Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VLN6

Protein Details
Accession H1VLN6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
290-311ELEARVRKLKEKREALRRQSDAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040050  ZNF830-like  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG chig:CH63R_08443  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MADVRSLLRQQRTARRIEHPHAAYSDAGKLLCTLCHEAIKSESLWDSHTRSATHTTKLKAAQQQASASANGLAATANGAPSNKRKHDEDDDMDDEDAAESVRKKRNRANMSTPARLSAGESDRDLKDVTLTPPSLNRRTSTTPVQGVEIQIPSRPHTPAYKDGASSNSTPTVQPVGPSPLVPQEAASANAAAATSAAQPNGVAAGAGSAGGQVDEDEWAAFEADIAATTAPYAEDAVIAAPAMTAEETAAAAKTEEQEQEKRRLAAEKDLLDEKEEAARALETEFEDMEELEARVRKLKEKREALRRQSDAGTVVPLAKSLEKPAGATGKENVEAVGEEEEEDEDEDGDDDDDFMGFRFRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.66
3 0.69
4 0.68
5 0.7
6 0.62
7 0.61
8 0.55
9 0.51
10 0.43
11 0.36
12 0.33
13 0.25
14 0.22
15 0.17
16 0.17
17 0.16
18 0.16
19 0.18
20 0.19
21 0.19
22 0.23
23 0.24
24 0.24
25 0.26
26 0.27
27 0.24
28 0.21
29 0.21
30 0.18
31 0.2
32 0.22
33 0.24
34 0.26
35 0.28
36 0.27
37 0.28
38 0.36
39 0.37
40 0.4
41 0.42
42 0.4
43 0.43
44 0.46
45 0.5
46 0.49
47 0.53
48 0.51
49 0.49
50 0.48
51 0.45
52 0.43
53 0.36
54 0.29
55 0.22
56 0.17
57 0.13
58 0.11
59 0.08
60 0.06
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.07
66 0.1
67 0.17
68 0.26
69 0.3
70 0.34
71 0.37
72 0.43
73 0.51
74 0.56
75 0.54
76 0.53
77 0.5
78 0.48
79 0.45
80 0.37
81 0.29
82 0.21
83 0.16
84 0.08
85 0.07
86 0.08
87 0.15
88 0.23
89 0.27
90 0.32
91 0.39
92 0.49
93 0.56
94 0.62
95 0.64
96 0.67
97 0.71
98 0.71
99 0.64
100 0.55
101 0.47
102 0.39
103 0.31
104 0.27
105 0.22
106 0.18
107 0.19
108 0.21
109 0.21
110 0.22
111 0.21
112 0.15
113 0.14
114 0.15
115 0.15
116 0.16
117 0.16
118 0.16
119 0.21
120 0.27
121 0.3
122 0.29
123 0.28
124 0.3
125 0.34
126 0.38
127 0.39
128 0.38
129 0.36
130 0.35
131 0.36
132 0.31
133 0.27
134 0.24
135 0.19
136 0.15
137 0.14
138 0.14
139 0.15
140 0.16
141 0.16
142 0.16
143 0.18
144 0.22
145 0.26
146 0.31
147 0.3
148 0.28
149 0.29
150 0.3
151 0.28
152 0.25
153 0.2
154 0.16
155 0.15
156 0.14
157 0.14
158 0.14
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.14
163 0.14
164 0.14
165 0.14
166 0.13
167 0.14
168 0.14
169 0.12
170 0.1
171 0.1
172 0.11
173 0.11
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.03
190 0.02
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.02
196 0.02
197 0.02
198 0.03
199 0.02
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.03
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.05
240 0.07
241 0.09
242 0.11
243 0.15
244 0.22
245 0.26
246 0.34
247 0.37
248 0.37
249 0.37
250 0.4
251 0.38
252 0.4
253 0.42
254 0.36
255 0.36
256 0.38
257 0.36
258 0.32
259 0.3
260 0.22
261 0.2
262 0.18
263 0.15
264 0.12
265 0.12
266 0.11
267 0.1
268 0.11
269 0.09
270 0.1
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.08
277 0.08
278 0.1
279 0.12
280 0.12
281 0.19
282 0.2
283 0.28
284 0.35
285 0.45
286 0.52
287 0.6
288 0.69
289 0.74
290 0.83
291 0.84
292 0.85
293 0.79
294 0.72
295 0.64
296 0.57
297 0.48
298 0.38
299 0.31
300 0.21
301 0.2
302 0.16
303 0.15
304 0.14
305 0.15
306 0.15
307 0.17
308 0.21
309 0.19
310 0.2
311 0.25
312 0.29
313 0.28
314 0.29
315 0.29
316 0.28
317 0.29
318 0.28
319 0.23
320 0.17
321 0.17
322 0.16
323 0.14
324 0.1
325 0.1
326 0.1
327 0.1
328 0.1
329 0.1
330 0.09
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.06
341 0.06