Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6GB06

Protein Details
Accession A0A5N6GB06    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-26ATAITKPTSHPPKMKRPPPPFIQAGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 10.5, cyto_mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MATAITKPTSHPPKMKRPPPPFIQAGVNGVKPQQSSSSPQPSSKRLPGSNQPATTGSISGAATNGVNGTSDSNGVKGSINRPKKDAQRPGDQGMRLAKPLARTPSTDNERRLGKKCPEPYVKTSSHILKKYAKCPPSLILHLHPTHFRFEQQDGSFPYNSEMKVIIEHIRAGTVPHDMMEELLRANVRFYEGCLIVRVVDHKSVSAQARKSTAPSTNDSNTPFSIHNYNEHVTPSAYVPYPKQNQLTSEKPTPKETGGAQSDAKTNEGLPSDSLDETEKSESSSSQHKQPPPNPRMFTTVLHPTSRSLQAELTLLATTPDPKATKQGATSSASRTQAPSSTTPPSPGGSSSQPERGHVAKRQKMLVEPQDLQECESKLTRALAPPLFLDPVESLEAVEDLLKYMESPLNNDPPPSPKRRKRTVAELAADEALAAEEERFMLIMDERLEPATSGGAGGPKSAVVDDTSGGAPFEPRFSRFKTLENIRMQHEEKAKREHEIKLKQEIAKRQQQEQERERRRAMEQRQAEEQAKEDSRRQHLAAQQQVQAQLAAQQQGRHVMPQANGVSQAPQSSPVVRNQTPHNTSSPLPGNAMGTQGGVPMSMTSSMQGAGSPPRPPSALQHAHPNVMGHPMAPSRSQQGQSRHGTPQMTQGTPAMSHATPIMRNVTPQRMSHASPGRSTVAATPVMNQAMMGTPQMAGGMGLTPQQQQMLLQQRQQMLAQQGHLGHGQLTPQQFAQYQANAHAQQNIQSHQQQMLQAQQQSHQQQQQNVPNPQVYQQQLMRAQFAQMQMAQQQQQQHSQGQQPQGQQNQVHQGGSQMNPQQQQMLMAAAQANGGKLPQNLQGVNMAQGAMAQRYNQLYQQRLLRLRQEMASRLMSQYGPPNQYPPQIAQQYHAGLERNAKAWVHEIIRRERDAAQQQRANQVAAVQAQVMQQQQQQNMMQNGMGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.84
3 0.84
4 0.84
5 0.85
6 0.83
7 0.82
8 0.75
9 0.68
10 0.65
11 0.57
12 0.54
13 0.48
14 0.43
15 0.36
16 0.33
17 0.32
18 0.26
19 0.26
20 0.24
21 0.24
22 0.3
23 0.38
24 0.46
25 0.47
26 0.53
27 0.57
28 0.6
29 0.65
30 0.65
31 0.65
32 0.59
33 0.63
34 0.67
35 0.71
36 0.72
37 0.65
38 0.6
39 0.53
40 0.51
41 0.45
42 0.35
43 0.26
44 0.2
45 0.19
46 0.16
47 0.14
48 0.12
49 0.1
50 0.1
51 0.1
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.09
56 0.09
57 0.11
58 0.11
59 0.12
60 0.12
61 0.12
62 0.15
63 0.17
64 0.26
65 0.34
66 0.42
67 0.45
68 0.49
69 0.56
70 0.63
71 0.7
72 0.71
73 0.68
74 0.69
75 0.73
76 0.75
77 0.74
78 0.64
79 0.58
80 0.55
81 0.5
82 0.41
83 0.37
84 0.33
85 0.3
86 0.35
87 0.38
88 0.33
89 0.34
90 0.39
91 0.47
92 0.53
93 0.56
94 0.53
95 0.52
96 0.57
97 0.61
98 0.59
99 0.58
100 0.58
101 0.6
102 0.64
103 0.68
104 0.7
105 0.7
106 0.73
107 0.72
108 0.66
109 0.6
110 0.59
111 0.58
112 0.57
113 0.54
114 0.54
115 0.55
116 0.59
117 0.64
118 0.68
119 0.62
120 0.56
121 0.56
122 0.55
123 0.52
124 0.5
125 0.46
126 0.42
127 0.46
128 0.46
129 0.45
130 0.45
131 0.39
132 0.39
133 0.35
134 0.33
135 0.29
136 0.3
137 0.36
138 0.33
139 0.37
140 0.36
141 0.39
142 0.37
143 0.33
144 0.33
145 0.28
146 0.27
147 0.22
148 0.19
149 0.15
150 0.15
151 0.17
152 0.19
153 0.17
154 0.18
155 0.16
156 0.16
157 0.15
158 0.15
159 0.14
160 0.12
161 0.11
162 0.1
163 0.11
164 0.1
165 0.11
166 0.11
167 0.1
168 0.08
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.11
173 0.1
174 0.12
175 0.11
176 0.13
177 0.16
178 0.16
179 0.17
180 0.18
181 0.17
182 0.15
183 0.16
184 0.17
185 0.14
186 0.16
187 0.16
188 0.15
189 0.16
190 0.21
191 0.26
192 0.3
193 0.3
194 0.3
195 0.33
196 0.34
197 0.36
198 0.35
199 0.36
200 0.33
201 0.34
202 0.37
203 0.37
204 0.4
205 0.4
206 0.38
207 0.32
208 0.31
209 0.28
210 0.24
211 0.26
212 0.23
213 0.24
214 0.26
215 0.27
216 0.25
217 0.26
218 0.24
219 0.2
220 0.2
221 0.17
222 0.15
223 0.15
224 0.15
225 0.17
226 0.24
227 0.29
228 0.33
229 0.35
230 0.34
231 0.38
232 0.43
233 0.46
234 0.44
235 0.48
236 0.5
237 0.49
238 0.51
239 0.49
240 0.43
241 0.41
242 0.36
243 0.35
244 0.31
245 0.32
246 0.29
247 0.28
248 0.31
249 0.28
250 0.27
251 0.19
252 0.16
253 0.16
254 0.16
255 0.15
256 0.12
257 0.13
258 0.14
259 0.14
260 0.14
261 0.13
262 0.12
263 0.14
264 0.15
265 0.13
266 0.12
267 0.13
268 0.12
269 0.13
270 0.21
271 0.22
272 0.29
273 0.36
274 0.41
275 0.5
276 0.56
277 0.65
278 0.63
279 0.7
280 0.64
281 0.59
282 0.59
283 0.52
284 0.47
285 0.41
286 0.42
287 0.36
288 0.35
289 0.33
290 0.28
291 0.3
292 0.33
293 0.29
294 0.21
295 0.19
296 0.19
297 0.19
298 0.18
299 0.14
300 0.1
301 0.09
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.11
307 0.11
308 0.12
309 0.18
310 0.2
311 0.22
312 0.23
313 0.26
314 0.27
315 0.29
316 0.3
317 0.29
318 0.31
319 0.3
320 0.29
321 0.27
322 0.24
323 0.23
324 0.24
325 0.23
326 0.22
327 0.24
328 0.24
329 0.25
330 0.25
331 0.23
332 0.21
333 0.19
334 0.18
335 0.17
336 0.19
337 0.19
338 0.25
339 0.25
340 0.25
341 0.27
342 0.27
343 0.29
344 0.33
345 0.41
346 0.39
347 0.42
348 0.43
349 0.41
350 0.41
351 0.43
352 0.43
353 0.38
354 0.34
355 0.33
356 0.34
357 0.33
358 0.31
359 0.27
360 0.21
361 0.18
362 0.17
363 0.16
364 0.13
365 0.15
366 0.15
367 0.14
368 0.18
369 0.17
370 0.17
371 0.18
372 0.18
373 0.16
374 0.14
375 0.14
376 0.09
377 0.1
378 0.1
379 0.09
380 0.08
381 0.07
382 0.07
383 0.06
384 0.06
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.05
391 0.07
392 0.07
393 0.11
394 0.13
395 0.19
396 0.19
397 0.2
398 0.2
399 0.25
400 0.3
401 0.36
402 0.43
403 0.46
404 0.55
405 0.63
406 0.71
407 0.69
408 0.74
409 0.75
410 0.72
411 0.66
412 0.58
413 0.5
414 0.41
415 0.36
416 0.25
417 0.15
418 0.07
419 0.05
420 0.04
421 0.03
422 0.02
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.05
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.08
434 0.08
435 0.07
436 0.07
437 0.06
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.04
450 0.05
451 0.05
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.08
460 0.08
461 0.1
462 0.13
463 0.16
464 0.22
465 0.23
466 0.26
467 0.3
468 0.35
469 0.41
470 0.43
471 0.42
472 0.38
473 0.42
474 0.4
475 0.37
476 0.4
477 0.36
478 0.35
479 0.4
480 0.38
481 0.37
482 0.4
483 0.41
484 0.42
485 0.45
486 0.46
487 0.45
488 0.49
489 0.49
490 0.5
491 0.52
492 0.49
493 0.49
494 0.48
495 0.46
496 0.48
497 0.51
498 0.55
499 0.56
500 0.6
501 0.6
502 0.63
503 0.59
504 0.56
505 0.53
506 0.53
507 0.51
508 0.49
509 0.46
510 0.44
511 0.46
512 0.47
513 0.45
514 0.36
515 0.32
516 0.27
517 0.24
518 0.23
519 0.24
520 0.26
521 0.28
522 0.3
523 0.3
524 0.3
525 0.32
526 0.38
527 0.4
528 0.38
529 0.37
530 0.36
531 0.35
532 0.31
533 0.26
534 0.19
535 0.17
536 0.15
537 0.15
538 0.14
539 0.14
540 0.15
541 0.19
542 0.19
543 0.15
544 0.16
545 0.16
546 0.16
547 0.21
548 0.21
549 0.18
550 0.18
551 0.18
552 0.17
553 0.14
554 0.14
555 0.09
556 0.1
557 0.1
558 0.13
559 0.14
560 0.18
561 0.25
562 0.25
563 0.27
564 0.3
565 0.38
566 0.38
567 0.38
568 0.35
569 0.31
570 0.31
571 0.34
572 0.33
573 0.25
574 0.23
575 0.21
576 0.21
577 0.18
578 0.18
579 0.13
580 0.09
581 0.08
582 0.08
583 0.07
584 0.06
585 0.05
586 0.04
587 0.05
588 0.05
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.05
593 0.05
594 0.05
595 0.06
596 0.1
597 0.12
598 0.14
599 0.14
600 0.16
601 0.17
602 0.17
603 0.21
604 0.27
605 0.3
606 0.29
607 0.39
608 0.39
609 0.39
610 0.39
611 0.35
612 0.26
613 0.23
614 0.22
615 0.12
616 0.12
617 0.12
618 0.13
619 0.13
620 0.14
621 0.15
622 0.2
623 0.23
624 0.28
625 0.33
626 0.4
627 0.44
628 0.47
629 0.45
630 0.44
631 0.42
632 0.36
633 0.39
634 0.36
635 0.31
636 0.28
637 0.26
638 0.23
639 0.22
640 0.22
641 0.17
642 0.11
643 0.11
644 0.12
645 0.13
646 0.13
647 0.14
648 0.18
649 0.14
650 0.18
651 0.21
652 0.27
653 0.29
654 0.29
655 0.33
656 0.32
657 0.34
658 0.4
659 0.44
660 0.38
661 0.36
662 0.38
663 0.35
664 0.31
665 0.3
666 0.23
667 0.18
668 0.19
669 0.18
670 0.16
671 0.17
672 0.17
673 0.16
674 0.14
675 0.11
676 0.1
677 0.1
678 0.09
679 0.06
680 0.06
681 0.06
682 0.07
683 0.06
684 0.05
685 0.04
686 0.04
687 0.04
688 0.06
689 0.07
690 0.08
691 0.08
692 0.09
693 0.09
694 0.09
695 0.16
696 0.25
697 0.27
698 0.29
699 0.34
700 0.35
701 0.36
702 0.36
703 0.33
704 0.29
705 0.28
706 0.25
707 0.23
708 0.22
709 0.22
710 0.22
711 0.18
712 0.13
713 0.12
714 0.12
715 0.14
716 0.14
717 0.14
718 0.14
719 0.16
720 0.15
721 0.18
722 0.2
723 0.19
724 0.19
725 0.21
726 0.26
727 0.27
728 0.27
729 0.28
730 0.25
731 0.28
732 0.31
733 0.29
734 0.29
735 0.29
736 0.3
737 0.28
738 0.31
739 0.27
740 0.26
741 0.3
742 0.3
743 0.31
744 0.3
745 0.3
746 0.35
747 0.37
748 0.42
749 0.42
750 0.41
751 0.45
752 0.52
753 0.59
754 0.61
755 0.6
756 0.56
757 0.52
758 0.48
759 0.45
760 0.44
761 0.36
762 0.33
763 0.31
764 0.35
765 0.38
766 0.38
767 0.38
768 0.31
769 0.3
770 0.28
771 0.27
772 0.23
773 0.19
774 0.19
775 0.19
776 0.23
777 0.24
778 0.23
779 0.29
780 0.29
781 0.34
782 0.36
783 0.37
784 0.37
785 0.42
786 0.45
787 0.46
788 0.48
789 0.48
790 0.52
791 0.54
792 0.55
793 0.5
794 0.48
795 0.5
796 0.47
797 0.41
798 0.33
799 0.32
800 0.3
801 0.3
802 0.32
803 0.28
804 0.31
805 0.32
806 0.33
807 0.31
808 0.27
809 0.27
810 0.22
811 0.18
812 0.14
813 0.13
814 0.13
815 0.11
816 0.12
817 0.11
818 0.1
819 0.08
820 0.09
821 0.1
822 0.1
823 0.13
824 0.17
825 0.22
826 0.22
827 0.23
828 0.27
829 0.25
830 0.26
831 0.24
832 0.18
833 0.13
834 0.15
835 0.15
836 0.12
837 0.12
838 0.11
839 0.14
840 0.17
841 0.19
842 0.23
843 0.28
844 0.3
845 0.34
846 0.4
847 0.45
848 0.48
849 0.52
850 0.53
851 0.52
852 0.52
853 0.52
854 0.5
855 0.46
856 0.44
857 0.44
858 0.38
859 0.34
860 0.33
861 0.29
862 0.26
863 0.31
864 0.34
865 0.34
866 0.34
867 0.38
868 0.39
869 0.43
870 0.44
871 0.4
872 0.42
873 0.44
874 0.43
875 0.41
876 0.44
877 0.41
878 0.4
879 0.38
880 0.31
881 0.26
882 0.32
883 0.32
884 0.28
885 0.29
886 0.27
887 0.25
888 0.27
889 0.31
890 0.28
891 0.29
892 0.35
893 0.42
894 0.48
895 0.48
896 0.48
897 0.45
898 0.49
899 0.56
900 0.59
901 0.59
902 0.57
903 0.59
904 0.65
905 0.64
906 0.55
907 0.45
908 0.37
909 0.32
910 0.28
911 0.25
912 0.16
913 0.16
914 0.17
915 0.2
916 0.2
917 0.19
918 0.23
919 0.28
920 0.29
921 0.34
922 0.36
923 0.4
924 0.41
925 0.39