Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6GDT6

Protein Details
Accession A0A5N6GDT6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
136-156ESEKWDKRMDKKQRHRDNVAFBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MSAKSSAEKPASNPSDTNEPGSVQVERPSDSAEGSNNVQKESEEVAAKSVEEDDTAAKARQRRERFIALQARAKSATERNLKETAAETQRLATDPSLLSSLSRKHAFASHNLLKADTEVAGEDFERKRAWDWTVDESEKWDKRMDKKQRHRDNVAFQDYTQDARKVYKKQLREMKPDLEAYERDKLAAIEKAAANGDLEIVETNDGEMIAVDKNGTFYSTADTIGFTENKPDRAAVDRLVGDLRKAEEAQLKRRRERRGDEEGDVTYINEKNKQFNQKLARFYNKYTTEIRDSFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.43
3 0.42
4 0.43
5 0.34
6 0.3
7 0.29
8 0.31
9 0.29
10 0.21
11 0.26
12 0.23
13 0.24
14 0.24
15 0.24
16 0.22
17 0.21
18 0.21
19 0.18
20 0.19
21 0.2
22 0.24
23 0.22
24 0.22
25 0.21
26 0.19
27 0.2
28 0.2
29 0.21
30 0.19
31 0.18
32 0.19
33 0.19
34 0.19
35 0.17
36 0.15
37 0.11
38 0.09
39 0.09
40 0.09
41 0.1
42 0.13
43 0.14
44 0.16
45 0.21
46 0.28
47 0.37
48 0.43
49 0.48
50 0.52
51 0.59
52 0.59
53 0.64
54 0.65
55 0.6
56 0.61
57 0.55
58 0.51
59 0.43
60 0.4
61 0.35
62 0.3
63 0.34
64 0.36
65 0.37
66 0.39
67 0.41
68 0.4
69 0.37
70 0.34
71 0.33
72 0.29
73 0.27
74 0.23
75 0.22
76 0.23
77 0.22
78 0.22
79 0.15
80 0.13
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.11
85 0.11
86 0.12
87 0.15
88 0.18
89 0.19
90 0.18
91 0.19
92 0.24
93 0.25
94 0.27
95 0.33
96 0.34
97 0.36
98 0.36
99 0.35
100 0.3
101 0.28
102 0.24
103 0.15
104 0.1
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.1
110 0.09
111 0.1
112 0.1
113 0.11
114 0.12
115 0.14
116 0.16
117 0.17
118 0.19
119 0.23
120 0.28
121 0.28
122 0.26
123 0.27
124 0.32
125 0.29
126 0.27
127 0.26
128 0.26
129 0.32
130 0.42
131 0.5
132 0.54
133 0.64
134 0.73
135 0.8
136 0.83
137 0.82
138 0.78
139 0.75
140 0.72
141 0.67
142 0.56
143 0.46
144 0.42
145 0.35
146 0.32
147 0.25
148 0.18
149 0.13
150 0.17
151 0.22
152 0.24
153 0.33
154 0.36
155 0.39
156 0.47
157 0.56
158 0.59
159 0.62
160 0.62
161 0.56
162 0.53
163 0.5
164 0.43
165 0.36
166 0.3
167 0.25
168 0.26
169 0.22
170 0.19
171 0.18
172 0.18
173 0.17
174 0.18
175 0.14
176 0.12
177 0.13
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.11
182 0.09
183 0.08
184 0.05
185 0.05
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.03
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.1
206 0.1
207 0.11
208 0.1
209 0.11
210 0.11
211 0.14
212 0.14
213 0.11
214 0.19
215 0.2
216 0.22
217 0.22
218 0.22
219 0.21
220 0.25
221 0.27
222 0.21
223 0.23
224 0.22
225 0.22
226 0.25
227 0.23
228 0.18
229 0.18
230 0.18
231 0.16
232 0.16
233 0.18
234 0.23
235 0.29
236 0.38
237 0.45
238 0.52
239 0.58
240 0.65
241 0.72
242 0.73
243 0.77
244 0.75
245 0.77
246 0.75
247 0.7
248 0.66
249 0.57
250 0.49
251 0.4
252 0.32
253 0.25
254 0.22
255 0.21
256 0.24
257 0.24
258 0.31
259 0.38
260 0.49
261 0.48
262 0.54
263 0.63
264 0.63
265 0.7
266 0.71
267 0.73
268 0.67
269 0.69
270 0.7
271 0.63
272 0.6
273 0.56
274 0.53
275 0.52
276 0.49
277 0.48
278 0.43
279 0.43
280 0.41