Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VFM2

Protein Details
Accession H1VFM2    Localization Confidence Low Confidence Score 8.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-35AAMKKALKRKSYGKRSTPPSLLCHydrophilic
58-83KSVPSSPTRANWRRPRAPKSTTKCIIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 20.5, cyto_mito 12, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039602  Rxt2  
IPR013904  RXT2_N  
Gene Ontology GO:0016575  P:histone deacetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08595  RXT2_N  
Amino Acid Sequences MATQQILFSETVAAMKKALKRKSYGKRSTPPSLLCPHWQNLTRMMRLTTTGIAATSFKSVPSSPTRANWRRPRAPKSTTKCIIDYAGQQRTIISRNPPIVDEEGYEIDSDDDEERIQEAVSSATELDPYANIRIEQILAPLTVSTDLPSHPTLSKPFTAKTLDEIAEQSCEVRRKENASLWRVRHLFTRLCGDYTWVPCGAMVGPDDADLYSTDYVERGYSRKTKATVAGGLDDASSGTASGNARLEQAPNGTNGESSGDKQSSDGDIAMTDACSDKGEARKQASEKSTEDTHTAGEASRPTNGQVPKSSAAPKTAQEESVADRKQKQRAVDVEMHEGQAAPPSQPGAEVAERNGTHAPSIASETVDETFVHPFFRPPPNARPDRDVGLPEAEAEDIRRLLALYVQKQEEVCRGAMKLHEGLLKANRLRKTVLQWSKAEAHSGANRDMSDGEDWYDKEEWGLTEDLKKGQDDEEEDTGTVAKKTRNRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.2
3 0.26
4 0.34
5 0.41
6 0.44
7 0.49
8 0.6
9 0.69
10 0.75
11 0.78
12 0.8
13 0.82
14 0.84
15 0.86
16 0.83
17 0.76
18 0.72
19 0.68
20 0.62
21 0.6
22 0.58
23 0.52
24 0.52
25 0.53
26 0.48
27 0.51
28 0.54
29 0.5
30 0.47
31 0.45
32 0.39
33 0.36
34 0.36
35 0.28
36 0.22
37 0.18
38 0.16
39 0.15
40 0.15
41 0.14
42 0.14
43 0.13
44 0.12
45 0.14
46 0.15
47 0.19
48 0.26
49 0.31
50 0.31
51 0.38
52 0.49
53 0.54
54 0.64
55 0.69
56 0.73
57 0.76
58 0.83
59 0.84
60 0.83
61 0.83
62 0.83
63 0.81
64 0.82
65 0.78
66 0.73
67 0.66
68 0.59
69 0.53
70 0.45
71 0.45
72 0.43
73 0.41
74 0.37
75 0.36
76 0.34
77 0.34
78 0.35
79 0.31
80 0.27
81 0.28
82 0.32
83 0.33
84 0.33
85 0.33
86 0.33
87 0.3
88 0.25
89 0.22
90 0.19
91 0.18
92 0.17
93 0.14
94 0.11
95 0.1
96 0.11
97 0.08
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.09
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.11
121 0.11
122 0.11
123 0.1
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.1
135 0.11
136 0.13
137 0.13
138 0.16
139 0.18
140 0.21
141 0.25
142 0.24
143 0.24
144 0.26
145 0.28
146 0.26
147 0.26
148 0.27
149 0.24
150 0.22
151 0.23
152 0.19
153 0.17
154 0.16
155 0.14
156 0.13
157 0.17
158 0.16
159 0.18
160 0.21
161 0.24
162 0.29
163 0.34
164 0.39
165 0.41
166 0.48
167 0.46
168 0.51
169 0.48
170 0.44
171 0.43
172 0.39
173 0.35
174 0.3
175 0.35
176 0.28
177 0.28
178 0.27
179 0.25
180 0.25
181 0.24
182 0.24
183 0.17
184 0.16
185 0.14
186 0.15
187 0.12
188 0.09
189 0.08
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.11
207 0.17
208 0.2
209 0.23
210 0.24
211 0.26
212 0.28
213 0.3
214 0.29
215 0.24
216 0.23
217 0.19
218 0.18
219 0.15
220 0.12
221 0.09
222 0.05
223 0.04
224 0.03
225 0.03
226 0.05
227 0.05
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.09
232 0.09
233 0.1
234 0.09
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.11
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.09
244 0.09
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.12
250 0.11
251 0.11
252 0.1
253 0.07
254 0.06
255 0.07
256 0.07
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.08
264 0.13
265 0.17
266 0.21
267 0.23
268 0.27
269 0.29
270 0.34
271 0.34
272 0.33
273 0.31
274 0.31
275 0.31
276 0.27
277 0.27
278 0.21
279 0.19
280 0.15
281 0.14
282 0.1
283 0.1
284 0.11
285 0.1
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.17
290 0.19
291 0.21
292 0.21
293 0.25
294 0.25
295 0.28
296 0.31
297 0.26
298 0.28
299 0.27
300 0.27
301 0.27
302 0.27
303 0.24
304 0.21
305 0.21
306 0.21
307 0.26
308 0.26
309 0.24
310 0.29
311 0.35
312 0.4
313 0.43
314 0.41
315 0.41
316 0.43
317 0.48
318 0.48
319 0.44
320 0.44
321 0.41
322 0.39
323 0.31
324 0.27
325 0.2
326 0.18
327 0.16
328 0.1
329 0.09
330 0.1
331 0.09
332 0.09
333 0.1
334 0.11
335 0.13
336 0.13
337 0.14
338 0.2
339 0.19
340 0.22
341 0.22
342 0.18
343 0.16
344 0.16
345 0.16
346 0.11
347 0.14
348 0.13
349 0.11
350 0.12
351 0.13
352 0.12
353 0.13
354 0.12
355 0.1
356 0.12
357 0.12
358 0.13
359 0.12
360 0.13
361 0.18
362 0.26
363 0.31
364 0.34
365 0.43
366 0.51
367 0.58
368 0.59
369 0.6
370 0.56
371 0.53
372 0.5
373 0.43
374 0.36
375 0.31
376 0.27
377 0.22
378 0.18
379 0.15
380 0.12
381 0.12
382 0.11
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.08
387 0.08
388 0.13
389 0.18
390 0.21
391 0.27
392 0.28
393 0.29
394 0.3
395 0.32
396 0.32
397 0.28
398 0.24
399 0.2
400 0.2
401 0.21
402 0.22
403 0.24
404 0.21
405 0.21
406 0.23
407 0.22
408 0.26
409 0.29
410 0.34
411 0.35
412 0.4
413 0.41
414 0.4
415 0.43
416 0.44
417 0.47
418 0.51
419 0.55
420 0.55
421 0.53
422 0.56
423 0.59
424 0.55
425 0.5
426 0.4
427 0.36
428 0.35
429 0.37
430 0.34
431 0.3
432 0.29
433 0.27
434 0.27
435 0.23
436 0.2
437 0.17
438 0.16
439 0.17
440 0.17
441 0.2
442 0.21
443 0.18
444 0.17
445 0.18
446 0.17
447 0.16
448 0.18
449 0.16
450 0.2
451 0.23
452 0.26
453 0.26
454 0.26
455 0.25
456 0.25
457 0.28
458 0.27
459 0.3
460 0.3
461 0.29
462 0.29
463 0.27
464 0.27
465 0.23
466 0.21
467 0.2
468 0.22