Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6FEJ9

Protein Details
Accession A0A5N6FEJ9    Localization Confidence Low Confidence Score 6.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-42RTSTLKFEHNRKIPPKKTSRSPIRTTRFAVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 14, cyto_nucl 5, nucl 4, cyto 4, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR033464  CSN8_PSD8_EIF3K  
IPR009374  eIF3k  
IPR000717  PCI_dom  
IPR016020  Transl_init_fac_sub12_N_euk  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0016282  C:eukaryotic 43S preinitiation complex  
GO:0033290  C:eukaryotic 48S preinitiation complex  
GO:0005852  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex  
GO:0043022  F:ribosome binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0001732  P:formation of cytoplasmic translation initiation complex  
GO:0006446  P:regulation of translational initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF10075  CSN8_PSD8_EIF3K  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50250  PCI  
Amino Acid Sequences MPFRASPTLRIARTSTLKFEHNRKIPPKKTSRSPIRTTRFAVARSFKIHTEIPIRGTVFFLSNDLFQGIQIYIVKMGVAFDKCETRPANIDAILNGLDRYNPETTTVFQDYVVQQCEDRTFDCYANLALLKLYQFNPHLLQAETVTNILAKALTVFPSPAFSLCLALLPAHTQPFPSTDADASQTSDFVESVQKLARLSTLLESAQYAQFWSTLNSDDLYADLTADVAGFEELVRIRIAVEVGKAFREINAELLEQWLDLRSREALEKFVVEVCSWEVEKSGANTIVKVPTNKENEARSEVKSERVDVDMFGRVIRRGFEQAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.46
3 0.41
4 0.47
5 0.5
6 0.56
7 0.59
8 0.59
9 0.66
10 0.7
11 0.77
12 0.78
13 0.82
14 0.84
15 0.82
16 0.85
17 0.86
18 0.87
19 0.85
20 0.86
21 0.86
22 0.83
23 0.81
24 0.75
25 0.72
26 0.66
27 0.59
28 0.58
29 0.54
30 0.5
31 0.48
32 0.47
33 0.39
34 0.38
35 0.37
36 0.34
37 0.34
38 0.32
39 0.3
40 0.32
41 0.32
42 0.28
43 0.28
44 0.24
45 0.2
46 0.18
47 0.16
48 0.13
49 0.12
50 0.12
51 0.12
52 0.11
53 0.09
54 0.1
55 0.08
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.07
63 0.08
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.12
68 0.16
69 0.17
70 0.23
71 0.23
72 0.22
73 0.25
74 0.27
75 0.28
76 0.25
77 0.25
78 0.19
79 0.2
80 0.18
81 0.14
82 0.12
83 0.09
84 0.07
85 0.08
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.13
90 0.14
91 0.15
92 0.2
93 0.22
94 0.19
95 0.17
96 0.2
97 0.19
98 0.21
99 0.22
100 0.16
101 0.14
102 0.15
103 0.16
104 0.14
105 0.14
106 0.14
107 0.14
108 0.14
109 0.14
110 0.14
111 0.13
112 0.13
113 0.12
114 0.09
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.09
119 0.09
120 0.11
121 0.12
122 0.13
123 0.15
124 0.15
125 0.17
126 0.15
127 0.14
128 0.13
129 0.13
130 0.11
131 0.1
132 0.09
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.04
137 0.03
138 0.04
139 0.04
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.08
148 0.07
149 0.08
150 0.07
151 0.08
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.1
162 0.12
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.12
167 0.14
168 0.14
169 0.13
170 0.11
171 0.1
172 0.09
173 0.09
174 0.08
175 0.07
176 0.09
177 0.07
178 0.09
179 0.1
180 0.11
181 0.1
182 0.11
183 0.11
184 0.09
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.11
192 0.11
193 0.1
194 0.09
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.1
205 0.1
206 0.09
207 0.08
208 0.07
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.08
226 0.07
227 0.09
228 0.1
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.14
235 0.13
236 0.13
237 0.14
238 0.14
239 0.13
240 0.14
241 0.14
242 0.11
243 0.11
244 0.1
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.12
250 0.17
251 0.18
252 0.18
253 0.19
254 0.19
255 0.19
256 0.2
257 0.2
258 0.15
259 0.15
260 0.14
261 0.16
262 0.15
263 0.14
264 0.12
265 0.12
266 0.14
267 0.14
268 0.17
269 0.19
270 0.19
271 0.2
272 0.22
273 0.28
274 0.29
275 0.3
276 0.3
277 0.34
278 0.39
279 0.43
280 0.45
281 0.43
282 0.45
283 0.5
284 0.49
285 0.43
286 0.44
287 0.41
288 0.44
289 0.42
290 0.39
291 0.34
292 0.34
293 0.32
294 0.26
295 0.28
296 0.25
297 0.23
298 0.21
299 0.21
300 0.2
301 0.21
302 0.22
303 0.23