Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VDS4

Protein Details
Accession H1VDS4    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
362-381EGKPKAVPGKAKRRKAQESEBasic
436-456AEKPKAPSGAKKNTAKDKAKVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
364-405KPKAVPGKAKRRXKAQESEDEKPAKKARGAKGSATSKSKAKV
428-459GRKSRGSKAAEKPKAPSGAKKNTAKDKAKVET
464-475TGSRRRSLRLKK
Subcellular Location(s) cyto 11, mito 7, nucl 5, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015886  DNA_glyclase/AP_lyase_DNA-bd  
IPR012319  FPG_cat  
IPR035937  MutM-like_N-ter  
IPR010979  Ribosomal_S13-like_H2TH  
Gene Ontology GO:0140078  F:class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0019104  F:DNA N-glycosylase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006284  P:base-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01149  Fapy_DNA_glyco  
PF06831  H2TH  
Amino Acid Sequences MGICSDCTLSSSHAFVVARCVHFLRRHLLGKKIAKVSAPDDANVFGKVGTSGPAFEKAVKGRKVVSVGSQGKYFWYVFRPRIPVHVGGSPAHESQDNLRQTASCGDALGHDRYEAPVAPPALLCLRADIAQGWIHIKGDKTAYTNYYKKMKDGEADVWPPKYWKFQLETDDDPPVAAAFTDPRRFGRIRLVNCPGADIRNHSPLKENGPDPVVDADVFTEAYFCDKMRSRHVPVKALLLDQSHISGIGNWVADEVLYQSRLHPEQYCDTFAEAESRRLYEAVRYVCQTAVDKLGDSDEFPADWLFNYRWGKGSKDAASALPNGEKLAFITVGGRTSCYAPGRQKKTGQVVASAKEEPVGDEEGKPKAVPGKAKRRXKAQESEDEKPAKKARGAKGSATSKSKAKVKQEEEDQEEEEAPQPPAVETVPGRKSRGSKAAEKPKAPSGAKKNTAKDKAKVETPVEDTGSRRRSLRLKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.26
4 0.29
5 0.28
6 0.29
7 0.31
8 0.33
9 0.38
10 0.42
11 0.39
12 0.41
13 0.48
14 0.51
15 0.56
16 0.59
17 0.62
18 0.66
19 0.66
20 0.6
21 0.54
22 0.53
23 0.49
24 0.48
25 0.41
26 0.34
27 0.29
28 0.29
29 0.28
30 0.24
31 0.21
32 0.12
33 0.11
34 0.11
35 0.1
36 0.11
37 0.1
38 0.11
39 0.13
40 0.17
41 0.17
42 0.18
43 0.23
44 0.28
45 0.36
46 0.37
47 0.37
48 0.37
49 0.4
50 0.42
51 0.38
52 0.36
53 0.38
54 0.41
55 0.41
56 0.39
57 0.35
58 0.32
59 0.34
60 0.29
61 0.21
62 0.23
63 0.28
64 0.31
65 0.38
66 0.43
67 0.4
68 0.46
69 0.48
70 0.44
71 0.41
72 0.39
73 0.35
74 0.3
75 0.32
76 0.29
77 0.25
78 0.23
79 0.2
80 0.17
81 0.19
82 0.27
83 0.25
84 0.23
85 0.23
86 0.22
87 0.23
88 0.25
89 0.23
90 0.15
91 0.13
92 0.13
93 0.15
94 0.19
95 0.19
96 0.16
97 0.14
98 0.14
99 0.15
100 0.16
101 0.14
102 0.12
103 0.14
104 0.14
105 0.14
106 0.14
107 0.15
108 0.14
109 0.15
110 0.13
111 0.1
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.11
117 0.11
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.13
123 0.13
124 0.13
125 0.14
126 0.15
127 0.17
128 0.19
129 0.22
130 0.28
131 0.31
132 0.34
133 0.4
134 0.38
135 0.38
136 0.4
137 0.38
138 0.34
139 0.34
140 0.34
141 0.31
142 0.35
143 0.35
144 0.32
145 0.3
146 0.29
147 0.26
148 0.27
149 0.24
150 0.23
151 0.25
152 0.29
153 0.34
154 0.38
155 0.41
156 0.37
157 0.37
158 0.32
159 0.27
160 0.23
161 0.17
162 0.12
163 0.07
164 0.05
165 0.07
166 0.11
167 0.15
168 0.16
169 0.17
170 0.22
171 0.23
172 0.24
173 0.31
174 0.34
175 0.35
176 0.41
177 0.45
178 0.43
179 0.42
180 0.43
181 0.33
182 0.27
183 0.24
184 0.21
185 0.2
186 0.26
187 0.26
188 0.24
189 0.28
190 0.29
191 0.33
192 0.33
193 0.3
194 0.22
195 0.23
196 0.23
197 0.2
198 0.18
199 0.13
200 0.09
201 0.08
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.09
212 0.13
213 0.15
214 0.22
215 0.28
216 0.32
217 0.38
218 0.42
219 0.43
220 0.4
221 0.43
222 0.37
223 0.31
224 0.27
225 0.21
226 0.18
227 0.13
228 0.13
229 0.08
230 0.07
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.1
247 0.11
248 0.13
249 0.13
250 0.15
251 0.19
252 0.21
253 0.23
254 0.2
255 0.2
256 0.19
257 0.17
258 0.21
259 0.17
260 0.18
261 0.16
262 0.16
263 0.16
264 0.16
265 0.16
266 0.12
267 0.17
268 0.17
269 0.18
270 0.18
271 0.19
272 0.19
273 0.2
274 0.19
275 0.15
276 0.15
277 0.14
278 0.12
279 0.12
280 0.13
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.09
291 0.08
292 0.15
293 0.17
294 0.17
295 0.22
296 0.23
297 0.26
298 0.28
299 0.34
300 0.29
301 0.3
302 0.31
303 0.27
304 0.28
305 0.26
306 0.23
307 0.18
308 0.15
309 0.13
310 0.12
311 0.1
312 0.09
313 0.1
314 0.08
315 0.07
316 0.08
317 0.09
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.1
322 0.12
323 0.16
324 0.16
325 0.21
326 0.28
327 0.38
328 0.44
329 0.5
330 0.53
331 0.57
332 0.63
333 0.63
334 0.55
335 0.53
336 0.5
337 0.47
338 0.45
339 0.39
340 0.3
341 0.25
342 0.24
343 0.17
344 0.16
345 0.16
346 0.14
347 0.15
348 0.18
349 0.18
350 0.19
351 0.18
352 0.17
353 0.2
354 0.23
355 0.3
356 0.37
357 0.47
358 0.56
359 0.66
360 0.72
361 0.75
362 0.81
363 0.8
364 0.8
365 0.79
366 0.78
367 0.74
368 0.77
369 0.73
370 0.65
371 0.64
372 0.6
373 0.53
374 0.5
375 0.53
376 0.52
377 0.56
378 0.59
379 0.57
380 0.61
381 0.64
382 0.65
383 0.61
384 0.56
385 0.5
386 0.53
387 0.55
388 0.53
389 0.55
390 0.59
391 0.61
392 0.66
393 0.7
394 0.72
395 0.7
396 0.67
397 0.58
398 0.5
399 0.44
400 0.37
401 0.3
402 0.24
403 0.19
404 0.16
405 0.15
406 0.13
407 0.14
408 0.13
409 0.15
410 0.15
411 0.23
412 0.29
413 0.33
414 0.35
415 0.39
416 0.44
417 0.48
418 0.55
419 0.52
420 0.55
421 0.61
422 0.7
423 0.74
424 0.72
425 0.69
426 0.67
427 0.7
428 0.63
429 0.62
430 0.61
431 0.63
432 0.69
433 0.73
434 0.74
435 0.76
436 0.83
437 0.81
438 0.78
439 0.76
440 0.73
441 0.71
442 0.69
443 0.62
444 0.58
445 0.56
446 0.53
447 0.48
448 0.43
449 0.4
450 0.43
451 0.45
452 0.41
453 0.38
454 0.41