269 0.1
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.11
274 0.11
275 0.13
276 0.14
277 0.15
278 0.15
279 0.18
280 0.2
281 0.2
282 0.25
283 0.28
284 0.29
285 0.36
286 0.42
287 0.43
288 0.48
289 0.53
290 0.49
291 0.5
292 0.5
293 0.41
294 0.36
295 0.33
296 0.26
297 0.18
298 0.17
299 0.12
300 0.09
301 0.09
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.12
306 0.11
307 0.14
308 0.14
309 0.14
310 0.12
311 0.12
312 0.13
313 0.12
314 0.11
315 0.09
316 0.08
317 0.11
318 0.13
319 0.18
320 0.25
321 0.36
322 0.43
323 0.47
324 0.56
325 0.63
326 0.71
327 0.75
328 0.78
329 0.78
330 0.8
331 0.81
332 0.72
333 0.64
334 0.54
335 0.43
336 0.35
337 0.25
338 0.17
339 0.13
340 0.12
341 0.1
342 0.11
343 0.12
344 0.11
345 0.12
346 0.17
347 0.17
348 0.17
349 0.19
350 0.19
351 0.21
352 0.27
353 0.27
354 0.24
355 0.23
356 0.23
357 0.22
358 0.21
359 0.21
360 0.13
361 0.14
362 0.11
363 0.1
364 0.1
365 0.09
366 0.09
367 0.07
368 0.08
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.06
376 0.05
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.05
392 0.06
393 0.07
394 0.08
395 0.08
396 0.1
397 0.1
398 0.12
399 0.12
400 0.11
401 0.11
402 0.09
403 0.1
404 0.09
405 0.08
406 0.07
407 0.06
408 0.08
409 0.1
410 0.11
411 0.11
412 0.12
413 0.13
414 0.14
415 0.22
416 0.2
417 0.21
418 0.2
419 0.19
420 0.17
421 0.17
422 0.16
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.08
427 0.08
428 0.11
429 0.13
430 0.17
431 0.24
432 0.31
433 0.35
434 0.39
435 0.47
436 0.55
437 0.62
438 0.69
439 0.73
440 0.77
441 0.81
442 0.86
443 0.83
444 0.82
445 0.8
446 0.74
447 0.7
448 0.61
449 0.53
450 0.46
451 0.41
452 0.31
453 0.27
454 0.23
455 0.17
456 0.17
457 0.16
458 0.15
459 0.15
460 0.16
461 0.16
462 0.19
463 0.19
464 0.21
465 0.22
466 0.23
467 0.24
468 0.29