Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VAQ2

Protein Details
Accession H1VAQ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-36SEEPKHSPSKRQRTELQGSEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR039601  Rrn5  
Gene Ontology GO:0000500  C:RNA polymerase I upstream activating factor complex  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
Amino Acid Sequences MEPEAEYLPDEEEIGVSEEPKHSPSKRQRTELQGSEPVYSGVSSSDGETGVQEARSSHKRRAMSIFVEPVLKRHKGVFNNNYLDLLNRDIGDVAGIMPVDGEDLPPSQIGLTLWAPYEKKVFFEALSRLGKDNIRGISDRIRTKSEIEVRQYISLLEDAIESRGQEQEGGLRSLGIEVYPAAVEISQPCCHALDEAADALSFRQERHEELAEQKKWGDCWNINLELAKRIEGDHGLERDPTFASDHGLEFTELLRVKNFVRLPERIFMNASHAENNWQFVSEEPPTIRATALQDFHSLLVSVTKRLVLSTLFIAESRIRGKRRVVPSTRNLVRRKDVEAAVASLGMKQNSDEFWVTCARRLRLEVWDDEDEEDAEEEDNDKEPMVYDNVENILRSRSDARQDRAMKERSSTPEIKFEDRESSDSAADETSGGEGSDDDEADAAHLDDAEREVIEEAKEVLVHSAYDFPKTHRTREALKNTIRHERAQEAQAEAEDAKTSYEAELELWRLLQRQPPESVDDATGSGAWPQSPPGRRGPL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.11
4 0.13
5 0.15
6 0.16
7 0.19
8 0.25
9 0.25
10 0.36
11 0.46
12 0.56
13 0.62
14 0.69
15 0.74
16 0.76
17 0.83
18 0.79
19 0.76
20 0.71
21 0.64
22 0.58
23 0.5
24 0.41
25 0.32
26 0.24
27 0.17
28 0.11
29 0.1
30 0.09
31 0.1
32 0.11
33 0.1
34 0.11
35 0.1
36 0.12
37 0.12
38 0.12
39 0.11
40 0.11
41 0.18
42 0.27
43 0.31
44 0.37
45 0.41
46 0.44
47 0.49
48 0.55
49 0.56
50 0.51
51 0.53
52 0.5
53 0.45
54 0.48
55 0.43
56 0.4
57 0.4
58 0.37
59 0.32
60 0.34
61 0.4
62 0.42
63 0.53
64 0.56
65 0.59
66 0.62
67 0.62
68 0.57
69 0.49
70 0.42
71 0.33
72 0.28
73 0.2
74 0.15
75 0.14
76 0.13
77 0.13
78 0.11
79 0.1
80 0.07
81 0.06
82 0.06
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.06
90 0.07
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.07
95 0.08
96 0.08
97 0.1
98 0.1
99 0.11
100 0.12
101 0.15
102 0.16
103 0.16
104 0.21
105 0.18
106 0.19
107 0.2
108 0.21
109 0.18
110 0.22
111 0.24
112 0.26
113 0.29
114 0.28
115 0.28
116 0.29
117 0.3
118 0.27
119 0.3
120 0.25
121 0.24
122 0.24
123 0.26
124 0.31
125 0.36
126 0.4
127 0.37
128 0.39
129 0.37
130 0.39
131 0.45
132 0.45
133 0.45
134 0.44
135 0.47
136 0.45
137 0.44
138 0.42
139 0.34
140 0.26
141 0.19
142 0.14
143 0.09
144 0.08
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.11
155 0.13
156 0.14
157 0.13
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.07
163 0.05
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.07
172 0.1
173 0.11
174 0.11
175 0.12
176 0.12
177 0.13
178 0.13
179 0.11
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.09
188 0.08
189 0.07
190 0.11
191 0.12
192 0.14
193 0.18
194 0.21
195 0.2
196 0.26
197 0.36
198 0.33
199 0.32
200 0.32
201 0.28
202 0.27
203 0.28
204 0.27
205 0.18
206 0.22
207 0.26
208 0.26
209 0.25
210 0.26
211 0.24
212 0.23
213 0.22
214 0.18
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.12
219 0.14
220 0.13
221 0.14
222 0.14
223 0.15
224 0.14
225 0.14
226 0.14
227 0.12
228 0.09
229 0.08
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.08
237 0.08
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.17
245 0.18
246 0.18
247 0.21
248 0.24
249 0.26
250 0.29
251 0.29
252 0.24
253 0.24
254 0.2
255 0.2
256 0.21
257 0.19
258 0.16
259 0.15
260 0.17
261 0.17
262 0.18
263 0.13
264 0.11
265 0.1
266 0.1
267 0.14
268 0.11
269 0.13
270 0.11
271 0.14
272 0.14
273 0.14
274 0.13
275 0.1
276 0.12
277 0.14
278 0.16
279 0.15
280 0.15
281 0.15
282 0.15
283 0.14
284 0.11
285 0.08
286 0.11
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.1
293 0.11
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.09
302 0.11
303 0.13
304 0.18
305 0.19
306 0.22
307 0.27
308 0.34
309 0.42
310 0.49
311 0.52
312 0.55
313 0.59
314 0.66
315 0.68
316 0.68
317 0.64
318 0.59
319 0.59
320 0.53
321 0.51
322 0.46
323 0.4
324 0.34
325 0.31
326 0.27
327 0.21
328 0.19
329 0.15
330 0.12
331 0.12
332 0.09
333 0.09
334 0.08
335 0.09
336 0.09
337 0.12
338 0.11
339 0.1
340 0.12
341 0.18
342 0.18
343 0.22
344 0.27
345 0.25
346 0.26
347 0.28
348 0.29
349 0.29
350 0.32
351 0.3
352 0.3
353 0.3
354 0.29
355 0.27
356 0.25
357 0.18
358 0.15
359 0.14
360 0.08
361 0.07
362 0.06
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.09
371 0.09
372 0.1
373 0.09
374 0.11
375 0.13
376 0.14
377 0.13
378 0.12
379 0.13
380 0.12
381 0.14
382 0.16
383 0.18
384 0.27
385 0.34
386 0.37
387 0.45
388 0.5
389 0.53
390 0.57
391 0.59
392 0.51
393 0.46
394 0.49
395 0.46
396 0.48
397 0.49
398 0.42
399 0.46
400 0.48
401 0.49
402 0.45
403 0.41
404 0.41
405 0.38
406 0.38
407 0.32
408 0.31
409 0.27
410 0.25
411 0.23
412 0.16
413 0.14
414 0.11
415 0.09
416 0.07
417 0.06
418 0.06
419 0.05
420 0.05
421 0.06
422 0.07
423 0.07
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.06
434 0.07
435 0.07
436 0.06
437 0.07
438 0.07
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.09
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.1
447 0.09
448 0.09
449 0.09
450 0.15
451 0.15
452 0.2
453 0.21
454 0.23
455 0.33
456 0.37
457 0.41
458 0.41
459 0.46
460 0.5
461 0.59
462 0.66
463 0.65
464 0.68
465 0.71
466 0.69
467 0.74
468 0.68
469 0.62
470 0.57
471 0.53
472 0.52
473 0.49
474 0.47
475 0.39
476 0.37
477 0.33
478 0.3
479 0.24
480 0.19
481 0.16
482 0.12
483 0.11
484 0.1
485 0.11
486 0.09
487 0.09
488 0.09
489 0.1
490 0.13
491 0.14
492 0.14
493 0.14
494 0.16
495 0.17
496 0.2
497 0.25
498 0.27
499 0.3
500 0.35
501 0.36
502 0.4
503 0.4
504 0.4
505 0.35
506 0.3
507 0.26
508 0.22
509 0.2
510 0.15
511 0.14
512 0.12
513 0.12
514 0.11
515 0.15
516 0.22
517 0.28
518 0.32