Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VN02

Protein Details
Accession H1VN02    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
233-264SEPSSKLAKLKKPEKKPGKKKSKRGDEFSDLFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
238-256KLAKLKKPEKKPGKKKSKR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047205  RMP1  
IPR047204  RMP1_RBD  
Gene Ontology GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
KEGG chig:CH63R_02630  -  
CDD cd22573  RMP1_RBD  
Amino Acid Sequences MAPVDTADVDRPAVAALVPVLQIFDGFNHRNKNQHRVARWWARFDLLRRSVRRLHDALEARVRHRHAQSFKAPSKKSASKANAGVVIGNGNRRGNALDEHVTARARLLLDSIIPSSFLAFSQLAADNQHAALGLVLLGVLARINSTVAPLVPQQSERGGDMPMTNTSASHDAVTVKDQTPSELMDLGVAISRDQLKLAAKPAARRPRKDDWEAVTSTATKKKRNMLDVSDSESEPSSKLAKLKKPEKKPGKKKSKRGDEFSDLFSSLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.07
3 0.06
4 0.07
5 0.07
6 0.07
7 0.07
8 0.07
9 0.07
10 0.07
11 0.08
12 0.14
13 0.17
14 0.22
15 0.3
16 0.31
17 0.4
18 0.45
19 0.52
20 0.55
21 0.6
22 0.6
23 0.61
24 0.69
25 0.72
26 0.71
27 0.67
28 0.59
29 0.55
30 0.54
31 0.5
32 0.51
33 0.48
34 0.52
35 0.5
36 0.54
37 0.57
38 0.57
39 0.6
40 0.52
41 0.46
42 0.46
43 0.47
44 0.46
45 0.47
46 0.45
47 0.4
48 0.43
49 0.44
50 0.41
51 0.41
52 0.45
53 0.42
54 0.47
55 0.53
56 0.57
57 0.61
58 0.64
59 0.6
60 0.56
61 0.6
62 0.59
63 0.55
64 0.55
65 0.53
66 0.5
67 0.52
68 0.5
69 0.44
70 0.37
71 0.34
72 0.24
73 0.21
74 0.16
75 0.15
76 0.15
77 0.12
78 0.12
79 0.13
80 0.13
81 0.12
82 0.13
83 0.15
84 0.15
85 0.16
86 0.17
87 0.18
88 0.17
89 0.15
90 0.14
91 0.12
92 0.1
93 0.09
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.09
99 0.07
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.06
107 0.07
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.1
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.06
117 0.05
118 0.04
119 0.03
120 0.03
121 0.02
122 0.02
123 0.02
124 0.02
125 0.02
126 0.02
127 0.02
128 0.02
129 0.02
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.04
134 0.04
135 0.05
136 0.06
137 0.08
138 0.09
139 0.09
140 0.1
141 0.11
142 0.12
143 0.12
144 0.12
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.08
153 0.1
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.12
161 0.14
162 0.12
163 0.15
164 0.15
165 0.15
166 0.15
167 0.15
168 0.14
169 0.12
170 0.11
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.05
177 0.06
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.1
182 0.11
183 0.13
184 0.17
185 0.21
186 0.22
187 0.27
188 0.37
189 0.45
190 0.51
191 0.54
192 0.58
193 0.63
194 0.69
195 0.7
196 0.67
197 0.62
198 0.6
199 0.56
200 0.5
201 0.41
202 0.35
203 0.33
204 0.34
205 0.33
206 0.33
207 0.37
208 0.45
209 0.5
210 0.56
211 0.59
212 0.58
213 0.62
214 0.59
215 0.61
216 0.55
217 0.47
218 0.41
219 0.35
220 0.29
221 0.2
222 0.19
223 0.15
224 0.15
225 0.21
226 0.28
227 0.35
228 0.45
229 0.55
230 0.63
231 0.71
232 0.8
233 0.85
234 0.88
235 0.92
236 0.93
237 0.94
238 0.94
239 0.95
240 0.95
241 0.95
242 0.93
243 0.9
244 0.88
245 0.85
246 0.79
247 0.72
248 0.65