Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VJC8

Protein Details
Accession H1VJC8    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-79FPISSKARTPCSNKKRKRGDKMEATSPLAHydrophilic
393-417AGAATPQTKKKRGRPRKADKSAMASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
65-67KRK
345-355PKAKRRGRPRK
401-412KKKRGRPRKADK
456-465PVKRGRGKKG
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Amino Acid Sequences MGSHRAKKAEKTRVVVDLTQVITPGRSNNATPRDMWDVPSSPASDQAAPVFPISSKARTPCSNKKRKRGDKMEATSPLATGIPSQGSTQPFDATPATRTNAVSVHEAKRWRLGNPESSLPAEDDVDMVVPLDVADVPSFRDLVSGQKPISLCIEPPQTLSASQRQEYKYHSVDPSQEDQAPVPTQPFSALPATARSSGATTIAYSTPSQTRVVGRPLTTFADHTTLDTVPERTQETSKVALDPEATVEILSSPDIISAAPARRKRGRDDDKAYKKVETHQANASWDSDGTGFHCKTFRPRTSRKVAGDGCWQDQTEHREETNVPAPDMGAAAQTPTGESALASLPKAKRRGRPRKSEVAAVASTVAIEAPAPPQATESDDVAKESAGVEAGAAGAATPQTKKKRGRPRKADKSAMASGRQGADEQSPAEVEGSHTSKHMDVEMDETPTKGIQAREPVKRGRGKKGDQKPGLTTTGVAGTSPTTDGSQVRGEDLVLQPVTPNVDSKSGSGGPDPQSAATEQKAAANCALVGKGESKTEEVLGKADGKKSSMAPASSAGKPIYRVGLSKKSRIAPLLKSLRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.58
3 0.51
4 0.46
5 0.39
6 0.34
7 0.29
8 0.23
9 0.2
10 0.19
11 0.19
12 0.18
13 0.19
14 0.21
15 0.3
16 0.36
17 0.37
18 0.37
19 0.4
20 0.42
21 0.41
22 0.42
23 0.38
24 0.34
25 0.35
26 0.37
27 0.33
28 0.25
29 0.29
30 0.29
31 0.24
32 0.23
33 0.23
34 0.22
35 0.21
36 0.21
37 0.18
38 0.15
39 0.2
40 0.22
41 0.23
42 0.26
43 0.29
44 0.35
45 0.42
46 0.51
47 0.56
48 0.64
49 0.71
50 0.76
51 0.83
52 0.88
53 0.91
54 0.93
55 0.92
56 0.92
57 0.92
58 0.89
59 0.87
60 0.81
61 0.74
62 0.63
63 0.52
64 0.43
65 0.32
66 0.25
67 0.17
68 0.14
69 0.11
70 0.11
71 0.13
72 0.16
73 0.18
74 0.21
75 0.21
76 0.21
77 0.19
78 0.21
79 0.22
80 0.18
81 0.19
82 0.21
83 0.22
84 0.23
85 0.23
86 0.22
87 0.22
88 0.23
89 0.25
90 0.27
91 0.29
92 0.31
93 0.34
94 0.34
95 0.39
96 0.38
97 0.35
98 0.38
99 0.39
100 0.42
101 0.43
102 0.46
103 0.41
104 0.4
105 0.39
106 0.32
107 0.27
108 0.2
109 0.16
110 0.12
111 0.09
112 0.08
113 0.07
114 0.06
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.07
125 0.08
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.14
130 0.19
131 0.21
132 0.21
133 0.24
134 0.24
135 0.24
136 0.28
137 0.22
138 0.18
139 0.2
140 0.25
141 0.22
142 0.23
143 0.23
144 0.2
145 0.21
146 0.24
147 0.25
148 0.25
149 0.27
150 0.32
151 0.32
152 0.34
153 0.37
154 0.4
155 0.36
156 0.37
157 0.37
158 0.33
159 0.35
160 0.38
161 0.37
162 0.33
163 0.32
164 0.27
165 0.26
166 0.26
167 0.23
168 0.18
169 0.15
170 0.13
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.11
175 0.12
176 0.12
177 0.11
178 0.14
179 0.16
180 0.16
181 0.16
182 0.14
183 0.13
184 0.13
185 0.13
186 0.11
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.11
191 0.1
192 0.12
193 0.13
194 0.14
195 0.15
196 0.15
197 0.18
198 0.2
199 0.25
200 0.25
201 0.24
202 0.24
203 0.25
204 0.26
205 0.23
206 0.2
207 0.17
208 0.17
209 0.16
210 0.15
211 0.15
212 0.12
213 0.13
214 0.13
215 0.14
216 0.11
217 0.13
218 0.14
219 0.14
220 0.15
221 0.16
222 0.17
223 0.18
224 0.18
225 0.18
226 0.16
227 0.15
228 0.15
229 0.13
230 0.11
231 0.09
232 0.08
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.07
245 0.11
246 0.16
247 0.19
248 0.25
249 0.31
250 0.33
251 0.39
252 0.47
253 0.52
254 0.56
255 0.63
256 0.68
257 0.71
258 0.74
259 0.69
260 0.6
261 0.52
262 0.48
263 0.48
264 0.4
265 0.34
266 0.32
267 0.33
268 0.33
269 0.33
270 0.28
271 0.19
272 0.16
273 0.13
274 0.1
275 0.08
276 0.08
277 0.12
278 0.11
279 0.12
280 0.13
281 0.13
282 0.21
283 0.29
284 0.35
285 0.38
286 0.45
287 0.53
288 0.6
289 0.67
290 0.61
291 0.61
292 0.56
293 0.5
294 0.51
295 0.45
296 0.38
297 0.32
298 0.3
299 0.23
300 0.25
301 0.27
302 0.22
303 0.21
304 0.2
305 0.2
306 0.2
307 0.24
308 0.27
309 0.22
310 0.19
311 0.17
312 0.17
313 0.15
314 0.15
315 0.11
316 0.05
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.05
327 0.06
328 0.07
329 0.07
330 0.12
331 0.15
332 0.2
333 0.28
334 0.32
335 0.39
336 0.5
337 0.61
338 0.66
339 0.74
340 0.76
341 0.79
342 0.76
343 0.74
344 0.64
345 0.58
346 0.49
347 0.38
348 0.31
349 0.2
350 0.17
351 0.11
352 0.09
353 0.03
354 0.03
355 0.04
356 0.04
357 0.06
358 0.07
359 0.07
360 0.08
361 0.08
362 0.11
363 0.12
364 0.13
365 0.14
366 0.13
367 0.14
368 0.13
369 0.13
370 0.1
371 0.09
372 0.08
373 0.05
374 0.05
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.04
384 0.06
385 0.13
386 0.2
387 0.28
388 0.36
389 0.46
390 0.57
391 0.68
392 0.78
393 0.82
394 0.87
395 0.91
396 0.92
397 0.91
398 0.83
399 0.79
400 0.75
401 0.67
402 0.58
403 0.47
404 0.4
405 0.33
406 0.29
407 0.22
408 0.17
409 0.14
410 0.14
411 0.13
412 0.11
413 0.1
414 0.1
415 0.1
416 0.08
417 0.08
418 0.12
419 0.14
420 0.13
421 0.14
422 0.15
423 0.16
424 0.16
425 0.16
426 0.12
427 0.11
428 0.14
429 0.15
430 0.18
431 0.17
432 0.17
433 0.16
434 0.15
435 0.15
436 0.15
437 0.15
438 0.15
439 0.25
440 0.32
441 0.39
442 0.44
443 0.48
444 0.53
445 0.6
446 0.62
447 0.63
448 0.65
449 0.67
450 0.72
451 0.77
452 0.8
453 0.77
454 0.76
455 0.7
456 0.65
457 0.59
458 0.49
459 0.39
460 0.29
461 0.27
462 0.22
463 0.17
464 0.12
465 0.1
466 0.11
467 0.11
468 0.11
469 0.08
470 0.1
471 0.11
472 0.14
473 0.17
474 0.16
475 0.17
476 0.16
477 0.16
478 0.18
479 0.18
480 0.2
481 0.16
482 0.16
483 0.15
484 0.16
485 0.18
486 0.15
487 0.16
488 0.13
489 0.17
490 0.18
491 0.19
492 0.24
493 0.23
494 0.23
495 0.23
496 0.27
497 0.27
498 0.3
499 0.3
500 0.25
501 0.24
502 0.25
503 0.26
504 0.22
505 0.21
506 0.17
507 0.21
508 0.22
509 0.23
510 0.22
511 0.19
512 0.18
513 0.17
514 0.17
515 0.13
516 0.13
517 0.13
518 0.14
519 0.16
520 0.17
521 0.17
522 0.18
523 0.2
524 0.21
525 0.18
526 0.18
527 0.19
528 0.24
529 0.25
530 0.29
531 0.28
532 0.27
533 0.29
534 0.3
535 0.35
536 0.34
537 0.31
538 0.28
539 0.32
540 0.36
541 0.34
542 0.36
543 0.3
544 0.27
545 0.28
546 0.29
547 0.29
548 0.26
549 0.29
550 0.33
551 0.42
552 0.46
553 0.51
554 0.55
555 0.55
556 0.58
557 0.6
558 0.59
559 0.55
560 0.6