Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6FJ04

Protein Details
Accession A0A5N6FJ04    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
366-390EGAEARAEKKRRKEEEEKKKKVGESBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
371-406RAEKKRRKEEEEKKKKVGESRGVRDLKKVNTIGMKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040456  RNase_H2_suB  
IPR019024  RNase_H2_suB_wHTH  
IPR041195  Rnh202_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0032299  C:ribonuclease H2 complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF09468  RNase_H2-Ydr279  
PF17745  Ydr279_N  
CDD cd09270  RNase_H2-B  
Amino Acid Sequences MLTRSKAPPSEQADSEESSKLPPTAEKPSKTFILPSAASDEARFLQLPNPQTGDLNRYYFCPKLGVYEFTVIASPSQSPRSILFTPKSYTPAPGEKGQEPTTGSITKLAQLLVATPIDVIFFLAPLLCSTSSQAKGLFQPLDDIIDSQDDISKHLRHVLYNETFKDTLQARVEAICDSVEAGDEKMFRFSEAKFLKELVAKAERMVAQGLPASMEERFIRQALATPLMSVKREDTTTNGVSTNSNEGEGESQDSKETPATTASSTSASTPSGQSTPATEVSPEDPGASDNVARLLRISTALSFMKDSYLSAALRTKVDELLTSVDSPIDFKPMHDHLKRVAELRAEALASRSLGDFSRKRDADDDEGAEARAEKKRRKEEEEKKKKVGESRGVRDLKKVNTIGMKKMSAFFAKAAPKKNS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.44
3 0.37
4 0.29
5 0.25
6 0.26
7 0.22
8 0.19
9 0.21
10 0.23
11 0.33
12 0.41
13 0.44
14 0.46
15 0.5
16 0.52
17 0.49
18 0.46
19 0.39
20 0.38
21 0.33
22 0.31
23 0.31
24 0.29
25 0.28
26 0.26
27 0.25
28 0.18
29 0.2
30 0.18
31 0.14
32 0.17
33 0.22
34 0.24
35 0.26
36 0.27
37 0.26
38 0.28
39 0.29
40 0.31
41 0.3
42 0.3
43 0.27
44 0.27
45 0.31
46 0.29
47 0.28
48 0.25
49 0.21
50 0.25
51 0.28
52 0.28
53 0.27
54 0.29
55 0.28
56 0.25
57 0.26
58 0.19
59 0.16
60 0.13
61 0.13
62 0.13
63 0.15
64 0.16
65 0.17
66 0.18
67 0.24
68 0.26
69 0.31
70 0.31
71 0.33
72 0.35
73 0.36
74 0.38
75 0.33
76 0.33
77 0.32
78 0.35
79 0.34
80 0.37
81 0.39
82 0.38
83 0.42
84 0.41
85 0.38
86 0.33
87 0.31
88 0.29
89 0.26
90 0.23
91 0.21
92 0.2
93 0.19
94 0.19
95 0.17
96 0.14
97 0.12
98 0.13
99 0.12
100 0.11
101 0.09
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.07
106 0.06
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.09
117 0.15
118 0.16
119 0.17
120 0.18
121 0.17
122 0.19
123 0.23
124 0.21
125 0.16
126 0.17
127 0.16
128 0.17
129 0.15
130 0.13
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.07
135 0.1
136 0.08
137 0.11
138 0.14
139 0.15
140 0.15
141 0.2
142 0.21
143 0.19
144 0.22
145 0.27
146 0.29
147 0.32
148 0.33
149 0.31
150 0.3
151 0.29
152 0.31
153 0.24
154 0.24
155 0.21
156 0.2
157 0.17
158 0.18
159 0.18
160 0.14
161 0.13
162 0.08
163 0.07
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.1
176 0.1
177 0.18
178 0.19
179 0.2
180 0.19
181 0.2
182 0.21
183 0.22
184 0.22
185 0.17
186 0.19
187 0.18
188 0.17
189 0.19
190 0.18
191 0.16
192 0.16
193 0.12
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.05
201 0.07
202 0.06
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.11
209 0.11
210 0.13
211 0.12
212 0.11
213 0.13
214 0.14
215 0.15
216 0.12
217 0.12
218 0.11
219 0.12
220 0.12
221 0.14
222 0.18
223 0.18
224 0.19
225 0.18
226 0.18
227 0.17
228 0.18
229 0.18
230 0.13
231 0.12
232 0.1
233 0.1
234 0.11
235 0.1
236 0.12
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.09
245 0.1
246 0.11
247 0.11
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.12
258 0.11
259 0.12
260 0.11
261 0.12
262 0.14
263 0.15
264 0.14
265 0.13
266 0.13
267 0.14
268 0.16
269 0.14
270 0.11
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.07
277 0.11
278 0.11
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.11
284 0.12
285 0.08
286 0.12
287 0.13
288 0.13
289 0.13
290 0.13
291 0.13
292 0.12
293 0.12
294 0.11
295 0.13
296 0.13
297 0.14
298 0.17
299 0.18
300 0.18
301 0.19
302 0.18
303 0.16
304 0.17
305 0.15
306 0.13
307 0.15
308 0.15
309 0.15
310 0.13
311 0.12
312 0.12
313 0.13
314 0.12
315 0.13
316 0.12
317 0.12
318 0.19
319 0.24
320 0.33
321 0.33
322 0.35
323 0.37
324 0.45
325 0.46
326 0.42
327 0.4
328 0.34
329 0.33
330 0.32
331 0.27
332 0.2
333 0.18
334 0.17
335 0.15
336 0.13
337 0.12
338 0.11
339 0.11
340 0.12
341 0.2
342 0.22
343 0.26
344 0.36
345 0.36
346 0.38
347 0.4
348 0.44
349 0.43
350 0.44
351 0.41
352 0.34
353 0.34
354 0.32
355 0.28
356 0.24
357 0.21
358 0.23
359 0.29
360 0.33
361 0.43
362 0.53
363 0.62
364 0.7
365 0.77
366 0.81
367 0.85
368 0.89
369 0.88
370 0.86
371 0.84
372 0.8
373 0.77
374 0.76
375 0.75
376 0.74
377 0.72
378 0.74
379 0.74
380 0.7
381 0.69
382 0.66
383 0.6
384 0.59
385 0.52
386 0.48
387 0.51
388 0.54
389 0.54
390 0.53
391 0.51
392 0.44
393 0.46
394 0.45
395 0.38
396 0.37
397 0.31
398 0.32
399 0.39
400 0.43