Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VRI7

Protein Details
Accession H1VRI7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-52PQSLSRAISPPKKRNRHGDRIASPFQLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-39KKR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 9, mito 6, cyto 3.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG chig:CH63R_07804  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
CDD cd09123  PLDc_Tdp1_2  
cd09194  PLDc_yTdp1_1  
Amino Acid Sequences MDRTPKRQRLSEDVEESKTGNRPPGPQSLSRAISPPKKRNRHGDRIASPFQLTRIRDLPEAANKDTVTLKDILGDPLIAECWEFNFLHDIHFLMSHFDEDTRNLVKVHVVHGFWKKEDPNRLALQKDAEAYPNVELHGAFMPEMFGTHHSKMMVLIRHDDSAQVIIHTANMIVRDWTNMTNAVWRSPLLPLLSDEHAEDTSATDHPFGTGKRFKHDLLSYLRAYNARRPITRTLVAQLCNYDFSSVRATFIASVPGRHPILDTSQTAWGWPALKRALGSVPVQEGESEIVIQVSSIATLGPTDSWIQKCLFDSLAVSKNKSSSRPKPKFKVVFPTADEIRQSLDGYASGGSIHTKIQSQQQMKQLQYLRPIFCHWANDAPEGKILSETAAIQKAGRERAAPHIKTYIRYGEKSIDWALVTSANISKQAWGEAMGASQEVRVASWEVGVLVWPSIITDNATMVGTFETDMPPREGGSGDTVVGLRIPYNLPLQSYGKDEIPWVASMAHTEPDRMGRFWGAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.58
3 0.52
4 0.47
5 0.43
6 0.36
7 0.35
8 0.34
9 0.36
10 0.4
11 0.49
12 0.5
13 0.5
14 0.54
15 0.56
16 0.55
17 0.51
18 0.51
19 0.5
20 0.54
21 0.59
22 0.62
23 0.65
24 0.72
25 0.78
26 0.84
27 0.86
28 0.87
29 0.87
30 0.88
31 0.85
32 0.83
33 0.8
34 0.71
35 0.63
36 0.53
37 0.48
38 0.44
39 0.37
40 0.35
41 0.34
42 0.35
43 0.34
44 0.35
45 0.37
46 0.39
47 0.42
48 0.39
49 0.38
50 0.35
51 0.35
52 0.36
53 0.3
54 0.25
55 0.21
56 0.19
57 0.19
58 0.2
59 0.19
60 0.17
61 0.16
62 0.13
63 0.12
64 0.12
65 0.09
66 0.07
67 0.06
68 0.07
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.14
73 0.14
74 0.16
75 0.16
76 0.15
77 0.13
78 0.14
79 0.13
80 0.12
81 0.12
82 0.11
83 0.12
84 0.12
85 0.13
86 0.13
87 0.17
88 0.16
89 0.17
90 0.16
91 0.16
92 0.18
93 0.19
94 0.21
95 0.21
96 0.2
97 0.25
98 0.32
99 0.34
100 0.32
101 0.36
102 0.38
103 0.4
104 0.49
105 0.46
106 0.45
107 0.48
108 0.52
109 0.47
110 0.44
111 0.4
112 0.33
113 0.32
114 0.27
115 0.22
116 0.19
117 0.19
118 0.18
119 0.16
120 0.14
121 0.13
122 0.11
123 0.11
124 0.12
125 0.11
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.08
131 0.07
132 0.09
133 0.14
134 0.15
135 0.17
136 0.16
137 0.16
138 0.18
139 0.22
140 0.23
141 0.2
142 0.23
143 0.23
144 0.24
145 0.24
146 0.22
147 0.17
148 0.15
149 0.14
150 0.09
151 0.08
152 0.07
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.1
163 0.1
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.16
168 0.16
169 0.16
170 0.15
171 0.14
172 0.14
173 0.14
174 0.16
175 0.11
176 0.11
177 0.12
178 0.14
179 0.15
180 0.14
181 0.14
182 0.13
183 0.12
184 0.12
185 0.1
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.09
190 0.08
191 0.07
192 0.08
193 0.1
194 0.1
195 0.16
196 0.21
197 0.21
198 0.26
199 0.29
200 0.29
201 0.33
202 0.34
203 0.32
204 0.33
205 0.37
206 0.33
207 0.31
208 0.32
209 0.28
210 0.29
211 0.29
212 0.31
213 0.3
214 0.3
215 0.34
216 0.37
217 0.4
218 0.4
219 0.35
220 0.32
221 0.32
222 0.32
223 0.28
224 0.25
225 0.2
226 0.19
227 0.18
228 0.14
229 0.1
230 0.1
231 0.14
232 0.13
233 0.13
234 0.12
235 0.12
236 0.12
237 0.12
238 0.16
239 0.12
240 0.13
241 0.12
242 0.16
243 0.16
244 0.15
245 0.15
246 0.1
247 0.13
248 0.15
249 0.15
250 0.13
251 0.15
252 0.15
253 0.15
254 0.14
255 0.12
256 0.11
257 0.11
258 0.13
259 0.11
260 0.12
261 0.12
262 0.13
263 0.13
264 0.14
265 0.14
266 0.11
267 0.12
268 0.11
269 0.11
270 0.1
271 0.09
272 0.07
273 0.07
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.04
289 0.06
290 0.09
291 0.1
292 0.12
293 0.13
294 0.14
295 0.15
296 0.15
297 0.14
298 0.11
299 0.12
300 0.15
301 0.21
302 0.21
303 0.21
304 0.21
305 0.24
306 0.27
307 0.32
308 0.37
309 0.4
310 0.5
311 0.59
312 0.68
313 0.71
314 0.79
315 0.8
316 0.75
317 0.75
318 0.68
319 0.64
320 0.57
321 0.55
322 0.46
323 0.4
324 0.36
325 0.26
326 0.23
327 0.17
328 0.16
329 0.1
330 0.09
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.07
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.07
340 0.07
341 0.09
342 0.1
343 0.18
344 0.26
345 0.29
346 0.34
347 0.41
348 0.47
349 0.46
350 0.51
351 0.49
352 0.44
353 0.49
354 0.49
355 0.43
356 0.38
357 0.4
358 0.38
359 0.34
360 0.34
361 0.27
362 0.27
363 0.28
364 0.31
365 0.31
366 0.27
367 0.27
368 0.25
369 0.23
370 0.17
371 0.15
372 0.11
373 0.1
374 0.1
375 0.11
376 0.12
377 0.12
378 0.12
379 0.15
380 0.18
381 0.21
382 0.21
383 0.2
384 0.2
385 0.3
386 0.4
387 0.38
388 0.37
389 0.41
390 0.42
391 0.43
392 0.45
393 0.43
394 0.38
395 0.39
396 0.39
397 0.36
398 0.35
399 0.36
400 0.33
401 0.26
402 0.21
403 0.2
404 0.18
405 0.14
406 0.14
407 0.12
408 0.13
409 0.12
410 0.13
411 0.13
412 0.14
413 0.14
414 0.15
415 0.13
416 0.13
417 0.13
418 0.12
419 0.12
420 0.1
421 0.1
422 0.09
423 0.08
424 0.08
425 0.07
426 0.07
427 0.08
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.1
432 0.08
433 0.08
434 0.09
435 0.08
436 0.06
437 0.06
438 0.05
439 0.06
440 0.07
441 0.07
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.09
446 0.1
447 0.09
448 0.09
449 0.09
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.1
454 0.11
455 0.14
456 0.16
457 0.16
458 0.16
459 0.17
460 0.16
461 0.16
462 0.19
463 0.17
464 0.15
465 0.16
466 0.15
467 0.14
468 0.14
469 0.13
470 0.09
471 0.1
472 0.11
473 0.12
474 0.17
475 0.18
476 0.19
477 0.23
478 0.26
479 0.26
480 0.29
481 0.3
482 0.27
483 0.26
484 0.26
485 0.24
486 0.24
487 0.22
488 0.19
489 0.16
490 0.15
491 0.17
492 0.17
493 0.19
494 0.17
495 0.17
496 0.18
497 0.25
498 0.29
499 0.27
500 0.28