Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6GDW5

Protein Details
Accession A0A5N6GDW5    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-58EGSTSRSRPSRRGGRGRGNRNPHRRPQTQTTVSHydrophilic
78-106LPSDPPHDAPRSRRRPRRGRGGRGGGAPPBasic
174-200SSATPAATKKKSKPKSTPPPPPKVTTKHydrophilic
983-1005SVSECVKLRERQRQKERDAQRLAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-50RSRPSRRGGRGRGNRNPHRR
87-107PRSRRRPRRGRGGRGGGAPPE
182-193KKKSKPKSTPPP
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR034077  R3H_FAP1  
IPR000967  Znf_NFX1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PF01422  zf-NF-X1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
cd06006  R3H_unknown_2  
Amino Acid Sequences MTVPDAVYNQISITATMSDNPAPIAEGSTSRSRPSRRGGRGRGNRNPHRRPQTQTTVSSHDTQSSSQQSPQAQPTQPLPSDPPHDAPRSRRRPRRGRGGRGGGAPPEASDYRQRERGGDRGIASAGRRFEGRLTKPEQASGDDQAGTTVGSNDLELRADAPEFVPGTQPENVTSSATPAATKKKSKPKSTPPPPPKVTTKSVAPDIATRIHEDIAHNLYECPICTAELGKRSRVWSCGLCWTVFHLSCVKKWSKNEGAAAQDPTRRQGEGDTNTPRAWRCPGCNLAHEVFPSSYTCWCQKEVDPRSLPGLPPHSCGQTCARPRKGCPHPCDTTCHAGPCKPCTAMGPTQDCFCGRNSSTKRCQDTDYENGWSCGEICGDILPCGEHTCSRPCHEGFCGSCEVKIEARCYCGKVHTEMMCSSKDEEKDSQMLHGQCGEDSHIDEWTGCFSCGEQCNRPFDCGVHSCQQGCHPQDIHPAHCPRSPDAVLNCPCGKTPLIEIPGYSPRTSCEDPIPNCLEACGKILRCGHSCDKVCHTGSCGPCFRKIPVQCRCGRNSFMTICHQGTIEPPQCFRICKAGLHCGRHACTERCCSGEQKAVERQALRRKLKSHLRPSDEDVEAEHICTRICGRMLKCGRHTCPELCHKGPCNTCREAIFEEISCNCGRSVLYPPLPCGTQPPPCSSPCERPKSCGHPQTPHNCHTDEESCPKCPYLTEKTCLCGKQALKNVPCWLADARCGRICGEPLKCGSHTCKKNCHRPGDCEDASKPCQQPCGKTKTMCSHPCTEPCHAPYPCSEKTPCSSMITVTCGCGRLRQERRCNAAKAVASKGQLQQPQRLPALTPLACDDECSRLERNRSLASALGIDINPSTTVAQNLTSTNLPYSSETLDMYIQLSSSSPLSTLQSYESTLHSLAANTTQRSVRFQPAKSSLRAFVHSLATDWGFASESFDPEPHRHVFVLKPTAWNPPLFGMGNGTAIGIGGMSVSECVKLRERQRQKERDAQRLAVAESKAQREAAKAQANAASDGGWAQVAASRRSNASTRSTTPNPGAAPLSGSMFAALAGDDGSTWGAPKKEKLVLRSGVGAGKQLRTPPAPTAVAESWEEEEEEQEQKDRAREQEQVIEHGDIEKETSEEITETGEAIATSSAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.14
4 0.17
5 0.16
6 0.15
7 0.15
8 0.14
9 0.13
10 0.13
11 0.14
12 0.12
13 0.13
14 0.17
15 0.25
16 0.26
17 0.29
18 0.36
19 0.39
20 0.45
21 0.53
22 0.6
23 0.63
24 0.72
25 0.78
26 0.81
27 0.87
28 0.91
29 0.9
30 0.9
31 0.9
32 0.9
33 0.9
34 0.89
35 0.89
36 0.85
37 0.83
38 0.82
39 0.83
40 0.79
41 0.77
42 0.72
43 0.69
44 0.65
45 0.61
46 0.53
47 0.47
48 0.41
49 0.35
50 0.37
51 0.37
52 0.36
53 0.35
54 0.39
55 0.38
56 0.42
57 0.48
58 0.48
59 0.44
60 0.45
61 0.47
62 0.5
63 0.46
64 0.44
65 0.41
66 0.39
67 0.41
68 0.42
69 0.43
70 0.41
71 0.47
72 0.49
73 0.55
74 0.61
75 0.66
76 0.73
77 0.77
78 0.82
79 0.86
80 0.9
81 0.92
82 0.92
83 0.91
84 0.92
85 0.91
86 0.86
87 0.8
88 0.73
89 0.64
90 0.55
91 0.44
92 0.34
93 0.29
94 0.25
95 0.22
96 0.27
97 0.31
98 0.35
99 0.41
100 0.42
101 0.42
102 0.46
103 0.51
104 0.48
105 0.46
106 0.42
107 0.37
108 0.38
109 0.35
110 0.32
111 0.29
112 0.25
113 0.21
114 0.2
115 0.19
116 0.24
117 0.31
118 0.34
119 0.38
120 0.42
121 0.49
122 0.49
123 0.52
124 0.48
125 0.43
126 0.41
127 0.37
128 0.33
129 0.26
130 0.25
131 0.21
132 0.19
133 0.14
134 0.11
135 0.09
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.1
147 0.09
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.15
152 0.14
153 0.18
154 0.2
155 0.2
156 0.18
157 0.2
158 0.21
159 0.2
160 0.19
161 0.18
162 0.17
163 0.17
164 0.17
165 0.19
166 0.27
167 0.31
168 0.39
169 0.46
170 0.55
171 0.64
172 0.73
173 0.79
174 0.81
175 0.86
176 0.89
177 0.91
178 0.9
179 0.91
180 0.86
181 0.82
182 0.8
183 0.75
184 0.7
185 0.63
186 0.59
187 0.54
188 0.53
189 0.49
190 0.41
191 0.38
192 0.35
193 0.35
194 0.3
195 0.27
196 0.24
197 0.22
198 0.23
199 0.21
200 0.22
201 0.2
202 0.2
203 0.18
204 0.17
205 0.18
206 0.17
207 0.16
208 0.14
209 0.12
210 0.12
211 0.11
212 0.14
213 0.17
214 0.24
215 0.27
216 0.27
217 0.3
218 0.33
219 0.35
220 0.34
221 0.34
222 0.29
223 0.3
224 0.35
225 0.34
226 0.31
227 0.29
228 0.31
229 0.33
230 0.3
231 0.29
232 0.27
233 0.27
234 0.29
235 0.37
236 0.38
237 0.37
238 0.41
239 0.48
240 0.49
241 0.53
242 0.56
243 0.53
244 0.53
245 0.5
246 0.5
247 0.44
248 0.4
249 0.36
250 0.34
251 0.31
252 0.26
253 0.22
254 0.23
255 0.29
256 0.29
257 0.36
258 0.38
259 0.39
260 0.39
261 0.41
262 0.37
263 0.32
264 0.34
265 0.31
266 0.3
267 0.35
268 0.42
269 0.42
270 0.44
271 0.47
272 0.42
273 0.39
274 0.35
275 0.3
276 0.23
277 0.21
278 0.19
279 0.15
280 0.16
281 0.17
282 0.21
283 0.21
284 0.23
285 0.25
286 0.28
287 0.38
288 0.41
289 0.47
290 0.45
291 0.44
292 0.46
293 0.45
294 0.41
295 0.36
296 0.37
297 0.29
298 0.31
299 0.31
300 0.31
301 0.29
302 0.31
303 0.31
304 0.33
305 0.4
306 0.46
307 0.53
308 0.53
309 0.57
310 0.64
311 0.69
312 0.7
313 0.67
314 0.65
315 0.63
316 0.61
317 0.64
318 0.58
319 0.55
320 0.48
321 0.47
322 0.41
323 0.38
324 0.39
325 0.37
326 0.36
327 0.29
328 0.28
329 0.25
330 0.29
331 0.31
332 0.34
333 0.35
334 0.32
335 0.32
336 0.33
337 0.31
338 0.26
339 0.23
340 0.22
341 0.18
342 0.28
343 0.33
344 0.41
345 0.49
346 0.56
347 0.6
348 0.55
349 0.57
350 0.52
351 0.53
352 0.51
353 0.46
354 0.42
355 0.38
356 0.36
357 0.33
358 0.28
359 0.22
360 0.15
361 0.12
362 0.07
363 0.06
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.06
369 0.07
370 0.08
371 0.08
372 0.09
373 0.11
374 0.16
375 0.19
376 0.22
377 0.27
378 0.27
379 0.29
380 0.29
381 0.33
382 0.28
383 0.29
384 0.3
385 0.25
386 0.25
387 0.23
388 0.23
389 0.2
390 0.22
391 0.21
392 0.17
393 0.2
394 0.21
395 0.22
396 0.22
397 0.22
398 0.21
399 0.22
400 0.27
401 0.26
402 0.27
403 0.27
404 0.28
405 0.25
406 0.24
407 0.23
408 0.22
409 0.21
410 0.22
411 0.21
412 0.22
413 0.24
414 0.23
415 0.22
416 0.23
417 0.23
418 0.19
419 0.19
420 0.17
421 0.14
422 0.14
423 0.14
424 0.09
425 0.1
426 0.1
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.09
432 0.09
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.12
437 0.17
438 0.21
439 0.24
440 0.26
441 0.33
442 0.33
443 0.34
444 0.3
445 0.26
446 0.27
447 0.25
448 0.26
449 0.24
450 0.25
451 0.24
452 0.25
453 0.28
454 0.29
455 0.28
456 0.28
457 0.24
458 0.24
459 0.33
460 0.35
461 0.33
462 0.33
463 0.35
464 0.34
465 0.35
466 0.35
467 0.28
468 0.32
469 0.3
470 0.28
471 0.27
472 0.32
473 0.32
474 0.35
475 0.33
476 0.27
477 0.26
478 0.24
479 0.22
480 0.14
481 0.15
482 0.16
483 0.19
484 0.18
485 0.18
486 0.2
487 0.25
488 0.26
489 0.23
490 0.18
491 0.17
492 0.22
493 0.23
494 0.21
495 0.21
496 0.27
497 0.28
498 0.33
499 0.35
500 0.29
501 0.28
502 0.27
503 0.22
504 0.15
505 0.16
506 0.14
507 0.12
508 0.15
509 0.18
510 0.2
511 0.21
512 0.26
513 0.27
514 0.31
515 0.33
516 0.32
517 0.34
518 0.36
519 0.35
520 0.3
521 0.3
522 0.28
523 0.29
524 0.31
525 0.31
526 0.28
527 0.3
528 0.32
529 0.3
530 0.32
531 0.36
532 0.4
533 0.44
534 0.5
535 0.53
536 0.56
537 0.58
538 0.54
539 0.5
540 0.43
541 0.39
542 0.34
543 0.3
544 0.29
545 0.29
546 0.25
547 0.23
548 0.21
549 0.16
550 0.16
551 0.21
552 0.22
553 0.19
554 0.19
555 0.22
556 0.23
557 0.23
558 0.23
559 0.22
560 0.19
561 0.21
562 0.23
563 0.29
564 0.33
565 0.36
566 0.37
567 0.33
568 0.32
569 0.34
570 0.35
571 0.28
572 0.27
573 0.28
574 0.27
575 0.26
576 0.27
577 0.25
578 0.24
579 0.27
580 0.24
581 0.25
582 0.28
583 0.28
584 0.3
585 0.29
586 0.32
587 0.35
588 0.43
589 0.43
590 0.42
591 0.42
592 0.48
593 0.57
594 0.61
595 0.63
596 0.62
597 0.63
598 0.62
599 0.64
600 0.61
601 0.52
602 0.42
603 0.32
604 0.27
605 0.22
606 0.2
607 0.15
608 0.09
609 0.09
610 0.09
611 0.09
612 0.07
613 0.09
614 0.14
615 0.14
616 0.23
617 0.29
618 0.33
619 0.4
620 0.45
621 0.46
622 0.46
623 0.49
624 0.41
625 0.43
626 0.46
627 0.46
628 0.4
629 0.42
630 0.41
631 0.44
632 0.47
633 0.45
634 0.43
635 0.38
636 0.38
637 0.34
638 0.34
639 0.29
640 0.26
641 0.23
642 0.18
643 0.17
644 0.16
645 0.17
646 0.14
647 0.12
648 0.1
649 0.09
650 0.09
651 0.09
652 0.15
653 0.19
654 0.23
655 0.23
656 0.25
657 0.25
658 0.25
659 0.23
660 0.23
661 0.21
662 0.24
663 0.25
664 0.3
665 0.32
666 0.32
667 0.39
668 0.38
669 0.43
670 0.45
671 0.53
672 0.48
673 0.5
674 0.55
675 0.58
676 0.62
677 0.61
678 0.56
679 0.53
680 0.6
681 0.66
682 0.65
683 0.61
684 0.55
685 0.47
686 0.43
687 0.41
688 0.36
689 0.3
690 0.32
691 0.3
692 0.3
693 0.3
694 0.29
695 0.25
696 0.23
697 0.26
698 0.28
699 0.3
700 0.32
701 0.33
702 0.35
703 0.39
704 0.39
705 0.34
706 0.3
707 0.27
708 0.3
709 0.37
710 0.42
711 0.4
712 0.43
713 0.44
714 0.4
715 0.38
716 0.32
717 0.27
718 0.2
719 0.24
720 0.23
721 0.24
722 0.24
723 0.24
724 0.23
725 0.23
726 0.24
727 0.25
728 0.24
729 0.23
730 0.23
731 0.26
732 0.25
733 0.26
734 0.3
735 0.34
736 0.4
737 0.43
738 0.52
739 0.57
740 0.67
741 0.72
742 0.76
743 0.71
744 0.7
745 0.71
746 0.7
747 0.63
748 0.56
749 0.5
750 0.46
751 0.44
752 0.43
753 0.39
754 0.31
755 0.37
756 0.36
757 0.42
758 0.43
759 0.48
760 0.47
761 0.47
762 0.52
763 0.53
764 0.6
765 0.59
766 0.56
767 0.54
768 0.54
769 0.58
770 0.56
771 0.51
772 0.47
773 0.44
774 0.49
775 0.42
776 0.39
777 0.38
778 0.41
779 0.38
780 0.37
781 0.35
782 0.3
783 0.32
784 0.35
785 0.33
786 0.28
787 0.27
788 0.24
789 0.24
790 0.25
791 0.23
792 0.2
793 0.19
794 0.18
795 0.17
796 0.19
797 0.22
798 0.28
799 0.37
800 0.46
801 0.54
802 0.6
803 0.67
804 0.69
805 0.68
806 0.6
807 0.57
808 0.51
809 0.45
810 0.42
811 0.39
812 0.34
813 0.34
814 0.36
815 0.35
816 0.37
817 0.36
818 0.39
819 0.4
820 0.44
821 0.42
822 0.38
823 0.33
824 0.32
825 0.37
826 0.29
827 0.25
828 0.22
829 0.24
830 0.23
831 0.24
832 0.21
833 0.17
834 0.18
835 0.2
836 0.22
837 0.23
838 0.27
839 0.29
840 0.32
841 0.31
842 0.31
843 0.3
844 0.27
845 0.24
846 0.2
847 0.17
848 0.15
849 0.12
850 0.11
851 0.1
852 0.09
853 0.08
854 0.08
855 0.09
856 0.07
857 0.09
858 0.09
859 0.1
860 0.11
861 0.11
862 0.13
863 0.13
864 0.13
865 0.13
866 0.13
867 0.13
868 0.13
869 0.15
870 0.14
871 0.14
872 0.14
873 0.14
874 0.14
875 0.13
876 0.12
877 0.1
878 0.08
879 0.07
880 0.07
881 0.07
882 0.08
883 0.07
884 0.07
885 0.08
886 0.1
887 0.11
888 0.11
889 0.13
890 0.13
891 0.15
892 0.16
893 0.16
894 0.16
895 0.16
896 0.16
897 0.14
898 0.13
899 0.12
900 0.17
901 0.2
902 0.18
903 0.21
904 0.23
905 0.24
906 0.29
907 0.33
908 0.36
909 0.39
910 0.4
911 0.46
912 0.53
913 0.56
914 0.54
915 0.54
916 0.5
917 0.46
918 0.47
919 0.4
920 0.34
921 0.33
922 0.29
923 0.27
924 0.23
925 0.2
926 0.18
927 0.15
928 0.13
929 0.1
930 0.1
931 0.13
932 0.12
933 0.13
934 0.14
935 0.15
936 0.18
937 0.19
938 0.24
939 0.22
940 0.23
941 0.22
942 0.24
943 0.27
944 0.32
945 0.38
946 0.35
947 0.38
948 0.37
949 0.45
950 0.45
951 0.41
952 0.34
953 0.28
954 0.3
955 0.26
956 0.24
957 0.19
958 0.18
959 0.18
960 0.16
961 0.14
962 0.1
963 0.09
964 0.09
965 0.05
966 0.04
967 0.03
968 0.03
969 0.03
970 0.04
971 0.04
972 0.06
973 0.07
974 0.1
975 0.16
976 0.23
977 0.32
978 0.42
979 0.52
980 0.62
981 0.72
982 0.79
983 0.81
984 0.85
985 0.84
986 0.84
987 0.79
988 0.71
989 0.65
990 0.58
991 0.52
992 0.47
993 0.4
994 0.34
995 0.33
996 0.33
997 0.3
998 0.29
999 0.28
1000 0.26
1001 0.3
1002 0.33
1003 0.36
1004 0.33
1005 0.34
1006 0.36
1007 0.36
1008 0.34
1009 0.29
1010 0.21
1011 0.14
1012 0.14
1013 0.11
1014 0.08
1015 0.06
1016 0.05
1017 0.08
1018 0.11
1019 0.15
1020 0.18
1021 0.19
1022 0.21
1023 0.24
1024 0.28
1025 0.29
1026 0.34
1027 0.36
1028 0.38
1029 0.45
1030 0.47
1031 0.49
1032 0.48
1033 0.49
1034 0.42
1035 0.39
1036 0.36
1037 0.28
1038 0.26
1039 0.22
1040 0.21
1041 0.16
1042 0.15
1043 0.13
1044 0.11
1045 0.1
1046 0.08
1047 0.07
1048 0.05
1049 0.05
1050 0.04
1051 0.04
1052 0.05
1053 0.06
1054 0.05
1055 0.07
1056 0.1
1057 0.13
1058 0.16
1059 0.2
1060 0.26
1061 0.33
1062 0.37
1063 0.41
1064 0.47
1065 0.48
1066 0.48
1067 0.48
1068 0.44
1069 0.4
1070 0.36
1071 0.36
1072 0.31
1073 0.29
1074 0.29
1075 0.29
1076 0.32
1077 0.32
1078 0.34
1079 0.33
1080 0.37
1081 0.35
1082 0.33
1083 0.37
1084 0.33
1085 0.33
1086 0.31
1087 0.28
1088 0.24
1089 0.23
1090 0.23
1091 0.16
1092 0.16
1093 0.16
1094 0.17
1095 0.16
1096 0.17
1097 0.18
1098 0.21
1099 0.26
1100 0.29
1101 0.32
1102 0.35
1103 0.41
1104 0.42
1105 0.48
1106 0.47
1107 0.47
1108 0.45
1109 0.4
1110 0.35
1111 0.31
1112 0.27
1113 0.19
1114 0.18
1115 0.14
1116 0.12
1117 0.11
1118 0.12
1119 0.1
1120 0.1
1121 0.1
1122 0.11
1123 0.11
1124 0.11
1125 0.1
1126 0.1
1127 0.09
1128 0.09