Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6GC78

Protein Details
Accession A0A5N6GC78    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
144-166AAQNGKSKKRSKGKKQSEAREEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
137-159KKRKREEAAQNGKSKKRSKGKKQ
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 8.5, cyto_mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010301  RRP1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF05997  Nop52  
Amino Acid Sequences MTDLQKTPFVRELASSDKKIRDKATESLTLFLRSRTDLSLMELLKLWKGLFFCFYHSDRPLTQQALARNLSYTLVPTLPRSAVHRFLRAFWITIGRDFHSLDRLRLDKYLFLIRCYVGVAFEVFVKGAQAQTKDDNKKRKREEAAQNGKSKKRSKGKKQSEAREEEEEEQDDETKWAGLESYISILEEGPLCPLNFDPDQPATDEKSDYVAMPHGPDGLRYHIMDIWIDELEKVLEFEEGADGERKPKAGVPIDLILRPIEKLRAESPYKPVRTRAQEALDDERLIEWGFRTQKVAADSDDESDEEWGGFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.41
3 0.42
4 0.49
5 0.52
6 0.55
7 0.55
8 0.53
9 0.52
10 0.54
11 0.54
12 0.54
13 0.51
14 0.49
15 0.46
16 0.43
17 0.38
18 0.33
19 0.28
20 0.22
21 0.23
22 0.21
23 0.22
24 0.18
25 0.22
26 0.26
27 0.25
28 0.23
29 0.23
30 0.22
31 0.2
32 0.21
33 0.16
34 0.13
35 0.13
36 0.14
37 0.16
38 0.16
39 0.19
40 0.23
41 0.26
42 0.3
43 0.31
44 0.34
45 0.3
46 0.35
47 0.36
48 0.33
49 0.34
50 0.32
51 0.34
52 0.36
53 0.36
54 0.31
55 0.27
56 0.25
57 0.22
58 0.18
59 0.15
60 0.11
61 0.12
62 0.12
63 0.13
64 0.15
65 0.15
66 0.16
67 0.19
68 0.22
69 0.29
70 0.32
71 0.36
72 0.35
73 0.35
74 0.41
75 0.37
76 0.33
77 0.26
78 0.29
79 0.23
80 0.25
81 0.26
82 0.21
83 0.22
84 0.22
85 0.22
86 0.23
87 0.24
88 0.22
89 0.24
90 0.25
91 0.24
92 0.25
93 0.25
94 0.19
95 0.2
96 0.27
97 0.23
98 0.22
99 0.23
100 0.21
101 0.2
102 0.19
103 0.16
104 0.09
105 0.09
106 0.08
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.08
116 0.09
117 0.1
118 0.16
119 0.25
120 0.33
121 0.39
122 0.48
123 0.53
124 0.62
125 0.66
126 0.69
127 0.67
128 0.68
129 0.72
130 0.73
131 0.77
132 0.73
133 0.75
134 0.71
135 0.69
136 0.66
137 0.61
138 0.59
139 0.58
140 0.61
141 0.66
142 0.72
143 0.79
144 0.82
145 0.86
146 0.86
147 0.84
148 0.8
149 0.72
150 0.65
151 0.56
152 0.48
153 0.4
154 0.32
155 0.24
156 0.19
157 0.15
158 0.12
159 0.1
160 0.08
161 0.07
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.11
182 0.11
183 0.12
184 0.14
185 0.14
186 0.15
187 0.16
188 0.18
189 0.16
190 0.17
191 0.17
192 0.13
193 0.14
194 0.14
195 0.13
196 0.12
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.1
203 0.12
204 0.13
205 0.15
206 0.17
207 0.16
208 0.18
209 0.16
210 0.17
211 0.16
212 0.14
213 0.12
214 0.1
215 0.1
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.09
229 0.09
230 0.12
231 0.13
232 0.13
233 0.13
234 0.16
235 0.21
236 0.24
237 0.26
238 0.28
239 0.32
240 0.34
241 0.33
242 0.31
243 0.25
244 0.21
245 0.2
246 0.17
247 0.17
248 0.15
249 0.19
250 0.21
251 0.28
252 0.32
253 0.35
254 0.42
255 0.48
256 0.52
257 0.52
258 0.55
259 0.56
260 0.6
261 0.63
262 0.61
263 0.58
264 0.57
265 0.58
266 0.59
267 0.52
268 0.44
269 0.38
270 0.31
271 0.26
272 0.21
273 0.17
274 0.11
275 0.16
276 0.2
277 0.2
278 0.23
279 0.24
280 0.27
281 0.3
282 0.31
283 0.25
284 0.26
285 0.26
286 0.25
287 0.25
288 0.21
289 0.19
290 0.17
291 0.16