Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VAX0

Protein Details
Accession H1VAX0    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-64FGDLNPRKRRRVGNTKESAAHydrophilic
73-95EDDGPGRRWKKKTLRSKGMSFVSHydrophilic
301-324DSEEEEKKRKRERKKKTASAGGSSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
79-84RRWKKK
225-234PKGKAKPNPK
284-295EKKEEKRQAKLR
306-332EKKRKRERKKKTASAGGSSVSTPKRQK
Subcellular Location(s) nucl 15cyto_nucl 15, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR022159  STIP/TFIP11_N  
IPR045211  TFP11/STIP/Ntr1  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000390  P:spliceosomal complex disassembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PF12457  TIP_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MASFPTFDPSRLTKKAATHYSSESEEDDDDDYLAPVADPSQGDDFGDLNPRKRRRVGNTKESAALGIFGSDSEDDGPGRRWKKKTLRSKGMSFVSTGATTLDQDDDEANSANTKEYSDDSNDNNDGNDDDDDEDEDEDEVGGVGLGFGGAQRGLGFKPAQHEETDQGAAVATAPPTRPFAKTKFDGKNPLGRGFVPSSANVPVLRADVQDAPPPPKVAHPSAFGPKGKAKPNPKSFGARMMAKMGYKEGDGLGREGQGRSVIIEAHLRPQGVGLGAVKEKSEHEKKEEKRQAKLRGEEVIDSEEEEKKRKRERKKKTASAGGSSVSTPKRQKPKYMTAEEIKKSAPGLHIPEAFAPILDMTGPGNKLLTTASGLLTPTSSAVVESPEVAAARKLVKRAHADLAAFSEEWRNLEERKTWVDLELREREQEMADLASDLGRLQVFSNIVTNELPLATEWDDVIRCLEKAVQHIGPATEEIADLAVAAIHPFFREPDWNLLEQPTRYAAELKGLGGILT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.57
3 0.6
4 0.58
5 0.54
6 0.55
7 0.55
8 0.52
9 0.47
10 0.39
11 0.32
12 0.28
13 0.25
14 0.22
15 0.17
16 0.15
17 0.13
18 0.12
19 0.1
20 0.1
21 0.08
22 0.07
23 0.07
24 0.09
25 0.09
26 0.11
27 0.14
28 0.14
29 0.14
30 0.15
31 0.15
32 0.14
33 0.24
34 0.24
35 0.29
36 0.38
37 0.44
38 0.49
39 0.56
40 0.64
41 0.65
42 0.74
43 0.76
44 0.78
45 0.8
46 0.78
47 0.73
48 0.64
49 0.54
50 0.43
51 0.33
52 0.22
53 0.14
54 0.1
55 0.07
56 0.08
57 0.07
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.1
63 0.15
64 0.22
65 0.29
66 0.37
67 0.4
68 0.49
69 0.6
70 0.68
71 0.75
72 0.78
73 0.82
74 0.82
75 0.84
76 0.82
77 0.76
78 0.67
79 0.57
80 0.47
81 0.38
82 0.31
83 0.25
84 0.17
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.11
89 0.08
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.1
94 0.1
95 0.09
96 0.09
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.11
103 0.15
104 0.18
105 0.21
106 0.22
107 0.27
108 0.27
109 0.26
110 0.24
111 0.22
112 0.17
113 0.16
114 0.14
115 0.1
116 0.09
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.09
122 0.08
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.04
128 0.04
129 0.03
130 0.03
131 0.02
132 0.02
133 0.02
134 0.02
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.05
140 0.05
141 0.09
142 0.09
143 0.1
144 0.15
145 0.19
146 0.2
147 0.2
148 0.22
149 0.21
150 0.24
151 0.23
152 0.18
153 0.14
154 0.13
155 0.11
156 0.1
157 0.08
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.12
163 0.14
164 0.16
165 0.2
166 0.24
167 0.3
168 0.35
169 0.43
170 0.47
171 0.5
172 0.56
173 0.54
174 0.57
175 0.53
176 0.51
177 0.43
178 0.36
179 0.35
180 0.29
181 0.29
182 0.22
183 0.19
184 0.18
185 0.18
186 0.19
187 0.15
188 0.13
189 0.11
190 0.11
191 0.11
192 0.09
193 0.1
194 0.11
195 0.13
196 0.16
197 0.17
198 0.19
199 0.19
200 0.2
201 0.19
202 0.19
203 0.23
204 0.23
205 0.24
206 0.23
207 0.25
208 0.3
209 0.34
210 0.31
211 0.3
212 0.31
213 0.35
214 0.38
215 0.42
216 0.46
217 0.52
218 0.59
219 0.62
220 0.59
221 0.6
222 0.55
223 0.55
224 0.5
225 0.41
226 0.34
227 0.31
228 0.3
229 0.24
230 0.23
231 0.16
232 0.13
233 0.11
234 0.1
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.09
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.08
245 0.08
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.09
251 0.09
252 0.12
253 0.13
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.09
259 0.09
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.15
268 0.21
269 0.21
270 0.27
271 0.36
272 0.4
273 0.5
274 0.58
275 0.55
276 0.57
277 0.64
278 0.68
279 0.66
280 0.66
281 0.57
282 0.53
283 0.5
284 0.42
285 0.35
286 0.27
287 0.19
288 0.16
289 0.15
290 0.15
291 0.15
292 0.19
293 0.22
294 0.27
295 0.37
296 0.45
297 0.55
298 0.61
299 0.72
300 0.78
301 0.86
302 0.88
303 0.87
304 0.88
305 0.81
306 0.74
307 0.64
308 0.54
309 0.44
310 0.34
311 0.3
312 0.22
313 0.24
314 0.24
315 0.29
316 0.39
317 0.41
318 0.5
319 0.54
320 0.63
321 0.67
322 0.68
323 0.67
324 0.64
325 0.7
326 0.62
327 0.56
328 0.45
329 0.36
330 0.31
331 0.27
332 0.22
333 0.17
334 0.2
335 0.23
336 0.24
337 0.24
338 0.24
339 0.24
340 0.21
341 0.17
342 0.13
343 0.08
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.05
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.09
359 0.09
360 0.1
361 0.1
362 0.09
363 0.09
364 0.07
365 0.07
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.07
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.14
379 0.16
380 0.2
381 0.21
382 0.28
383 0.33
384 0.37
385 0.4
386 0.38
387 0.37
388 0.34
389 0.34
390 0.3
391 0.24
392 0.2
393 0.18
394 0.15
395 0.16
396 0.16
397 0.16
398 0.15
399 0.19
400 0.22
401 0.23
402 0.27
403 0.29
404 0.28
405 0.29
406 0.33
407 0.33
408 0.36
409 0.4
410 0.37
411 0.35
412 0.35
413 0.33
414 0.29
415 0.25
416 0.19
417 0.12
418 0.11
419 0.1
420 0.09
421 0.08
422 0.08
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.1
429 0.11
430 0.12
431 0.15
432 0.14
433 0.16
434 0.15
435 0.15
436 0.12
437 0.12
438 0.11
439 0.08
440 0.11
441 0.11
442 0.11
443 0.11
444 0.13
445 0.13
446 0.13
447 0.16
448 0.14
449 0.13
450 0.13
451 0.16
452 0.16
453 0.2
454 0.26
455 0.24
456 0.24
457 0.26
458 0.26
459 0.24
460 0.22
461 0.19
462 0.13
463 0.12
464 0.11
465 0.09
466 0.08
467 0.06
468 0.05
469 0.05
470 0.04
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.06
475 0.07
476 0.08
477 0.11
478 0.17
479 0.2
480 0.29
481 0.33
482 0.34
483 0.35
484 0.39
485 0.42
486 0.36
487 0.35
488 0.3
489 0.27
490 0.26
491 0.28
492 0.23
493 0.25
494 0.26
495 0.24
496 0.22